RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439168.1

AC005588.1-201, humanhuman

BASIC

Gene AC005588.1, Length 162 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AC005588.1-201ENST00000439168 RAD23BP54727 409 aa9.66□□□□□ -0.86
AC005588.1-201ENST00000439168 EPHB3P54753 998 aa9.66□□□□□ -0.86
AC005588.1-201ENST00000439168 RPL10AP62906 217 aaKnown RBP9.66□□□□□ -0.86
AC005588.1-201ENST00000439168 MRPS5P82675 430 aaKnown RBP9.66□□□□□ -0.86
AC005588.1-201ENST00000439168 KCNMA1Q12791 1236 aa9.66□□□□□ -0.86
AC005588.1-201ENST00000439168 TWF1Q12792 350 aa9.66□□□□□ -0.86
AC005588.1-201ENST00000439168 VEPH1Q14D04 833 aa9.66□□□□□ -0.86
AC005588.1-201ENST00000439168 CLUL1Q15846 466 aa9.66□□□□□ -0.86
AC005588.1-201ENST00000439168 ZNF394Q53GI3 561 aa9.66□□□□□ -0.86
AC005588.1-201ENST00000439168 ATAT1Q5SQI0 421 aa9.66□□□□□ -0.86
AC005588.1-201ENST00000439168 KLHDC7AQ5VTJ3 777 aa9.66□□□□□ -0.86
AC005588.1-201ENST00000439168 TMEM270Q6UE05 265 aa9.66□□□□□ -0.86
AC005588.1-201ENST00000439168 ITIH5Q86UX2 942 aa9.66□□□□□ -0.86
AC005588.1-201ENST00000439168 C12orf76Q8N812 135 aaPredicted RBP9.66□□□□□ -0.86
AC005588.1-201ENST00000439168 SLC4A11Q8NBS3 891 aa9.66□□□□□ -0.86
AC005588.1-201ENST00000439168 SUSD6Q92537 303 aa9.66□□□□□ -0.86
AC005588.1-201ENST00000439168 SMG7Q92540 1137 aaKnown RBP9.66□□□□□ -0.86
AC005588.1-201ENST00000439168 KAT5Q92993 513 aa9.66□□□□□ -0.86
AC005588.1-201ENST00000439168 ZNF707Q96C28 371 aaPredicted RBP9.66□□□□□ -0.86
AC005588.1-201ENST00000439168 SMARCD1Q96GM5 515 aa9.66□□□□□ -0.86
AC005588.1-201ENST00000439168 KREMEN1Q96MU8 473 aa9.66□□□□□ -0.86
AC005588.1-201ENST00000439168 TWNKQ96RR1 684 aa9.66□□□□□ -0.86
AC005588.1-201ENST00000439168 SEPT5Q99719 369 aaPredicted RBP9.66□□□□□ -0.86
AC005588.1-201ENST00000439168 LSM14BQ9BX40 385 aaKnown RBP9.66□□□□□ -0.86
AC005588.1-201ENST00000439168 CRISPLD1Q9H336 500 aa9.66□□□□□ -0.86
AC005588.1-201ENST00000439168 PIDD1Q9HB75 910 aa9.66□□□□□ -0.86
AC005588.1-201ENST00000439168 SIX2Q9NPC8 291 aa9.66□□□□□ -0.86
AC005588.1-201ENST00000439168 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP9.66□□□□□ -0.86
AC005588.1-201ENST00000439168 PRDM6Q9NQX0 595 aa9.66□□□□□ -0.86
AC005588.1-201ENST00000439168 CNTN6Q9UQ52 1028 aa9.66□□□□□ -0.86
AC005588.1-201ENST00000439168 SIK3Q9Y2K2 1263 aa9.66□□□□□ -0.86
AC005588.1-201ENST00000439168 SLC27A5Q9Y2P5 690 aa9.66□□□□□ -0.86
AC005588.1-201ENST00000439168 USP15Q9Y4E8 981 aaPredicted RBP9.66□□□□□ -0.86
AC005588.1-201ENST00000439168 PCDHB4Q9Y5E5 795 aa9.66□□□□□ -0.86
AC005588.1-201ENST00000439168 UNC80Q8N2C7 3258 aa9.66□□□□□ -0.86
AC005588.1-201ENST00000439168 C5orf42Q9H799 3197 aa9.66□□□□□ -0.86
AC005588.1-201ENST00000439168 MYH10P35580 1976 aa9.66□□□□□ -0.86
AC005588.1-201ENST00000439168 TRIM66O15016 1216 aa9.65□□□□□ -0.86
AC005588.1-201ENST00000439168 CCL16O15467 120 aa9.65□□□□□ -0.86
AC005588.1-201ENST00000439168 MBTPS2O43462 519 aa9.65□□□□□ -0.86
AC005588.1-201ENST00000439168 TPM3P06753 285 aa9.65□□□□□ -0.86
AC005588.1-201ENST00000439168 UCHL3P15374 230 aa9.65□□□□□ -0.86
AC005588.1-201ENST00000439168 BDNFP23560 247 aa9.65□□□□□ -0.86
AC005588.1-201ENST00000439168 CYP2F1P24903 491 aa9.65□□□□□ -0.86
AC005588.1-201ENST00000439168 ANXA13P27216 316 aa9.65□□□□□ -0.86
AC005588.1-201ENST00000439168 FANCCQ00597 558 aa9.65□□□□□ -0.86
AC005588.1-201ENST00000439168 TFF2Q03403 129 aa9.65□□□□□ -0.86
AC005588.1-201ENST00000439168 ORC1Q13415 861 aa9.65□□□□□ -0.86
AC005588.1-201ENST00000439168 CBX2Q14781 532 aaPredicted RBP9.65□□□□□ -0.86
AC005588.1-201ENST00000439168 SYCP1Q15431 976 aa9.65□□□□□ -0.86
AC005588.1-201ENST00000439168 SMAD2Q15796 467 aaKnown RBP9.65□□□□□ -0.86
AC005588.1-201ENST00000439168 CCDC142Q17RM4 750 aa9.65□□□□□ -0.86
AC005588.1-201ENST00000439168 IQCEQ6IPM2 695 aa9.65□□□□□ -0.86
AC005588.1-201ENST00000439168 PTCRAQ6ISU1 281 aaPredicted RBP9.65□□□□□ -0.86
AC005588.1-201ENST00000439168 DPY19L2P1Q6NXN4 242 aa9.65□□□□□ -0.86
AC005588.1-201ENST00000439168 FAM35AQ86V20 835 aa9.65□□□□□ -0.86
AC005588.1-201ENST00000439168 FUKQ8N0W3 1084 aa9.65□□□□□ -0.86
AC005588.1-201ENST00000439168 TTC9BQ8N6N2 239 aa9.65□□□□□ -0.86
AC005588.1-201ENST00000439168 LEMD2Q8NC56 503 aa9.65□□□□□ -0.86
AC005588.1-201ENST00000439168 RBBP8NLQ8NC74 664 aaPredicted RBP9.65□□□□□ -0.86
AC005588.1-201ENST00000439168 NEK11Q8NG66 645 aa9.65□□□□□ -0.86
AC005588.1-201ENST00000439168 GADD45GIP1Q8TAE8 222 aaPredicted RBP9.65□□□□□ -0.86
AC005588.1-201ENST00000439168 SHC3Q92529 594 aa9.65□□□□□ -0.86
AC005588.1-201ENST00000439168 CYFIP2Q96F07 1278 aa9.65□□□□□ -0.86
AC005588.1-201ENST00000439168 SPATA17Q96L03 361 aa9.65□□□□□ -0.86
AC005588.1-201ENST00000439168 ZNF512Q96ME7 567 aaPredicted RBP9.65□□□□□ -0.86
AC005588.1-201ENST00000439168 PCMTD1Q96MG8 357 aaPredicted RBP9.65□□□□□ -0.86
AC005588.1-201ENST00000439168 HEXIM2Q96MH2 286 aaKnown RBP9.65□□□□□ -0.86
AC005588.1-201ENST00000439168 HNRNPABQ99729 332 aaKnown RBP9.65□□□□□ -0.86
AC005588.1-201ENST00000439168 MED10Q9BTT4 135 aa9.65□□□□□ -0.86
AC005588.1-201ENST00000439168 APOL5Q9BWW9 433 aa9.65□□□□□ -0.86
AC005588.1-201ENST00000439168 B3GNT5Q9BYG0 378 aa9.65□□□□□ -0.86
AC005588.1-201ENST00000439168 DNAJC12Q9UKB3 198 aa9.65□□□□□ -0.86
AC005588.1-201ENST00000439168 DENND4AQ7Z401 1863 aa9.65□□□□□ -0.86
AC005588.1-201ENST00000439168 SPTBN5Q9NRC6 3674 aaKnown RBP9.64□□□□□ -0.87
AC005588.1-201ENST00000439168 A0A1W2PQC6 194 aa9.64□□□□□ -0.87
AC005588.1-201ENST00000439168 GRXCR2A6NFK2 248 aa9.64□□□□□ -0.87
AC005588.1-201ENST00000439168 FGF19O95750 216 aa9.64□□□□□ -0.87
AC005588.1-201ENST00000439168 FAM200BP0CF97 657 aa9.64□□□□□ -0.87
AC005588.1-201ENST00000439168 CSH1P0DML2 217 aa9.64□□□□□ -0.87
AC005588.1-201ENST00000439168 CSH2P0DML3 217 aa9.64□□□□□ -0.87
AC005588.1-201ENST00000439168 VDRP11473 427 aa9.64□□□□□ -0.87
AC005588.1-201ENST00000439168 KRT5P13647 590 aa9.64□□□□□ -0.87
AC005588.1-201ENST00000439168 CCDC130P13994 396 aa9.64□□□□□ -0.87
AC005588.1-201ENST00000439168 PTPN2P17706 415 aa9.64□□□□□ -0.87
AC005588.1-201ENST00000439168 ATF6P18850 670 aa9.64□□□□□ -0.87
AC005588.1-201ENST00000439168 GRIK1P39086 918 aa9.64□□□□□ -0.87
AC005588.1-201ENST00000439168 ZNF132P52740 706 aa9.64□□□□□ -0.87
AC005588.1-201ENST00000439168 UBASH3AP57075 661 aa9.64□□□□□ -0.87
AC005588.1-201ENST00000439168 SLC8A3P57103 927 aa9.64□□□□□ -0.87
AC005588.1-201ENST00000439168 APBA1Q02410 837 aa9.64□□□□□ -0.87
AC005588.1-201ENST00000439168 RAPGEF1Q13905 1077 aa9.64□□□□□ -0.87
AC005588.1-201ENST00000439168 STILQ15468 1287 aa9.64□□□□□ -0.87
AC005588.1-201ENST00000439168 TAF12Q16514 161 aa9.64□□□□□ -0.87
AC005588.1-201ENST00000439168 ARHGAP44Q17R89 818 aa9.64□□□□□ -0.87
AC005588.1-201ENST00000439168 SGO2Q562F6 1265 aa9.64□□□□□ -0.87
AC005588.1-201ENST00000439168 ARHGAP17Q68EM7 881 aa9.64□□□□□ -0.87
AC005588.1-201ENST00000439168 GJB7Q6PEY0 223 aa9.64□□□□□ -0.87
AC005588.1-201ENST00000439168 SCN4BQ8IWT1 228 aa9.64□□□□□ -0.87
AC005588.1-201ENST00000439168 C12orf29Q8N999 325 aa9.64□□□□□ -0.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.7 ms