RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000559861.1

USP3-AS1-204, USP3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene USP3-AS1, Length 620 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP3-AS1-204ENST00000559861 AGBL4Q5VU57 503 aa10.06□□□□□ -0.8
USP3-AS1-204ENST00000559861 MFSD5Q6N075 450 aa10.06□□□□□ -0.8
USP3-AS1-204ENST00000559861 REPS2Q8NFH8 660 aa10.06□□□□□ -0.8
USP3-AS1-204ENST00000559861 OR10A2Q9H208 303 aa10.06□□□□□ -0.8
USP3-AS1-204ENST00000559861 PRDM12Q9H4Q4 367 aa10.06□□□□□ -0.8
USP3-AS1-204ENST00000559861 SLC5A4Q9NY91 659 aa10.06□□□□□ -0.8
USP3-AS1-204ENST00000559861 TMPRSS11EQ9UL52 423 aa10.06□□□□□ -0.8
USP3-AS1-204ENST00000559861 NUMBLQ9Y6R0 609 aa10.06□□□□□ -0.8
USP3-AS1-204ENST00000559861 GRXCR1A8MXD5 290 aa10.05□□□□□ -0.8
USP3-AS1-204ENST00000559861 WDR46O15213 610 aaKnown RBP10.05□□□□□ -0.8
USP3-AS1-204ENST00000559861 ADCY6O43306 1168 aa10.05□□□□□ -0.8
USP3-AS1-204ENST00000559861 CNOT4O95628 575 aaKnown RBP10.05□□□□□ -0.8
USP3-AS1-204ENST00000559861 GNAI2P04899 355 aa10.05□□□□□ -0.8
USP3-AS1-204ENST00000559861 CDK11BP21127 795 aaKnown RBP10.05□□□□□ -0.8
USP3-AS1-204ENST00000559861 CDK7P50613 346 aa10.05□□□□□ -0.8
USP3-AS1-204ENST00000559861 RARSP54136 660 aaKnown RBP10.05□□□□□ -0.8
USP3-AS1-204ENST00000559861 PPP2CBP62714 309 aa10.05□□□□□ -0.8
USP3-AS1-204ENST00000559861 PPP2CAP67775 309 aa10.05□□□□□ -0.8
USP3-AS1-204ENST00000559861 PSRC1Q6PGN9 363 aaPredicted RBP10.05□□□□□ -0.8
USP3-AS1-204ENST00000559861 ARHGEF18Q6ZSZ5 1173 aa10.05□□□□□ -0.8
USP3-AS1-204ENST00000559861 MAGEB6Q8N7X4 407 aa10.05□□□□□ -0.8
USP3-AS1-204ENST00000559861 SLC44A5Q8NCS7 719 aa10.05□□□□□ -0.8
USP3-AS1-204ENST00000559861 SSH3Q8TE77 659 aa10.05□□□□□ -0.8
USP3-AS1-204ENST00000559861 COG1Q8WTW3 980 aa10.05□□□□□ -0.8
USP3-AS1-204ENST00000559861 NKD2Q969F2 451 aaPredicted RBP10.05□□□□□ -0.8
USP3-AS1-204ENST00000559861 FAM122AQ96E09 287 aa10.05□□□□□ -0.8
USP3-AS1-204ENST00000559861 POLR3BQ9NW08 1133 aaPredicted RBP10.05□□□□□ -0.8
USP3-AS1-204ENST00000559861 HOXC10Q9NYD6 342 aa10.05□□□□□ -0.8
USP3-AS1-204ENST00000559861 SYNPO2Q9UMS6 1093 aa10.05□□□□□ -0.8
USP3-AS1-204ENST00000559861 TNNQ9UQP3 1299 aa10.05□□□□□ -0.8
USP3-AS1-204ENST00000559861 SCN5AQ14524 2016 aa10.05□□□□□ -0.8
USP3-AS1-204ENST00000559861 MROH7Q68CQ1 1323 aa10.05□□□□□ -0.8
USP3-AS1-204ENST00000559861 LAMTOR5O43504 91 aa10.04□□□□□ -0.8
USP3-AS1-204ENST00000559861 IDH1O75874 414 aaKnown RBP10.04□□□□□ -0.8
USP3-AS1-204ENST00000559861 FLOT1O75955 427 aa10.04□□□□□ -0.8
USP3-AS1-204ENST00000559861 PCDH8O95206 1070 aa10.04□□□□□ -0.8
USP3-AS1-204ENST00000559861 PGK2P07205 417 aa10.04□□□□□ -0.8
USP3-AS1-204ENST00000559861 FCER1AP12319 257 aa10.04□□□□□ -0.8
USP3-AS1-204ENST00000559861 CDKN1CP49918 316 aaPredicted RBP10.04□□□□□ -0.8
USP3-AS1-204ENST00000559861 SESN2P58004 480 aaPredicted RBP10.04□□□□□ -0.8
USP3-AS1-204ENST00000559861 MRPS5P82675 430 aaKnown RBP10.04□□□□□ -0.8
USP3-AS1-204ENST00000559861 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP10.04□□□□□ -0.8
USP3-AS1-204ENST00000559861 PPIGQ13427 754 aaKnown RBP eCLIP10.04□□□□□ -0.8
USP3-AS1-204ENST00000559861 TBR1Q16650 682 aa10.04□□□□□ -0.8
USP3-AS1-204ENST00000559861 ZNF568Q3ZCX4 644 aa10.04□□□□□ -0.8
USP3-AS1-204ENST00000559861 CCDC158Q5M9N0 1113 aa10.04□□□□□ -0.8
USP3-AS1-204ENST00000559861 KLHDC10Q6PID8 442 aa10.04□□□□□ -0.8
USP3-AS1-204ENST00000559861 TMEM179Q6ZVK1 233 aa10.04□□□□□ -0.8
USP3-AS1-204ENST00000559861 MSL3Q8N5Y2 521 aaKnown RBP10.04□□□□□ -0.8
USP3-AS1-204ENST00000559861 PRPF38AQ8NAV1 312 aaKnown RBP10.04□□□□□ -0.8
USP3-AS1-204ENST00000559861 GPATCH3Q96I76 525 aa10.04□□□□□ -0.8
USP3-AS1-204ENST00000559861 ACAP3Q96P50 834 aa10.04□□□□□ -0.8
USP3-AS1-204ENST00000559861 UPF3AQ9H1J1 476 aaKnown RBP10.04□□□□□ -0.8
USP3-AS1-204ENST00000559861 VCPKMTQ9H867 229 aa10.04□□□□□ -0.8
USP3-AS1-204ENST00000559861 STARD7Q9NQZ5 370 aa10.04□□□□□ -0.8
USP3-AS1-204ENST00000559861 TMX2Q9Y320 296 aa10.04□□□□□ -0.8
USP3-AS1-204ENST00000559861 ELP1O95163 1332 aa10.04□□□□□ -0.8
USP3-AS1-204ENST00000559861 USP34Q70CQ2 3546 aa10.03□□□□□ -0.8
USP3-AS1-204ENST00000559861 K7ESF4 209 aa10.03□□□□□ -0.8
USP3-AS1-204ENST00000559861 CTAGE5O15320 804 aa10.03□□□□□ -0.8
USP3-AS1-204ENST00000559861 SLC25A27O95847 323 aa10.03□□□□□ -0.8
USP3-AS1-204ENST00000559861 PLATP00750 562 aa10.03□□□□□ -0.8
USP3-AS1-204ENST00000559861 CLEC2LP0C7M8 214 aa10.03□□□□□ -0.8
USP3-AS1-204ENST00000559861 CSF2RAP15509 400 aa10.03□□□□□ -0.8
USP3-AS1-204ENST00000559861 ICA1Q05084 483 aa10.03□□□□□ -0.8
USP3-AS1-204ENST00000559861 NFYCQ13952 458 aa10.03□□□□□ -0.8
USP3-AS1-204ENST00000559861 FSCN1Q16658 493 aaKnown RBP10.03□□□□□ -0.8
USP3-AS1-204ENST00000559861 RNF151Q2KHN1 245 aa10.03□□□□□ -0.8
USP3-AS1-204ENST00000559861 MAMDC4Q6UXC1 1216 aa10.03□□□□□ -0.8
USP3-AS1-204ENST00000559861 USP30Q70CQ3 517 aa10.03□□□□□ -0.8
USP3-AS1-204ENST00000559861 CDYL2Q8N8U2 506 aa10.03□□□□□ -0.8
USP3-AS1-204ENST00000559861 RSAD2Q8WXG1 361 aa10.03□□□□□ -0.8
USP3-AS1-204ENST00000559861 EAF2Q96CJ1 260 aaPredicted RBP10.03□□□□□ -0.8
USP3-AS1-204ENST00000559861 AHCYL2Q96HN2 611 aaKnown RBP10.03□□□□□ -0.8
USP3-AS1-204ENST00000559861 HIST1H2AHQ96KK5 128 aa10.03□□□□□ -0.8
USP3-AS1-204ENST00000559861 WDR92Q96MX6 357 aa10.03□□□□□ -0.8
USP3-AS1-204ENST00000559861 HIST1H2AJQ99878 128 aa10.03□□□□□ -0.8
USP3-AS1-204ENST00000559861 PUS7LQ9H0K6 701 aaKnown RBP10.03□□□□□ -0.8
USP3-AS1-204ENST00000559861 SEC61A2Q9H9S3 476 aa10.03□□□□□ -0.8
USP3-AS1-204ENST00000559861 FBXO28Q9NVF7 368 aa10.03□□□□□ -0.8
USP3-AS1-204ENST00000559861 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP10.03□□□□□ -0.8
USP3-AS1-204ENST00000559861 CTDP1Q9Y5B0 961 aaPredicted RBP10.03□□□□□ -0.8
USP3-AS1-204ENST00000559861 PCDHB6Q9Y5E3 794 aa10.03□□□□□ -0.8
USP3-AS1-204ENST00000559861 A0A0A6YYK5 440 aaPredicted RBP10.02□□□□□ -0.81
USP3-AS1-204ENST00000559861 H2AFYO75367 372 aaKnown RBP10.02□□□□□ -0.81
USP3-AS1-204ENST00000559861 SNAI1O95863 264 aaPredicted RBP10.02□□□□□ -0.81
USP3-AS1-204ENST00000559861 CD4P01730 458 aa10.02□□□□□ -0.81
USP3-AS1-204ENST00000559861 PLS1Q14651 629 aa10.02□□□□□ -0.81
USP3-AS1-204ENST00000559861 RAB30Q15771 203 aa10.02□□□□□ -0.81
USP3-AS1-204ENST00000559861 PITRM1Q5JRX3 1037 aa10.02□□□□□ -0.81
USP3-AS1-204ENST00000559861 CCDC62Q6P9F0 684 aa10.02□□□□□ -0.81
USP3-AS1-204ENST00000559861 LYSMD2Q8IV50 215 aa10.02□□□□□ -0.81
USP3-AS1-204ENST00000559861 SPICE1Q8N0Z3 855 aa10.02□□□□□ -0.81
USP3-AS1-204ENST00000559861 NUP133Q8WUM0 1156 aa10.02□□□□□ -0.81
USP3-AS1-204ENST00000559861 LMBR1Q8WVP7 490 aa10.02□□□□□ -0.81
USP3-AS1-204ENST00000559861 HERVK_113Q902F9 699 aa10.02□□□□□ -0.81
USP3-AS1-204ENST00000559861 GFM2Q969S9 779 aaKnown RBP10.02□□□□□ -0.81
USP3-AS1-204ENST00000559861 SOX7Q9BT81 388 aa10.02□□□□□ -0.81
USP3-AS1-204ENST00000559861 C1QTNF1Q9BXJ1 281 aa10.02□□□□□ -0.81
USP3-AS1-204ENST00000559861 SCN10AQ9Y5Y9 1956 aa10.02□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.9 ms