RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000155840.9

KCNQ1-201, Transcript of potassium voltage-gated channel subfamily Q member 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene KCNQ1, Length 3,245 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNQ1-201ENST00000155840 C4BPAP04003 597 aaKnown RBP18.19■□□□□ 0.5
KCNQ1-201ENST00000155840 PGM1P36871 562 aa18.19■□□□□ 0.5
KCNQ1-201ENST00000155840 RGS7P49802 495 aa18.19■□□□□ 0.5
KCNQ1-201ENST00000155840 EIF3EP60228 445 aaKnown RBP18.19■□□□□ 0.5
KCNQ1-201ENST00000155840 PSMC1P62191 440 aaKnown RBP18.19■□□□□ 0.5
KCNQ1-201ENST00000155840 GCNT1Q02742 428 aa18.19■□□□□ 0.5
KCNQ1-201ENST00000155840 TRPC3Q13507 836 aa18.19■□□□□ 0.5
KCNQ1-201ENST00000155840 KATNAL2Q8IYT4 538 aa18.19■□□□□ 0.5
KCNQ1-201ENST00000155840 MOCOSQ96EN8 888 aa18.19■□□□□ 0.5
KCNQ1-201ENST00000155840 CYP26B1Q9NR63 512 aa18.19■□□□□ 0.5
KCNQ1-201ENST00000155840 COQ4Q9Y3A0 265 aa18.19■□□□□ 0.5
KCNQ1-201ENST00000155840 MRPL42Q9Y6G3 142 aaKnown RBP18.19■□□□□ 0.5
KCNQ1-201ENST00000155840 TRIM49D1C9J1S8 452 aa18.18■□□□□ 0.5
KCNQ1-201ENST00000155840 GNAZP19086 355 aa18.18■□□□□ 0.5
KCNQ1-201ENST00000155840 PTPN4P29074 926 aa18.18■□□□□ 0.5
KCNQ1-201ENST00000155840 C15orf59Q2T9L4 293 aaPredicted RBP18.18■□□□□ 0.5
KCNQ1-201ENST00000155840 TFDP3Q5H9I0 405 aa18.18■□□□□ 0.5
KCNQ1-201ENST00000155840 PPP6R3Q5H9R7 873 aaPredicted RBP18.18■□□□□ 0.5
KCNQ1-201ENST00000155840 CCDC62Q6P9F0 684 aa18.18■□□□□ 0.5
KCNQ1-201ENST00000155840 POLNQ7Z5Q5 900 aa18.18■□□□□ 0.5
KCNQ1-201ENST00000155840 SPATA18Q8TC71 538 aa18.18■□□□□ 0.5
KCNQ1-201ENST00000155840 TRAPPC12Q8WVT3 735 aa18.18■□□□□ 0.5
KCNQ1-201ENST00000155840 PCMTD2Q9NV79 361 aa18.18■□□□□ 0.5
KCNQ1-201ENST00000155840 IP6K2Q9UHH9 426 aa18.18■□□□□ 0.5
KCNQ1-201ENST00000155840 SCN9AQ15858 1988 aa18.18■□□□□ 0.5
KCNQ1-201ENST00000155840 hCG_1818297A0A087WSY0 165 aa18.18■□□□□ 0.5
KCNQ1-201ENST00000155840 LOC100653049A0A140TA62 436 aa18.18■□□□□ 0.5
KCNQ1-201ENST00000155840 KRT34O76011 436 aa18.18■□□□□ 0.5
KCNQ1-201ENST00000155840 CYP1A1P04798 512 aaPredicted RBP18.18■□□□□ 0.5
KCNQ1-201ENST00000155840 ACTR2P61160 394 aa18.18■□□□□ 0.5
KCNQ1-201ENST00000155840 UBAP2LQ14157 1087 aaKnown RBP18.18■□□□□ 0.5
KCNQ1-201ENST00000155840 BBOF1Q8ND07 529 aa18.18■□□□□ 0.5
KCNQ1-201ENST00000155840 RAB6BQ9NRW1 208 aa18.18■□□□□ 0.5
KCNQ1-201ENST00000155840 CISHQ9NSE2 258 aa18.18■□□□□ 0.5
KCNQ1-201ENST00000155840 TAS2R1Q9NYW7 299 aa18.18■□□□□ 0.5
KCNQ1-201ENST00000155840 HERC5Q9UII4 1024 aaKnown RBP18.18■□□□□ 0.5
KCNQ1-201ENST00000155840 CXorf49A8MYA2 514 aaPredicted RBP18.17■□□□□ 0.5
KCNQ1-201ENST00000155840 FCHO1O14526 889 aa18.17■□□□□ 0.5
KCNQ1-201ENST00000155840 PSTPIP1O43586 416 aa18.17■□□□□ 0.5
KCNQ1-201ENST00000155840 TYROBPO43914 113 aa18.17■□□□□ 0.5
KCNQ1-201ENST00000155840 TOM1L1O75674 476 aa18.17■□□□□ 0.5
KCNQ1-201ENST00000155840 APRTP07741 180 aa18.17■□□□□ 0.5
KCNQ1-201ENST00000155840 SP2Q02086 613 aa18.17■□□□□ 0.5
KCNQ1-201ENST00000155840 EMC2Q15006 297 aa18.17■□□□□ 0.5
KCNQ1-201ENST00000155840 C4orf50Q6ZRC1 276 aa18.17■□□□□ 0.5
KCNQ1-201ENST00000155840 RCOR2Q8IZ40 523 aa18.17■□□□□ 0.5
KCNQ1-201ENST00000155840 PPP1R14CQ8TAE6 165 aa18.17■□□□□ 0.5
KCNQ1-201ENST00000155840 GRAMD1AQ96CP6 724 aa18.17■□□□□ 0.5
KCNQ1-201ENST00000155840 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP18.17■□□□□ 0.5
KCNQ1-201ENST00000155840 C2CD2Q9Y426 696 aa18.17■□□□□ 0.5
KCNQ1-201ENST00000155840 TXNDC9O14530 226 aa18.17■□□□□ 0.5
KCNQ1-201ENST00000155840 KRT3P12035 628 aa18.17■□□□□ 0.5
KCNQ1-201ENST00000155840 ABCG1P45844 678 aa18.17■□□□□ 0.5
KCNQ1-201ENST00000155840 HSD17B4P51659 736 aa18.17■□□□□ 0.5
KCNQ1-201ENST00000155840 KLC1Q07866 573 aa18.17■□□□□ 0.5
KCNQ1-201ENST00000155840 CASC4Q6P4E1 433 aa18.17■□□□□ 0.5
KCNQ1-201ENST00000155840 FAM160B2Q86V87 743 aa18.17■□□□□ 0.5
KCNQ1-201ENST00000155840 PDIK1LQ8N165 341 aa18.17■□□□□ 0.5
KCNQ1-201ENST00000155840 FAF2Q96CS3 445 aa18.17■□□□□ 0.5
KCNQ1-201ENST00000155840 NRAPQ86VF7 1730 aa18.17■□□□□ 0.5
KCNQ1-201ENST00000155840 GSC2O15499 205 aa18.17■□□□□ 0.5
KCNQ1-201ENST00000155840 EXTL3O43909 919 aa18.17■□□□□ 0.5
KCNQ1-201ENST00000155840 HMGCS2P54868 508 aa18.17■□□□□ 0.5
KCNQ1-201ENST00000155840 CNTN2Q02246 1040 aa18.17■□□□□ 0.5
KCNQ1-201ENST00000155840 RBM41Q96IZ5 413 aaKnown RBP18.17■□□□□ 0.5
KCNQ1-201ENST00000155840 APOL6Q9BWW8 343 aa18.17■□□□□ 0.5
KCNQ1-201ENST00000155840 EURLQ9NYK6 297 aa18.17■□□□□ 0.5
KCNQ1-201ENST00000155840 SYNJ2BP-COX16A0A087WUM0 186 aa18.16■□□□□ 0.5
KCNQ1-201ENST00000155840 TMEM191CA6NGB0 347 aa18.16■□□□□ 0.5
KCNQ1-201ENST00000155840 LYPLA1O75608 230 aaPredicted RBP18.16■□□□□ 0.5
KCNQ1-201ENST00000155840 TMEM191BP0C7N4 346 aa18.16■□□□□ 0.5
KCNQ1-201ENST00000155840 KCNA3P22001 575 aa18.16■□□□□ 0.5
KCNQ1-201ENST00000155840 IGBP1P78318 339 aa18.16■□□□□ 0.5
KCNQ1-201ENST00000155840 CFAP157Q5JU67 520 aa18.16■□□□□ 0.5
KCNQ1-201ENST00000155840 FAM151AQ8WW52 585 aa18.16■□□□□ 0.5
KCNQ1-201ENST00000155840 NLRP4Q96MN2 994 aa18.16■□□□□ 0.5
KCNQ1-201ENST00000155840 JPH1Q9HDC5 661 aaPredicted RBP18.16■□□□□ 0.5
KCNQ1-201ENST00000155840 COX16Q9P0S2 106 aa18.16■□□□□ 0.5
KCNQ1-201ENST00000155840 HMGXB4Q9UGU5 601 aa18.16■□□□□ 0.5
KCNQ1-201ENST00000155840 GINS2Q9Y248 185 aa18.16■□□□□ 0.5
KCNQ1-201ENST00000155840 CCDC78A2IDD5 438 aa18.16■□□□□ 0.5
KCNQ1-201ENST00000155840 PDE5AO76074 875 aa18.16■□□□□ 0.5
KCNQ1-201ENST00000155840 MSX2P35548 267 aaPredicted RBP18.16■□□□□ 0.5
KCNQ1-201ENST00000155840 CDKN2BP42772 138 aa18.16■□□□□ 0.5
KCNQ1-201ENST00000155840 PHKA2P46019 1235 aa18.16■□□□□ 0.5
KCNQ1-201ENST00000155840 BPIFB4P59827 614 aa18.16■□□□□ 0.5
KCNQ1-201ENST00000155840 MYBPC2Q14324 1141 aa18.16■□□□□ 0.5
KCNQ1-201ENST00000155840 PPP2R5DQ14738 602 aa18.16■□□□□ 0.5
KCNQ1-201ENST00000155840 SYDE1Q6ZW31 735 aaPredicted RBP18.16■□□□□ 0.5
KCNQ1-201ENST00000155840 KBTBD2Q8IY47 623 aa18.16■□□□□ 0.5
KCNQ1-201ENST00000155840 TMEM192Q8IY95 271 aa18.16■□□□□ 0.5
KCNQ1-201ENST00000155840 TMC2Q8TDI7 906 aa18.16■□□□□ 0.5
KCNQ1-201ENST00000155840 SLCO2A1Q92959 643 aa18.16■□□□□ 0.5
KCNQ1-201ENST00000155840 AVENQ9NQS1 362 aaPredicted RBP18.16■□□□□ 0.5
KCNQ1-201ENST00000155840 BATF3Q9NR55 127 aa18.16■□□□□ 0.5
KCNQ1-201ENST00000155840 ATAD5Q96QE3 1844 aa18.15■□□□□ 0.5
KCNQ1-201ENST00000155840 ALOX15BO15296 676 aa18.15■□□□□ 0.5
KCNQ1-201ENST00000155840 SERPINB4P48594 390 aa18.15■□□□□ 0.5
KCNQ1-201ENST00000155840 CDH6P55285 790 aa18.15■□□□□ 0.5
KCNQ1-201ENST00000155840 RASA2Q15283 850 aa18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 55.4 ms