RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000605910.1

TRAM2-AS1-202, Transcript of TRAM2 antisense RNA 1 (head to head), humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene TRAM2-AS1, Length 1,053 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 ATF2P15336 505 aa9.8□□□□□ -0.84
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 PCSK1P29120 753 aa9.8□□□□□ -0.84
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 GCLMP48507 274 aa9.8□□□□□ -0.84
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 MXI1P50539 228 aa9.8□□□□□ -0.84
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 MYL6P60660 151 aa9.8□□□□□ -0.84
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 TSPY1Q01534 308 aa9.8□□□□□ -0.84
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 PTK2Q05397 1052 aa9.8□□□□□ -0.84
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 PPP3CAQ08209 521 aa9.8□□□□□ -0.84
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 MAPRE1Q15691 268 aaKnown RBP9.8□□□□□ -0.84
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 LEXMQ3ZCV2 418 aa9.8□□□□□ -0.84
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 C1orf220Q5T0J3 134 aa9.8□□□□□ -0.84
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 PTCRAQ6ISU1 281 aaPredicted RBP9.8□□□□□ -0.84
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 CES5AQ6NT32 575 aa9.8□□□□□ -0.84
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 ANKRD54Q6NXT1 300 aa9.8□□□□□ -0.84
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 EP400NLQ6ZTU2 488 aa9.8□□□□□ -0.84
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 LIMS2Q7Z4I7 341 aa9.8□□□□□ -0.84
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 PALB2Q86YC2 1186 aa9.8□□□□□ -0.84
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 CMASQ8NFW8 434 aaPredicted RBP9.8□□□□□ -0.84
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 SLC35C1Q96A29 364 aa9.8□□□□□ -0.84
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 BPIFA3Q9BQP9 254 aa9.8□□□□□ -0.84
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 RHOBTB2Q9BYZ6 727 aa9.8□□□□□ -0.84
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 XYLT2Q9H1B5 865 aa9.8□□□□□ -0.84
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 SFXN1Q9H9B4 322 aa9.8□□□□□ -0.84
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 ZDHHC7Q9NXF8 308 aa9.8□□□□□ -0.84
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 CD207Q9UJ71 328 aa9.8□□□□□ -0.84
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 FBXL5Q9UKA1 691 aa9.8□□□□□ -0.84
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 COQ4Q9Y3A0 265 aa9.8□□□□□ -0.84
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 UTP18Q9Y5J1 556 aaKnown RBP eCLIP9.8□□□□□ -0.84
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 MYO15AQ9UKN7 3530 aa9.79□□□□□ -0.84
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 ANKRD33BA6NCL7 494 aa9.79□□□□□ -0.84
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 CLSTN1O94985 981 aa9.79□□□□□ -0.84
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 PAPLNO95428 1278 aa9.79□□□□□ -0.84
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 VNN1O95497 513 aa9.79□□□□□ -0.84
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 ASS1P00966 412 aaKnown RBP9.79□□□□□ -0.84
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 HLA-DRAP01903 254 aa9.79□□□□□ -0.84
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 AFPP02771 609 aaKnown RBP9.79□□□□□ -0.84
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 HNRNPA1P09651 372 aaKnown RBP eCLIP9.79□□□□□ -0.84
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 CPB1P15086 417 aa9.79□□□□□ -0.84
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 RPL17P18621 184 aaKnown RBP9.79□□□□□ -0.84
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 KCNA5P22460 613 aa9.79□□□□□ -0.84
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 WARSP23381 471 aaKnown RBP9.79□□□□□ -0.84
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 EEF1GP26641 437 aaKnown RBP9.79□□□□□ -0.84
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 HOXA9P31269 272 aa9.79□□□□□ -0.84
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 GTF2F1P35269 517 aaKnown RBP eCLIP9.79□□□□□ -0.84
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 GNL1P36915 607 aaPredicted RBP9.79□□□□□ -0.84
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 LTBRP36941 435 aa9.79□□□□□ -0.84
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 FMO5P49326 533 aa9.79□□□□□ -0.84
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 ROR1Q01973 937 aa9.79□□□□□ -0.84
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 TYRO3Q06418 890 aa9.79□□□□□ -0.84
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 GPR17Q13304 367 aa9.79□□□□□ -0.84
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 LAPTM4AQ15012 233 aa9.79□□□□□ -0.84
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 NFE2Q16621 373 aaPredicted RBP9.79□□□□□ -0.84
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 SOWAHAQ2M3V2 549 aa9.79□□□□□ -0.84
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 LIN9Q5TKA1 542 aa9.79□□□□□ -0.84
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 WSCD1Q658N2 575 aa9.79□□□□□ -0.84
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 LLGL2Q6P1M3 1020 aa9.79□□□□□ -0.84
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 CREBRFQ8IUR6 639 aa9.79□□□□□ -0.84
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 TRIM59Q8IWR1 403 aa9.79□□□□□ -0.84
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 ADGRF2Q8IZF7 708 aa9.79□□□□□ -0.84
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 PDCL2Q8N4E4 241 aa9.79□□□□□ -0.84
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 KREMEN2Q8NCW0 462 aa9.79□□□□□ -0.84
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 ANKRD20A12PQ8NF67 263 aa9.79□□□□□ -0.84
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 GADD45GIP1Q8TAE8 222 aaPredicted RBP9.79□□□□□ -0.84
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 MSLNLQ96KJ4 702 aa9.79□□□□□ -0.84
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 CNOT6LQ96LI5 555 aaKnown RBP9.79□□□□□ -0.84
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 FAM81BQ96LP2 452 aa9.79□□□□□ -0.84
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 RIPOR3Q96MK2 946 aa9.79□□□□□ -0.84
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 NECTIN4Q96NY8 510 aa9.79□□□□□ -0.84
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 ZCWPW1Q9H0M4 648 aa9.79□□□□□ -0.84
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 SNX25Q9H3E2 840 aa9.79□□□□□ -0.84
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 MMRN2Q9H8L6 949 aa9.79□□□□□ -0.84
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 CYP3A43Q9HB55 503 aa9.79□□□□□ -0.84
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 MAN1C1Q9NR34 630 aa9.79□□□□□ -0.84
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 IGSF5Q9NSI5 407 aa9.79□□□□□ -0.84
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 DDX43Q9NXZ2 648 aaKnown RBP9.79□□□□□ -0.84
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 CLEC1BQ9P126 229 aa9.79□□□□□ -0.84
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 KIAA1522Q9P206 1035 aaPredicted RBP9.79□□□□□ -0.84
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 NXF1Q9UBU9 619 aaKnown RBP9.79□□□□□ -0.84
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 AFF4Q9UHB7 1163 aaKnown RBP9.79□□□□□ -0.84
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 FBXW11Q9UKB1 542 aa9.79□□□□□ -0.84
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 CDH9Q9ULB4 789 aa9.79□□□□□ -0.84
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 L1RE1Q9UN81 338 aa9.79□□□□□ -0.84
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 TIMM13Q9Y5L4 95 aaPredicted RBP9.79□□□□□ -0.84
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 ATG2AQ2TAZ0 1938 aa9.79□□□□□ -0.84
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 DCHS1Q96JQ0 3298 aa9.78□□□□□ -0.84
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 WDR27A2RRH5 827 aa9.78□□□□□ -0.84
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 GTPBP10A4D1E9 387 aaKnown RBP9.78□□□□□ -0.84
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 LINC01565O15544 149 aa9.78□□□□□ -0.84
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 GLP2RO95838 553 aa9.78□□□□□ -0.84
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 ABL1P00519 1130 aa9.78□□□□□ -0.84
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 POU2F2P09086 479 aa9.78□□□□□ -0.84
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 EPCAMP16422 314 aa9.78□□□□□ -0.84
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 MTHFRP42898 656 aa9.78□□□□□ -0.84
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 MTIF2P46199 727 aaKnown RBP9.78□□□□□ -0.84
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 TUFMP49411 452 aaKnown RBP9.78□□□□□ -0.84
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 ARPP19P56211 112 aa9.78□□□□□ -0.84
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 YWHAEP62258 255 aaKnown RBP9.78□□□□□ -0.84
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 MYL5Q02045 173 aa9.78□□□□□ -0.84
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 PLD1Q13393 1074 aa9.78□□□□□ -0.84
TRAM2-AS1-202ENST00000605910 SMAD4Q13485 552 aaKnown RBP9.78□□□□□ -0.84
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26 ms