RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000505941.5

SH3BP2-210, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP2, Length 917 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-210ENST00000505941 CAMK4Q16566 473 aa22.49■■□□□ 1.19
SH3BP2-210ENST00000505941 DCAF17Q5H9S7 520 aaPredicted RBP22.49■■□□□ 1.19
SH3BP2-210ENST00000505941 MDH1BQ5I0G3 518 aa22.49■■□□□ 1.19
SH3BP2-210ENST00000505941 SIX5Q8N196 739 aa22.49■■□□□ 1.19
SH3BP2-210ENST00000505941 ZSCAN18Q8TBC5 510 aaPredicted RBP22.49■■□□□ 1.19
SH3BP2-210ENST00000505941 CEP295NLQ96MC4 621 aa22.49■■□□□ 1.19
SH3BP2-210ENST00000505941 ASB16Q96NS5 453 aa22.49■■□□□ 1.19
SH3BP2-210ENST00000505941 GBP4Q96PP9 640 aa22.49■■□□□ 1.19
SH3BP2-210ENST00000505941 RPP25Q9BUL9 199 aaKnown RBP22.49■■□□□ 1.19
SH3BP2-210ENST00000505941 METTL14Q9HCE5 456 aaKnown RBP22.49■■□□□ 1.19
SH3BP2-210ENST00000505941 CRTAC1Q9NQ79 661 aa22.49■■□□□ 1.19
SH3BP2-210ENST00000505941 ARMCX3Q9UH62 379 aaPredicted RBP22.49■■□□□ 1.19
SH3BP2-210ENST00000505941 ATP8B3O60423 1300 aa22.49■■□□□ 1.19
SH3BP2-210ENST00000505941 DPYSL4O14531 572 aa22.48■■□□□ 1.19
SH3BP2-210ENST00000505941 MOSPD3O75425 235 aa22.48■■□□□ 1.19
SH3BP2-210ENST00000505941 ASS1P00966 412 aaKnown RBP22.48■■□□□ 1.19
SH3BP2-210ENST00000505941 BDNFP23560 247 aa22.48■■□□□ 1.19
SH3BP2-210ENST00000505941 CDH8P55286 799 aa22.48■■□□□ 1.19
SH3BP2-210ENST00000505941 PPP3CAQ08209 521 aa22.48■■□□□ 1.19
SH3BP2-210ENST00000505941 WDR44Q5JSH3 913 aa22.48■■□□□ 1.19
SH3BP2-210ENST00000505941 C1orf220Q5T0J3 134 aa22.48■■□□□ 1.19
SH3BP2-210ENST00000505941 GPR158Q5T848 1215 aa22.48■■□□□ 1.19
SH3BP2-210ENST00000505941 TANGO2Q6ICL3 276 aa22.48■■□□□ 1.19
SH3BP2-210ENST00000505941 B3GALNT2Q8NCR0 500 aa22.48■■□□□ 1.19
SH3BP2-210ENST00000505941 FLCNQ8NFG4 579 aa22.48■■□□□ 1.19
SH3BP2-210ENST00000505941 NELFBQ8WX92 580 aa22.48■■□□□ 1.19
SH3BP2-210ENST00000505941 PCED1BQ96HM7 432 aa22.48■■□□□ 1.19
SH3BP2-210ENST00000505941 SHDQ96IW2 340 aa22.48■■□□□ 1.19
SH3BP2-210ENST00000505941 CEP63Q96MT8 703 aa22.48■■□□□ 1.19
SH3BP2-210ENST00000505941 SMYD3Q9H7B4 428 aa22.48■■□□□ 1.19
SH3BP2-210ENST00000505941 ZNF334Q9HCZ1 680 aaPredicted RBP22.48■■□□□ 1.19
SH3BP2-210ENST00000505941 TRIM49BA6NDI0 452 aa22.47■■□□□ 1.19
SH3BP2-210ENST00000505941 TRIM66O15016 1216 aa22.47■■□□□ 1.19
SH3BP2-210ENST00000505941 FGFR1OPO95684 399 aaKnown RBP22.47■■□□□ 1.19
SH3BP2-210ENST00000505941 MXI1P50539 228 aa22.47■■□□□ 1.19
SH3BP2-210ENST00000505941 GPC5P78333 572 aa22.47■■□□□ 1.19
SH3BP2-210ENST00000505941 CCDC40Q4G0X9 1142 aa22.47■■□□□ 1.19
SH3BP2-210ENST00000505941 GAREM2Q75VX8 874 aa22.47■■□□□ 1.19
SH3BP2-210ENST00000505941 FILIP1Q7Z7B0 1213 aa22.47■■□□□ 1.19
SH3BP2-210ENST00000505941 YAF2Q8IY57 180 aa22.47■■□□□ 1.19
SH3BP2-210ENST00000505941 TAS1R2Q8TE23 839 aa22.47■■□□□ 1.19
SH3BP2-210ENST00000505941 MRPS31Q92665 395 aaKnown RBP22.47■■□□□ 1.19
SH3BP2-210ENST00000505941 ZSWIM3Q96MP5 696 aa22.47■■□□□ 1.19
SH3BP2-210ENST00000505941 PRRX2Q99811 253 aa22.47■■□□□ 1.19
SH3BP2-210ENST00000505941 MED10Q9BTT4 135 aa22.47■■□□□ 1.19
SH3BP2-210ENST00000505941 TRMT61BQ9BVS5 477 aaKnown RBP22.47■■□□□ 1.19
SH3BP2-210ENST00000505941 ELOVL4Q9GZR5 314 aa22.47■■□□□ 1.19
SH3BP2-210ENST00000505941 KCNH6Q9H252 994 aa22.47■■□□□ 1.19
SH3BP2-210ENST00000505941 TASP1Q9H6P5 420 aa22.47■■□□□ 1.19
SH3BP2-210ENST00000505941 KIAA1468Q9P260 1216 aa22.47■■□□□ 1.19
SH3BP2-210ENST00000505941 CA14Q9ULX7 337 aa22.47■■□□□ 1.19
SH3BP2-210ENST00000505941 TRIOO75962 3097 aa22.46■■□□□ 1.19
SH3BP2-210ENST00000505941 SLC38A8A6NNN8 435 aa22.46■■□□□ 1.19
SH3BP2-210ENST00000505941 GOLGA6L22H0YM25 854 aa22.46■■□□□ 1.19
SH3BP2-210ENST00000505941 DDX6P26196 483 aaKnown RBP eCLIP22.46■■□□□ 1.19
SH3BP2-210ENST00000505941 RAP1GAPP47736 663 aa22.46■■□□□ 1.19
SH3BP2-210ENST00000505941 GPR15P49685 360 aa22.46■■□□□ 1.19
SH3BP2-210ENST00000505941 PMS1P54277 932 aaKnown RBP22.46■■□□□ 1.19
SH3BP2-210ENST00000505941 NOP14P78316 857 aaKnown RBP22.46■■□□□ 1.19
SH3BP2-210ENST00000505941 SDHAF4Q5VUM1 108 aa22.46■■□□□ 1.19
SH3BP2-210ENST00000505941 UNC93AQ86WB7 457 aa22.46■■□□□ 1.19
SH3BP2-210ENST00000505941 FBXL13Q8NEE6 735 aa22.46■■□□□ 1.19
SH3BP2-210ENST00000505941 DEPDC1BQ8WUY9 529 aa22.46■■□□□ 1.19
SH3BP2-210ENST00000505941 BRD9Q9H8M2 597 aa22.46■■□□□ 1.19
SH3BP2-210ENST00000505941 CYP3A43Q9HB55 503 aa22.46■■□□□ 1.19
SH3BP2-210ENST00000505941 TRPV4Q9HBA0 871 aa22.46■■□□□ 1.19
SH3BP2-210ENST00000505941 UTP3Q9NQZ2 479 aaKnown RBP eCLIP22.46■■□□□ 1.194e-8■■■■■ 128.2
SH3BP2-210ENST00000505941 CTNND2Q9UQB3 1225 aa22.46■■□□□ 1.19
SH3BP2-210ENST00000505941 PPP1R3GB7ZBB8 358 aa22.45■■□□□ 1.18
SH3BP2-210ENST00000505941 PSMC3P17980 439 aa22.45■■□□□ 1.18
SH3BP2-210ENST00000505941 AVPR2P30518 371 aa22.45■■□□□ 1.18
SH3BP2-210ENST00000505941 CLCN5P51795 746 aa22.45■■□□□ 1.18
SH3BP2-210ENST00000505941 MCCD1P59942 119 aaPredicted RBP22.45■■□□□ 1.18
SH3BP2-210ENST00000505941 PAK1Q13153 545 aa22.45■■□□□ 1.18
SH3BP2-210ENST00000505941 ASTLQ6HA08 431 aaPredicted RBP22.45■■□□□ 1.18
SH3BP2-210ENST00000505941 SPOPLQ6IQ16 392 aa22.45■■□□□ 1.18
SH3BP2-210ENST00000505941 FOXR2Q6PJQ5 311 aa22.45■■□□□ 1.18
SH3BP2-210ENST00000505941 FRMD5Q7Z6J6 570 aa22.45■■□□□ 1.18
SH3BP2-210ENST00000505941 ARID3BQ8IVW6 561 aaPredicted RBP22.45■■□□□ 1.18
SH3BP2-210ENST00000505941 ZC3H3Q8IXZ2 948 aaKnown RBP22.45■■□□□ 1.18
SH3BP2-210ENST00000505941 TTC39CQ8N584 583 aa22.45■■□□□ 1.18
SH3BP2-210ENST00000505941 TRMT2BQ96GJ1 504 aaKnown RBP22.45■■□□□ 1.18
SH3BP2-210ENST00000505941 SPATA17Q96L03 361 aa22.45■■□□□ 1.18
SH3BP2-210ENST00000505941 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP22.45■■□□□ 1.18
SH3BP2-210ENST00000505941 DPEP3Q9H4B8 488 aa22.45■■□□□ 1.18
SH3BP2-210ENST00000505941 ARHGEF3Q9NR81 526 aa22.45■■□□□ 1.18
SH3BP2-210ENST00000505941 RAB20Q9NX57 234 aa22.45■■□□□ 1.18
SH3BP2-210ENST00000505941 ARIH1Q9Y4X5 557 aaPredicted RBP22.45■■□□□ 1.18
SH3BP2-210ENST00000505941 SOBPA7XYQ1 873 aa22.44■■□□□ 1.18
SH3BP2-210ENST00000505941 NOL4O94818 638 aa22.44■■□□□ 1.18
SH3BP2-210ENST00000505941 GNA14O95837 355 aa22.44■■□□□ 1.18
SH3BP2-210ENST00000505941 PDGFBP01127 241 aaPredicted RBP22.44■■□□□ 1.18
SH3BP2-210ENST00000505941 CD44P16070 742 aaKnown RBP22.44■■□□□ 1.18
SH3BP2-210ENST00000505941 HMGA1P17096 107 aaKnown RBP22.44■■□□□ 1.18
SH3BP2-210ENST00000505941 AVPR1AP37288 418 aa22.44■■□□□ 1.18
SH3BP2-210ENST00000505941 NLRP12P59046 1061 aa22.44■■□□□ 1.18
SH3BP2-210ENST00000505941 CETN1Q12798 172 aa22.44■■□□□ 1.18
SH3BP2-210ENST00000505941 CCDC142Q17RM4 750 aa22.44■■□□□ 1.18
SH3BP2-210ENST00000505941 CLEC17AQ6ZS10 378 aa22.44■■□□□ 1.18
SH3BP2-210ENST00000505941 MFSD6LQ8IWD5 586 aa22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.4 ms