RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466037.6

HOXB-AS3-204, HOXB cluster antisense RNA 3, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene HOXB-AS3, Length 522 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB-AS3-204ENST00000466037 VSTM1Q6UX27 236 aa21.1■□□□□ 0.97
HOXB-AS3-204ENST00000466037 TNIP3Q96KP6 325 aa21.1■□□□□ 0.97
HOXB-AS3-204ENST00000466037 ASB16Q96NS5 453 aa21.1■□□□□ 0.97
HOXB-AS3-204ENST00000466037 LRRC3Q9BY71 257 aa21.1■□□□□ 0.97
HOXB-AS3-204ENST00000466037 DNAI2Q9GZS0 605 aa21.1■□□□□ 0.97
HOXB-AS3-204ENST00000466037 CRTAC1Q9NQ79 661 aa21.1■□□□□ 0.97
HOXB-AS3-204ENST00000466037 SLC2A4RGQ9NR83 387 aa21.1■□□□□ 0.97
HOXB-AS3-204ENST00000466037 UXTQ9UBK9 157 aaPredicted RBP21.1■□□□□ 0.97
HOXB-AS3-204ENST00000466037 ATP8B3O60423 1300 aa21.09■□□□□ 0.97
HOXB-AS3-204ENST00000466037 NOTCH4Q99466 2003 aa21.09■□□□□ 0.97
HOXB-AS3-204ENST00000466037 TRIM49BA6NDI0 452 aa21.09■□□□□ 0.97
HOXB-AS3-204ENST00000466037 MOSPD3O75425 235 aa21.09■□□□□ 0.97
HOXB-AS3-204ENST00000466037 ASS1P00966 412 aaKnown RBP21.09■□□□□ 0.97
HOXB-AS3-204ENST00000466037 GRIK1P39086 918 aa21.09■□□□□ 0.97
HOXB-AS3-204ENST00000466037 RAP1GAPP47736 663 aa21.09■□□□□ 0.97
HOXB-AS3-204ENST00000466037 GPR15P49685 360 aa21.09■□□□□ 0.97
HOXB-AS3-204ENST00000466037 MXI1P50539 228 aa21.09■□□□□ 0.97
HOXB-AS3-204ENST00000466037 CDH8P55286 799 aa21.09■□□□□ 0.97
HOXB-AS3-204ENST00000466037 PPP3CAQ08209 521 aa21.09■□□□□ 0.97
HOXB-AS3-204ENST00000466037 MORC3Q14149 939 aa21.09■□□□□ 0.97
HOXB-AS3-204ENST00000466037 CCDC142Q17RM4 750 aa21.09■□□□□ 0.97
HOXB-AS3-204ENST00000466037 GPR158Q5T848 1215 aa21.09■□□□□ 0.97
HOXB-AS3-204ENST00000466037 SDHAF4Q5VUM1 108 aa21.09■□□□□ 0.97
HOXB-AS3-204ENST00000466037 TANGO2Q6ICL3 276 aa21.09■□□□□ 0.97
HOXB-AS3-204ENST00000466037 GAREM2Q75VX8 874 aa21.09■□□□□ 0.97
HOXB-AS3-204ENST00000466037 B3GALNT2Q8NCR0 500 aa21.09■□□□□ 0.97
HOXB-AS3-204ENST00000466037 FLCNQ8NFG4 579 aa21.09■□□□□ 0.97
HOXB-AS3-204ENST00000466037 E2F7Q96AV8 911 aa21.09■□□□□ 0.97
HOXB-AS3-204ENST00000466037 PCED1BQ96HM7 432 aa21.09■□□□□ 0.97
HOXB-AS3-204ENST00000466037 ZSWIM3Q96MP5 696 aa21.09■□□□□ 0.97
HOXB-AS3-204ENST00000466037 UTP3Q9NQZ2 479 aaKnown RBP eCLIP21.09■□□□□ 0.97
HOXB-AS3-204ENST00000466037 ARMCX3Q9UH62 379 aaPredicted RBP21.09■□□□□ 0.97
HOXB-AS3-204ENST00000466037 CA14Q9ULX7 337 aa21.09■□□□□ 0.97
HOXB-AS3-204ENST00000466037 DPYSL4O14531 572 aa21.08■□□□□ 0.97
HOXB-AS3-204ENST00000466037 TRIM66O15016 1216 aa21.08■□□□□ 0.97
HOXB-AS3-204ENST00000466037 PDGFBP01127 241 aaPredicted RBP21.08■□□□□ 0.97
HOXB-AS3-204ENST00000466037 BDNFP23560 247 aa21.08■□□□□ 0.97
HOXB-AS3-204ENST00000466037 PMS1P54277 932 aaKnown RBP21.08■□□□□ 0.97
HOXB-AS3-204ENST00000466037 NOP14P78316 857 aaKnown RBP21.08■□□□□ 0.97
HOXB-AS3-204ENST00000466037 GPC5P78333 572 aa21.08■□□□□ 0.97
HOXB-AS3-204ENST00000466037 TRIML1Q8N9V2 468 aa21.08■□□□□ 0.97
HOXB-AS3-204ENST00000466037 TAS1R2Q8TE23 839 aa21.08■□□□□ 0.97
HOXB-AS3-204ENST00000466037 NELFBQ8WX92 580 aa21.08■□□□□ 0.97
HOXB-AS3-204ENST00000466037 ELMO3Q96BJ8 720 aa21.08■□□□□ 0.97
HOXB-AS3-204ENST00000466037 GBP4Q96PP9 640 aa21.08■□□□□ 0.97
HOXB-AS3-204ENST00000466037 ELOVL4Q9GZR5 314 aa21.08■□□□□ 0.97
HOXB-AS3-204ENST00000466037 DPEP3Q9H4B8 488 aa21.08■□□□□ 0.97
HOXB-AS3-204ENST00000466037 ZMYM5Q9UJ78 669 aa21.08■□□□□ 0.97
HOXB-AS3-204ENST00000466037 CTNND2Q9UQB3 1225 aa21.08■□□□□ 0.97
HOXB-AS3-204ENST00000466037 ZDBF2Q9HCK1 2354 aa21.08■□□□□ 0.96
HOXB-AS3-204ENST00000466037 SLC38A8A6NNN8 435 aa21.07■□□□□ 0.96
HOXB-AS3-204ENST00000466037 CCDC40Q4G0X9 1142 aa21.07■□□□□ 0.96
HOXB-AS3-204ENST00000466037 WDR44Q5JSH3 913 aa21.07■□□□□ 0.96
HOXB-AS3-204ENST00000466037 SPOPLQ6IQ16 392 aa21.07■□□□□ 0.96
HOXB-AS3-204ENST00000466037 YAF2Q8IY57 180 aa21.07■□□□□ 0.96
HOXB-AS3-204ENST00000466037 FBXL13Q8NEE6 735 aa21.07■□□□□ 0.96
HOXB-AS3-204ENST00000466037 MRPS31Q92665 395 aaKnown RBP21.07■□□□□ 0.96
HOXB-AS3-204ENST00000466037 SHDQ96IW2 340 aa21.07■□□□□ 0.96
HOXB-AS3-204ENST00000466037 CEP63Q96MT8 703 aa21.07■□□□□ 0.96
HOXB-AS3-204ENST00000466037 MED10Q9BTT4 135 aa21.07■□□□□ 0.96
HOXB-AS3-204ENST00000466037 TRMT61BQ9BVS5 477 aaKnown RBP21.07■□□□□ 0.96
HOXB-AS3-204ENST00000466037 METTL14Q9HCE5 456 aaKnown RBP21.07■□□□□ 0.96
HOXB-AS3-204ENST00000466037 ARHGEF3Q9NR81 526 aa21.07■□□□□ 0.96
HOXB-AS3-204ENST00000466037 EHD2Q9NZN4 543 aa21.07■□□□□ 0.96
HOXB-AS3-204ENST00000466037 KIAA1468Q9P260 1216 aa21.07■□□□□ 0.96
HOXB-AS3-204ENST00000466037 NRG2O14511 850 aaPredicted RBP21.06■□□□□ 0.96
HOXB-AS3-204ENST00000466037 CD44P16070 742 aaKnown RBP21.06■□□□□ 0.96
HOXB-AS3-204ENST00000466037 FCARP24071 287 aa21.06■□□□□ 0.96
HOXB-AS3-204ENST00000466037 DDX6P26196 483 aaKnown RBP eCLIP21.06■□□□□ 0.96
HOXB-AS3-204ENST00000466037 CYP4F8P98187 520 aa21.06■□□□□ 0.96
HOXB-AS3-204ENST00000466037 PAK1Q13153 545 aa21.06■□□□□ 0.96
HOXB-AS3-204ENST00000466037 STXBP5Q5T5C0 1151 aa21.06■□□□□ 0.96
HOXB-AS3-204ENST00000466037 ASTLQ6HA08 431 aaPredicted RBP21.06■□□□□ 0.96
HOXB-AS3-204ENST00000466037 ZC3H3Q8IXZ2 948 aaKnown RBP21.06■□□□□ 0.96
HOXB-AS3-204ENST00000466037 DEPDC1BQ8WUY9 529 aa21.06■□□□□ 0.96
HOXB-AS3-204ENST00000466037 CEP295NLQ96MC4 621 aa21.06■□□□□ 0.96
HOXB-AS3-204ENST00000466037 NIF3L1Q9GZT8 377 aa21.06■□□□□ 0.96
HOXB-AS3-204ENST00000466037 TASP1Q9H6P5 420 aa21.06■□□□□ 0.96
HOXB-AS3-204ENST00000466037 BRD9Q9H8M2 597 aa21.06■□□□□ 0.96
HOXB-AS3-204ENST00000466037 CYP3A43Q9HB55 503 aa21.06■□□□□ 0.96
HOXB-AS3-204ENST00000466037 TRPV4Q9HBA0 871 aa21.06■□□□□ 0.96
HOXB-AS3-204ENST00000466037 PPP1R3GB7ZBB8 358 aa21.05■□□□□ 0.96
HOXB-AS3-204ENST00000466037 NOL4O94818 638 aa21.05■□□□□ 0.96
HOXB-AS3-204ENST00000466037 HMGA1P17096 107 aaKnown RBP21.05■□□□□ 0.96
HOXB-AS3-204ENST00000466037 PSMC3P17980 439 aa21.05■□□□□ 0.96
HOXB-AS3-204ENST00000466037 VIPR2P41587 438 aa21.05■□□□□ 0.96
HOXB-AS3-204ENST00000466037 ASPAP45381 313 aa21.05■□□□□ 0.96
HOXB-AS3-204ENST00000466037 NLRP12P59046 1061 aa21.05■□□□□ 0.96
HOXB-AS3-204ENST00000466037 GRM2Q14416 872 aa21.05■□□□□ 0.96
HOXB-AS3-204ENST00000466037 UNC93AQ86WB7 457 aa21.05■□□□□ 0.96
HOXB-AS3-204ENST00000466037 ARID3BQ8IVW6 561 aaPredicted RBP21.05■□□□□ 0.96
HOXB-AS3-204ENST00000466037 STKLD1Q8NE28 680 aa21.05■□□□□ 0.96
HOXB-AS3-204ENST00000466037 TRMT2BQ96GJ1 504 aaKnown RBP21.05■□□□□ 0.96
HOXB-AS3-204ENST00000466037 SPATA17Q96L03 361 aa21.05■□□□□ 0.96
HOXB-AS3-204ENST00000466037 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP21.05■□□□□ 0.96
HOXB-AS3-204ENST00000466037 PRRX2Q99811 253 aa21.05■□□□□ 0.96
HOXB-AS3-204ENST00000466037 PLA2G2FQ9BZM2 168 aa21.05■□□□□ 0.96
HOXB-AS3-204ENST00000466037 SDCBP2Q9H190 292 aa21.05■□□□□ 0.96
HOXB-AS3-204ENST00000466037 KCNH6Q9H252 994 aa21.05■□□□□ 0.96
HOXB-AS3-204ENST00000466037 IL21Q9HBE4 155 aa21.05■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.7 ms