RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000504927.5

DDR1-255, Transcript of discoidin domain receptor tyrosine kinase 1, humanhuman

TSL 4

Gene DDR1, Length 542 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDR1-255ENST00000504927 LRRC3Q9BY71 257 aa22.03■■□□□ 1.12
DDR1-255ENST00000504927 GPR88Q9GZN0 384 aa22.03■■□□□ 1.12
DDR1-255ENST00000504927 THAP9Q9H5L6 903 aa22.03■■□□□ 1.12
DDR1-255ENST00000504927 KCNK12Q9HB15 430 aa22.03■■□□□ 1.12
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DDR1-255ENST00000504927 CSH2P0DML3 217 aa22.02■■□□□ 1.12
DDR1-255ENST00000504927 MYL4P12829 197 aa22.02■■□□□ 1.12
DDR1-255ENST00000504927 INCA1Q0VD86 236 aa22.02■■□□□ 1.12
DDR1-255ENST00000504927 KCNH2Q12809 1159 aa22.02■■□□□ 1.12
DDR1-255ENST00000504927 FAM114A1Q8IWE2 563 aa22.02■■□□□ 1.12
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DDR1-255ENST00000504927 DPEP3Q9H4B8 488 aa22.02■■□□□ 1.12
DDR1-255ENST00000504927 C11orf16Q9NQ32 467 aa22.02■■□□□ 1.12
DDR1-255ENST00000504927 UTP3Q9NQZ2 479 aaKnown RBP eCLIP22.02■■□□□ 1.12
DDR1-255ENST00000504927 SORCS3Q9UPU3 1222 aa22.02■■□□□ 1.12
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DDR1-255ENST00000504927 MTSS1LQ765P7 747 aa22.01■■□□□ 1.11
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DDR1-255ENST00000504927 GIPC2Q8TF65 315 aa22.01■■□□□ 1.11
DDR1-255ENST00000504927 EDAQ92838 391 aa22.01■■□□□ 1.11
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DDR1-255ENST00000504927 ELOVL4Q9GZR5 314 aa22.01■■□□□ 1.11
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DDR1-255ENST00000504927 TCEAL4Q96EI5 215 aa22■■□□□ 1.11
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DDR1-255ENST00000504927 UXTQ9UBK9 157 aaPredicted RBP22■■□□□ 1.11
DDR1-255ENST00000504927 DOCK6Q96HP0 2047 aa21.99■■□□□ 1.11
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DDR1-255ENST00000504927 STX1AQ16623 288 aa21.97■■□□□ 1.11
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DDR1-255ENST00000504927 NT5C1BQ96P26 610 aa21.97■■□□□ 1.11
DDR1-255ENST00000504927 NOTCH4Q99466 2003 aa21.97■■□□□ 1.11
DDR1-255ENST00000504927 TEAD2Q15562 447 aa21.96■■□□□ 1.11
DDR1-255ENST00000504927 SDHAF4Q5VUM1 108 aa21.96■■□□□ 1.11
DDR1-255ENST00000504927 PARM1Q6UWI2 310 aa21.96■■□□□ 1.11
DDR1-255ENST00000504927 DENND5BQ6ZUT9 1274 aa21.96■■□□□ 1.11
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