RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492895.1

ANKRD28-211, Transcript of ankyrin repeat domain 28, humanhuman

TSL 4

Gene ANKRD28, Length 539 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD28-211ENST00000492895 GGA3Q9NZ52 723 aa3.96□□□□□ -1.78
ANKRD28-211ENST00000492895 FZD1Q9UP38 647 aa3.96□□□□□ -1.78
ANKRD28-211ENST00000492895 UNC80Q8N2C7 3258 aa3.96□□□□□ -1.78
ANKRD28-211ENST00000492895 RIC1Q4ADV7 1423 aa3.95□□□□□ -1.78
ANKRD28-211ENST00000492895 SNED1Q8TER0 1413 aa3.95□□□□□ -1.78
ANKRD28-211ENST00000492895 TAF1LQ8IZX4 1826 aa3.95□□□□□ -1.78
ANKRD28-211ENST00000492895 MYH14Q7Z406 1995 aaKnown RBP3.95□□□□□ -1.78
ANKRD28-211ENST00000492895 COL4A5P29400 1685 aa3.95□□□□□ -1.78
ANKRD28-211ENST00000492895 ZNF831Q5JPB2 1677 aa3.95□□□□□ -1.78
ANKRD28-211ENST00000492895 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa3.95□□□□□ -1.78
ANKRD28-211ENST00000492895 ATRNL1Q5VV63 1379 aa3.95□□□□□ -1.78
ANKRD28-211ENST00000492895 RTL9Q8NET4 1388 aa3.95□□□□□ -1.78
ANKRD28-211ENST00000492895 UBE2Q2LH0YL09 131 aa3.95□□□□□ -1.78
ANKRD28-211ENST00000492895 PJA2O43164 708 aa3.95□□□□□ -1.78
ANKRD28-211ENST00000492895 ANP32CO43423 234 aa3.95□□□□□ -1.78
ANKRD28-211ENST00000492895 PLIN1O60240 522 aa3.95□□□□□ -1.78
ANKRD28-211ENST00000492895 PCDHGA12O60330 932 aa3.95□□□□□ -1.78
ANKRD28-211ENST00000492895 SNUPNO95149 360 aaKnown RBP3.95□□□□□ -1.78
ANKRD28-211ENST00000492895 IGKV5-2P06315 115 aa3.95□□□□□ -1.78
ANKRD28-211ENST00000492895 ALOX15P16050 662 aaPredicted RBP3.95□□□□□ -1.78
ANKRD28-211ENST00000492895 KLRK1P26718 216 aa3.95□□□□□ -1.78
ANKRD28-211ENST00000492895 MAP2K2P36507 400 aa3.95□□□□□ -1.78
ANKRD28-211ENST00000492895 SREBF1P36956 1147 aa3.95□□□□□ -1.78
ANKRD28-211ENST00000492895 IGHMBP2P38935 993 aaKnown RBP3.95□□□□□ -1.78
ANKRD28-211ENST00000492895 FXR1P51114 621 aaKnown RBP eCLIP3.95□□□□□ -1.78
ANKRD28-211ENST00000492895 SLC16A1P53985 500 aa3.95□□□□□ -1.78
ANKRD28-211ENST00000492895 PER3P56645 1201 aa3.95□□□□□ -1.78
ANKRD28-211ENST00000492895 RNASE9P60153 205 aaKnown RBP3.95□□□□□ -1.78
ANKRD28-211ENST00000492895 FAM189BP81408 668 aa3.95□□□□□ -1.78
ANKRD28-211ENST00000492895 KIF23Q02241 960 aaPredicted RBP3.95□□□□□ -1.78
ANKRD28-211ENST00000492895 NOGQ13253 232 aa3.95□□□□□ -1.78
ANKRD28-211ENST00000492895 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP3.95□□□□□ -1.78
ANKRD28-211ENST00000492895 TIGD2Q4W5G0 525 aa3.95□□□□□ -1.78
ANKRD28-211ENST00000492895 RGMBQ6NW40 437 aa3.95□□□□□ -1.78
ANKRD28-211ENST00000492895 MOB2Q70IA6 237 aa3.95□□□□□ -1.78
ANKRD28-211ENST00000492895 RHOUQ7L0Q8 258 aa3.95□□□□□ -1.78
ANKRD28-211ENST00000492895 GDF7Q7Z4P5 450 aa3.95□□□□□ -1.78
ANKRD28-211ENST00000492895 ZBTB46Q86UZ6 589 aa3.95□□□□□ -1.78
ANKRD28-211ENST00000492895 FAM9BQ8IZU0 186 aa3.95□□□□□ -1.78
ANKRD28-211ENST00000492895 PQLC1Q8N2U9 271 aa3.95□□□□□ -1.78
ANKRD28-211ENST00000492895 PPM1NQ8N819 430 aa3.95□□□□□ -1.78
ANKRD28-211ENST00000492895 RNF169Q8NCN4 708 aa3.95□□□□□ -1.78
ANKRD28-211ENST00000492895 FBXO18Q8NFZ0 1043 aa3.95□□□□□ -1.78
ANKRD28-211ENST00000492895 SLC35B2Q8TB61 432 aa3.95□□□□□ -1.78
ANKRD28-211ENST00000492895 STON2Q8WXE9 905 aa3.95□□□□□ -1.78
ANKRD28-211ENST00000492895 DPF2Q92785 391 aa3.95□□□□□ -1.78
ANKRD28-211ENST00000492895 HOXB13Q92826 284 aaPredicted RBP3.95□□□□□ -1.78
ANKRD28-211ENST00000492895 CHMP4CQ96CF2 233 aa3.95□□□□□ -1.78
ANKRD28-211ENST00000492895 CHFRQ96EP1 664 aa3.95□□□□□ -1.78
ANKRD28-211ENST00000492895 CDCA5Q96FF9 252 aa3.95□□□□□ -1.78
ANKRD28-211ENST00000492895 PRRX2Q99811 253 aa3.95□□□□□ -1.78
ANKRD28-211ENST00000492895 SLC46A2Q9BY10 475 aa3.95□□□□□ -1.78
ANKRD28-211ENST00000492895 ZNF768Q9H5H4 540 aaKnown RBP3.95□□□□□ -1.78
ANKRD28-211ENST00000492895 TRPM5Q9NZQ8 1165 aa3.95□□□□□ -1.78
ANKRD28-211ENST00000492895 SAP30BPQ9UHR5 308 aaKnown RBP3.95□□□□□ -1.78
ANKRD28-211ENST00000492895 DNM3Q9UQ16 869 aa3.95□□□□□ -1.78
ANKRD28-211ENST00000492895 CHST2Q9Y4C5 530 aa3.95□□□□□ -1.78
ANKRD28-211ENST00000492895 PCDHGA9Q9Y5G4 932 aaKnown RBP3.95□□□□□ -1.78
ANKRD28-211ENST00000492895 PCDHGA8Q9Y5G5 932 aa3.95□□□□□ -1.78
ANKRD28-211ENST00000492895 PCDHGA7Q9Y5G6 932 aa3.95□□□□□ -1.78
ANKRD28-211ENST00000492895 PCDHGA6Q9Y5G7 932 aa3.95□□□□□ -1.78
ANKRD28-211ENST00000492895 PCDHGA3Q9Y5H0 932 aa3.95□□□□□ -1.78
ANKRD28-211ENST00000492895 VCANP13611 3396 aa3.95□□□□□ -1.78
ANKRD28-211ENST00000492895 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP3.95□□□□□ -1.78
ANKRD28-211ENST00000492895 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa3.95□□□□□ -1.78
ANKRD28-211ENST00000492895 CDHR2Q9BYE9 1310 aa3.95□□□□□ -1.78
ANKRD28-211ENST00000492895 CASP8AP2Q9UKL3 1982 aa3.94□□□□□ -1.78
ANKRD28-211ENST00000492895 PIEZO1Q92508 2521 aa3.94□□□□□ -1.78
ANKRD28-211ENST00000492895 FAM171A2A8MVW0 826 aa3.94□□□□□ -1.78
ANKRD28-211ENST00000492895 CXorf49A8MYA2 514 aaPredicted RBP3.94□□□□□ -1.78
ANKRD28-211ENST00000492895 DIRC3C9JPN6 131 aa3.94□□□□□ -1.78
ANKRD28-211ENST00000492895 SNAP23O00161 211 aa3.94□□□□□ -1.78
ANKRD28-211ENST00000492895 RNASET2O00584 256 aaKnown RBP3.94□□□□□ -1.78
ANKRD28-211ENST00000492895 WNT10BO00744 389 aa3.94□□□□□ -1.78
ANKRD28-211ENST00000492895 NDUFS2O75306 463 aa3.94□□□□□ -1.78
ANKRD28-211ENST00000492895 PPFIA4O75335 1185 aa3.94□□□□□ -1.78
ANKRD28-211ENST00000492895 TAF5LO75529 589 aa3.94□□□□□ -1.78
ANKRD28-211ENST00000492895 ALDH1L1O75891 902 aa3.94□□□□□ -1.78
ANKRD28-211ENST00000492895 ENDOD1O94919 500 aa3.94□□□□□ -1.78
ANKRD28-211ENST00000492895 ITGB1P05556 798 aa3.94□□□□□ -1.78
ANKRD28-211ENST00000492895 LAG3P18627 525 aa3.94□□□□□ -1.78
ANKRD28-211ENST00000492895 RPS12P25398 132 aaKnown RBP3.94□□□□□ -1.78
ANKRD28-211ENST00000492895 ZFP36P26651 326 aaKnown RBP3.94□□□□□ -1.78
ANKRD28-211ENST00000492895 RECQLP46063 649 aaPredicted RBP3.94□□□□□ -1.78
ANKRD28-211ENST00000492895 NEK2P51955 445 aa3.94□□□□□ -1.78
ANKRD28-211ENST00000492895 INHBCP55103 352 aa3.94□□□□□ -1.78
ANKRD28-211ENST00000492895 CLRN1P58418 232 aa3.94□□□□□ -1.78
ANKRD28-211ENST00000492895 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP3.94□□□□□ -1.78
ANKRD28-211ENST00000492895 MGAT2Q10469 447 aa3.94□□□□□ -1.78
ANKRD28-211ENST00000492895 RRP12Q5JTH9 1297 aaKnown RBP3.94□□□□□ -1.78
ANKRD28-211ENST00000492895 LY6G5CQ5SRR4 150 aa3.94□□□□□ -1.78
ANKRD28-211ENST00000492895 ATXN7L2Q5T6C5 722 aaPredicted RBP3.94□□□□□ -1.78
ANKRD28-211ENST00000492895 LDLRAD3Q86YD5 345 aa3.94□□□□□ -1.78
ANKRD28-211ENST00000492895 TEKT5Q96M29 485 aa3.94□□□□□ -1.78
ANKRD28-211ENST00000492895 MPHOSPH8Q99549 860 aa3.94□□□□□ -1.78
ANKRD28-211ENST00000492895 MLST8Q9BVC4 326 aa3.94□□□□□ -1.78
ANKRD28-211ENST00000492895 CHMP4AQ9BY43 222 aa3.94□□□□□ -1.78
ANKRD28-211ENST00000492895 SENP6Q9GZR1 1112 aaPredicted RBP3.94□□□□□ -1.78
ANKRD28-211ENST00000492895 IKZF4Q9H2S9 585 aa3.94□□□□□ -1.78
ANKRD28-211ENST00000492895 MYOZ2Q9NPC6 264 aa3.94□□□□□ -1.78
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.7 ms