RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000635397.1

SMARCA2-241, Transcript of SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily a, member 2, humanhuman

TSL 4

Gene SMARCA2, Length 578 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA2-241ENST00000635397 CRTC1Q6UUV9 634 aa6.39□□□□□ -1.39
SMARCA2-241ENST00000635397 TMEM108Q6UXF1 575 aa6.39□□□□□ -1.39
SMARCA2-241ENST00000635397 KCTD20Q7Z5Y7 419 aa6.39□□□□□ -1.39
SMARCA2-241ENST00000635397 CPT1CQ8TCG5 803 aa6.39□□□□□ -1.39
SMARCA2-241ENST00000635397 EDAQ92838 391 aa6.39□□□□□ -1.39
SMARCA2-241ENST00000635397 ADOQ96SZ5 270 aa6.39□□□□□ -1.39
SMARCA2-241ENST00000635397 DEF6Q9H4E7 631 aa6.39□□□□□ -1.39
SMARCA2-241ENST00000635397 CAPN11Q9UMQ6 739 aa6.39□□□□□ -1.39
SMARCA2-241ENST00000635397 ZBTB32Q9Y2Y4 487 aaPredicted RBP6.39□□□□□ -1.39
SMARCA2-241ENST00000635397 CHST2Q9Y4C5 530 aa6.39□□□□□ -1.39
SMARCA2-241ENST00000635397 PCDHGB3Q9Y5G1 929 aa6.39□□□□□ -1.39
SMARCA2-241ENST00000635397 KRTAP23-1A1A580 65 aa6.38□□□□□ -1.39
SMARCA2-241ENST00000635397 AHRRA9YTQ3 701 aa6.38□□□□□ -1.39
SMARCA2-241ENST00000635397 hCG_1984214I3L0E3 225 aa6.38□□□□□ -1.39
SMARCA2-241ENST00000635397 NPC1O15118 1278 aa6.38□□□□□ -1.39
SMARCA2-241ENST00000635397 RRP9O43818 475 aaKnown RBP6.38□□□□□ -1.39
SMARCA2-241ENST00000635397 TLR5O60602 858 aa6.38□□□□□ -1.39
SMARCA2-241ENST00000635397 RASAL1O95294 804 aa6.38□□□□□ -1.39
SMARCA2-241ENST00000635397 FPGSQ05932 587 aa6.38□□□□□ -1.39
SMARCA2-241ENST00000635397 BIRC3Q13489 604 aa6.38□□□□□ -1.39
SMARCA2-241ENST00000635397 SPARCL1Q14515 664 aa6.38□□□□□ -1.39
SMARCA2-241ENST00000635397 USP17L6PQ6QN14 398 aa6.38□□□□□ -1.39
SMARCA2-241ENST00000635397 LDHAL6AQ6ZMR3 332 aa6.38□□□□□ -1.39
SMARCA2-241ENST00000635397 USP49Q70CQ1 688 aa6.38□□□□□ -1.39
SMARCA2-241ENST00000635397 CACNA2D3Q8IZS8 1091 aa6.38□□□□□ -1.39
SMARCA2-241ENST00000635397 Q8NA96 180 aa6.38□□□□□ -1.39
SMARCA2-241ENST00000635397 BPIFB1Q8TDL5 484 aa6.38□□□□□ -1.39
SMARCA2-241ENST00000635397 EVI5LQ96CN4 794 aa6.38□□□□□ -1.39
SMARCA2-241ENST00000635397 NECTIN3Q9NQS3 549 aa6.38□□□□□ -1.39
SMARCA2-241ENST00000635397 DACT1Q9NYF0 836 aa6.38□□□□□ -1.39
SMARCA2-241ENST00000635397 DKK4Q9UBT3 224 aa6.38□□□□□ -1.39
SMARCA2-241ENST00000635397 JAG2Q9Y219 1238 aa6.38□□□□□ -1.39
SMARCA2-241ENST00000635397 MRPS17Q9Y2R5 130 aaKnown RBP6.38□□□□□ -1.39
SMARCA2-241ENST00000635397 TCAF1Q9Y4C2 921 aa6.38□□□□□ -1.39
SMARCA2-241ENST00000635397 CDY1Q9Y6F8 540 aa6.38□□□□□ -1.39
SMARCA2-241ENST00000635397 DGKBQ9Y6T7 804 aa6.38□□□□□ -1.39
SMARCA2-241ENST00000635397 FPGT-TNNI3KV9GXZ4 949 aa6.38□□□□□ -1.39
SMARCA2-241ENST00000635397 PRAMEF33A0A0G2JMD5 474 aa6.37□□□□□ -1.39
SMARCA2-241ENST00000635397 AQP7P3A6NL99 342 aa6.37□□□□□ -1.39
SMARCA2-241ENST00000635397 AQP12BA6NM10 295 aa6.37□□□□□ -1.39
SMARCA2-241ENST00000635397 GRXCR1A8MXD5 290 aa6.37□□□□□ -1.39
SMARCA2-241ENST00000635397 PIP5K1BO14986 540 aa6.37□□□□□ -1.39
SMARCA2-241ENST00000635397 KCNQ3O43525 872 aa6.37□□□□□ -1.39
SMARCA2-241ENST00000635397 RGS10O43665 173 aa6.37□□□□□ -1.39
SMARCA2-241ENST00000635397 PRAMEF10O60809 474 aa6.37□□□□□ -1.39
SMARCA2-241ENST00000635397 PIAS2O75928 621 aa6.37□□□□□ -1.39
SMARCA2-241ENST00000635397 FGAP02671 866 aa6.37□□□□□ -1.39
SMARCA2-241ENST00000635397 PAX3P23760 479 aa6.37□□□□□ -1.39
SMARCA2-241ENST00000635397 ATICP31939 592 aa6.37□□□□□ -1.39
SMARCA2-241ENST00000635397 NDUFV1P49821 464 aa6.37□□□□□ -1.39
SMARCA2-241ENST00000635397 RENBPP51606 427 aa6.37□□□□□ -1.39
SMARCA2-241ENST00000635397 DGKEP52429 567 aa6.37□□□□□ -1.39
SMARCA2-241ENST00000635397 PRKAG1P54619 331 aa6.37□□□□□ -1.39
SMARCA2-241ENST00000635397 DYRK1AQ13627 763 aa6.37□□□□□ -1.39
SMARCA2-241ENST00000635397 KCNAB1Q14722 419 aa6.37□□□□□ -1.39
SMARCA2-241ENST00000635397 ZNF750Q32MQ0 723 aa6.37□□□□□ -1.39
SMARCA2-241ENST00000635397 CD300EQ496F6 205 aaPredicted RBP6.37□□□□□ -1.39
SMARCA2-241ENST00000635397 LRRC55Q6ZSA7 311 aa6.37□□□□□ -1.39
SMARCA2-241ENST00000635397 KIAA0408Q6ZU52 694 aa6.37□□□□□ -1.39
SMARCA2-241ENST00000635397 TMEM132CQ8N3T6 1108 aa6.37□□□□□ -1.39
SMARCA2-241ENST00000635397 ZNF384Q8TF68 577 aa6.37□□□□□ -1.39
SMARCA2-241ENST00000635397 PPP2R3CQ969Q6 453 aa6.37□□□□□ -1.39
SMARCA2-241ENST00000635397 TMEM125Q96AQ2 219 aa6.37□□□□□ -1.39
SMARCA2-241ENST00000635397 RNF31Q96EP0 1072 aa6.37□□□□□ -1.39
SMARCA2-241ENST00000635397 LOXL4Q96JB6 756 aa6.37□□□□□ -1.39
SMARCA2-241ENST00000635397 WWC2-AS2Q96NR7 200 aa6.37□□□□□ -1.39
SMARCA2-241ENST00000635397 PAGR1Q9BTK6 254 aa6.37□□□□□ -1.39
SMARCA2-241ENST00000635397 PTDSS2Q9BVG9 487 aa6.37□□□□□ -1.39
SMARCA2-241ENST00000635397 SLC46A2Q9BY10 475 aa6.37□□□□□ -1.39
SMARCA2-241ENST00000635397 PCDHAC1Q9H158 963 aa6.37□□□□□ -1.39
SMARCA2-241ENST00000635397 FAM83DQ9H4H8 585 aa6.37□□□□□ -1.39
SMARCA2-241ENST00000635397 IGSF9Q9P2J2 1179 aa6.37□□□□□ -1.39
SMARCA2-241ENST00000635397 DNMT3BQ9UBC3 853 aaKnown RBP6.37□□□□□ -1.39
SMARCA2-241ENST00000635397 KCNE5Q9UJ90 142 aa6.37□□□□□ -1.39
SMARCA2-241ENST00000635397 ZMYND8Q9ULU4 1186 aaPredicted RBP6.37□□□□□ -1.39
SMARCA2-241ENST00000635397 NOX1Q9Y5S8 564 aa6.37□□□□□ -1.39
SMARCA2-241ENST00000635397 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa6.36□□□□□ -1.39
SMARCA2-241ENST00000635397 A0A1W2PS29 197 aa6.36□□□□□ -1.39
SMARCA2-241ENST00000635397 F5H697 171 aa6.36□□□□□ -1.39
SMARCA2-241ENST00000635397 SYT5O00445 386 aa6.36□□□□□ -1.39
SMARCA2-241ENST00000635397 CFIP05156 583 aa6.36□□□□□ -1.39
SMARCA2-241ENST00000635397 HLA-DOAP06340 250 aa6.36□□□□□ -1.39
SMARCA2-241ENST00000635397 SERPINF1P36955 418 aa6.36□□□□□ -1.39
SMARCA2-241ENST00000635397 NPTX2P47972 431 aa6.36□□□□□ -1.39
SMARCA2-241ENST00000635397 CCT5P48643 541 aa6.36□□□□□ -1.39
SMARCA2-241ENST00000635397 RPS7P62081 194 aaKnown RBP6.36□□□□□ -1.39
SMARCA2-241ENST00000635397 CXADRP78310 365 aa6.36□□□□□ -1.39
SMARCA2-241ENST00000635397 MYO1EQ12965 1108 aa6.36□□□□□ -1.39
SMARCA2-241ENST00000635397 PTK2BQ14289 1009 aa6.36□□□□□ -1.39
SMARCA2-241ENST00000635397 SPDYE7PQ495Y7 208 aa6.36□□□□□ -1.39
SMARCA2-241ENST00000635397 ARHGAP15Q53QZ3 475 aa6.36□□□□□ -1.39
SMARCA2-241ENST00000635397 RABL3Q5HYI8 236 aa6.36□□□□□ -1.39
SMARCA2-241ENST00000635397 EEF1AKMT2Q5JPI9 291 aaKnown RBP6.36□□□□□ -1.39
SMARCA2-241ENST00000635397 ARHGAP40Q5TG30 622 aa6.36□□□□□ -1.39
SMARCA2-241ENST00000635397 ARL6IP4Q66PJ3 421 aaKnown RBP6.36□□□□□ -1.39
SMARCA2-241ENST00000635397 B3GNTL1Q67FW5 361 aaPredicted RBP6.36□□□□□ -1.39
SMARCA2-241ENST00000635397 ZNF585AQ6P3V2 769 aa6.36□□□□□ -1.39
SMARCA2-241ENST00000635397 TMPRSS9Q7Z410 1059 aa6.36□□□□□ -1.39
SMARCA2-241ENST00000635397 ADGRG5Q8IZF4 528 aa6.36□□□□□ -1.39
SMARCA2-241ENST00000635397 FAM71BQ8TC56 605 aa6.36□□□□□ -1.39
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 79.5 ms