RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000576932.5

TOM1L1-223, Transcript of target of myb1 like 1 membrane trafficking protein, human

TSL 1 (best)

Gene TOM1L1, Length 1,252 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TOM1L1-223	ENST00000576932	DACH1	Q9UI36	760 aa		10.09	□□□□□ -0.79
TOM1L1-223	ENST00000576932	GDA	Q9Y2T3	454 aa		10.09	□□□□□ -0.79
TOM1L1-223	ENST00000576932	CACNA1E	Q15878	2313 aa		10.08	□□□□□ -0.8
TOM1L1-223	ENST00000576932	TRIP11	Q15643	1979 aa		10.08	□□□□□ -0.8
TOM1L1-223	ENST00000576932	MAST4	O15021	2626 aa		10.08	□□□□□ -0.8
TOM1L1-223	ENST00000576932	MARCH6	O60337	910 aa		10.08	□□□□□ -0.8
TOM1L1-223	ENST00000576932	CCNT1	O60563	726 aa	Known RBP	10.08	□□□□□ -0.8
TOM1L1-223	ENST00000576932	CPB1	P15086	417 aa		10.08	□□□□□ -0.8
TOM1L1-223	ENST00000576932	NAMPT	P43490	491 aa		10.08	□□□□□ -0.8
TOM1L1-223	ENST00000576932	YARS	P54577	528 aa	Known RBP	10.08	□□□□□ -0.8
TOM1L1-223	ENST00000576932	EPHB3	P54753	998 aa		10.08	□□□□□ -0.8
TOM1L1-223	ENST00000576932	SOX4	Q06945	474 aa	Predicted RBP	10.08	□□□□□ -0.8
TOM1L1-223	ENST00000576932	TNK2	Q07912	1038 aa		10.08	□□□□□ -0.8
TOM1L1-223	ENST00000576932	SSRP1	Q08945	709 aa	Known RBP	10.08	□□□□□ -0.8
TOM1L1-223	ENST00000576932	LBR	Q14739	615 aa	Known RBP	10.08	□□□□□ -0.8
TOM1L1-223	ENST00000576932	ARHGAP15	Q53QZ3	475 aa		10.08	□□□□□ -0.8
TOM1L1-223	ENST00000576932	DEFB124	Q8NES8	71 aa		10.08	□□□□□ -0.8
TOM1L1-223	ENST00000576932	PSMG2	Q969U7	264 aa		10.08	□□□□□ -0.8
TOM1L1-223	ENST00000576932	ZFYVE19	Q96K21	471 aa		10.08	□□□□□ -0.8
TOM1L1-223	ENST00000576932	DNAJC25	Q9H1X3	360 aa		10.08	□□□□□ -0.8
TOM1L1-223	ENST00000576932	HSFX1	Q9UBD0	423 aa		10.08	□□□□□ -0.8
TOM1L1-223	ENST00000576932	KLK13	Q9UKR3	277 aa		10.08	□□□□□ -0.8
TOM1L1-223	ENST00000576932	NUB1	Q9Y5A7	615 aa		10.08	□□□□□ -0.8
TOM1L1-223	ENST00000576932	BPTF	Q12830	3046 aa		10.07	□□□□□ -0.8
TOM1L1-223	ENST00000576932	CCDC194	A0A1B0GVG4	234 aa		10.07	□□□□□ -0.8
TOM1L1-223	ENST00000576932	USO1	O60763	962 aa	Known RBP	10.07	□□□□□ -0.8
TOM1L1-223	ENST00000576932	OAZ2	O95190	189 aa		10.07	□□□□□ -0.8
TOM1L1-223	ENST00000576932	KCNE1	P15382	129 aa		10.07	□□□□□ -0.8
TOM1L1-223	ENST00000576932	PDIA3	P30101	505 aa	Known RBP	10.07	□□□□□ -0.8
TOM1L1-223	ENST00000576932	DPP6	P42658	865 aa		10.07	□□□□□ -0.8
TOM1L1-223	ENST00000576932	ALDH1A3	P47895	512 aa		10.07	□□□□□ -0.8
TOM1L1-223	ENST00000576932	EFNA5	P52803	228 aa		10.07	□□□□□ -0.8
TOM1L1-223	ENST00000576932	RUNX3	Q13761	415 aa		10.07	□□□□□ -0.8
TOM1L1-223	ENST00000576932	PPP2R5A	Q15172	486 aa		10.07	□□□□□ -0.8
TOM1L1-223	ENST00000576932	ZNF423	Q2M1K9	1284 aa		10.07	□□□□□ -0.8
TOM1L1-223	ENST00000576932	USP39	Q53GS9	565 aa	Known RBP	10.07	□□□□□ -0.8
TOM1L1-223	ENST00000576932	STXBP5	Q5T5C0	1151 aa		10.07	□□□□□ -0.8
TOM1L1-223	ENST00000576932	EEF1DP3	Q658K8	133 aa		10.07	□□□□□ -0.8
TOM1L1-223	ENST00000576932	KIAA1211L	Q6NV74	962 aa		10.07	□□□□□ -0.8
TOM1L1-223	ENST00000576932	C16orf46	Q6P387	395 aa		10.07	□□□□□ -0.8
TOM1L1-223	ENST00000576932	FOXR1	Q6PIV2	292 aa		10.07	□□□□□ -0.8
TOM1L1-223	ENST00000576932	GAREM2	Q75VX8	874 aa		10.07	□□□□□ -0.8
TOM1L1-223	ENST00000576932	PIP4P1	Q86T03	277 aa		10.07	□□□□□ -0.8
TOM1L1-223	ENST00000576932	ALDH16A1	Q8IZ83	802 aa		10.07	□□□□□ -0.8
TOM1L1-223	ENST00000576932	CCDC26	Q8TAB7	109 aa		10.07	□□□□□ -0.8
TOM1L1-223	ENST00000576932	TTC8	Q8TAM2	541 aa		10.07	□□□□□ -0.8
TOM1L1-223	ENST00000576932	KCNB2	Q92953	911 aa		10.07	□□□□□ -0.8
TOM1L1-223	ENST00000576932	HHIP	Q96QV1	700 aa		10.07	□□□□□ -0.8
TOM1L1-223	ENST00000576932	FAM83C	Q9BQN1	747 aa		10.07	□□□□□ -0.8
TOM1L1-223	ENST00000576932	CCDC94	Q9BW85	323 aa	Predicted RBP	10.07	□□□□□ -0.8
TOM1L1-223	ENST00000576932	PHACTR1	Q9C0D0	580 aa		10.07	□□□□□ -0.8
TOM1L1-223	ENST00000576932	TASP1	Q9H6P5	420 aa		10.07	□□□□□ -0.8
TOM1L1-223	ENST00000576932	GPRC5C	Q9NQ84	441 aa		10.07	□□□□□ -0.8
TOM1L1-223	ENST00000576932	PCDHA12	Q9UN75	941 aa		10.07	□□□□□ -0.8
TOM1L1-223	ENST00000576932	TNFSF13B	Q9Y275	285 aa		10.07	□□□□□ -0.8
TOM1L1-223	ENST00000576932	ACACA	Q13085	2346 aa		10.07	□□□□□ -0.8
TOM1L1-223	ENST00000576932	ABCA7	Q8IZY2	2146 aa		10.06	□□□□□ -0.8
TOM1L1-223	ENST00000576932	DCLK1	O15075	740 aa		10.06	□□□□□ -0.8
TOM1L1-223	ENST00000576932	MEFV	O15553	781 aa	Predicted RBP	10.06	□□□□□ -0.8
TOM1L1-223	ENST00000576932	PRAMEF12	O95522	483 aa		10.06	□□□□□ -0.8
TOM1L1-223	ENST00000576932	GBP1	P32455	592 aa		10.06	□□□□□ -0.8
TOM1L1-223	ENST00000576932	IRX4	P78413	519 aa		10.06	□□□□□ -0.8
TOM1L1-223	ENST00000576932	PTS	Q03393	145 aa		10.06	□□□□□ -0.8
TOM1L1-223	ENST00000576932	YWHAH	Q04917	246 aa	Predicted RBP	10.06	□□□□□ -0.8
TOM1L1-223	ENST00000576932	SEMA3B	Q13214	749 aa		10.06	□□□□□ -0.8
TOM1L1-223	ENST00000576932	HNRNPD	Q14103	355 aa	Known RBP	10.06	□□□□□ -0.8
TOM1L1-223	ENST00000576932	DMC1	Q14565	340 aa		10.06	□□□□□ -0.8
TOM1L1-223	ENST00000576932	GPR158	Q5T848	1215 aa		10.06	□□□□□ -0.8
TOM1L1-223	ENST00000576932	ATF7IP2	Q5U623	682 aa		10.06	□□□□□ -0.8
TOM1L1-223	ENST00000576932	FIGNL1	Q6PIW4	674 aa		10.06	□□□□□ -0.8
TOM1L1-223	ENST00000576932	BLOC1S2	Q6QNY1	142 aa		10.06	□□□□□ -0.8
TOM1L1-223	ENST00000576932	ITIH5	Q86UX2	942 aa		10.06	□□□□□ -0.8
TOM1L1-223	ENST00000576932	RASSF3	Q86WH2	238 aa		10.06	□□□□□ -0.8
TOM1L1-223	ENST00000576932	DEPTOR	Q8TB45	409 aa		10.06	□□□□□ -0.8
TOM1L1-223	ENST00000576932	CHFR	Q96EP1	664 aa		10.06	□□□□□ -0.8
TOM1L1-223	ENST00000576932	NUSAP1	Q9BXS6	441 aa	Known RBP	10.06	□□□□□ -0.8
TOM1L1-223	ENST00000576932	ATXN3L	Q9H3M9	355 aa		10.06	□□□□□ -0.8
TOM1L1-223	ENST00000576932	CACNA2D2	Q9NY47	1150 aa		10.06	□□□□□ -0.8
TOM1L1-223	ENST00000576932	CNTN3	Q9P232	1028 aa		10.06	□□□□□ -0.8
TOM1L1-223	ENST00000576932	EGFL7	Q9UHF1	273 aa		10.06	□□□□□ -0.8
TOM1L1-223	ENST00000576932	GTF3C5	Q9Y5Q8	519 aa	Predicted RBP	10.06	□□□□□ -0.8
TOM1L1-223	ENST00000576932	CELSR3	Q9NYQ7	3312 aa		10.05	□□□□□ -0.8
TOM1L1-223	ENST00000576932	ATG2B	Q96BY7	2078 aa		10.05	□□□□□ -0.8
TOM1L1-223	ENST00000576932	OR6C75	A6NL08	312 aa		10.05	□□□□□ -0.8
TOM1L1-223	ENST00000576932		M0QZQ0	153 aa		10.05	□□□□□ -0.8
TOM1L1-223	ENST00000576932	VNN2	O95498	520 aa		10.05	□□□□□ -0.8
TOM1L1-223	ENST00000576932	EGF	P01133	1207 aa		10.05	□□□□□ -0.8
TOM1L1-223	ENST00000576932	EDN1	P05305	212 aa		10.05	□□□□□ -0.8
TOM1L1-223	ENST00000576932	ATP2B1	P20020	1258 aa		10.05	□□□□□ -0.8
TOM1L1-223	ENST00000576932	GABRR2	P28476	465 aa		10.05	□□□□□ -0.8
TOM1L1-223	ENST00000576932	CDC25C	P30307	473 aa		10.05	□□□□□ -0.8
TOM1L1-223	ENST00000576932	MCM4	P33991	863 aa		10.05	□□□□□ -0.8
TOM1L1-223	ENST00000576932	SIM1	P81133	766 aa	Predicted RBP	10.05	□□□□□ -0.8
TOM1L1-223	ENST00000576932	GPR17	Q13304	367 aa		10.05	□□□□□ -0.8
TOM1L1-223	ENST00000576932	UAP1L1	Q3KQV9	507 aa		10.05	□□□□□ -0.8
TOM1L1-223	ENST00000576932	SPDYC	Q5MJ68	293 aa		10.05	□□□□□ -0.8
TOM1L1-223	ENST00000576932	RIPOR1	Q6ZS17	1223 aa		10.05	□□□□□ -0.8
TOM1L1-223	ENST00000576932	RAB44	Q7Z6P3	723 aa	Predicted RBP	10.05	□□□□□ -0.8
TOM1L1-223	ENST00000576932	DNAJB7	Q7Z6W7	309 aa	Predicted RBP	10.05	□□□□□ -0.8
TOM1L1-223	ENST00000576932	GLIS3	Q8NEA6	775 aa		10.05	□□□□□ -0.8

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