RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000438888.5

PRAME-208, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 4

Gene PRAME, Length 566 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-208ENST00000438888 ENOX2Q16206 610 aaKnown RBP13.36□□□□□ -0.27
PRAME-208ENST00000438888 CCDC40Q4G0X9 1142 aa13.36□□□□□ -0.27
PRAME-208ENST00000438888 OVOS1Q6IE37 1185 aa13.36□□□□□ -0.27
PRAME-208ENST00000438888 IRF2BP1Q8IU81 584 aa13.36□□□□□ -0.27
PRAME-208ENST00000438888 ATAD1Q8NBU5 361 aa13.36□□□□□ -0.27
PRAME-208ENST00000438888 LEMD2Q8NC56 503 aa13.36□□□□□ -0.27
PRAME-208ENST00000438888 ANKRD20A12PQ8NF67 263 aa13.36□□□□□ -0.27
PRAME-208ENST00000438888 DEPDC1BQ8WUY9 529 aa13.36□□□□□ -0.27
PRAME-208ENST00000438888 SECISBP2LQ93073 1101 aaKnown RBP13.36□□□□□ -0.27
PRAME-208ENST00000438888 RSPRY1Q96DX4 576 aa13.36□□□□□ -0.27
PRAME-208ENST00000438888 SAAL1Q96ER3 474 aa13.36□□□□□ -0.27
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PRAME-208ENST00000438888 CHRDQ9H2X0 955 aa13.36□□□□□ -0.27
PRAME-208ENST00000438888 LMAN1LQ9HAT1 526 aa13.36□□□□□ -0.27
PRAME-208ENST00000438888 PLEKHA5Q9HAU0 1116 aa13.36□□□□□ -0.27
PRAME-208ENST00000438888 AGO2Q9UKV8 859 aaKnown RBP13.36□□□□□ -0.27
PRAME-208ENST00000438888 F5P12259 2224 aa13.36□□□□□ -0.27
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PRAME-208ENST00000438888 OR6C75A6NL08 312 aa13.35□□□□□ -0.27
PRAME-208ENST00000438888 GOLGA8JA6NMD2 632 aa13.35□□□□□ -0.27
PRAME-208ENST00000438888 SLC38A8A6NNN8 435 aa13.35□□□□□ -0.27
PRAME-208ENST00000438888 OGTO15294 1046 aa13.35□□□□□ -0.27
PRAME-208ENST00000438888 XPOTO43592 962 aaKnown RBP13.35□□□□□ -0.27
PRAME-208ENST00000438888 EXTL3O43909 919 aa13.35□□□□□ -0.27
PRAME-208ENST00000438888 AKAP3O75969 853 aa13.35□□□□□ -0.27
PRAME-208ENST00000438888 OAZ2O95190 189 aa13.35□□□□□ -0.27
PRAME-208ENST00000438888 NFICP08651 508 aa13.35□□□□□ -0.27
PRAME-208ENST00000438888 ATP1A3P13637 1013 aa13.35□□□□□ -0.27
PRAME-208ENST00000438888 CYP3A5P20815 502 aa13.35□□□□□ -0.27
PRAME-208ENST00000438888 PSMC2P35998 433 aaKnown RBP13.35□□□□□ -0.27
PRAME-208ENST00000438888 ALDH1A3P47895 512 aa13.35□□□□□ -0.27
PRAME-208ENST00000438888 CASP4P49662 377 aa13.35□□□□□ -0.27
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PRAME-208ENST00000438888 TCP11X2Q5H9J9 407 aa13.35□□□□□ -0.27
PRAME-208ENST00000438888 JADE1Q6IE81 842 aa13.35□□□□□ -0.27
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PRAME-208ENST00000438888 CREBRFQ8IUR6 639 aa13.35□□□□□ -0.27
PRAME-208ENST00000438888 MFSD6LQ8IWD5 586 aa13.35□□□□□ -0.27
PRAME-208ENST00000438888 FAM186BQ8IYM0 893 aa13.35□□□□□ -0.27
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PRAME-208ENST00000438888 BEST2Q8NFU1 509 aa13.35□□□□□ -0.27
PRAME-208ENST00000438888 CSGALNACT1Q8TDX6 532 aa13.35□□□□□ -0.27
PRAME-208ENST00000438888 SEPT5Q99719 369 aaPredicted RBP13.35□□□□□ -0.27
PRAME-208ENST00000438888 EPC1Q9H2F5 836 aa13.35□□□□□ -0.27
PRAME-208ENST00000438888 ATXN3LQ9H3M9 355 aa13.35□□□□□ -0.27
PRAME-208ENST00000438888 KIAA1586Q9HCI6 787 aa13.35□□□□□ -0.27
PRAME-208ENST00000438888 RBM12Q9NTZ6 932 aaKnown RBP13.35□□□□□ -0.27
PRAME-208ENST00000438888 MAFFQ9ULX9 164 aa13.35□□□□□ -0.27
PRAME-208ENST00000438888 MAPK13O15264 365 aa13.34□□□□□ -0.27
PRAME-208ENST00000438888 LILRB5O75023 590 aa13.34□□□□□ -0.27
PRAME-208ENST00000438888 LDHAP00338 332 aaKnown RBP13.34□□□□□ -0.27
PRAME-208ENST00000438888 ODC1P11926 461 aa13.34□□□□□ -0.27
PRAME-208ENST00000438888 MTIF2P46199 727 aaKnown RBP13.34□□□□□ -0.27
PRAME-208ENST00000438888 AARSP49588 968 aaKnown RBP eCLIP13.34□□□□□ -0.27
PRAME-208ENST00000438888 KPNA1P52294 538 aaPredicted RBP13.34□□□□□ -0.27
PRAME-208ENST00000438888 MARSP56192 900 aaKnown RBP13.34□□□□□ -0.27
PRAME-208ENST00000438888 SATB1Q01826 763 aa13.34□□□□□ -0.27
PRAME-208ENST00000438888 GPR17Q13304 367 aa13.34□□□□□ -0.27
PRAME-208ENST00000438888 KRT31Q15323 416 aa13.34□□□□□ -0.27
PRAME-208ENST00000438888 ZBTB6Q15916 424 aa13.34□□□□□ -0.27
PRAME-208ENST00000438888 SNRNP35Q16560 246 aaKnown RBP13.34□□□□□ -0.27
PRAME-208ENST00000438888 PRR23BQ6ZRT6 265 aa13.34□□□□□ -0.27
PRAME-208ENST00000438888 ZNF687Q8N1G0 1237 aa13.34□□□□□ -0.27
PRAME-208ENST00000438888 ZSWIM2Q8NEG5 633 aa13.34□□□□□ -0.27
PRAME-208ENST00000438888 NELL1Q92832 810 aa13.34□□□□□ -0.27
PRAME-208ENST00000438888 ZFYVE19Q96K21 471 aa13.34□□□□□ -0.27
PRAME-208ENST00000438888 SENP8Q96LD8 212 aa13.34□□□□□ -0.27
PRAME-208ENST00000438888 LPIN3Q9BQK8 851 aa13.34□□□□□ -0.27
PRAME-208ENST00000438888 FAM213AQ9BRX8 229 aa13.34□□□□□ -0.27
PRAME-208ENST00000438888 LRRC3Q9BY71 257 aa13.34□□□□□ -0.27
PRAME-208ENST00000438888 METTL14Q9HCE5 456 aaKnown RBP13.34□□□□□ -0.27
PRAME-208ENST00000438888 DLL3Q9NYJ7 618 aa13.34□□□□□ -0.27
PRAME-208ENST00000438888 ARMCX3Q9UH62 379 aaPredicted RBP13.34□□□□□ -0.27
PRAME-208ENST00000438888 LIMA1Q9UHB6 759 aaKnown RBP13.34□□□□□ -0.27
PRAME-208ENST00000438888 GMEB2Q9UKD1 530 aa13.34□□□□□ -0.27
PRAME-208ENST00000438888 RAB23Q9ULC3 237 aa13.34□□□□□ -0.27
PRAME-208ENST00000438888 SPTBN2O15020 2390 aa13.34□□□□□ -0.27
PRAME-208ENST00000438888 ANK1P16157 1881 aa13.33□□□□□ -0.27
PRAME-208ENST00000438888 PDCD11Q14690 1871 aaKnown RBP13.33□□□□□ -0.27
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PRAME-208ENST00000438888 ZNF233A6NK53 670 aa13.33□□□□□ -0.28
PRAME-208ENST00000438888 ARNTLO00327 626 aa13.33□□□□□ -0.28
PRAME-208ENST00000438888 DPYSL4O14531 572 aa13.33□□□□□ -0.28
PRAME-208ENST00000438888 FAM189A1O60320 539 aa13.33□□□□□ -0.28
PRAME-208ENST00000438888 SERPINC1P01008 464 aa13.33□□□□□ -0.28
PRAME-208ENST00000438888 TDGF1P13385 188 aa13.33□□□□□ -0.28
PRAME-208ENST00000438888 TYMPP19971 482 aa13.33□□□□□ -0.28
PRAME-208ENST00000438888 GABRR2P28476 465 aa13.33□□□□□ -0.28
PRAME-208ENST00000438888 ACOT2P49753 483 aa13.33□□□□□ -0.28
PRAME-208ENST00000438888 CCR3P51677 355 aa13.33□□□□□ -0.28
PRAME-208ENST00000438888 LILRA4P59901 499 aa13.33□□□□□ -0.28
PRAME-208ENST00000438888 CYP4F8P98187 520 aa13.33□□□□□ -0.28
PRAME-208ENST00000438888 FANCCQ00597 558 aa13.33□□□□□ -0.28
PRAME-208ENST00000438888 PLCB2Q00722 1185 aa13.33□□□□□ -0.28
PRAME-208ENST00000438888 PPP2R5DQ14738 602 aa13.33□□□□□ -0.28
PRAME-208ENST00000438888 TMEM132DQ14C87 1099 aa13.33□□□□□ -0.28
PRAME-208ENST00000438888 KYAT1Q16773 422 aa13.33□□□□□ -0.28
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