RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000543190.5

LTBR-211, Transcript of lymphotoxin beta receptor, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene LTBR, Length 785 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBR-211ENST00000543190 ZNF507Q8TCN5 953 aa20.02■□□□□ 0.8
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LTBR-211ENST00000543190 CHFRQ96EP1 664 aa20.02■□□□□ 0.8
LTBR-211ENST00000543190 ZFYVE19Q96K21 471 aa20.02■□□□□ 0.8
LTBR-211ENST00000543190 MAGEF1Q9HAY2 307 aa20.02■□□□□ 0.8
LTBR-211ENST00000543190 UBE4BO95155 1302 aa20.02■□□□□ 0.79
LTBR-211ENST00000543190 EPG5Q9HCE0 2579 aa20.01■□□□□ 0.79
LTBR-211ENST00000543190 ZNF233A6NK53 670 aa20.01■□□□□ 0.79
LTBR-211ENST00000543190 SPTLC2O15270 562 aa20.01■□□□□ 0.79
LTBR-211ENST00000543190 PRPF40AO75400 957 aaKnown RBP20.01■□□□□ 0.79
LTBR-211ENST00000543190 TADA3O75528 432 aa20.01■□□□□ 0.79
LTBR-211ENST00000543190 PRPF6O94906 941 aaKnown RBP20.01■□□□□ 0.79
LTBR-211ENST00000543190 TMEM191BP0C7N4 346 aa20.01■□□□□ 0.79
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LTBR-211ENST00000543190 MAPRE1Q15691 268 aaKnown RBP20.01■□□□□ 0.79
LTBR-211ENST00000543190 VSTM1Q6UX27 236 aa20.01■□□□□ 0.79
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LTBR-211ENST00000543190 ADGRF2Q8IZF7 708 aa20.01■□□□□ 0.79
LTBR-211ENST00000543190 MAB21L3Q8N8X9 362 aa20.01■□□□□ 0.79
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LTBR-211ENST00000543190 SPATA17Q96L03 361 aa20.01■□□□□ 0.79
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LTBR-211ENST00000543190 GMEB2Q9UKD1 530 aa20.01■□□□□ 0.79
LTBR-211ENST00000543190 RAB23Q9ULC3 237 aa20.01■□□□□ 0.79
LTBR-211ENST00000543190 SNX9Q9Y5X1 595 aa20.01■□□□□ 0.79
LTBR-211ENST00000543190 CHURC1-FNTBB4DL54 471 aa20■□□□□ 0.79
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LTBR-211ENST00000543190 TNK2Q07912 1038 aa20■□□□□ 0.79
LTBR-211ENST00000543190 PDGFRLQ15198 375 aa20■□□□□ 0.79
LTBR-211ENST00000543190 DUOXA2Q1HG44 320 aa20■□□□□ 0.79
LTBR-211ENST00000543190 OSTM1Q86WC4 334 aa20■□□□□ 0.79
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LTBR-211ENST00000543190 SNX21Q969T3 373 aa20■□□□□ 0.79
LTBR-211ENST00000543190 ZNF396Q96N95 335 aaPredicted RBP20■□□□□ 0.79
LTBR-211ENST00000543190 C7orf25Q9BPX7 421 aa20■□□□□ 0.79
LTBR-211ENST00000543190 PI4K2AQ9BTU6 479 aa20■□□□□ 0.79
LTBR-211ENST00000543190 CGNQ9P2M7 1197 aaKnown RBP20■□□□□ 0.79
LTBR-211ENST00000543190 GTF3C4Q9UKN8 822 aa20■□□□□ 0.79
LTBR-211ENST00000543190 CDH9Q9ULB4 789 aa20■□□□□ 0.79
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LTBR-211ENST00000543190 ATG13O75143 517 aa19.99■□□□□ 0.79
LTBR-211ENST00000543190 STAU1O95793 577 aaKnown RBP19.99■□□□□ 0.79
LTBR-211ENST00000543190 CYP2F1P24903 491 aa19.99■□□□□ 0.79
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LTBR-211ENST00000543190 RSPO4Q2I0M5 234 aaPredicted RBP19.99■□□□□ 0.79
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LTBR-211ENST00000543190 C4orf50Q6ZRC1 276 aa19.99■□□□□ 0.79
LTBR-211ENST00000543190 Q6ZS52 159 aa19.99■□□□□ 0.79
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LTBR-211ENST00000543190 C12orf56Q8IXR9 622 aa19.99■□□□□ 0.79
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LTBR-211ENST00000543190 OTOL1A6NHN0 477 aaPredicted RBP19.98■□□□□ 0.79
LTBR-211ENST00000543190 GOLGA8JA6NMD2 632 aa19.98■□□□□ 0.79
LTBR-211ENST00000543190 TGFB1I1O43294 461 aa19.98■□□□□ 0.79
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LTBR-211ENST00000543190 WARSP23381 471 aaKnown RBP19.98■□□□□ 0.79
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LTBR-211ENST00000543190 ZNF77Q15935 545 aa19.98■□□□□ 0.79
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LTBR-211ENST00000543190 GPR15P49685 360 aa19.97■□□□□ 0.79
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LTBR-211ENST00000543190 GRSF1Q12849 480 aaKnown RBP eCLIP19.97■□□□□ 0.79
LTBR-211ENST00000543190 SNRNP35Q16560 246 aaKnown RBP19.97■□□□□ 0.79
LTBR-211ENST00000543190 DDR2Q16832 855 aa19.97■□□□□ 0.79
LTBR-211ENST00000543190 FAM26FQ5R3K3 315 aa19.97■□□□□ 0.79
LTBR-211ENST00000543190 FSTL4Q6MZW2 842 aa19.97■□□□□ 0.79
LTBR-211ENST00000543190 SHC4Q6S5L8 630 aa19.97■□□□□ 0.79
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