RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495571.5

VWA3B-220, Transcript of von Willebrand factor A domain containing 3B, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene VWA3B, Length 2,711 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWA3B-220ENST00000495571 RCAN1P53805 252 aa8.96□□□□□ -0.97
VWA3B-220ENST00000495571 APOFQ13790 326 aa8.96□□□□□ -0.97
VWA3B-220ENST00000495571 ZNF423Q2M1K9 1284 aa8.96□□□□□ -0.97
VWA3B-220ENST00000495571 SGO2Q562F6 1265 aa8.96□□□□□ -0.97
VWA3B-220ENST00000495571 DEPDC1Q5TB30 811 aa8.96□□□□□ -0.97
VWA3B-220ENST00000495571 C12orf50Q8NA57 414 aaPredicted RBP8.96□□□□□ -0.97
VWA3B-220ENST00000495571 GABPB2Q8TAK5 448 aaPredicted RBP8.96□□□□□ -0.97
VWA3B-220ENST00000495571 HELQQ8TDG4 1101 aa8.96□□□□□ -0.97
VWA3B-220ENST00000495571 TBCKQ8TEA7 893 aa8.96□□□□□ -0.97
VWA3B-220ENST00000495571 SNX29Q8TEQ0 813 aa8.96□□□□□ -0.97
VWA3B-220ENST00000495571 GRK7Q8WTQ7 553 aa8.96□□□□□ -0.97
VWA3B-220ENST00000495571 CD101Q93033 1021 aa8.96□□□□□ -0.97
VWA3B-220ENST00000495571 ATP6V0A1Q93050 837 aa8.96□□□□□ -0.97
VWA3B-220ENST00000495571 RIC8AQ9NPQ8 531 aa8.96□□□□□ -0.97
VWA3B-220ENST00000495571 IGF2BP1Q9NZI8 577 aaKnown RBP eCLIP8.96□□□□□ -0.97
VWA3B-220ENST00000495571 PCDHGA3Q9Y5H0 932 aa8.96□□□□□ -0.97
VWA3B-220ENST00000495571 SYNGAP1Q96PV0 1343 aa8.96□□□□□ -0.97
VWA3B-220ENST00000495571 CROCCQ5TZA2 2017 aa8.96□□□□□ -0.97
VWA3B-220ENST00000495571 CCDC195A0A1B0GUA6 201 aa8.96□□□□□ -0.98
VWA3B-220ENST00000495571 USP17L12C9JPN9 530 aa8.96□□□□□ -0.98
VWA3B-220ENST00000495571 USP17L21D6R901 530 aa8.96□□□□□ -0.98
VWA3B-220ENST00000495571 MATN2O00339 956 aa8.96□□□□□ -0.98
VWA3B-220ENST00000495571 BIRC5O15392 142 aa8.96□□□□□ -0.98
VWA3B-220ENST00000495571 STRNO43815 780 aa8.96□□□□□ -0.98
VWA3B-220ENST00000495571 CIB2O75838 187 aa8.96□□□□□ -0.98
VWA3B-220ENST00000495571 CYP7A1P22680 504 aa8.96□□□□□ -0.98
VWA3B-220ENST00000495571 NDST2P52849 883 aa8.96□□□□□ -0.98
VWA3B-220ENST00000495571 PDIA2Q13087 525 aaKnown RBP8.96□□□□□ -0.98
VWA3B-220ENST00000495571 KRT72Q14CN4 511 aa8.96□□□□□ -0.98
VWA3B-220ENST00000495571 KCNJ8Q15842 424 aa8.96□□□□□ -0.98
VWA3B-220ENST00000495571 HERC4Q5GLZ8 1057 aaPredicted RBP8.96□□□□□ -0.98
VWA3B-220ENST00000495571 SPDYAQ5MJ70 313 aa8.96□□□□□ -0.98
VWA3B-220ENST00000495571 DCLRE1AQ6PJP8 1040 aa8.96□□□□□ -0.98
VWA3B-220ENST00000495571 DENND5BQ6ZUT9 1274 aa8.96□□□□□ -0.98
VWA3B-220ENST00000495571 DZIP1Q86YF9 867 aaKnown RBP8.96□□□□□ -0.98
VWA3B-220ENST00000495571 PIGBQ92521 554 aa8.96□□□□□ -0.98
VWA3B-220ENST00000495571 TTC17Q96AE7 1141 aa8.96□□□□□ -0.98
VWA3B-220ENST00000495571 DCPSQ96C86 337 aaKnown RBP8.96□□□□□ -0.98
VWA3B-220ENST00000495571 OSBPL6Q9BZF3 934 aa8.96□□□□□ -0.98
VWA3B-220ENST00000495571 XAB2Q9HCS7 855 aaKnown RBP8.96□□□□□ -0.98
VWA3B-220ENST00000495571 ANLNQ9NQW6 1124 aa8.96□□□□□ -0.98
VWA3B-220ENST00000495571 LRRC4BQ9NT99 713 aa8.96□□□□□ -0.98
VWA3B-220ENST00000495571 NDUFA13Q9P0J0 144 aa8.96□□□□□ -0.98
VWA3B-220ENST00000495571 PCDHB13Q9Y5F0 798 aa8.96□□□□□ -0.98
VWA3B-220ENST00000495571 ACTL7BQ9Y614 415 aa8.96□□□□□ -0.98
VWA3B-220ENST00000495571 AP4B1Q9Y6B7 739 aa8.96□□□□□ -0.98
VWA3B-220ENST00000495571 MYO3BQ8WXR4 1341 aa8.96□□□□□ -0.98
VWA3B-220ENST00000495571 POTEFA5A3E0 1075 aa8.96□□□□□ -0.98
VWA3B-220ENST00000495571 NDC80O14777 642 aa8.96□□□□□ -0.98
VWA3B-220ENST00000495571 SPOPO43791 374 aa8.96□□□□□ -0.98
VWA3B-220ENST00000495571 PDE8BO95263 885 aa8.96□□□□□ -0.98
VWA3B-220ENST00000495571 POLR2MP0CAP2 368 aa8.96□□□□□ -0.98
VWA3B-220ENST00000495571 POTEIP0CG38 1075 aa8.96□□□□□ -0.98
VWA3B-220ENST00000495571 CYP2C9P11712 490 aa8.96□□□□□ -0.98
VWA3B-220ENST00000495571 ITIH2P19823 946 aa8.96□□□□□ -0.98
VWA3B-220ENST00000495571 NKX2-5P52952 324 aaPredicted RBP8.96□□□□□ -0.98
VWA3B-220ENST00000495571 MAPK10P53779 464 aa8.96□□□□□ -0.98
VWA3B-220ENST00000495571 KRT81Q14533 505 aa8.96□□□□□ -0.98
VWA3B-220ENST00000495571 DLGAP5Q15398 846 aa8.96□□□□□ -0.98
VWA3B-220ENST00000495571 UBE2SQ16763 222 aa8.96□□□□□ -0.98
VWA3B-220ENST00000495571 C2CD6Q53TS8 623 aa8.96□□□□□ -0.98
VWA3B-220ENST00000495571 SEL1L2Q5TEA6 688 aa8.96□□□□□ -0.98
VWA3B-220ENST00000495571 IZUMO3Q5VZ72 239 aa8.96□□□□□ -0.98
VWA3B-220ENST00000495571 SPOPLQ6IQ16 392 aa8.96□□□□□ -0.98
VWA3B-220ENST00000495571 PROM2Q8N271 834 aa8.96□□□□□ -0.98
VWA3B-220ENST00000495571 MARVELD2Q8N4S9 558 aa8.96□□□□□ -0.98
VWA3B-220ENST00000495571 SCAIQ8N9R8 606 aa8.96□□□□□ -0.98
VWA3B-220ENST00000495571 ICA1LQ8NDH6 482 aa8.96□□□□□ -0.98
VWA3B-220ENST00000495571 PSPC1Q8WXF1 523 aaKnown RBP8.96□□□□□ -0.98
VWA3B-220ENST00000495571 SLC35C1Q96A29 364 aa8.96□□□□□ -0.98
VWA3B-220ENST00000495571 CAMKK2Q96RR4 588 aa8.96□□□□□ -0.98
VWA3B-220ENST00000495571 PCDHB18PQ96TA0 734 aa8.96□□□□□ -0.98
VWA3B-220ENST00000495571 MMP19Q99542 508 aa8.96□□□□□ -0.98
VWA3B-220ENST00000495571 PLGRKTQ9HBL7 147 aa8.96□□□□□ -0.98
VWA3B-220ENST00000495571 RSL24D1Q9UHA3 163 aaKnown RBP8.96□□□□□ -0.98
VWA3B-220ENST00000495571 CDC14AQ9UNH5 594 aa8.96□□□□□ -0.98
VWA3B-220ENST00000495571 TLL2Q9Y6L7 1015 aa8.96□□□□□ -0.98
VWA3B-220ENST00000495571 FRMPD4Q14CM0 1322 aa8.96□□□□□ -0.98
VWA3B-220ENST00000495571 FOXN3O00409 490 aaPredicted RBP8.95□□□□□ -0.98
VWA3B-220ENST00000495571 HNRNPCL1O60812 293 aaKnown RBP8.95□□□□□ -0.98
VWA3B-220ENST00000495571 GABRB3P28472 473 aa8.95□□□□□ -0.98
VWA3B-220ENST00000495571 IL6STP40189 918 aaPredicted RBP8.95□□□□□ -0.98
VWA3B-220ENST00000495571 STAT3P40763 770 aa8.95□□□□□ -0.98
VWA3B-220ENST00000495571 ALDH1A3P47895 512 aa8.95□□□□□ -0.98
VWA3B-220ENST00000495571 SCNN1DP51172 638 aa8.95□□□□□ -0.98
VWA3B-220ENST00000495571 MARSP56192 900 aaKnown RBP8.95□□□□□ -0.98
VWA3B-220ENST00000495571 NSUN2Q08J23 767 aaKnown RBP eCLIP8.95□□□□□ -0.98
VWA3B-220ENST00000495571 OASLQ15646 514 aaKnown RBP8.95□□□□□ -0.98
VWA3B-220ENST00000495571 PPP2R5EQ16537 467 aa8.95□□□□□ -0.98
VWA3B-220ENST00000495571 GET4Q7L5D6 327 aaPredicted RBP8.95□□□□□ -0.98
VWA3B-220ENST00000495571 LPCAT2Q7L5N7 544 aa8.95□□□□□ -0.98
VWA3B-220ENST00000495571 BTLAQ7Z6A9 289 aa8.95□□□□□ -0.98
VWA3B-220ENST00000495571 ERI1Q8IV48 349 aaKnown RBP8.95□□□□□ -0.98
VWA3B-220ENST00000495571 GSDMBQ8TAX9 411 aa8.95□□□□□ -0.98
VWA3B-220ENST00000495571 ZNF384Q8TF68 577 aa8.95□□□□□ -0.98
VWA3B-220ENST00000495571 TANKQ92844 425 aa8.95□□□□□ -0.98
VWA3B-220ENST00000495571 FAM111AQ96PZ2 611 aa8.95□□□□□ -0.98
VWA3B-220ENST00000495571 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP8.95□□□□□ -0.98
VWA3B-220ENST00000495571 EHD1Q9H4M9 534 aa8.95□□□□□ -0.98
VWA3B-220ENST00000495571 RNF41Q9H4P4 317 aaPredicted RBP8.95□□□□□ -0.98
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 122.5 ms