RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489850.5

NOM1-208, Transcript of nucleolar protein with MIF4G domain 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene NOM1, Length 559 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOM1-208ENST00000489850 UTP3Q9NQZ2 479 aaKnown RBP eCLIP21.84■■□□□ 1.09
NOM1-208ENST00000489850 MUTYHQ9UIF7 546 aa21.84■■□□□ 1.09
NOM1-208ENST00000489850 NME7Q9Y5B8 376 aa21.84■■□□□ 1.09
NOM1-208ENST00000489850 TRIM66O15016 1216 aa21.83■■□□□ 1.09
NOM1-208ENST00000489850 CSH1P0DML2 217 aa21.83■■□□□ 1.09
NOM1-208ENST00000489850 CSH2P0DML3 217 aa21.83■■□□□ 1.09
NOM1-208ENST00000489850 MYL4P12829 197 aa21.83■■□□□ 1.09
NOM1-208ENST00000489850 NDST1P52848 882 aa21.83■■□□□ 1.09
NOM1-208ENST00000489850 KCNH2Q12809 1159 aa21.83■■□□□ 1.09
NOM1-208ENST00000489850 MTMR3Q13615 1198 aa21.83■■□□□ 1.09
NOM1-208ENST00000489850 STX1AQ16623 288 aa21.83■■□□□ 1.09
NOM1-208ENST00000489850 PTPN21Q16825 1174 aa21.83■■□□□ 1.09
NOM1-208ENST00000489850 MTSS1LQ765P7 747 aa21.83■■□□□ 1.09
NOM1-208ENST00000489850 NPAS3Q8IXF0 933 aa21.83■■□□□ 1.09
NOM1-208ENST00000489850 CRYBG2Q8N1P7 616 aa21.83■■□□□ 1.09
NOM1-208ENST00000489850 LPIN3Q9BQK8 851 aa21.83■■□□□ 1.09
NOM1-208ENST00000489850 NT5C1AQ9BXI3 368 aa21.83■■□□□ 1.09
NOM1-208ENST00000489850 GPR88Q9GZN0 384 aa21.83■■□□□ 1.09
NOM1-208ENST00000489850 DPEP3Q9H4B8 488 aa21.83■■□□□ 1.09
NOM1-208ENST00000489850 EHD2Q9NZN4 543 aa21.83■■□□□ 1.09
NOM1-208ENST00000489850 SORCS3Q9UPU3 1222 aa21.83■■□□□ 1.09
NOM1-208ENST00000489850 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP21.82■■□□□ 1.08
NOM1-208ENST00000489850 BDNFP23560 247 aa21.82■■□□□ 1.08
NOM1-208ENST00000489850 TBXAS1P24557 533 aaPredicted RBP21.82■■□□□ 1.08
NOM1-208ENST00000489850 ANXA13P27216 316 aa21.82■■□□□ 1.08
NOM1-208ENST00000489850 CDR1P51861 262 aa21.82■■□□□ 1.08
NOM1-208ENST00000489850 YWHAEP62258 255 aaKnown RBP21.82■■□□□ 1.08
NOM1-208ENST00000489850 TMC8Q8IU68 726 aa21.82■■□□□ 1.08
NOM1-208ENST00000489850 CREBRFQ8IUR6 639 aa21.82■■□□□ 1.08
NOM1-208ENST00000489850 HS6ST3Q8IZP7 471 aa21.82■■□□□ 1.08
NOM1-208ENST00000489850 SPATA17Q96L03 361 aa21.82■■□□□ 1.08
NOM1-208ENST00000489850 GCNAQ96QF7 691 aa21.82■■□□□ 1.08
NOM1-208ENST00000489850 KCNK12Q9HB15 430 aa21.82■■□□□ 1.08
NOM1-208ENST00000489850 UXTQ9UBK9 157 aaPredicted RBP21.82■■□□□ 1.08
NOM1-208ENST00000489850 CILPO75339 1184 aa21.81■■□□□ 1.08
NOM1-208ENST00000489850 CDC25CP30307 473 aa21.81■■□□□ 1.08
NOM1-208ENST00000489850 GRIK1P39086 918 aa21.81■■□□□ 1.08
NOM1-208ENST00000489850 DDR2Q16832 855 aa21.81■■□□□ 1.08
NOM1-208ENST00000489850 CCDC142Q17RM4 750 aa21.81■■□□□ 1.08
NOM1-208ENST00000489850 ACOT1Q86TX2 421 aa21.81■■□□□ 1.08
NOM1-208ENST00000489850 SCN4BQ8IWT1 228 aa21.81■■□□□ 1.08
NOM1-208ENST00000489850 UBALD2Q8IYN6 164 aa21.81■■□□□ 1.08
NOM1-208ENST00000489850 GIPC2Q8TF65 315 aa21.81■■□□□ 1.08
NOM1-208ENST00000489850 ING5Q8WYH8 240 aa21.81■■□□□ 1.08
NOM1-208ENST00000489850 NT5C1BQ96P26 610 aa21.81■■□□□ 1.08
NOM1-208ENST00000489850 LRRC3Q9BY71 257 aa21.81■■□□□ 1.08
NOM1-208ENST00000489850 ZMYM5Q9UJ78 669 aa21.81■■□□□ 1.08
NOM1-208ENST00000489850 ANHXE9PGG2 379 aa21.8■■□□□ 1.08
NOM1-208ENST00000489850 LRRN2O75325 713 aa21.8■■□□□ 1.08
NOM1-208ENST00000489850 CEBPBP17676 345 aa21.8■■□□□ 1.08
NOM1-208ENST00000489850 CD58P19256 250 aa21.8■■□□□ 1.08
NOM1-208ENST00000489850 CCR2P41597 374 aa21.8■■□□□ 1.08
NOM1-208ENST00000489850 MTIF2P46199 727 aaKnown RBP21.8■■□□□ 1.08
NOM1-208ENST00000489850 CUL2Q13617 745 aa21.8■■□□□ 1.08
NOM1-208ENST00000489850 KLHL40Q2TBA0 621 aa21.8■■□□□ 1.08
NOM1-208ENST00000489850 ARHGAP15Q53QZ3 475 aa21.8■■□□□ 1.08
NOM1-208ENST00000489850 ENOX1Q8TC92 643 aaKnown RBP21.8■■□□□ 1.08
NOM1-208ENST00000489850 TCEAL4Q96EI5 215 aa21.8■■□□□ 1.08
NOM1-208ENST00000489850 TRMT2BQ96GJ1 504 aaKnown RBP21.8■■□□□ 1.08
NOM1-208ENST00000489850 SMARCD1Q96GM5 515 aa21.8■■□□□ 1.08
NOM1-208ENST00000489850 C8orf48Q96LL4 319 aa21.8■■□□□ 1.08
NOM1-208ENST00000489850 C1QTNF1Q9BXJ1 281 aa21.8■■□□□ 1.08
NOM1-208ENST00000489850 CISHQ9NSE2 258 aa21.8■■□□□ 1.08
NOM1-208ENST00000489850 TMEM63CQ9P1W3 806 aa21.8■■□□□ 1.08
NOM1-208ENST00000489850 DOCK6Q96HP0 2047 aa21.8■■□□□ 1.08
NOM1-208ENST00000489850 NOTCH4Q99466 2003 aa21.8■■□□□ 1.08
NOM1-208ENST00000489850 DOCK8Q8NF50 2099 aa21.79■■□□□ 1.08
NOM1-208ENST00000489850 NOL4O94818 638 aa21.79■■□□□ 1.08
NOM1-208ENST00000489850 ASGR2P07307 311 aa21.79■■□□□ 1.08
NOM1-208ENST00000489850 GABRR2P28476 465 aa21.79■■□□□ 1.08
NOM1-208ENST00000489850 TDGQ13569 410 aa21.79■■□□□ 1.08
NOM1-208ENST00000489850 HTR4Q13639 388 aa21.79■■□□□ 1.08
NOM1-208ENST00000489850 CAVIN1Q6NZI2 390 aaKnown RBP21.79■■□□□ 1.08
NOM1-208ENST00000489850 IRF2BP1Q8IU81 584 aa21.79■■□□□ 1.08
NOM1-208ENST00000489850 SHKBP1Q8TBC3 707 aa21.79■■□□□ 1.08
NOM1-208ENST00000489850 GPR152Q8TDT2 470 aa21.79■■□□□ 1.08
NOM1-208ENST00000489850 EDAQ92838 391 aa21.79■■□□□ 1.08
NOM1-208ENST00000489850 KHSRPQ92945 711 aaKnown RBP eCLIP21.79■■□□□ 1.089e-8■■■■□ 24.3
NOM1-208ENST00000489850 TATDN2Q93075 761 aa21.79■■□□□ 1.08
NOM1-208ENST00000489850 MYRFLQ96LU7 910 aa21.79■■□□□ 1.08
NOM1-208ENST00000489850 MED10Q9BTT4 135 aa21.79■■□□□ 1.08
NOM1-208ENST00000489850 B3GNT5Q9BYG0 378 aa21.79■■□□□ 1.08
NOM1-208ENST00000489850 HMGXB4Q9UGU5 601 aa21.79■■□□□ 1.08
NOM1-208ENST00000489850 A0A1W2PRU2 124 aa21.78■■□□□ 1.08
NOM1-208ENST00000489850 SLC38A8A6NNN8 435 aa21.78■■□□□ 1.08
NOM1-208ENST00000489850 LETM1O95202 739 aaPredicted RBP21.78■■□□□ 1.08
NOM1-208ENST00000489850 HMGA1P17096 107 aaKnown RBP21.78■■□□□ 1.08
NOM1-208ENST00000489850 GPR15P49685 360 aa21.78■■□□□ 1.08
NOM1-208ENST00000489850 ZXDAP98168 799 aa21.78■■□□□ 1.08
NOM1-208ENST00000489850 MAN2A1Q16706 1144 aa21.78■■□□□ 1.08
NOM1-208ENST00000489850 DENND5BQ6ZUT9 1274 aa21.78■■□□□ 1.08
NOM1-208ENST00000489850 GAREM2Q75VX8 874 aa21.78■■□□□ 1.08
NOM1-208ENST00000489850 EHBP1Q8NDI1 1231 aa21.78■■□□□ 1.08
NOM1-208ENST00000489850 MCRS1Q96EZ8 462 aa21.78■■□□□ 1.08
NOM1-208ENST00000489850 ZNF518BQ9C0D4 1074 aa21.78■■□□□ 1.08
NOM1-208ENST00000489850 NAT10Q9H0A0 1025 aaKnown RBP21.78■■□□□ 1.08
NOM1-208ENST00000489850 ATXN3LQ9H3M9 355 aa21.78■■□□□ 1.08
NOM1-208ENST00000489850 SLITRK6Q9H5Y7 841 aa21.78■■□□□ 1.08
NOM1-208ENST00000489850 ZNF334Q9HCZ1 680 aaPredicted RBP21.78■■□□□ 1.08
NOM1-208ENST00000489850 NFE2L3Q9Y4A8 694 aa21.78■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.9 ms