RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486978.5

CTDSPL-208, Transcript of CTD small phosphatase like, humanhuman

TSL 3

Gene CTDSPL, Length 609 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSPL-208ENST00000486978 CAVIN2O95810 425 aa6.95□□□□□ -1.3
CTDSPL-208ENST00000486978 RHOP08100 348 aa6.95□□□□□ -1.3
CTDSPL-208ENST00000486978 CCDC192P0DO97 292 aa6.95□□□□□ -1.3
CTDSPL-208ENST00000486978 GJA1P17302 382 aa6.95□□□□□ -1.3
CTDSPL-208ENST00000486978 ME1P48163 572 aa6.95□□□□□ -1.3
CTDSPL-208ENST00000486978 ACOT2P49753 483 aa6.95□□□□□ -1.3
CTDSPL-208ENST00000486978 CASP5P51878 434 aa6.95□□□□□ -1.3
CTDSPL-208ENST00000486978 AMPD3Q01432 767 aa6.95□□□□□ -1.3
CTDSPL-208ENST00000486978 POU5F1Q01860 360 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
CTDSPL-208ENST00000486978 CREB5Q02930 508 aa6.95□□□□□ -1.3
CTDSPL-208ENST00000486978 DNM1Q05193 864 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
CTDSPL-208ENST00000486978 SPAG1Q07617 926 aa6.95□□□□□ -1.3
CTDSPL-208ENST00000486978 KCNA1Q09470 495 aa6.95□□□□□ -1.3
CTDSPL-208ENST00000486978 MRPL58Q14197 206 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
CTDSPL-208ENST00000486978 TMEM132DQ14C87 1099 aa6.95□□□□□ -1.3
CTDSPL-208ENST00000486978 PON2Q15165 354 aa6.95□□□□□ -1.3
CTDSPL-208ENST00000486978 UVSSAQ2YD98 709 aa6.95□□□□□ -1.3
CTDSPL-208ENST00000486978 DAB2IPQ5VWQ8 1189 aa6.95□□□□□ -1.3
CTDSPL-208ENST00000486978 SPATA1Q5VX52 437 aa6.95□□□□□ -1.3
CTDSPL-208ENST00000486978 JADE1Q6IE81 842 aa6.95□□□□□ -1.3
CTDSPL-208ENST00000486978 SLC8B1Q6J4K2 584 aa6.95□□□□□ -1.3
CTDSPL-208ENST00000486978 TMEM92Q6UXU6 159 aa6.95□□□□□ -1.3
CTDSPL-208ENST00000486978 RTL10Q7L3V2 364 aa6.95□□□□□ -1.3
CTDSPL-208ENST00000486978 RAB44Q7Z6P3 723 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
CTDSPL-208ENST00000486978 PIP4P1Q86T03 277 aa6.95□□□□□ -1.3
CTDSPL-208ENST00000486978 MARCH9Q86YJ5 346 aa6.95□□□□□ -1.3
CTDSPL-208ENST00000486978 SYCP3Q8IZU3 236 aa6.95□□□□□ -1.3
CTDSPL-208ENST00000486978 ZNF843Q8N446 348 aa6.95□□□□□ -1.3
CTDSPL-208ENST00000486978 IQUBQ8NA54 791 aa6.95□□□□□ -1.3
CTDSPL-208ENST00000486978 APPL2Q8NEU8 664 aa6.95□□□□□ -1.3
CTDSPL-208ENST00000486978 BEST2Q8NFU1 509 aa6.95□□□□□ -1.3
CTDSPL-208ENST00000486978 POMGNT1Q8WZA1 660 aa6.95□□□□□ -1.3
CTDSPL-208ENST00000486978 DHX58Q96C10 678 aa6.95□□□□□ -1.3
CTDSPL-208ENST00000486978 ASB16Q96NS5 453 aa6.95□□□□□ -1.3
CTDSPL-208ENST00000486978 MKNK1Q9BUB5 465 aa6.95□□□□□ -1.3
CTDSPL-208ENST00000486978 TRMT61BQ9BVS5 477 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
CTDSPL-208ENST00000486978 TRIM9Q9C026 710 aa6.95□□□□□ -1.3
CTDSPL-208ENST00000486978 IKZF4Q9H2S9 585 aa6.95□□□□□ -1.3
CTDSPL-208ENST00000486978 ASB7Q9H672 318 aa6.95□□□□□ -1.3
CTDSPL-208ENST00000486978 TMEM9BQ9NQ34 198 aa6.95□□□□□ -1.3
CTDSPL-208ENST00000486978 FSCN3Q9NQT6 498 aa6.95□□□□□ -1.3
CTDSPL-208ENST00000486978 KBTBD4Q9NVX7 518 aa6.95□□□□□ -1.3
CTDSPL-208ENST00000486978 FAM13BQ9NYF5 915 aa6.95□□□□□ -1.3
CTDSPL-208ENST00000486978 KCNH3Q9ULD8 1083 aa6.95□□□□□ -1.3
CTDSPL-208ENST00000486978 PCDHA7Q9UN72 937 aa6.95□□□□□ -1.3
CTDSPL-208ENST00000486978 DERAQ9Y315 318 aa6.95□□□□□ -1.3
CTDSPL-208ENST00000486978 PCDHGA5Q9Y5G8 931 aa6.95□□□□□ -1.3
CTDSPL-208ENST00000486978 CEP192Q8TEP8 1941 aa6.95□□□□□ -1.3
CTDSPL-208ENST00000486978 WDR27A2RRH5 827 aa6.94□□□□□ -1.3
CTDSPL-208ENST00000486978 M0QZQ0 153 aa6.94□□□□□ -1.3
CTDSPL-208ENST00000486978 POLR2DO15514 142 aaKnown RBP6.94□□□□□ -1.3
CTDSPL-208ENST00000486978 XYLBO75191 536 aa6.94□□□□□ -1.3
CTDSPL-208ENST00000486978 IL18RAPO95256 599 aa6.94□□□□□ -1.3
CTDSPL-208ENST00000486978 LDHAP00338 332 aaKnown RBP6.94□□□□□ -1.3
CTDSPL-208ENST00000486978 NFICP08651 508 aa6.94□□□□□ -1.3
CTDSPL-208ENST00000486978 POU2F2P09086 479 aa6.94□□□□□ -1.3
CTDSPL-208ENST00000486978 GARTP22102 1010 aa6.94□□□□□ -1.3
CTDSPL-208ENST00000486978 PAX3P23760 479 aa6.94□□□□□ -1.3
CTDSPL-208ENST00000486978 ADSSP30520 456 aa6.94□□□□□ -1.3
CTDSPL-208ENST00000486978 AARSP49588 968 aaKnown RBP eCLIP6.94□□□□□ -1.3
CTDSPL-208ENST00000486978 GUCY2FP51841 1108 aa6.94□□□□□ -1.3
CTDSPL-208ENST00000486978 ASIC1P78348 528 aa6.94□□□□□ -1.3
CTDSPL-208ENST00000486978 SIM1P81133 766 aaPredicted RBP6.94□□□□□ -1.3
CTDSPL-208ENST00000486978 ROR1Q01973 937 aa6.94□□□□□ -1.3
CTDSPL-208ENST00000486978 SRSF1Q07955 248 aaKnown RBP eCLIP6.94□□□□□ -1.3
CTDSPL-208ENST00000486978 CCINQ13939 588 aa6.94□□□□□ -1.3
CTDSPL-208ENST00000486978 CTXN3Q4LDR2 81 aa6.94□□□□□ -1.3
CTDSPL-208ENST00000486978 RESP18Q5W5W9 173 aa6.94□□□□□ -1.3
CTDSPL-208ENST00000486978 ZNF280DQ6N043 979 aa6.94□□□□□ -1.3
CTDSPL-208ENST00000486978 CNNM4Q6P4Q7 775 aa6.94□□□□□ -1.3
CTDSPL-208ENST00000486978 CRELD2Q6UXH1 353 aaPredicted RBP6.94□□□□□ -1.3
CTDSPL-208ENST00000486978 STXBP4Q6ZWJ1 553 aa6.94□□□□□ -1.3
CTDSPL-208ENST00000486978 TMEM130Q8N3G9 435 aa6.94□□□□□ -1.3
CTDSPL-208ENST00000486978 PNPLA1Q8N8W4 532 aa6.94□□□□□ -1.3
CTDSPL-208ENST00000486978 ZNF461Q8TAF7 563 aa6.94□□□□□ -1.3
CTDSPL-208ENST00000486978 CHFRQ96EP1 664 aa6.94□□□□□ -1.3
CTDSPL-208ENST00000486978 PYM1Q9BRP8 204 aaKnown RBP6.94□□□□□ -1.3
CTDSPL-208ENST00000486978 FGFBP2Q9BYJ0 223 aa6.94□□□□□ -1.3
CTDSPL-208ENST00000486978 TMEM206Q9H813 350 aa6.94□□□□□ -1.3
CTDSPL-208ENST00000486978 TRPV5Q9NQA5 729 aa6.94□□□□□ -1.3
CTDSPL-208ENST00000486978 FBXL5Q9UKA1 691 aa6.94□□□□□ -1.3
CTDSPL-208ENST00000486978 RCOR1Q9UKL0 485 aa6.94□□□□□ -1.3
CTDSPL-208ENST00000486978 C2CD2Q9Y426 696 aa6.94□□□□□ -1.3
CTDSPL-208ENST00000486978 ANK1P16157 1881 aa6.94□□□□□ -1.3
CTDSPL-208ENST00000486978 PTPN13Q12923 2485 aa6.93□□□□□ -1.3
CTDSPL-208ENST00000486978 BOD1L1Q8NFC6 3051 aa6.93□□□□□ -1.3
CTDSPL-208ENST00000486978 ANO9A1A5B4 782 aa6.93□□□□□ -1.3
CTDSPL-208ENST00000486978 ARHGEF37A1IGU5 675 aa6.93□□□□□ -1.3
CTDSPL-208ENST00000486978 MYBPHLA2RUH7 354 aa6.93□□□□□ -1.3
CTDSPL-208ENST00000486978 ANTXRLA6NF34 631 aa6.93□□□□□ -1.3
CTDSPL-208ENST00000486978 PPEF2O14830 753 aa6.93□□□□□ -1.3
CTDSPL-208ENST00000486978 KIAA0391O15091 583 aaKnown RBP6.93□□□□□ -1.3
CTDSPL-208ENST00000486978 EIF3DO15371 548 aaKnown RBP eCLIP6.93□□□□□ -1.3
CTDSPL-208ENST00000486978 ARHGAP6O43182 974 aa6.93□□□□□ -1.3
CTDSPL-208ENST00000486978 PRPF6O94906 941 aaKnown RBP6.93□□□□□ -1.3
CTDSPL-208ENST00000486978 ABLIM3O94929 683 aa6.93□□□□□ -1.3
CTDSPL-208ENST00000486978 OAZ2O95190 189 aa6.93□□□□□ -1.3
CTDSPL-208ENST00000486978 ODC1P11926 461 aa6.93□□□□□ -1.3
CTDSPL-208ENST00000486978 CPB1P15086 417 aa6.93□□□□□ -1.3
CTDSPL-208ENST00000486978 ATF2P15336 505 aa6.93□□□□□ -1.3
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.3 ms