RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487006.2

BUD23-217, Transcript of BUD23, rRNA methyltransferase and ribosome maturation factor, humanhuman

TSL 3

Gene BUD23, Length 631 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BUD23-217ENST00000487006 TRIM59Q8IWR1 403 aa22.93■■□□□ 1.26
BUD23-217ENST00000487006 SCN4BQ8IWT1 228 aa22.93■■□□□ 1.26
BUD23-217ENST00000487006 CCDC150Q8NCX0 1101 aa22.93■■□□□ 1.26
BUD23-217ENST00000487006 SHKBP1Q8TBC3 707 aa22.93■■□□□ 1.26
BUD23-217ENST00000487006 FUBP3Q96I24 572 aaKnown RBP eCLIP22.93■■□□□ 1.26
BUD23-217ENST00000487006 MAGEC2Q9UBF1 373 aaPredicted RBP22.93■■□□□ 1.26
BUD23-217ENST00000487006 ASB3Q9Y575 518 aa22.93■■□□□ 1.26
BUD23-217ENST00000487006 OBSL1O75147 1896 aa22.93■■□□□ 1.26
BUD23-217ENST00000487006 FAM86C2PA6NEL3 165 aa22.92■■□□□ 1.26
BUD23-217ENST00000487006 CLDN5O00501 218 aa22.92■■□□□ 1.26
BUD23-217ENST00000487006 ZNF197O14709 1029 aa22.92■■□□□ 1.26
BUD23-217ENST00000487006 GNA14O95837 355 aa22.92■■□□□ 1.26
BUD23-217ENST00000487006 CD58P19256 250 aa22.92■■□□□ 1.26
BUD23-217ENST00000487006 MTMR3Q13615 1198 aa22.92■■□□□ 1.26
BUD23-217ENST00000487006 HTR4Q13639 388 aa22.92■■□□□ 1.26
BUD23-217ENST00000487006 TEAD2Q15562 447 aa22.92■■□□□ 1.26
BUD23-217ENST00000487006 ACOT1Q86TX2 421 aa22.92■■□□□ 1.26
BUD23-217ENST00000487006 LEMD2Q8NC56 503 aa22.92■■□□□ 1.26
BUD23-217ENST00000487006 TATDN2Q93075 761 aa22.92■■□□□ 1.26
BUD23-217ENST00000487006 TWNKQ96RR1 684 aa22.92■■□□□ 1.26
BUD23-217ENST00000487006 ARID3AQ99856 593 aa22.92■■□□□ 1.26
BUD23-217ENST00000487006 B3GNT5Q9BYG0 378 aa22.92■■□□□ 1.26
BUD23-217ENST00000487006 ZNF518BQ9C0D4 1074 aa22.92■■□□□ 1.26
BUD23-217ENST00000487006 SORCS3Q9UPU3 1222 aa22.92■■□□□ 1.26
BUD23-217ENST00000487006 COQ4Q9Y3A0 265 aa22.92■■□□□ 1.26
BUD23-217ENST00000487006 A0A1W2PRU2 124 aa22.91■■□□□ 1.26
BUD23-217ENST00000487006 MAGEA11P43364 429 aa22.91■■□□□ 1.26
BUD23-217ENST00000487006 CACNA2D1P54289 1103 aa22.91■■□□□ 1.26
BUD23-217ENST00000487006 MARSP56192 900 aaKnown RBP22.91■■□□□ 1.26
BUD23-217ENST00000487006 RPL10AP62906 217 aaKnown RBP22.91■■□□□ 1.26
BUD23-217ENST00000487006 ZXDAP98168 799 aa22.91■■□□□ 1.26
BUD23-217ENST00000487006 PARM1Q6UWI2 310 aa22.91■■□□□ 1.26
BUD23-217ENST00000487006 GAREM2Q75VX8 874 aa22.91■■□□□ 1.26
BUD23-217ENST00000487006 FGF14Q92915 247 aa22.91■■□□□ 1.26
BUD23-217ENST00000487006 CNOT6LQ96LI5 555 aaKnown RBP22.91■■□□□ 1.26
BUD23-217ENST00000487006 RPP25Q9BUL9 199 aaKnown RBP22.91■■□□□ 1.26
BUD23-217ENST00000487006 C11orf16Q9NQ32 467 aa22.91■■□□□ 1.26
BUD23-217ENST00000487006 TMEM30AQ9NV96 361 aa22.91■■□□□ 1.26
BUD23-217ENST00000487006 ZFP37Q9Y6Q3 630 aaPredicted RBP22.91■■□□□ 1.26
BUD23-217ENST00000487006 NUMBLQ9Y6R0 609 aa22.91■■□□□ 1.26
BUD23-217ENST00000487006 ZNF638Q14966 1978 aaKnown RBP22.9■■□□□ 1.26
BUD23-217ENST00000487006 ANHXE9PGG2 379 aa22.9■■□□□ 1.26
BUD23-217ENST00000487006 FGFR1OPO95684 399 aaKnown RBP22.9■■□□□ 1.26
BUD23-217ENST00000487006 CCDC192P0DO97 292 aa22.9■■□□□ 1.26
BUD23-217ENST00000487006 HMGA1P17096 107 aaKnown RBP22.9■■□□□ 1.26
BUD23-217ENST00000487006 GABRR2P28476 465 aa22.9■■□□□ 1.26
BUD23-217ENST00000487006 INCA1Q0VD86 236 aa22.9■■□□□ 1.26
BUD23-217ENST00000487006 LRMPQ12912 555 aa22.9■■□□□ 1.26
BUD23-217ENST00000487006 TAF12Q16514 161 aa22.9■■□□□ 1.26
BUD23-217ENST00000487006 WDR44Q5JSH3 913 aa22.9■■□□□ 1.26
BUD23-217ENST00000487006 STXBP5Q5T5C0 1151 aa22.9■■□□□ 1.26
BUD23-217ENST00000487006 IRF2BP1Q8IU81 584 aa22.9■■□□□ 1.26
BUD23-217ENST00000487006 CREBRFQ8IUR6 639 aa22.9■■□□□ 1.26
BUD23-217ENST00000487006 EDAQ92838 391 aa22.9■■□□□ 1.26
BUD23-217ENST00000487006 ZSWIM3Q96MP5 696 aa22.9■■□□□ 1.26
BUD23-217ENST00000487006 CYP3A43Q9HB55 503 aa22.9■■□□□ 1.26
BUD23-217ENST00000487006 IL21Q9HBE4 155 aa22.9■■□□□ 1.26
BUD23-217ENST00000487006 IGSF9Q9P2J2 1179 aa22.9■■□□□ 1.26
BUD23-217ENST00000487006 MAGED2Q9UNF1 606 aaPredicted RBP22.9■■□□□ 1.26
BUD23-217ENST00000487006 SLC38A8A6NNN8 435 aa22.89■■□□□ 1.25
BUD23-217ENST00000487006 NARSO43776 548 aaKnown RBP22.89■■□□□ 1.25
BUD23-217ENST00000487006 MICAL2O94851 1124 aa22.89■■□□□ 1.25
BUD23-217ENST00000487006 CCDC130P13994 396 aa22.89■■□□□ 1.25
BUD23-217ENST00000487006 KCNH2Q12809 1159 aa22.89■■□□□ 1.25
BUD23-217ENST00000487006 CCDC183Q5T5S1 534 aa22.89■■□□□ 1.25
BUD23-217ENST00000487006 VSTM1Q6UX27 236 aa22.89■■□□□ 1.25
BUD23-217ENST00000487006 UNC93AQ86WB7 457 aa22.89■■□□□ 1.25
BUD23-217ENST00000487006 WHAMMQ8TF30 809 aa22.89■■□□□ 1.25
BUD23-217ENST00000487006 TNIP3Q96KP6 325 aa22.89■■□□□ 1.25
BUD23-217ENST00000487006 KXD1Q9BQD3 176 aa22.89■■□□□ 1.25
BUD23-217ENST00000487006 FAM49BQ9NUQ9 324 aa22.89■■□□□ 1.25
BUD23-217ENST00000487006 GDE1Q9NZC3 331 aa22.89■■□□□ 1.25
BUD23-217ENST00000487006 TMEM63CQ9P1W3 806 aa22.89■■□□□ 1.25
BUD23-217ENST00000487006 DACH1Q9UI36 760 aa22.89■■□□□ 1.25
BUD23-217ENST00000487006 UTP18Q9Y5J1 556 aaKnown RBP eCLIP22.89■■□□□ 1.25
BUD23-217ENST00000487006 CILPO75339 1184 aa22.88■■□□□ 1.25
BUD23-217ENST00000487006 ERCC5P28715 1186 aaPredicted RBP22.88■■□□□ 1.25
BUD23-217ENST00000487006 GRIK1P39086 918 aa22.88■■□□□ 1.25
BUD23-217ENST00000487006 CYP4F8P98187 520 aa22.88■■□□□ 1.25
BUD23-217ENST00000487006 TDGQ13569 410 aa22.88■■□□□ 1.25
BUD23-217ENST00000487006 TPD52L1Q16890 204 aaPredicted RBP22.88■■□□□ 1.25
BUD23-217ENST00000487006 PAQR9Q6ZVX9 377 aa22.88■■□□□ 1.25
BUD23-217ENST00000487006 FAM35AQ86V20 835 aa22.88■■□□□ 1.25
BUD23-217ENST00000487006 C12orf29Q8N999 325 aa22.88■■□□□ 1.25
BUD23-217ENST00000487006 MED10Q9BTT4 135 aa22.88■■□□□ 1.25
BUD23-217ENST00000487006 ELOVL4Q9GZR5 314 aa22.88■■□□□ 1.25
BUD23-217ENST00000487006 ATXN3LQ9H3M9 355 aa22.88■■□□□ 1.25
BUD23-217ENST00000487006 ZDBF2Q9HCK1 2354 aa22.87■■□□□ 1.25
BUD23-217ENST00000487006 ANAPC1Q9H1A4 1944 aa22.87■■□□□ 1.25
BUD23-217ENST00000487006 F8VP50 259 aa22.87■■□□□ 1.25
BUD23-217ENST00000487006 NOL4O94818 638 aa22.87■■□□□ 1.25
BUD23-217ENST00000487006 AFPP02771 609 aaKnown RBP22.87■■□□□ 1.25
BUD23-217ENST00000487006 CSH1P0DML2 217 aa22.87■■□□□ 1.25
BUD23-217ENST00000487006 CSH2P0DML3 217 aa22.87■■□□□ 1.25
BUD23-217ENST00000487006 HSP90AA4PQ58FG1 418 aa22.87■■□□□ 1.25
BUD23-217ENST00000487006 FAM78AQ5JUQ0 283 aa22.87■■□□□ 1.25
BUD23-217ENST00000487006 TMEM150AQ86TG1 271 aa22.87■■□□□ 1.25
BUD23-217ENST00000487006 FUKQ8N0W3 1084 aa22.87■■□□□ 1.25
BUD23-217ENST00000487006 CRYBG2Q8N1P7 616 aa22.87■■□□□ 1.25
BUD23-217ENST00000487006 SLC44A3Q8N4M1 653 aa22.87■■□□□ 1.25
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