RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000585685.5

APOC4-APOC2-201, Transcript of APOC4-APOC2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

TSL 5

Gene APOC4-APOC2, Length 1,829 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 ZNF286BP0CG31 522 aa17.37■□□□□ 0.37
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APOC4-APOC2-201ENST00000585685 PCGF5Q86SE9 256 aa17.33■□□□□ 0.37
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 CMASQ8NFW8 434 aaPredicted RBP17.33■□□□□ 0.37
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 HEXIM2Q96MH2 286 aaKnown RBP17.33■□□□□ 0.37
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 CFAP57Q96MR6 1250 aa17.33■□□□□ 0.37
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 TMEM121Q9BTD3 319 aa17.33■□□□□ 0.37
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 SAYSD1Q9NPB0 183 aa17.33■□□□□ 0.37
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 ACTL7BQ9Y614 415 aa17.33■□□□□ 0.37
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 TMEM120BA0PK00 339 aa17.33■□□□□ 0.36
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 BTBD19C9JJ37 291 aa17.33■□□□□ 0.36
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 SGK1O00141 431 aa17.33■□□□□ 0.36
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 CST8O60676 142 aa17.33■□□□□ 0.36
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