RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498224.5

SLC20A1-209, Transcript of solute carrier family 20 member 1, humanhuman

TSL 2

Gene SLC20A1, Length 692 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC20A1-209ENST00000498224 ANKLE1Q8NAG6 615 aa11.13□□□□□ -0.63
SLC20A1-209ENST00000498224 C3orf20Q8ND61 904 aa11.13□□□□□ -0.63
SLC20A1-209ENST00000498224 SPATA18Q8TC71 538 aa11.13□□□□□ -0.63
SLC20A1-209ENST00000498224 ACTRT1Q8TDG2 376 aa11.13□□□□□ -0.63
SLC20A1-209ENST00000498224 TSC1Q92574 1164 aa11.13□□□□□ -0.63
SLC20A1-209ENST00000498224 ZNF333Q96JL9 665 aa11.13□□□□□ -0.63
SLC20A1-209ENST00000498224 SENP8Q96LD8 212 aa11.13□□□□□ -0.63
SLC20A1-209ENST00000498224 CARD9Q9H257 536 aa11.13□□□□□ -0.63
SLC20A1-209ENST00000498224 ELAC1Q9H777 363 aaKnown RBP11.13□□□□□ -0.63
SLC20A1-209ENST00000498224 TMEM161AQ9NX61 479 aa11.13□□□□□ -0.63
SLC20A1-209ENST00000498224 IP6K2Q9UHH9 426 aa11.13□□□□□ -0.63
SLC20A1-209ENST00000498224 INPP5FQ9Y2H2 1132 aa11.13□□□□□ -0.63
SLC20A1-209ENST00000498224 TMEM191CA6NGB0 347 aa11.12□□□□□ -0.63
SLC20A1-209ENST00000498224 CASTOR2A6NHX0 329 aa11.12□□□□□ -0.63
SLC20A1-209ENST00000498224 PGRMC1O00264 195 aaKnown RBP11.12□□□□□ -0.63
SLC20A1-209ENST00000498224 PDE2AO00408 941 aaPredicted RBP11.12□□□□□ -0.63
SLC20A1-209ENST00000498224 ENPP3O14638 875 aa11.12□□□□□ -0.63
SLC20A1-209ENST00000498224 NBNO60934 754 aa11.12□□□□□ -0.63
SLC20A1-209ENST00000498224 GABBR2O75899 941 aa11.12□□□□□ -0.63
SLC20A1-209ENST00000498224 PDGFRBP09619 1106 aa11.12□□□□□ -0.63
SLC20A1-209ENST00000498224 FGFR1P11362 822 aa11.12□□□□□ -0.63
SLC20A1-209ENST00000498224 ODC1P11926 461 aa11.12□□□□□ -0.63
SLC20A1-209ENST00000498224 CAPN2P17655 700 aa11.12□□□□□ -0.63
SLC20A1-209ENST00000498224 MAN1A1P33908 653 aa11.12□□□□□ -0.63
SLC20A1-209ENST00000498224 CTNNA1P35221 906 aaKnown RBP11.12□□□□□ -0.63
SLC20A1-209ENST00000498224 GABRB2P47870 512 aa11.12□□□□□ -0.63
SLC20A1-209ENST00000498224 PSMC1P62191 440 aaKnown RBP11.12□□□□□ -0.63
SLC20A1-209ENST00000498224 PDCLQ13371 301 aa11.12□□□□□ -0.63
SLC20A1-209ENST00000498224 NAA30Q147X3 362 aaPredicted RBP11.12□□□□□ -0.63
SLC20A1-209ENST00000498224 PTPROQ16827 1216 aa11.12□□□□□ -0.63
SLC20A1-209ENST00000498224 PTPN20Q4JDL3 420 aa11.12□□□□□ -0.63
SLC20A1-209ENST00000498224 C2CD6Q53TS8 623 aa11.12□□□□□ -0.63
SLC20A1-209ENST00000498224 PPP1R26Q5T8A7 1209 aaPredicted RBP11.12□□□□□ -0.63
SLC20A1-209ENST00000498224 DCLRE1AQ6PJP8 1040 aa11.12□□□□□ -0.63
SLC20A1-209ENST00000498224 METTL23Q86XA0 190 aa11.12□□□□□ -0.63
SLC20A1-209ENST00000498224 RASGEF1CQ8N431 466 aa11.12□□□□□ -0.63
SLC20A1-209ENST00000498224 MMGT1Q8N4V1 131 aa11.12□□□□□ -0.63
SLC20A1-209ENST00000498224 C12orf29Q8N999 325 aa11.12□□□□□ -0.63
SLC20A1-209ENST00000498224 SPATA4Q8NEY3 305 aa11.12□□□□□ -0.63
SLC20A1-209ENST00000498224 UBA3Q8TBC4 463 aa11.12□□□□□ -0.63
SLC20A1-209ENST00000498224 STK32AQ8WU08 396 aa11.12□□□□□ -0.63
SLC20A1-209ENST00000498224 LINC01599Q8WXQ3 324 aa11.12□□□□□ -0.63
SLC20A1-209ENST00000498224 ARMC5Q96C12 935 aa11.12□□□□□ -0.63
SLC20A1-209ENST00000498224 MS4A14Q96JA4 679 aa11.12□□□□□ -0.63
SLC20A1-209ENST00000498224 BTBD6Q96KE9 485 aa11.12□□□□□ -0.63
SLC20A1-209ENST00000498224 NAP1L3Q99457 506 aaPredicted RBP11.12□□□□□ -0.63
SLC20A1-209ENST00000498224 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP11.12□□□□□ -0.631e-8■□□□□ 9
SLC20A1-209ENST00000498224 PLVAPQ9BX97 442 aa11.12□□□□□ -0.63
SLC20A1-209ENST00000498224 METRNQ9UJH8 293 aa11.12□□□□□ -0.63
SLC20A1-209ENST00000498224 DSEQ9UL01 958 aa11.12□□□□□ -0.63
SLC20A1-209ENST00000498224 TTC7AQ9ULT0 858 aaPredicted RBP11.12□□□□□ -0.63
SLC20A1-209ENST00000498224 SBDSQ9Y3A5 250 aaKnown RBP eCLIP11.12□□□□□ -0.63
SLC20A1-209ENST00000498224 PCDHA3Q9Y5H8 950 aa11.12□□□□□ -0.63
SLC20A1-209ENST00000498224 CITO14578 2027 aa11.12□□□□□ -0.63
SLC20A1-209ENST00000498224 TCRBV5S1A1TA0A578 114 aa11.11□□□□□ -0.63
SLC20A1-209ENST00000498224 SIGLEC16A6NMB1 481 aa11.11□□□□□ -0.63
SLC20A1-209ENST00000498224 GABRDO14764 452 aa11.11□□□□□ -0.63
SLC20A1-209ENST00000498224 HOXA2O43364 376 aa11.11□□□□□ -0.63
SLC20A1-209ENST00000498224 B3GAT3O94766 335 aa11.11□□□□□ -0.63
SLC20A1-209ENST00000498224 HSPA8P11142 646 aaKnown RBP11.11□□□□□ -0.63
SLC20A1-209ENST00000498224 KRT3P12035 628 aa11.11□□□□□ -0.63
SLC20A1-209ENST00000498224 MCM3P25205 808 aa11.11□□□□□ -0.63
SLC20A1-209ENST00000498224 LMO2P25791 158 aa11.11□□□□□ -0.63
SLC20A1-209ENST00000498224 AARSP49588 968 aaKnown RBP eCLIP11.11□□□□□ -0.63
SLC20A1-209ENST00000498224 PEX5P50542 639 aa11.11□□□□□ -0.63
SLC20A1-209ENST00000498224 BCAT1P54687 386 aa11.11□□□□□ -0.63
SLC20A1-209ENST00000498224 PRSS12P56730 875 aa11.11□□□□□ -0.63
SLC20A1-209ENST00000498224 RWDD2BP57060 319 aa11.11□□□□□ -0.63
SLC20A1-209ENST00000498224 SLC8A3P57103 927 aa11.11□□□□□ -0.63
SLC20A1-209ENST00000498224 PIGHQ14442 188 aaPredicted RBP11.11□□□□□ -0.63
SLC20A1-209ENST00000498224 NOMO2Q5JPE7 1267 aa11.11□□□□□ -0.63
SLC20A1-209ENST00000498224 CYP4A22Q5TCH4 519 aa11.11□□□□□ -0.63
SLC20A1-209ENST00000498224 SEL1L2Q5TEA6 688 aa11.11□□□□□ -0.63
SLC20A1-209ENST00000498224 WSCD1Q658N2 575 aa11.11□□□□□ -0.63
SLC20A1-209ENST00000498224 OSTM1Q86WC4 334 aa11.11□□□□□ -0.63
SLC20A1-209ENST00000498224 ABI1Q8IZP0 508 aa11.11□□□□□ -0.63
SLC20A1-209ENST00000498224 DNAJC5GQ8N7S2 189 aa11.11□□□□□ -0.63
SLC20A1-209ENST00000498224 ANKRD52Q8NB46 1076 aa11.11□□□□□ -0.63
SLC20A1-209ENST00000498224 DBF4BQ8NFT6 615 aa11.11□□□□□ -0.63
SLC20A1-209ENST00000498224 RSPH1Q8WYR4 309 aa11.11□□□□□ -0.63
SLC20A1-209ENST00000498224 ANKRD7Q92527 254 aa11.11□□□□□ -0.63
SLC20A1-209ENST00000498224 CD101Q93033 1021 aa11.11□□□□□ -0.63
SLC20A1-209ENST00000498224 FAM193BQ96PV7 902 aaPredicted RBP11.11□□□□□ -0.63
SLC20A1-209ENST00000498224 CPXM1Q96SM3 734 aa11.11□□□□□ -0.63
SLC20A1-209ENST00000498224 HIPK3Q9H422 1215 aa11.11□□□□□ -0.63
SLC20A1-209ENST00000498224 DPEP3Q9H4B8 488 aa11.11□□□□□ -0.63
SLC20A1-209ENST00000498224 CYLDQ9NQC7 956 aa11.11□□□□□ -0.63
SLC20A1-209ENST00000498224 ST7Q9NRC1 585 aa11.11□□□□□ -0.63
SLC20A1-209ENST00000498224 FAM49BQ9NUQ9 324 aa11.11□□□□□ -0.63
SLC20A1-209ENST00000498224 ARGLU1Q9NWB6 273 aaPredicted RBP11.11□□□□□ -0.63
SLC20A1-209ENST00000498224 CYTH4Q9UIA0 394 aa11.11□□□□□ -0.63
SLC20A1-209ENST00000498224 LRFN2Q9ULH4 789 aa11.11□□□□□ -0.63
SLC20A1-209ENST00000498224 PCDHB7Q9Y5E2 793 aa11.11□□□□□ -0.63
SLC20A1-209ENST00000498224 FRMPD3Q5JV73 1810 aa11.11□□□□□ -0.63
SLC20A1-209ENST00000498224 GOLGA8SH3BPF8 625 aa11.1□□□□□ -0.63
SLC20A1-209ENST00000498224 CCDC188H7C350 402 aa11.1□□□□□ -0.63
SLC20A1-209ENST00000498224 CXCL10P02778 98 aa11.1□□□□□ -0.63
SLC20A1-209ENST00000498224 ERBB2P04626 1255 aa11.1□□□□□ -0.63
SLC20A1-209ENST00000498224 PTPN1P18031 435 aaKnown RBP11.1□□□□□ -0.63
SLC20A1-209ENST00000498224 PCSK1P29120 753 aa11.1□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.8 ms