RNA–Protein interactions for RNA: YMR135W-A

YMR135W-A, Transcript of Dubious open reading frame, yeastyeast

Gene YMR135W-A, Length 534 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YMR135W-AYMR135W-A CSI2Q08054 341 aa3.97□□□□□ -1.77
YMR135W-AYMR135W-A YKL068W-AQ3E826 78 aa3.97□□□□□ -1.77
YMR135W-AYMR135W-A SCS22Q6Q595 175 aa3.97□□□□□ -1.77
YMR135W-AYMR135W-A DUR1,2P32528 1835 aaKnown RBP3.97□□□□□ -1.77
YMR135W-AYMR135W-A YBR090CP38253 122 aa3.96□□□□□ -1.78
YMR135W-AYMR135W-A TVP23P38962 199 aa3.96□□□□□ -1.78
YMR135W-AYMR135W-A YAL064WP39711 94 aa3.96□□□□□ -1.78
YMR135W-AYMR135W-A LSM8P47093 109 aaKnown RBP3.96□□□□□ -1.78
YMR135W-AYMR135W-A IRC23Q08416 157 aa3.96□□□□□ -1.78
YMR135W-AYMR135W-A YOR097CQ12274 175 aaPredicted RBP3.96□□□□□ -1.78
YMR135W-AYMR135W-A YET1P35723 206 aa3.95□□□□□ -1.78
YMR135W-AYMR135W-A AIM18P38884 321 aa3.95□□□□□ -1.78
YMR135W-AYMR135W-A FLX1P40464 311 aa3.95□□□□□ -1.78
YMR135W-AYMR135W-A YIR035CP40579 254 aa3.95□□□□□ -1.78
YMR135W-AYMR135W-A PAM16P42949 149 aa3.95□□□□□ -1.78
YMR135W-AYMR135W-A NSE4P43124 402 aa3.95□□□□□ -1.78
YMR135W-AYMR135W-A GNA1P43577 159 aaPredicted RBP3.95□□□□□ -1.78
YMR135W-AYMR135W-A BAT2P47176 376 aaKnown RBP3.95□□□□□ -1.78
YMR135W-AYMR135W-A GRX5Q02784 150 aa3.95□□□□□ -1.78
YMR135W-AYMR135W-A RRP5Q05022 1729 aaKnown RBP3.95□□□□□ -1.78
YMR135W-AYMR135W-A KRE5P22023 1365 aa3.94□□□□□ -1.78
YMR135W-AYMR135W-A HSP26P15992 214 aaKnown RBP RIP-Chip data3.94□□□□□ -1.78not detected
YMR135W-AYMR135W-A HYP2P23301 157 aaKnown RBP3.94□□□□□ -1.78
YMR135W-AYMR135W-A YEA6P39953 335 aa3.94□□□□□ -1.78
YMR135W-AYMR135W-A UPS1Q05776 175 aa3.94□□□□□ -1.78
YMR135W-AYMR135W-A YOR376W-AQ3E805 51 aa3.94□□□□□ -1.78
YMR135W-AYMR135W-A FKS1P38631 1876 aaKnown RBP3.94□□□□□ -1.78
YMR135W-AYMR135W-A GCN2P15442 1659 aa3.94□□□□□ -1.78
YMR135W-AYMR135W-A SRL3P36167 246 aa3.93□□□□□ -1.78
YMR135W-AYMR135W-A YHL042WP38729 150 aa3.93□□□□□ -1.78
YMR135W-AYMR135W-A YFL012WP43580 148 aa3.93□□□□□ -1.78
YMR135W-AYMR135W-A YNR077CP53758 84 aa3.93□□□□□ -1.78
YMR135W-AYMR135W-A UIP4Q08926 304 aa3.93□□□□□ -1.78
YMR135W-AYMR135W-A ATG40Q99325 256 aa3.93□□□□□ -1.78
YMR135W-AYMR135W-A UBC5P15732 148 aa3.92□□□□□ -1.78
YMR135W-AYMR135W-A MIG1P27705 504 aa3.92□□□□□ -1.78
YMR135W-AYMR135W-A TMA19P35691 167 aaKnown RBP3.92□□□□□ -1.78
YMR135W-AYMR135W-A PIR5P46999 287 aa3.92□□□□□ -1.78
YMR135W-AYMR135W-A MPC1P53157 130 aaKnown RBP3.92□□□□□ -1.78
YMR135W-AYMR135W-A RCE1Q03530 315 aa3.92□□□□□ -1.78
YMR135W-AYMR135W-A YOR015WQ12169 119 aa3.92□□□□□ -1.78
YMR135W-AYMR135W-A RPS23AP0CX29 145 aaKnown RBP3.91□□□□□ -1.78
YMR135W-AYMR135W-A RPS23BP0CX30 145 aa3.91□□□□□ -1.78
YMR135W-AYMR135W-A SCM4P32564 187 aa3.91□□□□□ -1.78
YMR135W-AYMR135W-A RPL33BP41056 107 aaKnown RBP3.91□□□□□ -1.78
YMR135W-AYMR135W-A THG1P53215 237 aaKnown RBP3.91□□□□□ -1.78
YMR135W-AYMR135W-A ATP19P81451 68 aa3.91□□□□□ -1.78
YMR135W-AYMR135W-A URB1P34241 1764 aaKnown RBP3.9□□□□□ -1.79
YMR135W-AYMR135W-A INO4P13902 151 aa3.9□□□□□ -1.79
YMR135W-AYMR135W-A YCR099CP25657 155 aa3.9□□□□□ -1.79
YMR135W-AYMR135W-A YMR103CQ04436 120 aa3.9□□□□□ -1.79
YMR135W-AYMR135W-A SRB8P25648 1427 aa3.89□□□□□ -1.79
YMR135W-AYMR135W-A YEL045CP32616 141 aa3.89□□□□□ -1.79
YMR135W-AYMR135W-A CLB6P32943 380 aa3.89□□□□□ -1.79
YMR135W-AYMR135W-A YGR164WP53291 111 aa3.89□□□□□ -1.79
YMR135W-AYMR135W-A YOR385WQ08909 290 aa3.89□□□□□ -1.79
YMR135W-AYMR135W-A RPL13AQ12690 199 aaPredicted RBP3.89□□□□□ -1.79
YMR135W-AYMR135W-A CCS1P40202 249 aaKnown RBP3.88□□□□□ -1.79
YMR135W-AYMR135W-A PIR1Q03178 341 aa3.88□□□□□ -1.79
YMR135W-AYMR135W-A KEI1Q06346 221 aa3.88□□□□□ -1.79
YMR135W-AYMR135W-A FEX1Q08913 375 aa3.88□□□□□ -1.79
YMR135W-AYMR135W-A FEX2Q08991 375 aa3.88□□□□□ -1.79
YMR135W-AYMR135W-A MED11Q99278 115 aa3.88□□□□□ -1.79
YMR135W-AYMR135W-A FKS3Q04952 1785 aa3.88□□□□□ -1.79
YMR135W-AYMR135W-A YLR236CA0A023PZG4 107 aa3.87□□□□□ -1.79
YMR135W-AYMR135W-A HAP3P13434 144 aa3.87□□□□□ -1.79
YMR135W-AYMR135W-A ERG25P53045 309 aa3.87□□□□□ -1.79
YMR135W-AYMR135W-A BOL2P53082 120 aa3.87□□□□□ -1.79
YMR135W-AYMR135W-A MZM1Q03429 123 aaPredicted RBP3.87□□□□□ -1.79
YMR135W-AYMR135W-A NHP10Q03435 203 aa3.87□□□□□ -1.79
YMR135W-AYMR135W-A UPS3Q04006 179 aa3.87□□□□□ -1.79
YMR135W-AYMR135W-A YDL241WQ07738 123 aa3.87□□□□□ -1.79
YMR135W-AYMR135W-A ATG41Q12048 136 aa3.87□□□□□ -1.79
YMR135W-AYMR135W-A ERV15P38312 142 aa3.86□□□□□ -1.79
YMR135W-AYMR135W-A TIR3P40552 269 aa3.86□□□□□ -1.79
YMR135W-AYMR135W-A YJL027CP47063 138 aaPredicted RBP3.86□□□□□ -1.79
YMR135W-AYMR135W-A IRC19Q07843 230 aa3.86□□□□□ -1.79
YMR135W-AYMR135W-A YPR013CQ12145 317 aa3.86□□□□□ -1.79
YMR135W-AYMR135W-A TY3B-IQ7LHG5 1498 aaKnown RBP3.86□□□□□ -1.79
YMR135W-AYMR135W-A UBR1P19812 1950 aa3.85□□□□□ -1.79
YMR135W-AYMR135W-A NUP192P47054 1683 aa3.85□□□□□ -1.79
YMR135W-AYMR135W-A YGL041W-AP0C5N3 154 aa3.85□□□□□ -1.79
YMR135W-AYMR135W-A QCR10P37299 77 aa3.85□□□□□ -1.79
YMR135W-AYMR135W-A MRPS9P38120 278 aa3.85□□□□□ -1.79
YMR135W-AYMR135W-A YFR035CP43608 114 aa3.85□□□□□ -1.79
YMR135W-AYMR135W-A YML079WQ03629 201 aa3.85□□□□□ -1.79
YMR135W-AYMR135W-A YHP1Q04116 353 aa3.85□□□□□ -1.79
YMR135W-AYMR135W-A SOM1Q05676 74 aa3.85□□□□□ -1.79
YMR135W-AYMR135W-A YPR174CQ06616 221 aaPredicted RBP3.85□□□□□ -1.79
YMR135W-AYMR135W-A TMC1Q08422 150 aaPredicted RBP3.85□□□□□ -1.79
YMR135W-AYMR135W-A GTT2Q12390 233 aa3.85□□□□□ -1.79
YMR135W-AYMR135W-A YCR075W-AQ3E830 75 aa3.85□□□□□ -1.79
YMR135W-AYMR135W-A ADE6P38972 1358 aaKnown RBP3.85□□□□□ -1.79
YMR135W-AYMR135W-A TY4B-HP0C2J7 1802 aa3.84□□□□□ -1.79
YMR135W-AYMR135W-A TY4B-JP47024 1803 aa3.84□□□□□ -1.79
YMR135W-AYMR135W-A RPL26AP05743 127 aaKnown RBP3.84□□□□□ -1.79
YMR135W-AYMR135W-A UTH1P36135 365 aa3.84□□□□□ -1.79
YMR135W-AYMR135W-A YBR209WP38311 105 aa3.84□□□□□ -1.79
YMR135W-AYMR135W-A SNF11P38956 169 aa3.84□□□□□ -1.79
YMR135W-AYMR135W-A YEL067CP39978 195 aa3.84□□□□□ -1.79
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 43.9 ms