RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000556749.1

TTC7B-210, Transcript of tetratricopeptide repeat domain 7B, human

TSL 4

Gene TTC7B, Length 526 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TTC7B-210	ENST00000556749	TISP43	B9A030	160 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TTC7B-210	ENST00000556749	SPECC1L-ADORA2A	F8WAN1	911 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TTC7B-210	ENST00000556749		H0YCG3	227 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TTC7B-210	ENST00000556749	SLC30A4	O14863	429 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TTC7B-210	ENST00000556749	ZNF263	O14978	683 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TTC7B-210	ENST00000556749	SOAT2	O75908	522 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TTC7B-210	ENST00000556749	PRAMEF12	O95522	483 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TTC7B-210	ENST00000556749	F11	P03951	625 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TTC7B-210	ENST00000556749	NEFL	P07196	543 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TTC7B-210	ENST00000556749	RET	P07949	1114 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TTC7B-210	ENST00000556749	HARS	P12081	509 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
TTC7B-210	ENST00000556749	MYL4	P12829	197 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TTC7B-210	ENST00000556749	CPB1	P15086	417 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TTC7B-210	ENST00000556749	SDHB	P21912	280 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TTC7B-210	ENST00000556749	MARCKS	P29966	332 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
TTC7B-210	ENST00000556749	ADSS	P30520	456 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TTC7B-210	ENST00000556749	CXCL12	P48061	93 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TTC7B-210	ENST00000556749	EPHB3	P54753	998 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TTC7B-210	ENST00000556749	NRL	P54845	237 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TTC7B-210	ENST00000556749	GRIN1	Q05586	938 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TTC7B-210	ENST00000556749	STRN3	Q13033	797 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TTC7B-210	ENST00000556749	PLD1	Q13393	1074 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TTC7B-210	ENST00000556749	CSRP2	Q16527	193 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TTC7B-210	ENST00000556749	SCARA3	Q6AZY7	606 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TTC7B-210	ENST00000556749	LAIR1	Q6GTX8	287 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TTC7B-210	ENST00000556749	OVOS1	Q6IE37	1185 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TTC7B-210	ENST00000556749	JADE1	Q6IE81	842 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TTC7B-210	ENST00000556749	C1orf228	Q6PIY5	440 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TTC7B-210	ENST00000556749		Q6ZS52	159 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TTC7B-210	ENST00000556749	LIMS2	Q7Z4I7	341 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TTC7B-210	ENST00000556749	RALGPS2	Q86X27	583 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
TTC7B-210	ENST00000556749	SYNPO	Q8N3V7	929 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TTC7B-210	ENST00000556749	CELF5	Q8N6W0	485 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
TTC7B-210	ENST00000556749	FAM184A	Q8NB25	1140 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TTC7B-210	ENST00000556749	RIN3	Q8TB24	985 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TTC7B-210	ENST00000556749	TMX3	Q96JJ7	454 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TTC7B-210	ENST00000556749	SENP8	Q96LD8	212 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TTC7B-210	ENST00000556749	PGLYRP2	Q96PD5	576 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TTC7B-210	ENST00000556749	PLIN2	Q99541	437 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TTC7B-210	ENST00000556749	PKMYT1	Q99640	499 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TTC7B-210	ENST00000556749	FAM83C	Q9BQN1	747 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TTC7B-210	ENST00000556749	SLC46A2	Q9BY10	475 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TTC7B-210	ENST00000556749	IKZF4	Q9H2S9	585 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TTC7B-210	ENST00000556749	ASB7	Q9H672	318 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TTC7B-210	ENST00000556749	TASP1	Q9H6P5	420 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TTC7B-210	ENST00000556749	C8orf33	Q9H7E9	229 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
TTC7B-210	ENST00000556749	RBM12	Q9NTZ6	932 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
TTC7B-210	ENST00000556749	LARS	Q9P2J5	1176 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
TTC7B-210	ENST00000556749	NCDN	Q9UBB6	729 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TTC7B-210	ENST00000556749	DERA	Q9Y315	318 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TTC7B-210	ENST00000556749	C2CD2	Q9Y426	696 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TTC7B-210	ENST00000556749	CHD6	Q8TD26	2715 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TTC7B-210	ENST00000556749	FRYL	O94915	3013 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TTC7B-210	ENST00000556749	MAP1B	P46821	2468 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
TTC7B-210	ENST00000556749	VWA3A	A6NCI4	1184 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TTC7B-210	ENST00000556749	SLC38A8	A6NNN8	435 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TTC7B-210	ENST00000556749	CHURC1-FNTB	B4DL54	471 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TTC7B-210	ENST00000556749	HNRNPDL	O14979	420 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
TTC7B-210	ENST00000556749	TRAK2	O60296	914 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TTC7B-210	ENST00000556749	TADA3	O75528	432 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TTC7B-210	ENST00000556749	FGF19	O95750	216 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TTC7B-210	ENST00000556749	ADRB1	P08588	477 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TTC7B-210	ENST00000556749	NFIC	P08651	508 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TTC7B-210	ENST00000556749	HAPLN1	P10915	354 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
TTC7B-210	ENST00000556749	CCNE1	P24864	410 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TTC7B-210	ENST00000556749	NMT1	P30419	496 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
TTC7B-210	ENST00000556749	CNR2	P34972	360 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TTC7B-210	ENST00000556749	FNTB	P49356	437 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TTC7B-210	ENST00000556749	TUFM	P49411	452 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
TTC7B-210	ENST00000556749	PPP2R3A	Q06190	1150 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TTC7B-210	ENST00000556749	TNK2	Q07912	1038 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TTC7B-210	ENST00000556749	VAC14	Q08AM6	782 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TTC7B-210	ENST00000556749	SPEM2	Q0P670	501 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TTC7B-210	ENST00000556749	SMARCB1	Q12824	385 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TTC7B-210	ENST00000556749	SRSF5	Q13243	272 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
TTC7B-210	ENST00000556749	GNL2	Q13823	731 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
TTC7B-210	ENST00000556749	PTPA	Q15257	358 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TTC7B-210	ENST00000556749	ARHGAP29	Q52LW3	1261 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TTC7B-210	ENST00000556749	ZC2HC1C	Q53FD0	456 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
TTC7B-210	ENST00000556749	TMEM196	Q5HYL7	178 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TTC7B-210	ENST00000556749	DGKK	Q5KSL6	1271 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TTC7B-210	ENST00000556749	PKN3	Q6P5Z2	889 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TTC7B-210	ENST00000556749	USP49	Q70CQ1	688 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TTC7B-210	ENST00000556749	ZNF720	Q7Z2F6	126 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TTC7B-210	ENST00000556749	LONP2	Q86WA8	852 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TTC7B-210	ENST00000556749	GPBP1	Q86WP2	473 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TTC7B-210	ENST00000556749	CD302	Q8IX05	232 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TTC7B-210	ENST00000556749	EFCAB13	Q8IY85	973 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TTC7B-210	ENST00000556749	ELMOD1	Q8N336	334 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TTC7B-210	ENST00000556749	C2orf15	Q8WU43	125 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
TTC7B-210	ENST00000556749	RAD54L	Q92698	747 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TTC7B-210	ENST00000556749	EZH1	Q92800	747 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
TTC7B-210	ENST00000556749	DNAJC19	Q96DA6	116 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TTC7B-210	ENST00000556749	ZFYVE19	Q96K21	471 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TTC7B-210	ENST00000556749	MYRFL	Q96LU7	910 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TTC7B-210	ENST00000556749	RTKN	Q9BST9	563 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TTC7B-210	ENST00000556749	PARVG	Q9HBI0	331 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TTC7B-210	ENST00000556749	GDPD2	Q9HCC8	539 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TTC7B-210	ENST00000556749	FBRSL1	Q9HCM7	1045 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
TTC7B-210	ENST00000556749	HPS4	Q9NQG7	708 aa		4.89	□□□□□ -1.63

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