RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000485019.1

RBM34-208, Transcript of RNA binding motif protein 34, human

TSL 3

Gene RBM34, Length 409 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBM34-208	ENST00000485019	CLDN5	O00501	218 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RBM34-208	ENST00000485019	KRT5	P13647	590 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RBM34-208	ENST00000485019	GRIK1	P39086	918 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RBM34-208	ENST00000485019	KCNQ1	P51787	676 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RBM34-208	ENST00000485019	EPHB3	P54753	998 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RBM34-208	ENST00000485019	VEPH1	Q14D04	833 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RBM34-208	ENST00000485019	TAF12	Q16514	161 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RBM34-208	ENST00000485019	CFAP221	Q4G0U5	840 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RBM34-208	ENST00000485019	IQCE	Q6IPM2	695 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RBM34-208	ENST00000485019	GJB7	Q6PEY0	223 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RBM34-208	ENST00000485019	TMEM270	Q6UE05	265 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RBM34-208	ENST00000485019	ENOSF1	Q7L5Y1	443 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RBM34-208	ENST00000485019	GRASP	Q7Z6J2	395 aa	Predicted RBP	13.56	□□□□□ -0.24
RBM34-208	ENST00000485019	PHF6	Q8IWS0	365 aa	Known RBP eCLIP	13.56	□□□□□ -0.24
RBM34-208	ENST00000485019	CRYBG2	Q8N1P7	616 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RBM34-208	ENST00000485019	RNF214	Q8ND24	703 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RBM34-208	ENST00000485019	WHAMM	Q8TF30	809 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RBM34-208	ENST00000485019	GIPC2	Q8TF65	315 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RBM34-208	ENST00000485019	ZNF707	Q96C28	371 aa	Predicted RBP	13.56	□□□□□ -0.24
RBM34-208	ENST00000485019	CYFIP2	Q96F07	1278 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RBM34-208	ENST00000485019	B3GNT5	Q9BYG0	378 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RBM34-208	ENST00000485019	RHOBTB2	Q9BYZ6	727 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RBM34-208	ENST00000485019	ABCB6	Q9NP58	842 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RBM34-208	ENST00000485019	FAM49B	Q9NUQ9	324 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RBM34-208	ENST00000485019	CDH22	Q9UJ99	828 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RBM34-208	ENST00000485019	DNAJC12	Q9UKB3	198 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RBM34-208	ENST00000485019	PLXNA3	P51805	1871 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RBM34-208	ENST00000485019	CCDC130	P13994	396 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RBM34-208	ENST00000485019	IL9	P15248	144 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RBM34-208	ENST00000485019	CD19	P15391	556 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RBM34-208	ENST00000485019	PTPN2	P17706	415 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RBM34-208	ENST00000485019	ANXA13	P27216	316 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RBM34-208	ENST00000485019	ADORA2B	P29275	332 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RBM34-208	ENST00000485019	USP8	P40818	1118 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RBM34-208	ENST00000485019	GPR15	P49685	360 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RBM34-208	ENST00000485019	RAD23B	P54727	409 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RBM34-208	ENST00000485019	RPL10A	P62906	217 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
RBM34-208	ENST00000485019	CBX2	Q14781	532 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
RBM34-208	ENST00000485019	DDR2	Q16832	855 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RBM34-208	ENST00000485019	APTX	Q7Z2E3	356 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
RBM34-208	ENST00000485019	C12orf29	Q8N999	325 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RBM34-208	ENST00000485019	SLC4A11	Q8NBS3	891 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RBM34-208	ENST00000485019	FEZF2	Q8TBJ5	459 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RBM34-208	ENST00000485019	SLC2A14	Q8TDB8	520 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RBM34-208	ENST00000485019	KREMEN1	Q96MU8	473 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RBM34-208	ENST00000485019	NECTIN4	Q96NY8	510 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RBM34-208	ENST00000485019	ASB2	Q96Q27	587 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RBM34-208	ENST00000485019	CORO1B	Q9BR76	489 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RBM34-208	ENST00000485019	ZNF518B	Q9C0D4	1074 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RBM34-208	ENST00000485019	SIX2	Q9NPC8	291 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RBM34-208	ENST00000485019	PRRC2B	Q5JSZ5	2229 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
RBM34-208	ENST00000485019	TRIM66	O15016	1216 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RBM34-208	ENST00000485019	ACO1	P21399	889 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
RBM34-208	ENST00000485019	MAGEA11	P43364	429 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RBM34-208	ENST00000485019	KLK7	P49862	253 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RBM34-208	ENST00000485019	NTHL1	P78549	312 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RBM34-208	ENST00000485019	FANCC	Q00597	558 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RBM34-208	ENST00000485019	RAPGEF1	Q13905	1077 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RBM34-208	ENST00000485019	SYCP1	Q15431	976 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RBM34-208	ENST00000485019	KLHDC7A	Q5VTJ3	777 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RBM34-208	ENST00000485019	SDHAF4	Q5VUM1	108 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RBM34-208	ENST00000485019	VSTM1	Q6UX27	236 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RBM34-208	ENST00000485019	ITIH5	Q86UX2	942 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RBM34-208	ENST00000485019	FAM35A	Q86V20	835 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RBM34-208	ENST00000485019	UBR7	Q8N806	425 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RBM34-208	ENST00000485019	RBBP8NL	Q8NC74	664 aa	Predicted RBP	13.54	□□□□□ -0.24
RBM34-208	ENST00000485019	GPR152	Q8TDT2	470 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RBM34-208	ENST00000485019	SUSD6	Q92537	303 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RBM34-208	ENST00000485019	JAKMIP2	Q96AA8	810 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RBM34-208	ENST00000485019	ANP32E	Q9BTT0	268 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RBM34-208	ENST00000485019	RTN4	Q9NQC3	1192 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
RBM34-208	ENST00000485019	HCFC1R1	Q9NWW0	138 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RBM34-208	ENST00000485019	CEP72	Q9P209	647 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RBM34-208	ENST00000485019	DNMT3B	Q9UBC3	853 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
RBM34-208	ENST00000485019	ASB3	Q9Y575	518 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RBM34-208	ENST00000485019	TRANK1	O15050	2925 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RBM34-208	ENST00000485019	RNF225	M0QZC1	329 aa	Predicted RBP	13.53	□□□□□ -0.24
RBM34-208	ENST00000485019	TEX33	O43247	280 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RBM34-208	ENST00000485019	AP1G2	O75843	785 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RBM34-208	ENST00000485019	SLC34A2	O95436	690 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RBM34-208	ENST00000485019	POU2F2	P09086	479 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RBM34-208	ENST00000485019	PAEP	P09466	180 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RBM34-208	ENST00000485019	VDR	P11473	427 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RBM34-208	ENST00000485019	MYL4	P12829	197 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RBM34-208	ENST00000485019	ATF6	P18850	670 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RBM34-208	ENST00000485019	UBASH3A	P57075	661 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RBM34-208	ENST00000485019	SMAD2	Q15796	467 aa	Known RBP	13.53	□□□□□ -0.24
RBM34-208	ENST00000485019	PABPC1L	Q4VXU2	614 aa	Known RBP	13.53	□□□□□ -0.24
RBM34-208	ENST00000485019	SGO2	Q562F6	1265 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RBM34-208	ENST00000485019	PPP1R26	Q5T8A7	1209 aa	Predicted RBP	13.53	□□□□□ -0.24
RBM34-208	ENST00000485019	CYP4A22	Q5TCH4	519 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RBM34-208	ENST00000485019	PDZD4	Q76G19	769 aa	Predicted RBP	13.53	□□□□□ -0.24
RBM34-208	ENST00000485019	DNAJB7	Q7Z6W7	309 aa	Predicted RBP	13.53	□□□□□ -0.24
RBM34-208	ENST00000485019	FUK	Q8N0W3	1084 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RBM34-208	ENST00000485019	NEK11	Q8NG66	645 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RBM34-208	ENST00000485019	SMARCD1	Q96GM5	515 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RBM34-208	ENST00000485019	HNRNPAB	Q99729	332 aa	Known RBP	13.53	□□□□□ -0.24
RBM34-208	ENST00000485019	POMK	Q9H5K3	350 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RBM34-208	ENST00000485019	WDR6	Q9NNW5	1121 aa	Known RBP	13.53	□□□□□ -0.24
RBM34-208	ENST00000485019	PLCB1	Q9NQ66	1216 aa		13.53	□□□□□ -0.24

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