RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000640501.1

PNKP-231, Transcript of polynucleotide kinase 3'-phosphatase, humanhuman

TSL 5

Gene PNKP, Length 151 nt, Biotype non stop decay, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNKP-231ENST00000640501 ATP8A1Q9Y2Q0 1164 aa8.76□□□□□ -1.01
PNKP-231ENST00000640501 PTPN22Q9Y2R2 807 aa8.76□□□□□ -1.01
PNKP-231ENST00000640501 SNX24Q9Y343 169 aa8.76□□□□□ -1.01
PNKP-231ENST00000640501 TCRBV5S1A1TA0A578 114 aa8.75□□□□□ -1.01
PNKP-231ENST00000640501 FAM170AA1A519 330 aa8.75□□□□□ -1.01
PNKP-231ENST00000640501 A8MXQ7 604 aa8.75□□□□□ -1.01
PNKP-231ENST00000640501 KPNA7A9QM74 516 aa8.75□□□□□ -1.01
PNKP-231ENST00000640501 AGPSO00116 658 aa8.75□□□□□ -1.01
PNKP-231ENST00000640501 SEPT4O43236 478 aa8.75□□□□□ -1.01
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PNKP-231ENST00000640501 ZNF143P52747 638 aaPredicted RBP8.75□□□□□ -1.01
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PNKP-231ENST00000640501 PTPN20Q4JDL3 420 aa8.75□□□□□ -1.01
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PNKP-231ENST00000640501 SPOCD1Q6ZMY3 1216 aa8.75□□□□□ -1.01
PNKP-231ENST00000640501 PAXIP1Q6ZW49 1069 aaPredicted RBP8.75□□□□□ -1.01
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PNKP-231ENST00000640501 ROPN1Q9HAT0 212 aaPredicted RBP8.75□□□□□ -1.01
PNKP-231ENST00000640501 PRDM16Q9HAZ2 1276 aa8.75□□□□□ -1.01
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PNKP-231ENST00000640501 FLRT1Q9NZU1 646 aa8.75□□□□□ -1.01
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PNKP-231ENST00000640501 SMIM28A0A1B0GU29 152 aa8.74□□□□□ -1.01
PNKP-231ENST00000640501 TMEM88BA6NKF7 163 aa8.74□□□□□ -1.01
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PNKP-231ENST00000640501 ITGAVP06756 1048 aa8.74□□□□□ -1.01
PNKP-231ENST00000640501 CYBAP13498 195 aa8.74□□□□□ -1.01
PNKP-231ENST00000640501 NR1D1P20393 614 aa8.74□□□□□ -1.01
PNKP-231ENST00000640501 FGFR4P22455 802 aa8.74□□□□□ -1.01
PNKP-231ENST00000640501 SSTR3P32745 418 aaPredicted RBP8.74□□□□□ -1.01
PNKP-231ENST00000640501 RFC1P35251 1148 aaPredicted RBP8.74□□□□□ -1.01
PNKP-231ENST00000640501 ACTN2P35609 894 aa8.74□□□□□ -1.01
PNKP-231ENST00000640501 GNL1P36915 607 aaPredicted RBP8.74□□□□□ -1.01
PNKP-231ENST00000640501 PSMC4P43686 418 aa8.74□□□□□ -1.01
PNKP-231ENST00000640501 RPL21P46778 160 aaKnown RBP8.74□□□□□ -1.01
PNKP-231ENST00000640501 TAS2R40P59535 323 aa8.74□□□□□ -1.01
PNKP-231ENST00000640501 NKX3-2P78367 333 aa8.74□□□□□ -1.01
PNKP-231ENST00000640501 BEX3Q00994 111 aa8.74□□□□□ -1.01
PNKP-231ENST00000640501 SNX1Q13596 522 aa8.74□□□□□ -1.01
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