RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000623052.1

C9orf170-201, Transcript of chromosome 9 open reading frame 170, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene C9orf170, Length 3,239 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf170-201ENST00000623052 PHTF1Q9UMS5 762 aa14.05□□□□□ -0.16
C9orf170-201ENST00000623052 OGTO15294 1046 aa14.04□□□□□ -0.16
C9orf170-201ENST00000623052 ERBB2P04626 1255 aa14.04□□□□□ -0.16
C9orf170-201ENST00000623052 PRKCBP05771 671 aa14.04□□□□□ -0.16
C9orf170-201ENST00000623052 SSTR1P30872 391 aa14.04□□□□□ -0.16
C9orf170-201ENST00000623052 RDXP35241 583 aaKnown RBP14.04□□□□□ -0.16
C9orf170-201ENST00000623052 CTCFP49711 727 aaPredicted RBP14.04□□□□□ -0.16
C9orf170-201ENST00000623052 IL9RQ01113 521 aa14.04□□□□□ -0.16
C9orf170-201ENST00000623052 CCDC15Q0P6D6 951 aa14.04□□□□□ -0.16
C9orf170-201ENST00000623052 TFDP1Q14186 410 aa14.04□□□□□ -0.16
C9orf170-201ENST00000623052 RAB6CQ53S08 254 aa14.04□□□□□ -0.16
C9orf170-201ENST00000623052 ZNF276Q8N554 614 aa14.04□□□□□ -0.16
C9orf170-201ENST00000623052 TAB3Q8N5C8 712 aaPredicted RBP14.04□□□□□ -0.16
C9orf170-201ENST00000623052 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa14.04□□□□□ -0.16
C9orf170-201ENST00000623052 DHRS4Q9BTZ2 278 aa14.04□□□□□ -0.16
C9orf170-201ENST00000623052 RAB6CQ9H0N0 254 aa14.04□□□□□ -0.16
C9orf170-201ENST00000623052 C12orf65Q9H3J6 166 aaKnown RBP14.04□□□□□ -0.16
C9orf170-201ENST00000623052 SIX4Q9UIU6 781 aa14.04□□□□□ -0.16
C9orf170-201ENST00000623052 STARD13Q9Y3M8 1113 aa14.04□□□□□ -0.16
C9orf170-201ENST00000623052 MCM3APO60318 1980 aa14.04□□□□□ -0.16
C9orf170-201ENST00000623052 ZSWIM8A7E2V4 1837 aa14.04□□□□□ -0.16
C9orf170-201ENST00000623052 SLC18A1P54219 525 aa14.04□□□□□ -0.16
C9orf170-201ENST00000623052 TFAMQ00059 246 aaKnown RBP14.04□□□□□ -0.16
C9orf170-201ENST00000623052 PDK4Q16654 411 aa14.04□□□□□ -0.16
C9orf170-201ENST00000623052 SGSM1Q2NKQ1 1148 aa14.04□□□□□ -0.16
C9orf170-201ENST00000623052 ZNF699Q32M78 642 aa14.04□□□□□ -0.16
C9orf170-201ENST00000623052 EEF1DP3Q658K8 133 aa14.04□□□□□ -0.16
C9orf170-201ENST00000623052 EEPD1Q7L9B9 569 aa14.04□□□□□ -0.16
C9orf170-201ENST00000623052 POLNQ7Z5Q5 900 aa14.04□□□□□ -0.16
C9orf170-201ENST00000623052 GBP7Q8N8V2 638 aaPredicted RBP14.04□□□□□ -0.16
C9orf170-201ENST00000623052 KLHL29Q96CT2 875 aa14.04□□□□□ -0.16
C9orf170-201ENST00000623052 ZNF518BQ9C0D4 1074 aa14.04□□□□□ -0.16
C9orf170-201ENST00000623052 EBF2Q9HAK2 575 aa14.04□□□□□ -0.16
C9orf170-201ENST00000623052 CYLDQ9NQC7 956 aa14.04□□□□□ -0.16
C9orf170-201ENST00000623052 DDX56Q9NY93 547 aaKnown RBP14.04□□□□□ -0.16
C9orf170-201ENST00000623052 SNCAIPQ9Y6H5 919 aa14.04□□□□□ -0.16
C9orf170-201ENST00000623052 FZD9O00144 591 aa14.03□□□□□ -0.16
C9orf170-201ENST00000623052 IQCF3P0C7M6 154 aa14.03□□□□□ -0.16
C9orf170-201ENST00000623052 PSMA2P25787 234 aa14.03□□□□□ -0.16
C9orf170-201ENST00000623052 RPL22P35268 128 aaKnown RBP14.03□□□□□ -0.16
C9orf170-201ENST00000623052 AP3M2P53677 418 aa14.03□□□□□ -0.16
C9orf170-201ENST00000623052 OSTNP61366 133 aa14.03□□□□□ -0.16
C9orf170-201ENST00000623052 DUOXA2Q1HG44 320 aa14.03□□□□□ -0.16
C9orf170-201ENST00000623052 DEFB132Q7Z7B7 95 aa14.03□□□□□ -0.16
C9orf170-201ENST00000623052 UNC45BQ8IWX7 931 aa14.03□□□□□ -0.16
C9orf170-201ENST00000623052 RNF149Q8NC42 400 aa14.03□□□□□ -0.16
C9orf170-201ENST00000623052 CHST13Q8NET6 341 aa14.03□□□□□ -0.16
C9orf170-201ENST00000623052 TRAPPC12Q8WVT3 735 aa14.03□□□□□ -0.16
C9orf170-201ENST00000623052 FGD4Q96M96 766 aa14.03□□□□□ -0.16
C9orf170-201ENST00000623052 HOXC10Q9NYD6 342 aa14.03□□□□□ -0.16
C9orf170-201ENST00000623052 IGKV6-21A0A0C4DH24 114 aa14.03□□□□□ -0.16
C9orf170-201ENST00000623052 SOCS7O14512 581 aa14.03□□□□□ -0.16
C9orf170-201ENST00000623052 EDF1O60869 148 aaKnown RBP14.03□□□□□ -0.16
C9orf170-201ENST00000623052 UNC5CO95185 931 aa14.03□□□□□ -0.16
C9orf170-201ENST00000623052 RAD23BP54727 409 aa14.03□□□□□ -0.16
C9orf170-201ENST00000623052 CDH8P55286 799 aa14.03□□□□□ -0.16
C9orf170-201ENST00000623052 PRKG1Q13976 671 aa14.03□□□□□ -0.16
C9orf170-201ENST00000623052 HSDL1Q3SXM5 330 aa14.03□□□□□ -0.16
C9orf170-201ENST00000623052 NOL9Q5SY16 702 aaKnown RBP14.03□□□□□ -0.16
C9orf170-201ENST00000623052 LBX2Q6XYB7 198 aa14.03□□□□□ -0.16
C9orf170-201ENST00000623052 XYLT1Q86Y38 959 aa14.03□□□□□ -0.16
C9orf170-201ENST00000623052 CXorf38Q8TB03 319 aa14.03□□□□□ -0.16
C9orf170-201ENST00000623052 C10orf82Q8WW14 230 aa14.03□□□□□ -0.16
C9orf170-201ENST00000623052 MINDY3Q9H8M7 445 aa14.03□□□□□ -0.16
C9orf170-201ENST00000623052 KLHL14Q9P2G3 628 aa14.03□□□□□ -0.16
C9orf170-201ENST00000623052 SIGLEC16A6NMB1 481 aa14.03□□□□□ -0.16
C9orf170-201ENST00000623052 CST8O60676 142 aa14.03□□□□□ -0.16
C9orf170-201ENST00000623052 KDELR1P24390 212 aa14.03□□□□□ -0.16
C9orf170-201ENST00000623052 SLC8A1P32418 973 aa14.03□□□□□ -0.16
C9orf170-201ENST00000623052 NR1H3Q13133 447 aa14.03□□□□□ -0.16
C9orf170-201ENST00000623052 NEDD9Q14511 834 aa14.03□□□□□ -0.16
C9orf170-201ENST00000623052 HIF1AQ16665 826 aa14.03□□□□□ -0.16
C9orf170-201ENST00000623052 SH3D19Q5HYK7 790 aa14.03□□□□□ -0.16
C9orf170-201ENST00000623052 TRNP1Q6NT89 227 aa14.03□□□□□ -0.16
C9orf170-201ENST00000623052 BBS12Q6ZW61 710 aa14.03□□□□□ -0.16
C9orf170-201ENST00000623052 CYP4V2Q6ZWL3 525 aaPredicted RBP14.03□□□□□ -0.16
C9orf170-201ENST00000623052 CENPUQ71F23 418 aa14.03□□□□□ -0.16
C9orf170-201ENST00000623052 IGDCC3Q8IVU1 814 aa14.03□□□□□ -0.16
C9orf170-201ENST00000623052 PEBP4Q96S96 227 aa14.03□□□□□ -0.16
C9orf170-201ENST00000623052 TCHPQ9BT92 498 aa14.03□□□□□ -0.16
C9orf170-201ENST00000623052 METTL5Q9NRN9 209 aaKnown RBP14.03□□□□□ -0.16
C9orf170-201ENST00000623052 GEMIN8Q9NWZ8 242 aaKnown RBP14.03□□□□□ -0.16
C9orf170-201ENST00000623052 PSMC3IPQ9P2W1 217 aaPredicted RBP14.03□□□□□ -0.16
C9orf170-201ENST00000623052 E7ESA3 106 aa14.02□□□□□ -0.16
C9orf170-201ENST00000623052 KRT15P19012 456 aa14.02□□□□□ -0.16
C9orf170-201ENST00000623052 CETN2P41208 172 aa14.02□□□□□ -0.16
C9orf170-201ENST00000623052 TAP1Q03518 808 aa14.02□□□□□ -0.16
C9orf170-201ENST00000623052 RASA2Q15283 850 aa14.02□□□□□ -0.16
C9orf170-201ENST00000623052 MAPK6Q16659 721 aa14.02□□□□□ -0.16
C9orf170-201ENST00000623052 THNSL1Q8IYQ7 743 aa14.02□□□□□ -0.16
C9orf170-201ENST00000623052 AGGF1Q8N302 714 aaeCLIP14.02□□□□□ -0.16
C9orf170-201ENST00000623052 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP14.02□□□□□ -0.16
C9orf170-201ENST00000623052 BCO2Q9BYV7 579 aa14.02□□□□□ -0.16
C9orf170-201ENST00000623052 NRBP2Q9NSY0 501 aa14.02□□□□□ -0.16
C9orf170-201ENST00000623052 EVPLQ92817 2033 aa14.02□□□□□ -0.16
C9orf170-201ENST00000623052 T-ENOLP0DO92 83 aa14.02□□□□□ -0.17
C9orf170-201ENST00000623052 CXCL8P10145 99 aa14.02□□□□□ -0.17
C9orf170-201ENST00000623052 MSH2P43246 934 aa14.02□□□□□ -0.17
C9orf170-201ENST00000623052 EFNA5P52803 228 aa14.02□□□□□ -0.17
C9orf170-201ENST00000623052 YARSP54577 528 aaKnown RBP14.02□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.5 ms