RNA–Protein interactions for RNA: YOR377W

ATF1, Transcript of Alcohol acetyltransferase, yeast

Gene ATF1, Length 1,578 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
ATF1	YOR377W	YIR035C	P40579	254 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ATF1	YOR377W	YNR064C	P53750	290 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ATF1	YOR377W	YPL067C	Q02754	198 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ATF1	YOR377W	RSM10	Q03201	203 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ATF1	YOR377W	CRC1	Q12289	327 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ATF1	YOR377W	ODC2	Q99297	307 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ATF1	YOR377W	AUS1	Q08409	1394 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ATF1	YOR377W	TIM9	O74700	87 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATF1	YOR377W	RAS2	P01120	322 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
ATF1	YOR377W	HMRA1	P0CY11	126 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATF1	YOR377W	CLB6	P32943	380 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATF1	YOR377W	GPI11	Q06636	219 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATF1	YOR377W	ATP20	Q12233	115 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATF1	YOR377W	PMD1	P32634	1753 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATF1	YOR377W	YGL118C	P53132	145 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATF1	YOR377W	YDR274C	P87283	123 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATF1	YOR377W	TVP15	Q03860	143 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATF1	YOR377W	SML1	Q04964	104 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATF1	YOR377W	RRT7	Q07829	113 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATF1	YOR377W	DFM1	Q12743	341 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
ATF1	YOR377W	RPL9A	P05738	191 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
ATF1	YOR377W	RPL9B	P51401	191 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
ATF1	YOR377W	MRPS8	Q03799	155 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATF1	YOR377W	FIT3	Q08907	204 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATF1	YOR377W	YDR029W	Q12111	104 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATF1	YOR377W	UTP10	P42945	1769 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
ATF1	YOR377W	YET1	P35723	206 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ATF1	YOR377W	GPI18	P38211	433 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ATF1	YOR377W	KSH1	Q8TGJ3	72 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ATF1	YOR377W	MDH2	P22133	377 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ATF1	YOR377W	YGL010W	P25338	174 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ATF1	YOR377W	FMT1	P32785	401 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ATF1	YOR377W	ASP1	P38986	381 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
ATF1	YOR377W	HPA3	P39979	161 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ATF1	YOR377W	YFR035C	P43608	114 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ATF1	YOR377W	YMR082C	Q04276	118 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ATF1	YOR377W	SHH3	Q04487	196 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ATF1	YOR377W	ECM19	Q06011	112 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ATF1	YOR377W	CSI2	Q08054	341 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ATF1	YOR377W	YOL029C	Q08187	201 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ATF1	YOR377W	TIR3	P40552	269 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ATF1	YOR377W	DSK2	P48510	373 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ATF1	YOR377W	CTR2	P38865	189 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ATF1	YOR377W	HAL1	Q01766	294 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ATF1	YOR377W	LIP1	Q03579	150 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ATF1	YOR377W	YLR281C	Q05863	155 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ATF1	YOR377W	PIN3	Q06449	215 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ATF1	YOR377W	FIG2	P25653	1609 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ATF1	YOR377W	POR1	P04840	283 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
ATF1	YOR377W	UMP1	P38293	148 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ATF1	YOR377W	FLX1	P40464	311 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ATF1	YOR377W	SCW4	P53334	386 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
ATF1	YOR377W	SEN15	Q04675	128 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ATF1	YOR377W	SRL1	Q08673	210 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ATF1	YOR377W	UBC4	P15731	148 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ATF1	YOR377W	RPB9	P27999	122 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ATF1	YOR377W	RRT1	P38192	103 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ATF1	YOR377W	YHL042W	P38729	150 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ATF1	YOR377W	RIM9	Q04734	239 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ATF1	YOR377W	SCS22	Q6Q595	175 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ATF1	YOR377W	COX5B	P00425	151 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ATF1	YOR377W	MAK31	P23059	88 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ATF1	YOR377W	YHR125W	P38831	101 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ATF1	YOR377W	YEL073C	P39974	107 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ATF1	YOR377W	ERG25	P53045	309 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ATF1	YOR377W	YOL162W	P0CF19	215 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ATF1	YOR377W	SDH3	P33421	198 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ATF1	YOR377W	MRPL11	P36521	249 aa	Predicted RBP	4.79	□□□□□ -1.64
ATF1	YOR377W	YIL054W	P40524	105 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ATF1	YOR377W	MPC1	P53157	130 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
ATF1	YOR377W	RAF1	Q06891	181 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ATF1	YOR377W	VPS13	Q07878	3144 aa		4.79	□□□□□ -1.64
ATF1	YOR377W	PIR5	P46999	287 aa		4.78	□□□□□ -1.64
ATF1	YOR377W	KNH1	P50112	268 aa		4.78	□□□□□ -1.64
ATF1	YOR377W	MPC3	P53311	146 aa		4.78	□□□□□ -1.64
ATF1	YOR377W	HRT1	Q08273	121 aa		4.78	□□□□□ -1.64
ATF1	YOR377W	YLR422W	Q06409	1932 aa		4.78	□□□□□ -1.64
ATF1	YOR377W	HKR1	P41809	1802 aa		4.78	□□□□□ -1.64
ATF1	YOR377W	ECM12	O13529	151 aa		4.78	□□□□□ -1.64
ATF1	YOR377W	SNF11	P38956	169 aa		4.78	□□□□□ -1.64
ATF1	YOR377W	TVP23	P38962	199 aa		4.78	□□□□□ -1.64
ATF1	YOR377W	TDA2	P40045	126 aa		4.78	□□□□□ -1.64
ATF1	YOR377W	CAX4	P53223	239 aa		4.78	□□□□□ -1.64
ATF1	YOR377W	SUN4	P53616	420 aa		4.78	□□□□□ -1.64
ATF1	YOR377W	YOR385W	Q08909	290 aa		4.78	□□□□□ -1.64
ATF1	YOR377W	MIC10	Q96VH5	97 aa		4.78	□□□□□ -1.64
ATF1	YOR377W	FKS1	P38631	1876 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
ATF1	YOR377W	YKL044W	P36092	106 aa		4.77	□□□□□ -1.65
ATF1	YOR377W	MSL1	P40567	111 aa	Predicted RBP	4.77	□□□□□ -1.65
ATF1	YOR377W	ECO1	P43605	281 aa		4.77	□□□□□ -1.65
ATF1	YOR377W	YMR295C	Q03559	197 aa		4.77	□□□□□ -1.65
ATF1	YOR377W	IRC25	Q07951	179 aa		4.77	□□□□□ -1.65
ATF1	YOR377W	MYO1	P08964	1928 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ATF1	YOR377W	YNL217W	P40152	326 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ATF1	YOR377W	EMC5	P40540	141 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ATF1	YOR377W	IGD1	P43598	195 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ATF1	YOR377W	YGR026W	P53217	278 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ATF1	YOR377W	MZM1	Q03429	123 aa	Predicted RBP	4.76	□□□□□ -1.65
ATF1	YOR377W	YLR365W	Q7LIF2	110 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ATF1	YOR377W	YCL021W-A	Q96VH3	125 aa		4.76	□□□□□ -1.65

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 73.5 ms