RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000449844.6

NPAS1-202, Transcript of neuronal PAS domain protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene NPAS1, Length 2,043 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPAS1-202ENST00000449844 PURAQ00577 322 aaKnown RBP22.96■■□□□ 1.27
NPAS1-202ENST00000449844 NOGQ13253 232 aa22.96■■□□□ 1.27
NPAS1-202ENST00000449844 ZNF473Q8WTR7 871 aaKnown RBP22.96■■□□□ 1.27
NPAS1-202ENST00000449844 DNAJB3Q8WWF6 145 aa22.96■■□□□ 1.27
NPAS1-202ENST00000449844 CENPTQ96BT3 561 aa22.96■■□□□ 1.27
NPAS1-202ENST00000449844 CCT8L2Q96SF2 557 aa22.96■■□□□ 1.27
NPAS1-202ENST00000449844 WDR35Q9P2L0 1181 aa22.96■■□□□ 1.27
NPAS1-202ENST00000449844 C17orf102A2RUQ5 167 aa22.96■■□□□ 1.27
NPAS1-202ENST00000449844 SIGLEC16A6NMB1 481 aa22.96■■□□□ 1.27
NPAS1-202ENST00000449844 RASGRF2O14827 1237 aa22.96■■□□□ 1.27
NPAS1-202ENST00000449844 TREHO43280 583 aa22.96■■□□□ 1.27
NPAS1-202ENST00000449844 P4HA1P13674 534 aa22.96■■□□□ 1.27
NPAS1-202ENST00000449844 RAP1GAPP47736 663 aa22.96■■□□□ 1.27
NPAS1-202ENST00000449844 FLT3LGP49771 235 aa22.96■■□□□ 1.27
NPAS1-202ENST00000449844 CORO7P57737 925 aa22.96■■□□□ 1.27
NPAS1-202ENST00000449844 TRIP13Q15645 432 aaPredicted RBP22.96■■□□□ 1.27
NPAS1-202ENST00000449844 DCAF4L1Q3SXM0 396 aa22.96■■□□□ 1.27
NPAS1-202ENST00000449844 PTPN20Q4JDL3 420 aa22.96■■□□□ 1.27
NPAS1-202ENST00000449844 ATP13A4Q4VNC1 1196 aa22.96■■□□□ 1.27
NPAS1-202ENST00000449844 ZFYVE27Q5T4F4 411 aa22.96■■□□□ 1.27
NPAS1-202ENST00000449844 MFSD5Q6N075 450 aa22.96■■□□□ 1.27
NPAS1-202ENST00000449844 SPOCD1Q6ZMY3 1216 aa22.96■■□□□ 1.27
NPAS1-202ENST00000449844 POLNQ7Z5Q5 900 aa22.96■■□□□ 1.27
NPAS1-202ENST00000449844 APBB1IPQ7Z5R6 666 aaPredicted RBP22.96■■□□□ 1.27
NPAS1-202ENST00000449844 CXorf38Q8TB03 319 aa22.96■■□□□ 1.27
NPAS1-202ENST00000449844 ACAP3Q96P50 834 aa22.96■■□□□ 1.27
NPAS1-202ENST00000449844 GMNCA6NCL1 334 aa22.95■■□□□ 1.26
NPAS1-202ENST00000449844 E7EVH7 732 aa22.95■■□□□ 1.26
NPAS1-202ENST00000449844 MEFVO15553 781 aaPredicted RBP22.95■■□□□ 1.26
NPAS1-202ENST00000449844 TRAPPC3O43617 180 aa22.95■■□□□ 1.26
NPAS1-202ENST00000449844 ITGB3P05106 788 aa22.95■■□□□ 1.26
NPAS1-202ENST00000449844 TCF4P15884 667 aa22.95■■□□□ 1.26
NPAS1-202ENST00000449844 TNFAIP8L3Q5GJ75 292 aa22.95■■□□□ 1.26
NPAS1-202ENST00000449844 CYP4A22Q5TCH4 519 aa22.95■■□□□ 1.26
NPAS1-202ENST00000449844 MFSD7Q6UXD7 560 aa22.95■■□□□ 1.26
NPAS1-202ENST00000449844 FNIP1Q8TF40 1166 aa22.95■■□□□ 1.26
NPAS1-202ENST00000449844 FOXP3Q9BZS1 431 aa22.95■■□□□ 1.26
NPAS1-202ENST00000449844 SDCBP2Q9H190 292 aa22.95■■□□□ 1.26
NPAS1-202ENST00000449844 CDHR5Q9HBB8 845 aa22.95■■□□□ 1.26
NPAS1-202ENST00000449844 CASP8AP2Q9UKL3 1982 aa22.95■■□□□ 1.26
NPAS1-202ENST00000449844 ATXN2Q99700 1313 aaKnown RBP22.94■■□□□ 1.26
NPAS1-202ENST00000449844 MYADML2A6NDP7 307 aa22.94■■□□□ 1.26
NPAS1-202ENST00000449844 PI4K2BG5E9Z4 385 aa22.94■■□□□ 1.26
NPAS1-202ENST00000449844 LIASO43766 372 aa22.94■■□□□ 1.26
NPAS1-202ENST00000449844 KLRC2P26717 231 aa22.94■■□□□ 1.26
NPAS1-202ENST00000449844 CHKAP35790 457 aa22.94■■□□□ 1.26
NPAS1-202ENST00000449844 SEC24CP53992 1094 aa22.94■■□□□ 1.26
NPAS1-202ENST00000449844 ZNF200P98182 395 aaPredicted RBP22.94■■□□□ 1.26
NPAS1-202ENST00000449844 SLC10A6Q3KNW5 377 aa22.94■■□□□ 1.26
NPAS1-202ENST00000449844 UBAP2Q5T6F2 1119 aaKnown RBP22.94■■□□□ 1.26
NPAS1-202ENST00000449844 CEP128Q6ZU80 1094 aa22.94■■□□□ 1.26
NPAS1-202ENST00000449844 C7orf31Q8N865 590 aa22.94■■□□□ 1.26
NPAS1-202ENST00000449844 SLC4A11Q8NBS3 891 aa22.94■■□□□ 1.26
NPAS1-202ENST00000449844 FAM124BQ9H5Z6 455 aaPredicted RBP22.94■■□□□ 1.26
NPAS1-202ENST00000449844 PPANQ9NQ55 473 aaKnown RBP22.94■■□□□ 1.26
NPAS1-202ENST00000449844 RALGAPA2Q2PPJ7 1873 aa22.94■■□□□ 1.26
NPAS1-202ENST00000449844 KPNA6O60684 536 aa22.94■■□□□ 1.26
NPAS1-202ENST00000449844 AOC2O75106 756 aa22.94■■□□□ 1.26
NPAS1-202ENST00000449844 CILPO75339 1184 aa22.94■■□□□ 1.26
NPAS1-202ENST00000449844 NPTXRO95502 500 aa22.94■■□□□ 1.26
NPAS1-202ENST00000449844 GNAT1P11488 350 aa22.94■■□□□ 1.26
NPAS1-202ENST00000449844 DARSP14868 501 aaKnown RBP22.94■■□□□ 1.26
NPAS1-202ENST00000449844 MMP13P45452 471 aa22.94■■□□□ 1.26
NPAS1-202ENST00000449844 PRKCZQ05513 592 aa22.94■■□□□ 1.26
NPAS1-202ENST00000449844 PTPN11Q06124 597 aaPredicted RBP22.94■■□□□ 1.26
NPAS1-202ENST00000449844 PCBP1Q15365 356 aaKnown RBP eCLIP22.94■■□□□ 1.26
NPAS1-202ENST00000449844 NT5DC4Q86YG4 428 aa22.94■■□□□ 1.26
NPAS1-202ENST00000449844 KLHL11Q9NVR0 708 aa22.94■■□□□ 1.26
NPAS1-202ENST00000449844 DRG1Q9Y295 367 aaKnown RBP22.94■■□□□ 1.26
NPAS1-202ENST00000449844 hCG_1818297A0A087WSY0 165 aa22.93■■□□□ 1.26
NPAS1-202ENST00000449844 TTC4O95801 387 aa22.93■■□□□ 1.26
NPAS1-202ENST00000449844 KRT3P12035 628 aa22.93■■□□□ 1.26
NPAS1-202ENST00000449844 GRM5P41594 1212 aa22.93■■□□□ 1.26
NPAS1-202ENST00000449844 CDH8P55286 799 aa22.93■■□□□ 1.26
NPAS1-202ENST00000449844 GJA9P57773 515 aa22.93■■□□□ 1.26
NPAS1-202ENST00000449844 TMEM132DQ14C87 1099 aa22.93■■□□□ 1.26
NPAS1-202ENST00000449844 TFDP3Q5H9I0 405 aa22.93■■□□□ 1.26
NPAS1-202ENST00000449844 EPS8L3Q8TE67 593 aaKnown RBP22.93■■□□□ 1.26
NPAS1-202ENST00000449844 TMEM176AQ96HP8 235 aa22.93■■□□□ 1.26
NPAS1-202ENST00000449844 SMYD3Q9H7B4 428 aa22.93■■□□□ 1.26
NPAS1-202ENST00000449844 GGA2Q9UJY4 613 aa22.93■■□□□ 1.26
NPAS1-202ENST00000449844 ITGA11Q9UKX5 1188 aa22.93■■□□□ 1.26
NPAS1-202ENST00000449844 C2CD2Q9Y426 696 aa22.93■■□□□ 1.26
NPAS1-202ENST00000449844 STAU1O95793 577 aaKnown RBP22.92■■□□□ 1.26
NPAS1-202ENST00000449844 KRT10P13645 584 aa22.92■■□□□ 1.26
NPAS1-202ENST00000449844 ATF7P17544 494 aaPredicted RBP22.92■■□□□ 1.26
NPAS1-202ENST00000449844 PSMA2P25787 234 aa22.92■■□□□ 1.26
NPAS1-202ENST00000449844 AUHQ13825 339 aaKnown RBP22.92■■□□□ 1.26
NPAS1-202ENST00000449844 ZNF268Q14587 947 aaPredicted RBP22.92■■□□□ 1.26
NPAS1-202ENST00000449844 IZUMO3Q5VZ72 239 aa22.92■■□□□ 1.26
NPAS1-202ENST00000449844 KAZNQ674X7 775 aa22.92■■□□□ 1.26
NPAS1-202ENST00000449844 NOTUMQ6P988 496 aa22.92■■□□□ 1.26
NPAS1-202ENST00000449844 SLC27A1Q6PCB7 646 aa22.92■■□□□ 1.26
NPAS1-202ENST00000449844 MICALCLQ6ZW33 695 aa22.92■■□□□ 1.26
NPAS1-202ENST00000449844 GSTA5Q7RTV2 222 aa22.92■■□□□ 1.26
NPAS1-202ENST00000449844 RELL1Q8IUW5 271 aa22.92■■□□□ 1.26
NPAS1-202ENST00000449844 UHMK1Q8TAS1 419 aaKnown RBP22.92■■□□□ 1.26
NPAS1-202ENST00000449844 CYTH4Q9UIA0 394 aa22.92■■□□□ 1.26
NPAS1-202ENST00000449844 EFR3BQ9Y2G0 817 aa22.92■■□□□ 1.26
NPAS1-202ENST00000449844 FAM169AQ9Y6X4 670 aa22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.6 ms