RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560957.1

AKAP13-223, Transcript of A-kinase anchoring protein 13, human

TSL 3

Gene AKAP13, Length 751 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
AKAP13-223	ENST00000560957	FAM193A	P78312	1265 aa		3.32	□□□□□ -1.88
AKAP13-223	ENST00000560957	GPSM2	P81274	684 aa		3.32	□□□□□ -1.88
AKAP13-223	ENST00000560957	MGAT2	Q10469	447 aa		3.32	□□□□□ -1.88
AKAP13-223	ENST00000560957	SLC10A2	Q12908	348 aa	Predicted RBP	3.32	□□□□□ -1.88
AKAP13-223	ENST00000560957	MALL	Q13021	153 aa		3.32	□□□□□ -1.88
AKAP13-223	ENST00000560957	PCBP2	Q15366	365 aa	Known RBP eCLIP	3.32	□□□□□ -1.88
AKAP13-223	ENST00000560957	ETFDH	Q16134	617 aa		3.32	□□□□□ -1.88
AKAP13-223	ENST00000560957	MUM1L1	Q5H9M0	696 aa		3.32	□□□□□ -1.88
AKAP13-223	ENST00000560957	TOR2A	Q5JU69	321 aa		3.32	□□□□□ -1.88
AKAP13-223	ENST00000560957	ATAT1	Q5SQI0	421 aa		3.32	□□□□□ -1.88
AKAP13-223	ENST00000560957	GJC2	Q5T442	439 aa	Predicted RBP	3.32	□□□□□ -1.88
AKAP13-223	ENST00000560957	FCRLB	Q6BAA4	426 aa		3.32	□□□□□ -1.88
AKAP13-223	ENST00000560957	AWAT2	Q6E213	333 aa		3.32	□□□□□ -1.88
AKAP13-223	ENST00000560957	LDHAL6A	Q6ZMR3	332 aa		3.32	□□□□□ -1.88
AKAP13-223	ENST00000560957	SUGP1	Q8IWZ8	645 aa	Known RBP	3.32	□□□□□ -1.88
AKAP13-223	ENST00000560957	KRT78	Q8N1N4	520 aa		3.32	□□□□□ -1.88
AKAP13-223	ENST00000560957	OR2I1P	Q8NGU4	316 aa		3.32	□□□□□ -1.88
AKAP13-223	ENST00000560957	POF1B	Q8WVV4	589 aa		3.32	□□□□□ -1.88
AKAP13-223	ENST00000560957	CASKIN2	Q8WXE0	1202 aa		3.32	□□□□□ -1.88
AKAP13-223	ENST00000560957	STON2	Q8WXE9	905 aa		3.32	□□□□□ -1.88
AKAP13-223	ENST00000560957	GCC1	Q96CN9	775 aa		3.32	□□□□□ -1.88
AKAP13-223	ENST00000560957	CCDC138	Q96M89	665 aa		3.32	□□□□□ -1.88
AKAP13-223	ENST00000560957	MYOC	Q99972	504 aa		3.32	□□□□□ -1.88
AKAP13-223	ENST00000560957	ACE2	Q9BYF1	805 aa	Predicted RBP	3.32	□□□□□ -1.88
AKAP13-223	ENST00000560957	WDR12	Q9GZL7	423 aa	Known RBP	3.32	□□□□□ -1.88
AKAP13-223	ENST00000560957	TMEM60	Q9H2L4	133 aa		3.32	□□□□□ -1.88
AKAP13-223	ENST00000560957	LDAH	Q9H6V9	325 aa		3.32	□□□□□ -1.88
AKAP13-223	ENST00000560957	CPNE5	Q9HCH3	593 aa		3.32	□□□□□ -1.88
AKAP13-223	ENST00000560957	LANCL2	Q9NS86	450 aa		3.32	□□□□□ -1.88
AKAP13-223	ENST00000560957	CCM2L	Q9NUG4	571 aa	Predicted RBP	3.32	□□□□□ -1.88
AKAP13-223	ENST00000560957	FBXO34	Q9NWN3	711 aa		3.32	□□□□□ -1.88
AKAP13-223	ENST00000560957	C14orf119	Q9NWQ9	140 aa		3.32	□□□□□ -1.88
AKAP13-223	ENST00000560957	SAGE1	Q9NXZ1	904 aa		3.32	□□□□□ -1.88
AKAP13-223	ENST00000560957	MTMR4	Q9NYA4	1195 aa		3.32	□□□□□ -1.88
AKAP13-223	ENST00000560957	DNM3	Q9UQ16	869 aa		3.32	□□□□□ -1.88
AKAP13-223	ENST00000560957	FAM50B	Q9Y247	325 aa		3.32	□□□□□ -1.88
AKAP13-223	ENST00000560957	TTLL3	Q9Y4R7	772 aa		3.32	□□□□□ -1.88
AKAP13-223	ENST00000560957	LRRFIP2	Q9Y608	721 aa	Known RBP	3.32	□□□□□ -1.88
AKAP13-223	ENST00000560957	AOX1	Q06278	1338 aa		3.32	□□□□□ -1.88
AKAP13-223	ENST00000560957	AATK	Q6ZMQ8	1374 aa		3.31	□□□□□ -1.88
AKAP13-223	ENST00000560957		A0A1W2PRQ8	180 aa		3.31	□□□□□ -1.88
AKAP13-223	ENST00000560957	RASA4B	C9J798	803 aa		3.31	□□□□□ -1.88
AKAP13-223	ENST00000560957	FAM227A	F5H4B4	570 aa		3.31	□□□□□ -1.88
AKAP13-223	ENST00000560957	RASA4	O43374	803 aa		3.31	□□□□□ -1.88
AKAP13-223	ENST00000560957	FIBP	O43427	364 aa		3.31	□□□□□ -1.88
AKAP13-223	ENST00000560957	OFD1	O75665	1012 aa		3.31	□□□□□ -1.88
AKAP13-223	ENST00000560957	IL33	O95760	270 aa		3.31	□□□□□ -1.88
AKAP13-223	ENST00000560957	AMY1A	P04745	511 aa		3.31	□□□□□ -1.88
AKAP13-223	ENST00000560957	RAP2A	P10114	183 aa		3.31	□□□□□ -1.88
AKAP13-223	ENST00000560957	KRT10	P13645	584 aa		3.31	□□□□□ -1.88
AKAP13-223	ENST00000560957	ATP5J	P18859	108 aa		3.31	□□□□□ -1.88
AKAP13-223	ENST00000560957	ATP8B2	P98198	1209 aa		3.31	□□□□□ -1.88
AKAP13-223	ENST00000560957	PPFIA1	Q13136	1202 aa		3.31	□□□□□ -1.88
AKAP13-223	ENST00000560957	IFIT5	Q13325	482 aa	Known RBP	3.31	□□□□□ -1.88
AKAP13-223	ENST00000560957	ODF1	Q14990	250 aa		3.31	□□□□□ -1.88
AKAP13-223	ENST00000560957	UBXN2B	Q14CS0	331 aa		3.31	□□□□□ -1.88
AKAP13-223	ENST00000560957	CDC37	Q16543	378 aa	Predicted RBP	3.31	□□□□□ -1.88
AKAP13-223	ENST00000560957	CYP2A13	Q16696	494 aa		3.31	□□□□□ -1.88
AKAP13-223	ENST00000560957	LONRF1	Q17RB8	773 aa		3.31	□□□□□ -1.88
AKAP13-223	ENST00000560957	WDR45B	Q5MNZ6	344 aa		3.31	□□□□□ -1.88
AKAP13-223	ENST00000560957	MORN5	Q5VZ52	161 aa		3.31	□□□□□ -1.88
AKAP13-223	ENST00000560957	KIAA0895L	Q68EN5	471 aa		3.31	□□□□□ -1.88
AKAP13-223	ENST00000560957	FAM180A	Q6UWF9	173 aa		3.31	□□□□□ -1.88
AKAP13-223	ENST00000560957	C1orf122	Q6ZSJ8	110 aa		3.31	□□□□□ -1.88
AKAP13-223	ENST00000560957	RSRC2	Q7L4I2	434 aa	Known RBP	3.31	□□□□□ -1.88
AKAP13-223	ENST00000560957	ANKRD18A	Q8IVF6	992 aa		3.31	□□□□□ -1.88
AKAP13-223	ENST00000560957	SAMD14	Q8IZD0	417 aa	Predicted RBP	3.31	□□□□□ -1.88
AKAP13-223	ENST00000560957	NKAIN3	Q8N8D7	197 aa		3.31	□□□□□ -1.88
AKAP13-223	ENST00000560957	CCT6B	Q92526	530 aa		3.31	□□□□□ -1.88
AKAP13-223	ENST00000560957	RNF31	Q96EP0	1072 aa		3.31	□□□□□ -1.88
AKAP13-223	ENST00000560957	ZC3H10	Q96K80	434 aa	Known RBP	3.31	□□□□□ -1.88
AKAP13-223	ENST00000560957	UHRF1	Q96T88	793 aa	Predicted RBP	3.31	□□□□□ -1.88
AKAP13-223	ENST00000560957	SEMA4C	Q9C0C4	833 aa		3.31	□□□□□ -1.88
AKAP13-223	ENST00000560957	DDX24	Q9GZR7	859 aa	Known RBP eCLIP	3.31	□□□□□ -1.88
AKAP13-223	ENST00000560957	RNPEP	Q9H4A4	650 aa		3.31	□□□□□ -1.88
AKAP13-223	ENST00000560957	ARFGAP3	Q9NP61	516 aa		3.31	□□□□□ -1.88
AKAP13-223	ENST00000560957	MKS1	Q9NXB0	559 aa		3.31	□□□□□ -1.88
AKAP13-223	ENST00000560957	MOCS1	Q9NZB8	636 aa		3.31	□□□□□ -1.88
AKAP13-223	ENST00000560957	KCNE5	Q9UJ90	142 aa		3.31	□□□□□ -1.88
AKAP13-223	ENST00000560957	AJAP1	Q9UKB5	411 aa	Predicted RBP	3.31	□□□□□ -1.88
AKAP13-223	ENST00000560957	TBC1D30	Q9Y2I9	924 aa		3.31	□□□□□ -1.88
AKAP13-223	ENST00000560957	TMEM98	Q9Y2Y6	226 aa		3.31	□□□□□ -1.88
AKAP13-223	ENST00000560957	DYTN	A2CJ06	578 aa		3.3	□□□□□ -1.88
AKAP13-223	ENST00000560957	CCDC151	A5D8V7	595 aa		3.3	□□□□□ -1.88
AKAP13-223	ENST00000560957	LINC01548	A6NM66	108 aa		3.3	□□□□□ -1.88
AKAP13-223	ENST00000560957	PRSS47	A8MTI9	375 aa		3.3	□□□□□ -1.88
AKAP13-223	ENST00000560957		H3BML4	177 aa		3.3	□□□□□ -1.88
AKAP13-223	ENST00000560957	PCDHGA12	O60330	932 aa		3.3	□□□□□ -1.88
AKAP13-223	ENST00000560957	SNX2	O60749	519 aa		3.3	□□□□□ -1.88
AKAP13-223	ENST00000560957	MT-CO1	P00395	513 aa		3.3	□□□□□ -1.88
AKAP13-223	ENST00000560957	POMC	P01189	267 aa		3.3	□□□□□ -1.88
AKAP13-223	ENST00000560957	RPN1	P04843	607 aa	Known RBP	3.3	□□□□□ -1.88
AKAP13-223	ENST00000560957	OSM	P13725	252 aa		3.3	□□□□□ -1.88
AKAP13-223	ENST00000560957	KEL	P23276	732 aa		3.3	□□□□□ -1.88
AKAP13-223	ENST00000560957	ADK	P55263	362 aa	Known RBP	3.3	□□□□□ -1.88
AKAP13-223	ENST00000560957	PER3	P56645	1201 aa		3.3	□□□□□ -1.88
AKAP13-223	ENST00000560957	HSD11B2	P80365	405 aa		3.3	□□□□□ -1.88
AKAP13-223	ENST00000560957	PRKG2	Q13237	762 aa		3.3	□□□□□ -1.88
AKAP13-223	ENST00000560957	MTM1	Q13496	603 aa		3.3	□□□□□ -1.88
AKAP13-223	ENST00000560957	SEMA5A	Q13591	1074 aa		3.3	□□□□□ -1.88

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