RNA–Protein interactions for RNA: YCR069W

CPR4, Transcript of Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase (cyclophilin), yeast

Gene CPR4, Length 957 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Mitochondria .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
CPR4	YCR069W	YOR105W	Q08504	108 aa		3.57	□□□□□ -1.84
CPR4	YCR069W	AYT1	Q12226	474 aa		3.57	□□□□□ -1.84
CPR4	YCR069W	MRPL23	Q12487	163 aa	Predicted RBP	3.57	□□□□□ -1.84
CPR4	YCR069W	PAU19	P0CE85	124 aa		3.56	□□□□□ -1.84
CPR4	YCR069W	PAU21	P0CE86	164 aa		3.56	□□□□□ -1.84
CPR4	YCR069W	PAU22	P0CE87	164 aa		3.56	□□□□□ -1.84
CPR4	YCR069W	YHR213W	P0CI67	198 aa		3.56	□□□□□ -1.84
CPR4	YCR069W	CPT1	P17898	393 aa		3.56	□□□□□ -1.84
CPR4	YCR069W	PAU3	P25610	124 aa		3.56	□□□□□ -1.84
CPR4	YCR069W	YPS1	P32329	569 aa		3.56	□□□□□ -1.84
CPR4	YCR069W	RPS0A	P32905	252 aa	Known RBP	3.56	□□□□□ -1.84
CPR4	YCR069W	YKL102C	P34249	101 aa		3.56	□□□□□ -1.84
CPR4	YCR069W	YNK1	P36010	153 aa	Known RBP	3.56	□□□□□ -1.84
CPR4	YCR069W	PHD1	P36093	366 aa		3.56	□□□□□ -1.84
CPR4	YCR069W	VMA21	P41806	77 aa		3.56	□□□□□ -1.84
CPR4	YCR069W	DAN1	P47178	298 aa		3.56	□□□□□ -1.84
CPR4	YCR069W	TOS8	P53147	276 aa		3.56	□□□□□ -1.84
CPR4	YCR069W	URA2	P07259	2214 aa	Known RBP	3.55	□□□□□ -1.84
CPR4	YCR069W	CMC1	P36064	111 aa		3.55	□□□□□ -1.84
CPR4	YCR069W	AIM24	P47127	394 aa		3.55	□□□□□ -1.84
CPR4	YCR069W	YLR342W-A	Q3E810	57 aa		3.55	□□□□□ -1.84
CPR4	YCR069W	YGR035W-A	Q45U48	73 aa		3.55	□□□□□ -1.84
CPR4	YCR069W	YLR302C	O13544	120 aa		3.54	□□□□□ -1.84
CPR4	YCR069W	RPL31B	P0C2H9	113 aa	Known RBP	3.54	□□□□□ -1.84
CPR4	YCR069W	RPL12A	P0CX53	165 aa	Known RBP	3.54	□□□□□ -1.84
CPR4	YCR069W	RPL12B	P0CX54	165 aa		3.54	□□□□□ -1.84
CPR4	YCR069W	QRI5	P32344	111 aa		3.54	□□□□□ -1.84
CPR4	YCR069W	NTF2	P33331	125 aa	Known RBP	3.54	□□□□□ -1.84
CPR4	YCR069W	YBR144C	P34215	104 aa		3.54	□□□□□ -1.84
CPR4	YCR069W	PAU7	P39545	55 aa		3.54	□□□□□ -1.84
CPR4	YCR069W	UIP3	P39547	235 aa		3.54	□□□□□ -1.84
CPR4	YCR069W	YDL186W	P48568	277 aa		3.54	□□□□□ -1.84
CPR4	YCR069W	FYV6	P53913	173 aa		3.54	□□□□□ -1.84
CPR4	YCR069W	GIM5	Q04493	163 aa		3.54	□□□□□ -1.84
CPR4	YCR069W	POM33	Q12164	279 aa		3.54	□□□□□ -1.84
CPR4	YCR069W	DAD1	Q12248	94 aa		3.54	□□□□□ -1.84
CPR4	YCR069W	RPS22B	Q3E7Y3	130 aa	Known RBP	3.54	□□□□□ -1.84
CPR4	YCR069W	LSM2	P38203	95 aa	Known RBP	3.53	□□□□□ -1.84
CPR4	YCR069W	MPC2	P38857	129 aa		3.53	□□□□□ -1.84
CPR4	YCR069W	SRP14	P38985	146 aa		3.53	□□□□□ -1.84
CPR4	YCR069W	MBB1	P39534	108 aa		3.53	□□□□□ -1.84
CPR4	YCR069W	ATG39	Q06159	398 aa		3.53	□□□□□ -1.84
CPR4	YCR069W	NAT3	Q06504	195 aa		3.53	□□□□□ -1.84
CPR4	YCR069W	YNL146C-A	Q3E7Z1	64 aa		3.53	□□□□□ -1.84
CPR4	YCR069W	YCR041W	P37265	110 aa		3.52	□□□□□ -1.85
CPR4	YCR069W	RPB11	P38902	120 aa		3.52	□□□□□ -1.85
CPR4	YCR069W	LSM4	P40070	187 aa	Known RBP	3.52	□□□□□ -1.85
CPR4	YCR069W	YFR045W	P43617	309 aa		3.52	□□□□□ -1.85
CPR4	YCR069W	TDA4	P47153	279 aa		3.52	□□□□□ -1.85
CPR4	YCR069W	DUG3	P53871	357 aa		3.52	□□□□□ -1.85
CPR4	YCR069W	TIM11	P81449	96 aa	Predicted RBP	3.52	□□□□□ -1.85
CPR4	YCR069W	RAV2	Q03956	351 aa		3.52	□□□□□ -1.85
CPR4	YCR069W	CCW12	Q12127	133 aa		3.52	□□□□□ -1.85
CPR4	YCR069W	YGL010W	P25338	174 aa		3.51	□□□□□ -1.85
CPR4	YCR069W	GLE2	P40066	365 aa		3.51	□□□□□ -1.85
CPR4	YCR069W	SPI1	P40092	148 aa		3.51	□□□□□ -1.85
CPR4	YCR069W	NSE4	P43124	402 aa		3.51	□□□□□ -1.85
CPR4	YCR069W	RPA43	P46669	326 aa		3.51	□□□□□ -1.85
CPR4	YCR069W	ALG13	P53178	202 aa		3.51	□□□□□ -1.85
CPR4	YCR069W	YIP3	P53633	176 aa		3.51	□□□□□ -1.85
CPR4	YCR069W	DAD4	P69851	72 aa		3.51	□□□□□ -1.85
CPR4	YCR069W	IRC23	Q08416	157 aa		3.51	□□□□□ -1.85
CPR4	YCR069W	COA6	Q3E846	104 aa		3.51	□□□□□ -1.85
CPR4	YCR069W	MIX23	P38162	196 aa		3.5	□□□□□ -1.85
CPR4	YCR069W	YIL163C	P40448	117 aa		3.5	□□□□□ -1.85
CPR4	YCR069W	YCH1	P42937	148 aa		3.5	□□□□□ -1.85
CPR4	YCR069W	CGR1	P53188	120 aa		3.5	□□□□□ -1.85
CPR4	YCR069W	YGR026W	P53217	278 aa		3.5	□□□□□ -1.85
CPR4	YCR069W	TOM7	P53507	60 aa		3.5	□□□□□ -1.85
CPR4	YCR069W	CSM4	Q08955	156 aa		3.5	□□□□□ -1.85
CPR4	YCR069W	YNR034W-A	Q3E841	98 aa		3.5	□□□□□ -1.85
CPR4	YCR069W	YCL001W-B	Q96VH2	84 aa		3.5	□□□□□ -1.85
CPR4	YCR069W	RPL27A	P0C2H6	136 aa	Known RBP	3.49	□□□□□ -1.85
CPR4	YCR069W	MRPL31	P14063	131 aa	Predicted RBP	3.49	□□□□□ -1.85
CPR4	YCR069W	MRPL49	P40858	161 aa	Predicted RBP	3.49	□□□□□ -1.85
CPR4	YCR069W	WWM1	P43582	211 aa	Known RBP	3.49	□□□□□ -1.85
CPR4	YCR069W	KEG1	P43614	200 aa		3.49	□□□□□ -1.85
CPR4	YCR069W	HIT1	P46973	164 aa		3.49	□□□□□ -1.85
CPR4	YCR069W	YGL118C	P53132	145 aa		3.49	□□□□□ -1.85
CPR4	YCR069W	YDR366C	P87287	132 aa		3.49	□□□□□ -1.85
CPR4	YCR069W	YOL160W	Q08321	113 aa		3.49	□□□□□ -1.85
CPR4	YCR069W	MSA1	Q08471	629 aa		3.49	□□□□□ -1.85
CPR4	YCR069W	YBR126W-A	Q8TGU7	68 aa		3.49	□□□□□ -1.85
CPR4	YCR069W	YHR212W-A	P0CX91	67 aa		3.48	□□□□□ -1.85
CPR4	YCR069W	DAD2	P36162	133 aa		3.48	□□□□□ -1.85
CPR4	YCR069W	PRE5	P40302	234 aa	Known RBP	3.48	□□□□□ -1.85
CPR4	YCR069W	FIP1	P45976	327 aa		3.48	□□□□□ -1.85
CPR4	YCR069W	TIM22	Q12328	207 aa		3.48	□□□□□ -1.85
CPR4	YCR069W	VAR1	P02381	398 aa		3.47	□□□□□ -1.85
CPR4	YCR069W	RPL2A	P0CX45	254 aa	Known RBP	3.47	□□□□□ -1.85
CPR4	YCR069W	RPL2B	P0CX46	254 aa	Known RBP	3.47	□□□□□ -1.85
CPR4	YCR069W	YBR013C	P38215	129 aa		3.47	□□□□□ -1.85
CPR4	YCR069W	YHR022C	P38763	256 aa		3.47	□□□□□ -1.85
CPR4	YCR069W	YHR140W	P38842	239 aa		3.47	□□□□□ -1.85
CPR4	YCR069W	KRE9	P39005	276 aa		3.47	□□□□□ -1.85
CPR4	YCR069W	SNU13	P39990	126 aa	Known RBP	3.47	□□□□□ -1.85
CPR4	YCR069W	DIA1	P54005	336 aa		3.47	□□□□□ -1.85
CPR4	YCR069W	YDR274C	P87283	123 aa		3.47	□□□□□ -1.85
CPR4	YCR069W	CYT2	Q00873	224 aa		3.47	□□□□□ -1.85
CPR4	YCR069W	MRPS8	Q03799	155 aa		3.47	□□□□□ -1.85

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