RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000637511.1

NRXN1-259, Transcript of neurexin 1, human

TSL 5 BASIC

Gene NRXN1, Length 3,651 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NRXN1-259	ENST00000637511	PSMC1	P62191	440 aa	Known RBP	13.73	□□□□□ -0.21
NRXN1-259	ENST00000637511	RIPK1	Q13546	671 aa		13.73	□□□□□ -0.21
NRXN1-259	ENST00000637511	MYBPC2	Q14324	1141 aa		13.73	□□□□□ -0.21
NRXN1-259	ENST00000637511	TAS1R2	Q8TE23	839 aa		13.73	□□□□□ -0.21
NRXN1-259	ENST00000637511	STK33	Q9BYT3	514 aa		13.73	□□□□□ -0.21
NRXN1-259	ENST00000637511	CTNNAL1	Q9UBT7	734 aa		13.73	□□□□□ -0.21
NRXN1-259	ENST00000637511	COG5	Q9UP83	839 aa		13.73	□□□□□ -0.21
NRXN1-259	ENST00000637511	IGKV6D-21	A0A0A0MT36	114 aa		13.72	□□□□□ -0.21
NRXN1-259	ENST00000637511	FOXD2	O60548	495 aa	Predicted RBP	13.72	□□□□□ -0.21
NRXN1-259	ENST00000637511	HAUS5	O94927	633 aa		13.72	□□□□□ -0.21
NRXN1-259	ENST00000637511	PSAP	P07602	524 aa		13.72	□□□□□ -0.21
NRXN1-259	ENST00000637511	FGFR4	P22455	802 aa		13.72	□□□□□ -0.21
NRXN1-259	ENST00000637511	HAL	P42357	657 aa		13.72	□□□□□ -0.21
NRXN1-259	ENST00000637511	PPAT	Q06203	517 aa		13.72	□□□□□ -0.21
NRXN1-259	ENST00000637511	GPR162	Q16538	588 aa		13.72	□□□□□ -0.21
NRXN1-259	ENST00000637511	CCDC110	Q8TBZ0	833 aa		13.72	□□□□□ -0.21
NRXN1-259	ENST00000637511	PPP1R13L	Q8WUF5	828 aa		13.72	□□□□□ -0.21
NRXN1-259	ENST00000637511	SPATA16	Q9BXB7	569 aa		13.72	□□□□□ -0.21
NRXN1-259	ENST00000637511	TCEAL9	Q9UHQ7	104 aa		13.72	□□□□□ -0.21
NRXN1-259	ENST00000637511	SNX24	Q9Y343	169 aa		13.72	□□□□□ -0.21
NRXN1-259	ENST00000637511	CFAP69	A5D8W1	941 aa		13.72	□□□□□ -0.21
NRXN1-259	ENST00000637511	HTR3E	A5X5Y0	456 aa		13.72	□□□□□ -0.21
NRXN1-259	ENST00000637511	TPBGL	P0DKB5	382 aa		13.72	□□□□□ -0.21
NRXN1-259	ENST00000637511	SOX5	P35711	763 aa		13.72	□□□□□ -0.21
NRXN1-259	ENST00000637511	ACOT2	P49753	483 aa		13.72	□□□□□ -0.21
NRXN1-259	ENST00000637511	BIRC3	Q13489	604 aa		13.72	□□□□□ -0.21
NRXN1-259	ENST00000637511	XRRA1	Q6P2D8	792 aa		13.72	□□□□□ -0.21
NRXN1-259	ENST00000637511	LRRC57	Q8N9N7	239 aa		13.72	□□□□□ -0.21
NRXN1-259	ENST00000637511	EPS8L3	Q8TE67	593 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21
NRXN1-259	ENST00000637511	PCDHB18P	Q96TA0	734 aa		13.72	□□□□□ -0.21
NRXN1-259	ENST00000637511	ARHGAP28	Q9P2N2	729 aa		13.72	□□□□□ -0.21
NRXN1-259	ENST00000637511	RNF14	Q9UBS8	474 aa		13.72	□□□□□ -0.21
NRXN1-259	ENST00000637511	EVPL	Q92817	2033 aa		13.72	□□□□□ -0.21
NRXN1-259	ENST00000637511		E7ENQ6	273 aa		13.72	□□□□□ -0.21
NRXN1-259	ENST00000637511	SART1	O43290	800 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21
NRXN1-259	ENST00000637511	DDX5	P17844	614 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21
NRXN1-259	ENST00000637511	NLRP11	P59045	1033 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21
NRXN1-259	ENST00000637511	DMP1	Q13316	513 aa	Predicted RBP	13.72	□□□□□ -0.21
NRXN1-259	ENST00000637511	LRP8	Q14114	963 aa		13.72	□□□□□ -0.21
NRXN1-259	ENST00000637511	EXOC3L1	Q86VI1	746 aa		13.72	□□□□□ -0.21
NRXN1-259	ENST00000637511	ERO1B	Q86YB8	467 aa		13.72	□□□□□ -0.21
NRXN1-259	ENST00000637511	SLC43A3	Q8NBI5	491 aa		13.72	□□□□□ -0.21
NRXN1-259	ENST00000637511	FAM13C	Q8NE31	585 aa		13.72	□□□□□ -0.21
NRXN1-259	ENST00000637511	CHST13	Q8NET6	341 aa		13.72	□□□□□ -0.21
NRXN1-259	ENST00000637511	TRAPPC9	Q96Q05	1148 aa		13.72	□□□□□ -0.21
NRXN1-259	ENST00000637511	PITPNM3	Q9BZ71	974 aa		13.72	□□□□□ -0.21
NRXN1-259	ENST00000637511	ZNF408	Q9H9D4	720 aa		13.72	□□□□□ -0.21
NRXN1-259	ENST00000637511	HEMK1	Q9Y5R4	338 aa	Predicted RBP	13.72	□□□□□ -0.21
NRXN1-259	ENST00000637511	TTI1	O43156	1089 aa		13.71	□□□□□ -0.21
NRXN1-259	ENST00000637511	GSTA2	P09210	222 aa		13.71	□□□□□ -0.21
NRXN1-259	ENST00000637511	ICAM3	P32942	547 aa		13.71	□□□□□ -0.21
NRXN1-259	ENST00000637511	ERVK-9	P63128	1117 aa		13.71	□□□□□ -0.21
NRXN1-259	ENST00000637511	EMC2	Q15006	297 aa		13.71	□□□□□ -0.21
NRXN1-259	ENST00000637511	SLC47A2	Q86VL8	602 aa		13.71	□□□□□ -0.21
NRXN1-259	ENST00000637511	TREML1	Q86YW5	311 aa		13.71	□□□□□ -0.21
NRXN1-259	ENST00000637511	SLC15A3	Q8IY34	581 aa		13.71	□□□□□ -0.21
NRXN1-259	ENST00000637511	FAM213A	Q9BRX8	229 aa		13.71	□□□□□ -0.21
NRXN1-259	ENST00000637511	TMEM206	Q9H813	350 aa		13.71	□□□□□ -0.21
NRXN1-259	ENST00000637511	SLC12A6	Q9UHW9	1150 aa		13.71	□□□□□ -0.21
NRXN1-259	ENST00000637511	KCNH4	Q9UQ05	1017 aa		13.71	□□□□□ -0.21
NRXN1-259	ENST00000637511	ASB3	Q9Y575	518 aa		13.71	□□□□□ -0.21
NRXN1-259	ENST00000637511	MYPN	Q86TC9	1320 aa		13.71	□□□□□ -0.21
NRXN1-259	ENST00000637511	DOCK3	Q8IZD9	2030 aa		13.71	□□□□□ -0.21
NRXN1-259	ENST00000637511	SGPL1	O95470	568 aa		13.71	□□□□□ -0.21
NRXN1-259	ENST00000637511	ABCB4	P21439	1286 aa		13.71	□□□□□ -0.21
NRXN1-259	ENST00000637511	TCF7	P36402	384 aa	Predicted RBP	13.71	□□□□□ -0.21
NRXN1-259	ENST00000637511	THOC5	Q13769	683 aa	Known RBP	13.71	□□□□□ -0.21
NRXN1-259	ENST00000637511	LBR	Q14739	615 aa	Known RBP	13.71	□□□□□ -0.21
NRXN1-259	ENST00000637511	KHDC1	Q4VXA5	237 aa	Known RBP	13.71	□□□□□ -0.21
NRXN1-259	ENST00000637511	FAM117B	Q6P1L5	589 aa		13.71	□□□□□ -0.21
NRXN1-259	ENST00000637511	ANKRD13A	Q8IZ07	590 aa		13.71	□□□□□ -0.21
NRXN1-259	ENST00000637511	NME8	Q8N427	588 aa		13.71	□□□□□ -0.21
NRXN1-259	ENST00000637511	DEPTOR	Q8TB45	409 aa		13.71	□□□□□ -0.21
NRXN1-259	ENST00000637511	TMEM174	Q8WUU8	243 aa		13.71	□□□□□ -0.21
NRXN1-259	ENST00000637511	TGS1	Q96RS0	853 aa	Known RBP	13.71	□□□□□ -0.21
NRXN1-259	ENST00000637511	CCT7	Q99832	543 aa		13.71	□□□□□ -0.21
NRXN1-259	ENST00000637511	DHX33	Q9H6R0	707 aa	Known RBP	13.71	□□□□□ -0.21
NRXN1-259	ENST00000637511	ZNF302	Q9NR11	478 aa		13.71	□□□□□ -0.21
NRXN1-259	ENST00000637511	USP1	O94782	785 aa		13.71	□□□□□ -0.22
NRXN1-259	ENST00000637511	GGPS1	O95749	300 aa		13.71	□□□□□ -0.22
NRXN1-259	ENST00000637511	DLAT	P10515	647 aa	Known RBP	13.71	□□□□□ -0.22
NRXN1-259	ENST00000637511	GALC	P54803	685 aa		13.71	□□□□□ -0.22
NRXN1-259	ENST00000637511	LIN52	Q52LA3	116 aa		13.71	□□□□□ -0.22
NRXN1-259	ENST00000637511	RFWD3	Q6PCD5	774 aa		13.71	□□□□□ -0.22
NRXN1-259	ENST00000637511	C12orf56	Q8IXR9	622 aa		13.71	□□□□□ -0.22
NRXN1-259	ENST00000637511	GALNT4	Q8N4A0	578 aa		13.71	□□□□□ -0.22
NRXN1-259	ENST00000637511	SERBP1	Q8NC51	408 aa	Known RBP eCLIP	13.71	□□□□□ -0.22
NRXN1-259	ENST00000637511	DNER	Q8NFT8	737 aa		13.71	□□□□□ -0.22
NRXN1-259	ENST00000637511	GIPC3	Q8TF64	312 aa		13.71	□□□□□ -0.22
NRXN1-259	ENST00000637511	PDP2	Q9P2J9	529 aa		13.71	□□□□□ -0.22
NRXN1-259	ENST00000637511	SLC12A4	Q9UP95	1085 aa		13.71	□□□□□ -0.22
NRXN1-259	ENST00000637511	AGTPBP1	Q9UPW5	1226 aa		13.71	□□□□□ -0.22
NRXN1-259	ENST00000637511	DNAJC25-GNG10	A0A024R161	153 aa		13.7	□□□□□ -0.22
NRXN1-259	ENST00000637511	CHRNB2	P17787	502 aa		13.7	□□□□□ -0.22
NRXN1-259	ENST00000637511	IREB2	P48200	963 aa	Known RBP	13.7	□□□□□ -0.22
NRXN1-259	ENST00000637511	NOP14	P78316	857 aa	Known RBP	13.7	□□□□□ -0.22
NRXN1-259	ENST00000637511	TARBP2	Q15633	366 aa	Known RBP	13.7	□□□□□ -0.22
NRXN1-259	ENST00000637511	OR52E8	Q6IFG1	317 aa		13.7	□□□□□ -0.22
NRXN1-259	ENST00000637511	SPOPL	Q6IQ16	392 aa		13.7	□□□□□ -0.22
NRXN1-259	ENST00000637511	CAVIN3	Q969G5	261 aa		13.7	□□□□□ -0.22

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