RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000480155.1

SHOC2-204, Transcript of SHOC2, leucine rich repeat scaffold protein, human

TSL 2

Gene SHOC2, Length 650 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SHOC2-204	ENST00000480155	FAM136A	Q96C01	138 aa		4.17	□□□□□ -1.74
SHOC2-204	ENST00000480155	OSBPL9	Q96SU4	736 aa		4.17	□□□□□ -1.74
SHOC2-204	ENST00000480155	MS4A7	Q9GZW8	240 aa	Predicted RBP	4.17	□□□□□ -1.74
SHOC2-204	ENST00000480155	PRDM13	Q9H4Q3	707 aa		4.17	□□□□□ -1.74
SHOC2-204	ENST00000480155	RIOX1	Q9H6W3	641 aa		4.17	□□□□□ -1.74
SHOC2-204	ENST00000480155	DKK3	Q9UBP4	350 aa		4.17	□□□□□ -1.74
SHOC2-204	ENST00000480155	SERTAD3	Q9UJW9	196 aa		4.17	□□□□□ -1.74
SHOC2-204	ENST00000480155	FAM50B	Q9Y247	325 aa		4.17	□□□□□ -1.74
SHOC2-204	ENST00000480155	SSX2IP	Q9Y2D8	614 aa		4.17	□□□□□ -1.74
SHOC2-204	ENST00000480155	WDR27	A2RRH5	827 aa		4.16	□□□□□ -1.74
SHOC2-204	ENST00000480155	GOLIM4	O00461	696 aa		4.16	□□□□□ -1.74
SHOC2-204	ENST00000480155	MPPED1	O15442	326 aa		4.16	□□□□□ -1.74
SHOC2-204	ENST00000480155	MARCH6	O60337	910 aa		4.16	□□□□□ -1.74
SHOC2-204	ENST00000480155	SOAT2	O75908	522 aa		4.16	□□□□□ -1.74
SHOC2-204	ENST00000480155	MAP4K4	O95819	1239 aa	Predicted RBP	4.16	□□□□□ -1.74
SHOC2-204	ENST00000480155	HRG	P04196	525 aa		4.16	□□□□□ -1.74
SHOC2-204	ENST00000480155	TH	P07101	528 aa		4.16	□□□□□ -1.74
SHOC2-204	ENST00000480155	MYF5	P13349	255 aa		4.16	□□□□□ -1.74
SHOC2-204	ENST00000480155	VIPR2	P41587	438 aa		4.16	□□□□□ -1.74
SHOC2-204	ENST00000480155	CLCN2	P51788	898 aa		4.16	□□□□□ -1.74
SHOC2-204	ENST00000480155	CACNB3	P54284	484 aa		4.16	□□□□□ -1.74
SHOC2-204	ENST00000480155	FAM193A	P78312	1265 aa		4.16	□□□□□ -1.74
SHOC2-204	ENST00000480155	ITIH3	Q06033	890 aa		4.16	□□□□□ -1.74
SHOC2-204	ENST00000480155	SEMA5A	Q13591	1074 aa		4.16	□□□□□ -1.74
SHOC2-204	ENST00000480155	POLD3	Q15054	466 aa	Predicted RBP	4.16	□□□□□ -1.74
SHOC2-204	ENST00000480155	CNGA2	Q16280	664 aa		4.16	□□□□□ -1.74
SHOC2-204	ENST00000480155	KAZN	Q674X7	775 aa		4.16	□□□□□ -1.74
SHOC2-204	ENST00000480155	RGS7BP	Q6MZT1	257 aa	Predicted RBP	4.16	□□□□□ -1.74
SHOC2-204	ENST00000480155	SESTD1	Q86VW0	696 aa		4.16	□□□□□ -1.74
SHOC2-204	ENST00000480155	FKBP10	Q96AY3	582 aa		4.16	□□□□□ -1.74
SHOC2-204	ENST00000480155	C8orf48	Q96LL4	319 aa		4.16	□□□□□ -1.74
SHOC2-204	ENST00000480155	MESP1	Q9BRJ9	268 aa		4.16	□□□□□ -1.74
SHOC2-204	ENST00000480155	CXorf36	Q9H7Y0	433 aa		4.16	□□□□□ -1.74
SHOC2-204	ENST00000480155	IL17RB	Q9NRM6	502 aa		4.16	□□□□□ -1.74
SHOC2-204	ENST00000480155	ARHGEF17	Q96PE2	2063 aa	Predicted RBP	4.15	□□□□□ -1.74
SHOC2-204	ENST00000480155	TRIM43B	A6NCK2	446 aa		4.15	□□□□□ -1.75
SHOC2-204	ENST00000480155	LINC00473	A8K010	186 aa		4.15	□□□□□ -1.75
SHOC2-204	ENST00000480155	FRS3	O43559	492 aa		4.15	□□□□□ -1.75
SHOC2-204	ENST00000480155	MGEA5	O60502	916 aa		4.15	□□□□□ -1.75
SHOC2-204	ENST00000480155	NR2F6	P10588	404 aa		4.15	□□□□□ -1.75
SHOC2-204	ENST00000480155	ZKSCAN1	P17029	563 aa	Predicted RBP	4.15	□□□□□ -1.75
SHOC2-204	ENST00000480155	ADORA2A	P29274	412 aa		4.15	□□□□□ -1.75
SHOC2-204	ENST00000480155	NXPH1	P58417	271 aa		4.15	□□□□□ -1.75
SHOC2-204	ENST00000480155	RPS16	P62249	146 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
SHOC2-204	ENST00000480155	FMO1	Q01740	532 aa		4.15	□□□□□ -1.75
SHOC2-204	ENST00000480155	MYO1E	Q12965	1108 aa		4.15	□□□□□ -1.75
SHOC2-204	ENST00000480155	RAB32	Q13637	225 aa		4.15	□□□□□ -1.75
SHOC2-204	ENST00000480155	PTPRR	Q15256	657 aa		4.15	□□□□□ -1.75
SHOC2-204	ENST00000480155	TBCC	Q15814	346 aa		4.15	□□□□□ -1.75
SHOC2-204	ENST00000480155	PLA1A	Q53H76	456 aa		4.15	□□□□□ -1.75
SHOC2-204	ENST00000480155	PRR16	Q569H4	304 aa		4.15	□□□□□ -1.75
SHOC2-204	ENST00000480155	MAVS	Q7Z434	540 aa		4.15	□□□□□ -1.75
SHOC2-204	ENST00000480155	SIMC1	Q8NDZ2	872 aa		4.15	□□□□□ -1.75
SHOC2-204	ENST00000480155	ATG4A	Q8WYN0	398 aa		4.15	□□□□□ -1.75
SHOC2-204	ENST00000480155	RFK	Q969G6	155 aa		4.15	□□□□□ -1.75
SHOC2-204	ENST00000480155	TRIM43	Q96BQ3	446 aa	Predicted RBP	4.15	□□□□□ -1.75
SHOC2-204	ENST00000480155	APIP	Q96GX9	242 aa		4.15	□□□□□ -1.75
SHOC2-204	ENST00000480155	PGBD1	Q96JS3	809 aa		4.15	□□□□□ -1.75
SHOC2-204	ENST00000480155	PDLIM2	Q96JY6	352 aa		4.15	□□□□□ -1.75
SHOC2-204	ENST00000480155	PTDSS2	Q9BVG9	487 aa		4.15	□□□□□ -1.75
SHOC2-204	ENST00000480155	LRRC27	Q9C0I9	530 aa		4.15	□□□□□ -1.75
SHOC2-204	ENST00000480155	KLC4	Q9NSK0	619 aa		4.15	□□□□□ -1.75
SHOC2-204	ENST00000480155	COL20A1	Q9P218	1284 aa		4.15	□□□□□ -1.75
SHOC2-204	ENST00000480155	OGDHL	Q9ULD0	1010 aa		4.15	□□□□□ -1.75
SHOC2-204	ENST00000480155	NDRG4	Q9ULP0	352 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
SHOC2-204	ENST00000480155	ST3GAL5	Q9UNP4	418 aa		4.15	□□□□□ -1.75
SHOC2-204	ENST00000480155	SHOC2	Q9UQ13	582 aa		4.15	□□□□□ -1.75
SHOC2-204	ENST00000480155	UTP18	Q9Y5J1	556 aa	Known RBP eCLIP	4.15	□□□□□ -1.75
SHOC2-204	ENST00000480155	ZAR1L	A6NP61	321 aa		4.14	□□□□□ -1.75
SHOC2-204	ENST00000480155	ISM1	B1AKI9	464 aa		4.14	□□□□□ -1.75
SHOC2-204	ENST00000480155		F8W8V4	182 aa		4.14	□□□□□ -1.75
SHOC2-204	ENST00000480155	PQBP1	O60828	265 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
SHOC2-204	ENST00000480155	CSF1R	P07333	972 aa		4.14	□□□□□ -1.75
SHOC2-204	ENST00000480155	PCSK6	P29122	969 aa		4.14	□□□□□ -1.75
SHOC2-204	ENST00000480155	LIPA	P38571	399 aa		4.14	□□□□□ -1.75
SHOC2-204	ENST00000480155	GRIA3	P42263	894 aa		4.14	□□□□□ -1.75
SHOC2-204	ENST00000480155	RARRES1	P49788	294 aa		4.14	□□□□□ -1.75
SHOC2-204	ENST00000480155	KRT17	Q04695	432 aa		4.14	□□□□□ -1.75
SHOC2-204	ENST00000480155	ZNF362	Q5T0B9	420 aa	Predicted RBP	4.14	□□□□□ -1.75
SHOC2-204	ENST00000480155	STRIP1	Q5VSL9	837 aa		4.14	□□□□□ -1.75
SHOC2-204	ENST00000480155	ICE2	Q659A1	982 aa		4.14	□□□□□ -1.75
SHOC2-204	ENST00000480155	GAS2L3	Q86XJ1	694 aa		4.14	□□□□□ -1.75
SHOC2-204	ENST00000480155	TMEM171	Q8WVE6	324 aa		4.14	□□□□□ -1.75
SHOC2-204	ENST00000480155	MOGAT1	Q96PD6	335 aa		4.14	□□□□□ -1.75
SHOC2-204	ENST00000480155	STK31	Q9BXU1	1019 aa		4.14	□□□□□ -1.75
SHOC2-204	ENST00000480155	ZNF518B	Q9C0D4	1074 aa		4.14	□□□□□ -1.75
SHOC2-204	ENST00000480155	ZNF287	Q9HBT7	754 aa		4.14	□□□□□ -1.75
SHOC2-204	ENST00000480155	KIAA1586	Q9HCI6	787 aa		4.14	□□□□□ -1.75
SHOC2-204	ENST00000480155	DDX21	Q9NR30	783 aa	Known RBP eCLIP	4.14	□□□□□ -1.75
SHOC2-204	ENST00000480155	AFF4	Q9UHB7	1163 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
SHOC2-204	ENST00000480155	TLK1	Q9UKI8	766 aa		4.14	□□□□□ -1.75
SHOC2-204	ENST00000480155	CORO2B	Q9UQ03	480 aa		4.14	□□□□□ -1.75
SHOC2-204	ENST00000480155	COL11A2	P13942	1736 aa	Predicted RBP	4.14	□□□□□ -1.75
SHOC2-204	ENST00000480155	FER1L4	A9Z1Z3	1794 aa		4.14	□□□□□ -1.75
SHOC2-204	ENST00000480155		H7C4K7	107 aa		4.13	□□□□□ -1.75
SHOC2-204	ENST00000480155	PYCARD-AS1	I3L0S3	204 aa		4.13	□□□□□ -1.75
SHOC2-204	ENST00000480155	APAF1	O14727	1248 aa		4.13	□□□□□ -1.75
SHOC2-204	ENST00000480155	VNN1	O95497	513 aa		4.13	□□□□□ -1.75
SHOC2-204	ENST00000480155	IL1R1	P14778	569 aa		4.13	□□□□□ -1.75
SHOC2-204	ENST00000480155	KCNA3	P22001	575 aa		4.13	□□□□□ -1.75

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