RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489247.1

ATG4A-208, Transcript of autophagy related 4A cysteine peptidase, human

TSL 2

Gene ATG4A, Length 623 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATG4A-208	ENST00000489247	ADM	P35318	185 aa		5.97	□□□□□ -1.45
ATG4A-208	ENST00000489247	AP3M2	P53677	418 aa		5.97	□□□□□ -1.45
ATG4A-208	ENST00000489247	CHMP4BP1	P59074	171 aa		5.97	□□□□□ -1.45
ATG4A-208	ENST00000489247	DLG4	P78352	724 aa		5.97	□□□□□ -1.45
ATG4A-208	ENST00000489247	GCNT1	Q02742	428 aa		5.97	□□□□□ -1.45
ATG4A-208	ENST00000489247	GFPT1	Q06210	699 aa	Predicted RBP	5.97	□□□□□ -1.45
ATG4A-208	ENST00000489247	CAPS	Q13938	189 aa		5.97	□□□□□ -1.45
ATG4A-208	ENST00000489247	MXD4	Q14582	209 aa	Predicted RBP	5.97	□□□□□ -1.45
ATG4A-208	ENST00000489247	INPP5A	Q14642	412 aa		5.97	□□□□□ -1.45
ATG4A-208	ENST00000489247	DRAP1	Q14919	205 aa	Predicted RBP	5.97	□□□□□ -1.45
ATG4A-208	ENST00000489247	PLCB4	Q15147	1175 aa		5.97	□□□□□ -1.45
ATG4A-208	ENST00000489247	ELF2	Q15723	593 aa		5.97	□□□□□ -1.45
ATG4A-208	ENST00000489247	CCL15	Q16663	113 aa		5.97	□□□□□ -1.45
ATG4A-208	ENST00000489247	HSDL1	Q3SXM5	330 aa		5.97	□□□□□ -1.45
ATG4A-208	ENST00000489247	MTERF2	Q49AM1	385 aa		5.97	□□□□□ -1.45
ATG4A-208	ENST00000489247	ZNF484	Q5JVG2	852 aa		5.97	□□□□□ -1.45
ATG4A-208	ENST00000489247	LCE4A	Q5TA78	99 aa		5.97	□□□□□ -1.45
ATG4A-208	ENST00000489247	RNF43	Q68DV7	783 aa		5.97	□□□□□ -1.45
ATG4A-208	ENST00000489247	KRT39	Q6A163	491 aa		5.97	□□□□□ -1.45
ATG4A-208	ENST00000489247	ALKBH5	Q6P6C2	394 aa	Known RBP	5.97	□□□□□ -1.45
ATG4A-208	ENST00000489247	ARMCX2	Q7L311	632 aa		5.97	□□□□□ -1.45
ATG4A-208	ENST00000489247	MAEA	Q7L5Y9	396 aa		5.97	□□□□□ -1.45
ATG4A-208	ENST00000489247	SLFN11	Q7Z7L1	901 aa		5.97	□□□□□ -1.45
ATG4A-208	ENST00000489247	VPS36	Q86VN1	386 aa		5.97	□□□□□ -1.45
ATG4A-208	ENST00000489247	C12orf40	Q86WS4	652 aa		5.97	□□□□□ -1.45
ATG4A-208	ENST00000489247	CBWD2	Q8IUF1	395 aa		5.97	□□□□□ -1.45
ATG4A-208	ENST00000489247	MNS1	Q8NEH6	495 aa		5.97	□□□□□ -1.45
ATG4A-208	ENST00000489247	PPTC7	Q8NI37	304 aa		5.97	□□□□□ -1.45
ATG4A-208	ENST00000489247	UBXN4	Q92575	508 aa		5.97	□□□□□ -1.45
ATG4A-208	ENST00000489247	RUBCN	Q92622	972 aa		5.97	□□□□□ -1.45
ATG4A-208	ENST00000489247	GOLGA1	Q92805	767 aa		5.97	□□□□□ -1.45
ATG4A-208	ENST00000489247	NOX5	Q96PH1	765 aa		5.97	□□□□□ -1.45
ATG4A-208	ENST00000489247	ALS2CR12	Q96Q35	445 aa		5.97	□□□□□ -1.45
ATG4A-208	ENST00000489247	PARK7	Q99497	189 aa	Known RBP	5.97	□□□□□ -1.45
ATG4A-208	ENST00000489247	KIFC3	Q9BVG8	833 aa		5.97	□□□□□ -1.45
ATG4A-208	ENST00000489247	C2orf40	Q9H1Z8	148 aa		5.97	□□□□□ -1.45
ATG4A-208	ENST00000489247	PDCL3	Q9H2J4	239 aa		5.97	□□□□□ -1.45
ATG4A-208	ENST00000489247	AZI2	Q9H6S1	392 aa		5.97	□□□□□ -1.45
ATG4A-208	ENST00000489247	MLXIP	Q9HAP2	919 aa		5.97	□□□□□ -1.45
ATG4A-208	ENST00000489247	FAM53C	Q9NYF3	392 aa		5.97	□□□□□ -1.45
ATG4A-208	ENST00000489247	RAB21	Q9UL25	225 aa		5.97	□□□□□ -1.45
ATG4A-208	ENST00000489247	SNX12	Q9UMY4	172 aa		5.97	□□□□□ -1.45
ATG4A-208	ENST00000489247	EFR3B	Q9Y2G0	817 aa		5.97	□□□□□ -1.45
ATG4A-208	ENST00000489247	SAR1B	Q9Y6B6	198 aa		5.97	□□□□□ -1.45
ATG4A-208	ENST00000489247	CAPN6	Q9Y6Q1	641 aa		5.97	□□□□□ -1.45
ATG4A-208	ENST00000489247	DUSP10	Q9Y6W6	482 aa		5.97	□□□□□ -1.45
ATG4A-208	ENST00000489247	TARSL2	A2RTX5	802 aa	Known RBP	5.96	□□□□□ -1.46
ATG4A-208	ENST00000489247	FAM221A	A4D161	298 aa		5.96	□□□□□ -1.46
ATG4A-208	ENST00000489247	CTAGE15	A4D2H0	777 aa		5.96	□□□□□ -1.46
ATG4A-208	ENST00000489247	SLC15A5	A6NIM6	579 aa		5.96	□□□□□ -1.46
ATG4A-208	ENST00000489247	ZNF233	A6NK53	670 aa		5.96	□□□□□ -1.46
ATG4A-208	ENST00000489247	HNRNPDL	O14979	420 aa	Known RBP	5.96	□□□□□ -1.46
ATG4A-208	ENST00000489247	MSC	O60682	206 aa		5.96	□□□□□ -1.46
ATG4A-208	ENST00000489247	TOM1L1	O75674	476 aa		5.96	□□□□□ -1.46
ATG4A-208	ENST00000489247	MTA2	O94776	668 aa		5.96	□□□□□ -1.46
ATG4A-208	ENST00000489247	ZRANB2	O95218	330 aa	Known RBP eCLIP	5.96	□□□□□ -1.46
ATG4A-208	ENST00000489247	SNAI1	O95863	264 aa	Predicted RBP	5.96	□□□□□ -1.46
ATG4A-208	ENST00000489247	GH1	P01241	217 aa		5.96	□□□□□ -1.46
ATG4A-208	ENST00000489247	C4BPA	P04003	597 aa	Known RBP	5.96	□□□□□ -1.46
ATG4A-208	ENST00000489247	ATP1A1	P05023	1023 aa	Known RBP	5.96	□□□□□ -1.46
ATG4A-208	ENST00000489247	H2AFZ	P0C0S5	128 aa		5.96	□□□□□ -1.46
ATG4A-208	ENST00000489247	TMEM253	P0C7T8	217 aa		5.96	□□□□□ -1.46
ATG4A-208	ENST00000489247	CTAGE8	P0CG41	777 aa		5.96	□□□□□ -1.46
ATG4A-208	ENST00000489247	CYP2C8	P10632	490 aa		5.96	□□□□□ -1.46
ATG4A-208	ENST00000489247	GZMA	P12544	262 aa		5.96	□□□□□ -1.46
ATG4A-208	ENST00000489247	KLRC1	P26715	233 aa		5.96	□□□□□ -1.46
ATG4A-208	ENST00000489247	ADORA2A	P29274	412 aa		5.96	□□□□□ -1.46
ATG4A-208	ENST00000489247	MAPK4	P31152	587 aa		5.96	□□□□□ -1.46
ATG4A-208	ENST00000489247	GCLM	P48507	274 aa		5.96	□□□□□ -1.46
ATG4A-208	ENST00000489247	LIG4	P49917	911 aa		5.96	□□□□□ -1.46
ATG4A-208	ENST00000489247	SOX10	P56693	466 aa		5.96	□□□□□ -1.46
ATG4A-208	ENST00000489247	CKAP4	Q07065	602 aa	Known RBP	5.96	□□□□□ -1.46
ATG4A-208	ENST00000489247	MCL1	Q07820	350 aa		5.96	□□□□□ -1.46
ATG4A-208	ENST00000489247	STRN3	Q13033	797 aa		5.96	□□□□□ -1.46
ATG4A-208	ENST00000489247	PRPF4B	Q13523	1007 aa	Known RBP	5.96	□□□□□ -1.46
ATG4A-208	ENST00000489247	IFI16	Q16666	785 aa	Known RBP	5.96	□□□□□ -1.46
ATG4A-208	ENST00000489247	FAM187B	Q17R55	369 aa		5.96	□□□□□ -1.46
ATG4A-208	ENST00000489247	LY6K	Q17RY6	165 aa		5.96	□□□□□ -1.46
ATG4A-208	ENST00000489247	ERCC6L	Q2NKX8	1250 aa		5.96	□□□□□ -1.46
ATG4A-208	ENST00000489247	ZACN	Q401N2	412 aa		5.96	□□□□□ -1.46
ATG4A-208	ENST00000489247	SEZ6	Q53EL9	994 aa		5.96	□□□□□ -1.46
ATG4A-208	ENST00000489247	PPM1J	Q5JR12	505 aa		5.96	□□□□□ -1.46
ATG4A-208	ENST00000489247	FBXO38	Q6PIJ6	1188 aa		5.96	□□□□□ -1.46
ATG4A-208	ENST00000489247	LRFN4	Q6PJG9	635 aa		5.96	□□□□□ -1.46
ATG4A-208	ENST00000489247	CRELD2	Q6UXH1	353 aa	Predicted RBP	5.96	□□□□□ -1.46
ATG4A-208	ENST00000489247	H2AFV	Q71UI9	128 aa		5.96	□□□□□ -1.46
ATG4A-208	ENST00000489247	UBE3D	Q7Z6J8	389 aa		5.96	□□□□□ -1.46
ATG4A-208	ENST00000489247	CTAGE6	Q86UF2	777 aa		5.96	□□□□□ -1.46
ATG4A-208	ENST00000489247	CREG2	Q8IUH2	290 aa		5.96	□□□□□ -1.46
ATG4A-208	ENST00000489247	BRSK2	Q8IWQ3	736 aa		5.96	□□□□□ -1.46
ATG4A-208	ENST00000489247	FBXO16	Q8IX29	292 aa	Predicted RBP	5.96	□□□□□ -1.46
ATG4A-208	ENST00000489247	CTAGE4	Q8IX94	777 aa		5.96	□□□□□ -1.46
ATG4A-208	ENST00000489247	DHX37	Q8IY37	1157 aa	Known RBP	5.96	□□□□□ -1.46
ATG4A-208	ENST00000489247	C2orf69	Q8N8R5	385 aa		5.96	□□□□□ -1.46
ATG4A-208	ENST00000489247	LRRC57	Q8N9N7	239 aa		5.96	□□□□□ -1.46
ATG4A-208	ENST00000489247	FBXL13	Q8NEE6	735 aa		5.96	□□□□□ -1.46
ATG4A-208	ENST00000489247	ZSWIM2	Q8NEG5	633 aa		5.96	□□□□□ -1.46
ATG4A-208	ENST00000489247	DEPTOR	Q8TB45	409 aa		5.96	□□□□□ -1.46
ATG4A-208	ENST00000489247	LNX1	Q8TBB1	728 aa	Predicted RBP	5.96	□□□□□ -1.46
ATG4A-208	ENST00000489247	HNRNPLL	Q8WVV9	542 aa	Known RBP	5.96	□□□□□ -1.46

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