RNA–Protein interactions for RNA: YHR178W

STB5, Transcript of Transcription factor, yeast

Gene STB5, Length 2,232 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
STB5	YHR178W	RPS14A	P06367	137 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
STB5	YHR178W	ATX1	P38636	73 aa		4.94	□□□□□ -1.62
STB5	YHR178W	RPS14B	P39516	138 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
STB5	YHR178W	HSK3	P69852	69 aa		4.94	□□□□□ -1.62
STB5	YHR178W	FOL3	Q12676	427 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
STB5	YHR178W	VAR1	P02381	398 aa		4.93	□□□□□ -1.62
STB5	YHR178W	HEM13	P11353	328 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
STB5	YHR178W	YMR31	P19955	123 aa		4.93	□□□□□ -1.62
STB5	YHR178W	HSP12	P22943	109 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
STB5	YHR178W	YKR041W	P36134	250 aa		4.93	□□□□□ -1.62
STB5	YHR178W	YMR141C	P40211	102 aa		4.93	□□□□□ -1.62
STB5	YHR178W	TIF34	P40217	347 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
STB5	YHR178W	YIL086C	P40503	102 aa		4.93	□□□□□ -1.62
STB5	YHR178W	GAR1	P28007	205 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
STB5	YHR178W	SPC29	P33419	253 aa		4.93	□□□□□ -1.62
STB5	YHR178W	YIL029C	P40538	142 aa		4.93	□□□□□ -1.62
STB5	YHR178W	LCL3	P53153	274 aa		4.93	□□□□□ -1.62
STB5	YHR178W	SNP1	Q00916	300 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
STB5	YHR178W	HNT3	Q08702	217 aa		4.93	□□□□□ -1.62
STB5	YHR178W	YBL112C	Q3E7Y4	105 aa		4.93	□□□□□ -1.62
STB5	YHR178W	UGX2	P32772	223 aa		4.92	□□□□□ -1.62
STB5	YHR178W	APS1	P35181	156 aa		4.92	□□□□□ -1.62
STB5	YHR178W	CMC1	P36064	111 aa		4.92	□□□□□ -1.62
STB5	YHR178W	ECO1	P43605	281 aa		4.92	□□□□□ -1.62
STB5	YHR178W	PGU1	P47180	361 aa		4.92	□□□□□ -1.62
STB5	YHR178W	YNR077C	P53758	84 aa		4.92	□□□□□ -1.62
STB5	YHR178W	YMR103C	Q04436	120 aa		4.92	□□□□□ -1.62
STB5	YHR178W	TAO3	P40468	2376 aa		4.92	□□□□□ -1.62
STB5	YHR178W	RPL27B	P0C2H7	136 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
STB5	YHR178W	YPL073C	P40323	161 aa		4.92	□□□□□ -1.62
STB5	YHR178W	YFR057W	P43625	151 aa		4.92	□□□□□ -1.62
STB5	YHR178W	MOT3	P54785	490 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
STB5	YHR178W	UPS1	Q05776	175 aa		4.92	□□□□□ -1.62
STB5	YHR178W	FCY1	Q12178	158 aa		4.92	□□□□□ -1.62
STB5	YHR178W	ERG8	P24521	451 aa		4.91	□□□□□ -1.62
STB5	YHR178W	YCR022C	P25620	114 aa		4.91	□□□□□ -1.62
STB5	YHR178W	NHP2	P32495	156 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
STB5	YHR178W	PAU7	P39545	55 aa		4.91	□□□□□ -1.62
STB5	YHR178W	YGR018C	P53211	109 aa		4.91	□□□□□ -1.62
STB5	YHR178W	YCR006C	P25350	157 aa		4.91	□□□□□ -1.62
STB5	YHR178W	BNA2	P47125	453 aa		4.91	□□□□□ -1.62
STB5	YHR178W	YDR114C	Q04597	100 aa		4.91	□□□□□ -1.62
STB5	YHR178W	YLR112W	Q12130	139 aa		4.91	□□□□□ -1.62
STB5	YHR178W	CSF1	Q12150	2958 aa		4.9	□□□□□ -1.62
STB5	YHR178W	YKL097C	P34245	136 aa		4.9	□□□□□ -1.63
STB5	YHR178W	REE1	P40893	198 aa		4.9	□□□□□ -1.63
STB5	YHR178W	YFL015C	P43578	164 aa		4.9	□□□□□ -1.63
STB5	YHR178W	YJL118W	P47022	219 aa		4.9	□□□□□ -1.63
STB5	YHR178W	HTL1	Q9URQ5	78 aa		4.9	□□□□□ -1.63
STB5	YHR178W	RPL35A	P0CX84	120 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
STB5	YHR178W	RPL35B	P0CX85	120 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
STB5	YHR178W	FPR2	P32472	135 aa		4.89	□□□□□ -1.63
STB5	YHR178W	YKR073C	P36153	106 aa		4.89	□□□□□ -1.63
STB5	YHR178W	GPI18	P38211	433 aa		4.89	□□□□□ -1.63
STB5	YHR178W	SUN4	P53616	420 aa		4.89	□□□□□ -1.63
STB5	YHR178W	ATG21	Q02887	496 aa		4.89	□□□□□ -1.63
STB5	YHR178W	GTO3	Q04806	366 aa		4.89	□□□□□ -1.63
STB5	YHR178W	YIR021W-A	Q3E739	70 aa		4.89	□□□□□ -1.63
STB5	YHR178W	MRPS5	P33759	307 aa		4.89	□□□□□ -1.63
STB5	YHR178W	MTC6	P38849	526 aa		4.89	□□□□□ -1.63
STB5	YHR178W	YER181C	P40097	107 aa		4.89	□□□□□ -1.63
STB5	YHR178W	SWS2	P53937	143 aa		4.89	□□□□□ -1.63
STB5	YHR178W	RPA12	P32529	125 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
STB5	YHR178W	VTC1	P40046	129 aa	RIP-Chip data	4.88	□□□□□ -1.63	not detected
STB5	YHR178W	PRY1	P47032	299 aa		4.88	□□□□□ -1.63
STB5	YHR178W	DAD4	P69851	72 aa		4.88	□□□□□ -1.63
STB5	YHR178W	NUP53	Q03790	475 aa		4.88	□□□□□ -1.63
STB5	YHR178W	YLR361C-A	Q3E795	98 aa		4.88	□□□□□ -1.63
STB5	YHR178W	KRE1	P17260	313 aa		4.88	□□□□□ -1.63
STB5	YHR178W	RPS26B	P39939	119 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
STB5	YHR178W	OXA1	P39952	402 aa		4.88	□□□□□ -1.63
STB5	YHR178W	YCH1	P42937	148 aa		4.88	□□□□□ -1.63
STB5	YHR178W	HPA2	Q06592	156 aa		4.88	□□□□□ -1.63
STB5	YHR178W	YOR097C	Q12274	175 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
STB5	YHR178W	SEN1	Q00416	2231 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
STB5	YHR178W	YHR214C-D	P0CX93	97 aa		4.87	□□□□□ -1.63
STB5	YHR178W	GON7	P46984	123 aa		4.87	□□□□□ -1.63
STB5	YHR178W	SDC1	Q03323	175 aa		4.87	□□□□□ -1.63
STB5	YHR178W	MIX14	Q04341	121 aa		4.87	□□□□□ -1.63
STB5	YHR178W	RFM1	Q12192	310 aa		4.87	□□□□□ -1.63
STB5	YHR178W	YAL063C-A	Q3E791	96 aa		4.87	□□□□□ -1.63
STB5	YHR178W	AQY1	P0CD91	305 aa		4.87	□□□□□ -1.63
STB5	YHR178W	MSN1	P22148	382 aa		4.87	□□□□□ -1.63
STB5	YHR178W	NCA3	P46955	337 aa		4.87	□□□□□ -1.63
STB5	YHR178W	RPL15B	P54780	204 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
STB5	YHR178W	MGR2	Q02889	113 aa		4.86	□□□□□ -1.63
STB5	YHR178W	GLE2	P40066	365 aa		4.85	□□□□□ -1.63
STB5	YHR178W	YMR317W	Q04893	1140 aa		4.85	□□□□□ -1.63
STB5	YHR178W	YPR053C	Q6Q5F3	151 aa		4.85	□□□□□ -1.63
STB5	YHR178W	HFA1	P32874	2273 aa		4.85	□□□□□ -1.63
STB5	YHR178W	YIP3	P53633	176 aa		4.85	□□□□□ -1.63
STB5	YHR178W	HST4	P53688	370 aa		4.85	□□□□□ -1.63
STB5	YHR178W	AGA1	P32323	725 aa		4.84	□□□□□ -1.63
STB5	YHR178W	YKL070W	P36087	169 aa		4.84	□□□□□ -1.63
STB5	YHR178W	FCF1	Q05498	189 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
STB5	YHR178W	RRS1	Q08746	203 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
STB5	YHR178W	COA3	Q3E7B2	85 aa		4.84	□□□□□ -1.63
STB5	YHR178W	MRPL20	P22354	195 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.64
STB5	YHR178W	YKR045C	P36138	183 aa		4.84	□□□□□ -1.64
STB5	YHR178W	YER084W	P40057	128 aa		4.84	□□□□□ -1.64

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 57.9 ms