RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000493752.5

ABCD4-216, Transcript of ATP binding cassette subfamily D member 4, humanhuman

TSL 3

Gene ABCD4, Length 719 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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ABCD4-216ENST00000493752 CNGA2Q16280 664 aa8.64□□□□□ -1.03
ABCD4-216ENST00000493752 SGO2Q562F6 1265 aa8.64□□□□□ -1.03
ABCD4-216ENST00000493752 ARHGAP17Q68EM7 881 aa8.64□□□□□ -1.03
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ABCD4-216ENST00000493752 CYP26C1Q6V0L0 522 aa8.64□□□□□ -1.03
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ABCD4-216ENST00000493752 CCDC130P13994 396 aa8.62□□□□□ -1.03
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