RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551525.5

PTPRB-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRB, Length 5,291 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-210ENST00000551525 UBLCP1Q8WVY7 318 aaPredicted RBP6.58□□□□□ -1.36
PTPRB-210ENST00000551525 GMCL1Q96IK5 515 aa6.58□□□□□ -1.36
PTPRB-210ENST00000551525 PPP1R13BQ96KQ4 1090 aa6.58□□□□□ -1.36
PTPRB-210ENST00000551525 NUDCD1Q96RS6 583 aa6.58□□□□□ -1.36
PTPRB-210ENST00000551525 HNRNPABQ99729 332 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
PTPRB-210ENST00000551525 TMEM39BQ9GZU3 492 aa6.58□□□□□ -1.36
PTPRB-210ENST00000551525 ELAC1Q9H777 363 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
PTPRB-210ENST00000551525 EPB41L4AQ9HCS5 686 aaPredicted RBP6.58□□□□□ -1.36
PTPRB-210ENST00000551525 XPNPEP3Q9NQH7 507 aa6.58□□□□□ -1.36
PTPRB-210ENST00000551525 XYLBO75191 536 aa6.58□□□□□ -1.36
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PTPRB-210ENST00000551525 GPC3P51654 580 aa6.58□□□□□ -1.36
PTPRB-210ENST00000551525 CACNA2D1P54289 1103 aa6.58□□□□□ -1.36
PTPRB-210ENST00000551525 CYP4F2P78329 520 aa6.58□□□□□ -1.36
PTPRB-210ENST00000551525 CYP4F3Q08477 520 aa6.58□□□□□ -1.36
PTPRB-210ENST00000551525 C8orf74Q6P047 294 aa6.58□□□□□ -1.36
PTPRB-210ENST00000551525 YTHDF3Q7Z739 585 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
PTPRB-210ENST00000551525 ITIH5Q86UX2 942 aa6.58□□□□□ -1.36
PTPRB-210ENST00000551525 SCUBE1Q8IWY4 988 aa6.58□□□□□ -1.36
PTPRB-210ENST00000551525 ICA1LQ8NDH6 482 aa6.58□□□□□ -1.36
PTPRB-210ENST00000551525 S100PBPQ96BU1 408 aa6.58□□□□□ -1.36
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PTPRB-210ENST00000551525 PUS7LQ9H0K6 701 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
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PTPRB-210ENST00000551525 RAB20Q9NX57 234 aa6.58□□□□□ -1.36
PTPRB-210ENST00000551525 DDX56Q9NY93 547 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
PTPRB-210ENST00000551525 CTNND2Q9UQB3 1225 aa6.58□□□□□ -1.36
PTPRB-210ENST00000551525 GMNCA6NCL1 334 aa6.57□□□□□ -1.36
PTPRB-210ENST00000551525 SPDYE5A6NIY4 337 aa6.57□□□□□ -1.36
PTPRB-210ENST00000551525 NPPAP01160 153 aa6.57□□□□□ -1.36
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PTPRB-210ENST00000551525 MCF2P10911 925 aa6.57□□□□□ -1.36
PTPRB-210ENST00000551525 PRG2P13727 222 aa6.57□□□□□ -1.36
PTPRB-210ENST00000551525 MARK3P27448 753 aa6.57□□□□□ -1.36
PTPRB-210ENST00000551525 PCSK1P29120 753 aa6.57□□□□□ -1.36
PTPRB-210ENST00000551525 ETV5P41161 510 aa6.57□□□□□ -1.36
PTPRB-210ENST00000551525 SERPINB10P48595 397 aa6.57□□□□□ -1.36
PTPRB-210ENST00000551525 USP46P62068 366 aa6.57□□□□□ -1.36
PTPRB-210ENST00000551525 TFAMQ00059 246 aaKnown RBP6.57□□□□□ -1.36
PTPRB-210ENST00000551525 GUCY2DQ02846 1103 aa6.57□□□□□ -1.36
PTPRB-210ENST00000551525 GRIN1Q05586 938 aa6.57□□□□□ -1.36
PTPRB-210ENST00000551525 LGALS3BPQ08380 585 aa6.57□□□□□ -1.36
PTPRB-210ENST00000551525 NFYCQ13952 458 aa6.57□□□□□ -1.36
PTPRB-210ENST00000551525 BAATQ14032 418 aaPredicted RBP6.57□□□□□ -1.36
PTPRB-210ENST00000551525 EMC10Q5UCC4 262 aa6.57□□□□□ -1.36
PTPRB-210ENST00000551525 NOTUMQ6P988 496 aa6.57□□□□□ -1.36
PTPRB-210ENST00000551525 B3GNT6Q6ZMB0 384 aa6.57□□□□□ -1.36
PTPRB-210ENST00000551525 TOGARAM2Q6ZUX3 1019 aa6.57□□□□□ -1.36
PTPRB-210ENST00000551525 ZNF473Q8WTR7 871 aaKnown RBP6.57□□□□□ -1.36
PTPRB-210ENST00000551525 FAM163AQ96GL9 167 aaPredicted RBP6.57□□□□□ -1.36
PTPRB-210ENST00000551525 NSMCE3Q96MG7 304 aa6.57□□□□□ -1.36
PTPRB-210ENST00000551525 FTHL17Q9BXU8 183 aa6.57□□□□□ -1.36
PTPRB-210ENST00000551525 ASCC2Q9H1I8 757 aaPredicted RBP6.57□□□□□ -1.36
PTPRB-210ENST00000551525 ABCB6Q9NP58 842 aa6.57□□□□□ -1.36
PTPRB-210ENST00000551525 THG1LQ9NWX6 298 aaKnown RBP6.57□□□□□ -1.36
PTPRB-210ENST00000551525 CDKN2AIPQ9NXV6 580 aaPredicted RBP6.57□□□□□ -1.36
PTPRB-210ENST00000551525 CPA4Q9UI42 421 aa6.57□□□□□ -1.36
PTPRB-210ENST00000551525 NDUFB9Q9Y6M9 179 aa6.57□□□□□ -1.36
PTPRB-210ENST00000551525 POLR2DO15514 142 aaKnown RBP6.57□□□□□ -1.36
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PTPRB-210ENST00000551525 H2AFXP16104 143 aaPredicted RBP6.57□□□□□ -1.36
PTPRB-210ENST00000551525 ZNF18P17022 549 aa6.57□□□□□ -1.36
PTPRB-210ENST00000551525 PDIA3P30101 505 aaKnown RBP6.57□□□□□ -1.36
PTPRB-210ENST00000551525 DSG3P32926 999 aa6.57□□□□□ -1.36
PTPRB-210ENST00000551525 GJC1P36383 396 aa6.57□□□□□ -1.36
PTPRB-210ENST00000551525 ARL4AP40617 200 aa6.57□□□□□ -1.36
PTPRB-210ENST00000551525 NSFP46459 744 aaKnown RBP6.57□□□□□ -1.36
PTPRB-210ENST00000551525 CSTF3Q12996 717 aaKnown RBP6.57□□□□□ -1.36
PTPRB-210ENST00000551525 KARSQ15046 597 aaKnown RBP6.57□□□□□ -1.36
PTPRB-210ENST00000551525 PABPC1LQ4VXU2 614 aaKnown RBP6.57□□□□□ -1.36
PTPRB-210ENST00000551525 ZC2HC1CQ53FD0 456 aaPredicted RBP6.57□□□□□ -1.36
PTPRB-210ENST00000551525 WLSQ5T9L3 541 aa6.57□□□□□ -1.36
PTPRB-210ENST00000551525 ZNF746Q6NUN9 644 aaPredicted RBP6.57□□□□□ -1.36
PTPRB-210ENST00000551525 ENOSF1Q7L5Y1 443 aa6.57□□□□□ -1.36
PTPRB-210ENST00000551525 GRK7Q8WTQ7 553 aa6.57□□□□□ -1.36
PTPRB-210ENST00000551525 INPP5DQ92835 1189 aa6.57□□□□□ -1.36
PTPRB-210ENST00000551525 C17orf75Q9HAS0 396 aa6.57□□□□□ -1.36
PTPRB-210ENST00000551525 CYP4F12Q9HCS2 524 aa6.57□□□□□ -1.36
PTPRB-210ENST00000551525 CDC23Q9UJX2 597 aa6.57□□□□□ -1.36
PTPRB-210ENST00000551525 PLAAQ9Y263 795 aa6.57□□□□□ -1.36
PTPRB-210ENST00000551525 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa6.57□□□□□ -1.36
PTPRB-210ENST00000551525 C9IYK1 514 aa6.57□□□□□ -1.36
PTPRB-210ENST00000551525 AKR1B15C9JRZ8 316 aaPredicted RBP6.57□□□□□ -1.36
PTPRB-210ENST00000551525 GSTA1P08263 222 aa6.57□□□□□ -1.36
PTPRB-210ENST00000551525 NNTQ13423 1086 aa6.57□□□□□ -1.36
PTPRB-210ENST00000551525 MED21Q13503 144 aa6.57□□□□□ -1.36
PTPRB-210ENST00000551525 IKBKEQ14164 716 aa6.57□□□□□ -1.36
PTPRB-210ENST00000551525 SMU1Q2TAY7 513 aa6.57□□□□□ -1.36
PTPRB-210ENST00000551525 GRAMD1BQ3KR37 738 aa6.57□□□□□ -1.36
PTPRB-210ENST00000551525 TRIM67Q6ZTA4 783 aa6.57□□□□□ -1.36
PTPRB-210ENST00000551525 CCDC28AQ8IWP9 274 aa6.57□□□□□ -1.36
PTPRB-210ENST00000551525 MYCBPAPQ8TBZ2 947 aa6.57□□□□□ -1.36
PTPRB-210ENST00000551525 PGBD1Q96JS3 809 aa6.57□□□□□ -1.36
PTPRB-210ENST00000551525 DEFB118Q96PH6 123 aa6.57□□□□□ -1.36
PTPRB-210ENST00000551525 MRPL47Q9HD33 250 aaKnown RBP6.57□□□□□ -1.36
PTPRB-210ENST00000551525 POLLQ9UGP5 575 aa6.57□□□□□ -1.36
PTPRB-210ENST00000551525 STAP1Q9ULZ2 295 aa6.57□□□□□ -1.36
PTPRB-210ENST00000551525 FMN2Q9NZ56 1722 aa6.57□□□□□ -1.36
PTPRB-210ENST00000551525 RASA4O43374 803 aa6.57□□□□□ -1.36
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