RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000612341.4

SMTN-222, Transcript of smoothelin, human

APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC

Gene SMTN, Length 3,321 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SMTN-222	ENST00000612341	DNAJC3	Q13217	504 aa		13.56	□□□□□ -0.24
SMTN-222	ENST00000612341	STAT4	Q14765	748 aa		13.56	□□□□□ -0.24
SMTN-222	ENST00000612341	CDO1	Q16878	200 aa		13.56	□□□□□ -0.24
SMTN-222	ENST00000612341	CCDC63	Q8NA47	563 aa		13.56	□□□□□ -0.24
SMTN-222	ENST00000612341	LRRN4	Q8WUT4	740 aa		13.56	□□□□□ -0.24
SMTN-222	ENST00000612341	CPB2	Q96IY4	423 aa		13.56	□□□□□ -0.24
SMTN-222	ENST00000612341	CFAP57	Q96MR6	1250 aa		13.56	□□□□□ -0.24
SMTN-222	ENST00000612341	KLF6	Q99612	283 aa	Predicted RBP	13.56	□□□□□ -0.24
SMTN-222	ENST00000612341	XYLT2	Q9H1B5	865 aa		13.56	□□□□□ -0.24
SMTN-222	ENST00000612341	G3BP2	Q9UN86	482 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
SMTN-222	ENST00000612341	GINS2	Q9Y248	185 aa		13.56	□□□□□ -0.24
SMTN-222	ENST00000612341	SSTR1	P30872	391 aa		13.56	□□□□□ -0.24
SMTN-222	ENST00000612341	VCP	P55072	806 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
SMTN-222	ENST00000612341	EFTUD2	Q15029	972 aa	Known RBP eCLIP	13.56	□□□□□ -0.24	1e-17	■■■■■ 48.7
SMTN-222	ENST00000612341	PLCB4	Q15147	1175 aa		13.56	□□□□□ -0.24
SMTN-222	ENST00000612341	ZNF667	Q5HYK9	610 aa		13.56	□□□□□ -0.24
SMTN-222	ENST00000612341	ANKRD22	Q5VYY1	191 aa		13.56	□□□□□ -0.24
SMTN-222	ENST00000612341	MPZL3	Q6UWV2	235 aa		13.56	□□□□□ -0.24
SMTN-222	ENST00000612341	ARHGEF18	Q6ZSZ5	1173 aa		13.56	□□□□□ -0.24
SMTN-222	ENST00000612341	SPATA21	Q7Z572	469 aa		13.56	□□□□□ -0.24
SMTN-222	ENST00000612341	CKAP2	Q8WWK9	683 aa		13.56	□□□□□ -0.24
SMTN-222	ENST00000612341	ASCC2	Q9H1I8	757 aa	Predicted RBP	13.56	□□□□□ -0.24
SMTN-222	ENST00000612341	RPF1	Q9H9Y2	349 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
SMTN-222	ENST00000612341	RNF19A	Q9NV58	838 aa		13.56	□□□□□ -0.24
SMTN-222	ENST00000612341	SSC5D	A1L4H1	1573 aa		13.56	□□□□□ -0.24
SMTN-222	ENST00000612341	WDR91	A4D1P6	747 aa		13.56	□□□□□ -0.24
SMTN-222	ENST00000612341	ZBTB42	B2RXF5	422 aa		13.56	□□□□□ -0.24
SMTN-222	ENST00000612341	GOLGA8R	I6L899	631 aa		13.56	□□□□□ -0.24
SMTN-222	ENST00000612341	LRCH4	O75427	683 aa		13.56	□□□□□ -0.24
SMTN-222	ENST00000612341	SUN1	O94901	812 aa		13.56	□□□□□ -0.24
SMTN-222	ENST00000612341	FOXN2	P32314	431 aa		13.56	□□□□□ -0.24
SMTN-222	ENST00000612341	PIGH	Q14442	188 aa	Predicted RBP	13.56	□□□□□ -0.24
SMTN-222	ENST00000612341	MXD4	Q14582	209 aa	Predicted RBP	13.56	□□□□□ -0.24
SMTN-222	ENST00000612341	ITIH4	Q14624	930 aa		13.56	□□□□□ -0.24
SMTN-222	ENST00000612341	LACTB2	Q53H82	288 aa	Predicted RBP	13.56	□□□□□ -0.24
SMTN-222	ENST00000612341	RAB6C	Q53S08	254 aa		13.56	□□□□□ -0.24
SMTN-222	ENST00000612341	SH3PXD2A	Q5TCZ1	1133 aa		13.56	□□□□□ -0.24
SMTN-222	ENST00000612341	RFX6	Q8HWS3	928 aa		13.56	□□□□□ -0.24
SMTN-222	ENST00000612341	ARFGAP1	Q8N6T3	406 aa		13.56	□□□□□ -0.24
SMTN-222	ENST00000612341	UBR7	Q8N806	425 aa		13.56	□□□□□ -0.24
SMTN-222	ENST00000612341	KCTD6	Q8NC69	237 aa		13.56	□□□□□ -0.24
SMTN-222	ENST00000612341	PPP1R13L	Q8WUF5	828 aa		13.56	□□□□□ -0.24
SMTN-222	ENST00000612341	RAB6C	Q9H0N0	254 aa		13.56	□□□□□ -0.24
SMTN-222	ENST00000612341	TRIM33	Q9UPN9	1127 aa		13.56	□□□□□ -0.24
SMTN-222	ENST00000612341	ARID2	Q68CP9	1835 aa		13.55	□□□□□ -0.24
SMTN-222	ENST00000612341		A0A1W2PPM1	405 aa		13.55	□□□□□ -0.24
SMTN-222	ENST00000612341	TXN	P10599	105 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
SMTN-222	ENST00000612341	PEX19	P40855	299 aa		13.55	□□□□□ -0.24
SMTN-222	ENST00000612341	CTCF	P49711	727 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
SMTN-222	ENST00000612341	MCL1	Q07820	350 aa		13.55	□□□□□ -0.24
SMTN-222	ENST00000612341	SNCB	Q16143	134 aa		13.55	□□□□□ -0.24
SMTN-222	ENST00000612341	ZC3H18	Q86VM9	953 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
SMTN-222	ENST00000612341	RSAD2	Q8WXG1	361 aa		13.55	□□□□□ -0.24
SMTN-222	ENST00000612341	RMDN2	Q96LZ7	410 aa		13.55	□□□□□ -0.24
SMTN-222	ENST00000612341	PITPNM3	Q9BZ71	974 aa		13.55	□□□□□ -0.24
SMTN-222	ENST00000612341	SDCBP2	Q9H190	292 aa		13.55	□□□□□ -0.24
SMTN-222	ENST00000612341	CDT1	Q9H211	546 aa		13.55	□□□□□ -0.24
SMTN-222	ENST00000612341	C12orf65	Q9H3J6	166 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
SMTN-222	ENST00000612341	RNPEP	Q9H4A4	650 aa		13.55	□□□□□ -0.24
SMTN-222	ENST00000612341	CCDC134	Q9H6E4	229 aa		13.55	□□□□□ -0.24
SMTN-222	ENST00000612341	SLCO1B3	Q9NPD5	702 aa		13.55	□□□□□ -0.24
SMTN-222	ENST00000612341	MCM8	Q9UJA3	840 aa		13.55	□□□□□ -0.24
SMTN-222	ENST00000612341	STK38L	Q9Y2H1	464 aa		13.55	□□□□□ -0.24
SMTN-222	ENST00000612341	DOCK1	Q14185	1865 aa		13.55	□□□□□ -0.24
SMTN-222	ENST00000612341	GPR25	O00155	361 aa		13.55	□□□□□ -0.24
SMTN-222	ENST00000612341	LSM8	O95777	96 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
SMTN-222	ENST00000612341	RDX	P35241	583 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
SMTN-222	ENST00000612341	WDR4	P57081	412 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
SMTN-222	ENST00000612341	KCNJ2	P63252	427 aa		13.55	□□□□□ -0.24
SMTN-222	ENST00000612341	BASP1	P80723	227 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
SMTN-222	ENST00000612341	BBS9	Q3SYG4	887 aa		13.55	□□□□□ -0.24
SMTN-222	ENST00000612341	FAM71D	Q8N9W8	422 aa		13.55	□□□□□ -0.24
SMTN-222	ENST00000612341	HEXIM2	Q96MH2	286 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
SMTN-222	ENST00000612341	FAM210A	Q96ND0	272 aa		13.55	□□□□□ -0.24
SMTN-222	ENST00000612341	TRABD	Q9H4I3	376 aa		13.55	□□□□□ -0.24
SMTN-222	ENST00000612341	EPB41L3	Q9Y2J2	1087 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
SMTN-222	ENST00000612341	DNAH12	Q6ZR08	3092 aa		13.55	□□□□□ -0.24
SMTN-222	ENST00000612341	TCRBV5S1A1T	A0A578	114 aa		13.54	□□□□□ -0.24
SMTN-222	ENST00000612341		M0QYV0	167 aa		13.54	□□□□□ -0.24
SMTN-222	ENST00000612341	ABLIM1	O14639	778 aa		13.54	□□□□□ -0.24
SMTN-222	ENST00000612341	ERBB2	P04626	1255 aa		13.54	□□□□□ -0.24
SMTN-222	ENST00000612341	CA4	P22748	312 aa		13.54	□□□□□ -0.24
SMTN-222	ENST00000612341	EIF4B	P23588	611 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
SMTN-222	ENST00000612341	MMRN1	Q13201	1228 aa		13.54	□□□□□ -0.24
SMTN-222	ENST00000612341	TFDP1	Q14186	410 aa		13.54	□□□□□ -0.24
SMTN-222	ENST00000612341	TRIM74	Q86UV6	250 aa		13.54	□□□□□ -0.24
SMTN-222	ENST00000612341	TRIM73	Q86UV7	250 aa		13.54	□□□□□ -0.24
SMTN-222	ENST00000612341	C1orf127	Q8N9H9	656 aa		13.54	□□□□□ -0.24
SMTN-222	ENST00000612341	TCRBV7S3A2	A0A539	114 aa		13.54	□□□□□ -0.24
SMTN-222	ENST00000612341	FAM47DP	A6NHR8	397 aa		13.54	□□□□□ -0.24
SMTN-222	ENST00000612341	LACTBL1	A8MY62	500 aa		13.54	□□□□□ -0.24
SMTN-222	ENST00000612341	VTN	P04004	478 aa		13.54	□□□□□ -0.24
SMTN-222	ENST00000612341	FAM163B	P0C2L3	166 aa		13.54	□□□□□ -0.24
SMTN-222	ENST00000612341	EDNRB	P24530	442 aa		13.54	□□□□□ -0.24
SMTN-222	ENST00000612341	GCA	P28676	217 aa		13.54	□□□□□ -0.24
SMTN-222	ENST00000612341	AP3M2	P53677	418 aa		13.54	□□□□□ -0.24
SMTN-222	ENST00000612341	OASL	Q15646	514 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
SMTN-222	ENST00000612341	MSS51	Q4VC12	460 aa		13.54	□□□□□ -0.24
SMTN-222	ENST00000612341	CELF3	Q5SZQ8	465 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
SMTN-222	ENST00000612341	JADE1	Q6IE81	842 aa		13.54	□□□□□ -0.24

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