RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428858.1

TTC28-AS1-209, TTC28 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 4

Gene TTC28-AS1, Length 565 nt, Biotype retained intron.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC28-AS1-209ENST00000428858 B3GNT5Q9BYG0 378 aa8.68□□□□□ -1.02
TTC28-AS1-209ENST00000428858 RHOBTB2Q9BYZ6 727 aa8.68□□□□□ -1.02
TTC28-AS1-209ENST00000428858 TTYH3Q9C0H2 523 aa8.68□□□□□ -1.02
TTC28-AS1-209ENST00000428858 CRISPLD1Q9H336 500 aa8.68□□□□□ -1.02
TTC28-AS1-209ENST00000428858 RRAGDQ9NQL2 400 aaPredicted RBP8.68□□□□□ -1.02
TTC28-AS1-209ENST00000428858 ZDHHC7Q9NXF8 308 aa8.68□□□□□ -1.02
TTC28-AS1-209ENST00000428858 CLEC1BQ9P126 229 aa8.68□□□□□ -1.02
TTC28-AS1-209ENST00000428858 MYO6Q9UM54 1294 aa8.68□□□□□ -1.02
TTC28-AS1-209ENST00000428858 PCDHB5Q9Y5E4 795 aa8.68□□□□□ -1.02
TTC28-AS1-209ENST00000428858 PCDHB4Q9Y5E5 795 aa8.68□□□□□ -1.02
TTC28-AS1-209ENST00000428858 PPAN-P2RY11A0A0B4J1V8 794 aaPredicted RBP8.67□□□□□ -1.02
TTC28-AS1-209ENST00000428858 SPDYE4A6NLX3 237 aa8.67□□□□□ -1.02
TTC28-AS1-209ENST00000428858 TDRD15B5MCY1 1934 aaKnown RBP8.67□□□□□ -1.02
TTC28-AS1-209ENST00000428858 O00370 1275 aa8.67□□□□□ -1.02
TTC28-AS1-209ENST00000428858 FOXN3O00409 490 aaPredicted RBP8.67□□□□□ -1.02
TTC28-AS1-209ENST00000428858 PRRG1O14668 218 aa8.67□□□□□ -1.02
TTC28-AS1-209ENST00000428858 TRANK1O15050 2925 aa8.67□□□□□ -1.02
TTC28-AS1-209ENST00000428858 LINC01565O15544 149 aa8.67□□□□□ -1.02
TTC28-AS1-209ENST00000428858 C8AP07357 584 aa8.67□□□□□ -1.02
TTC28-AS1-209ENST00000428858 HNRNPA1P09651 372 aaKnown RBP eCLIP8.67□□□□□ -1.02
TTC28-AS1-209ENST00000428858 VDRP11473 427 aa8.67□□□□□ -1.02
TTC28-AS1-209ENST00000428858 HOXB8P17481 243 aaPredicted RBP8.67□□□□□ -1.02
TTC28-AS1-209ENST00000428858 ELF1P32519 619 aa8.67□□□□□ -1.02
TTC28-AS1-209ENST00000428858 LTBRP36941 435 aa8.67□□□□□ -1.02
TTC28-AS1-209ENST00000428858 DUSP4Q13115 394 aa8.67□□□□□ -1.02
TTC28-AS1-209ENST00000428858 TRIM14Q14142 442 aa8.67□□□□□ -1.02
TTC28-AS1-209ENST00000428858 MEA1Q16626 185 aa8.67□□□□□ -1.02
TTC28-AS1-209ENST00000428858 ARHGAP44Q17R89 818 aa8.67□□□□□ -1.02
TTC28-AS1-209ENST00000428858 ANKRD54Q6NXT1 300 aa8.67□□□□□ -1.02
TTC28-AS1-209ENST00000428858 LLGL2Q6P1M3 1020 aa8.67□□□□□ -1.02
TTC28-AS1-209ENST00000428858 CYP26C1Q6V0L0 522 aa8.67□□□□□ -1.02
TTC28-AS1-209ENST00000428858 PAQR9Q6ZVX9 377 aa8.67□□□□□ -1.02
TTC28-AS1-209ENST00000428858 FAM35AQ86V20 835 aa8.67□□□□□ -1.02
TTC28-AS1-209ENST00000428858 SPATA2LQ8IUW3 424 aaPredicted RBP8.67□□□□□ -1.02
TTC28-AS1-209ENST00000428858 FMNL3Q8IVF7 1028 aa8.67□□□□□ -1.02
TTC28-AS1-209ENST00000428858 VSTM4Q8IW00 320 aa8.67□□□□□ -1.02
TTC28-AS1-209ENST00000428858 TTC9BQ8N6N2 239 aa8.67□□□□□ -1.02
TTC28-AS1-209ENST00000428858 C12orf29Q8N999 325 aa8.67□□□□□ -1.02
TTC28-AS1-209ENST00000428858 CMASQ8NFW8 434 aaPredicted RBP8.67□□□□□ -1.02
TTC28-AS1-209ENST00000428858 SLC7A14Q8TBB6 771 aa8.67□□□□□ -1.02
TTC28-AS1-209ENST00000428858 SLC2A14Q8TDB8 520 aa8.67□□□□□ -1.02
TTC28-AS1-209ENST00000428858 TFAP2BQ92481 460 aa8.67□□□□□ -1.02
TTC28-AS1-209ENST00000428858 BAP1Q92560 729 aa8.67□□□□□ -1.02
TTC28-AS1-209ENST00000428858 MRFAP1L1Q96HT8 127 aa8.67□□□□□ -1.02
TTC28-AS1-209ENST00000428858 HEXIM2Q96MH2 286 aaKnown RBP8.67□□□□□ -1.02
TTC28-AS1-209ENST00000428858 SPAG5Q96R06 1193 aa8.67□□□□□ -1.02
TTC28-AS1-209ENST00000428858 LPIN3Q9BQK8 851 aa8.67□□□□□ -1.02
TTC28-AS1-209ENST00000428858 TRIM5Q9C035 493 aa8.67□□□□□ -1.02
TTC28-AS1-209ENST00000428858 ZNF518BQ9C0D4 1074 aa8.67□□□□□ -1.02
TTC28-AS1-209ENST00000428858 IGFLR1Q9H665 355 aa8.67□□□□□ -1.02
TTC28-AS1-209ENST00000428858 SFXN1Q9H9B4 322 aa8.67□□□□□ -1.02
TTC28-AS1-209ENST00000428858 CYP4F11Q9HBI6 524 aa8.67□□□□□ -1.02
TTC28-AS1-209ENST00000428858 CSNK1G1Q9HCP0 422 aa8.67□□□□□ -1.02
TTC28-AS1-209ENST00000428858 MAN1C1Q9NR34 630 aa8.67□□□□□ -1.02
TTC28-AS1-209ENST00000428858 FAM49BQ9NUQ9 324 aa8.67□□□□□ -1.02
TTC28-AS1-209ENST00000428858 ABI2Q9NYB9 513 aaPredicted RBP8.67□□□□□ -1.02
TTC28-AS1-209ENST00000428858 WDR3Q9UNX4 943 aaKnown RBP eCLIP8.67□□□□□ -1.02
TTC28-AS1-209ENST00000428858 YIPF1Q9Y548 306 aa8.67□□□□□ -1.02
TTC28-AS1-209ENST00000428858 UCHL5Q9Y5K5 329 aaKnown RBP eCLIP8.67□□□□□ -1.02
TTC28-AS1-209ENST00000428858 INSL5Q9Y5Q6 135 aa8.67□□□□□ -1.02
TTC28-AS1-209ENST00000428858 ATP8B3O60423 1300 aa8.66□□□□□ -1.02
TTC28-AS1-209ENST00000428858 TRIM66O15016 1216 aa8.66□□□□□ -1.02
TTC28-AS1-209ENST00000428858 TBX10O75333 385 aa8.66□□□□□ -1.02
TTC28-AS1-209ENST00000428858 GYPCP04921 128 aa8.66□□□□□ -1.02
TTC28-AS1-209ENST00000428858 SPATA31D3P0C874 917 aa8.66□□□□□ -1.02
TTC28-AS1-209ENST00000428858 FAM200BP0CF97 657 aa8.66□□□□□ -1.02
TTC28-AS1-209ENST00000428858 KRT5P13647 590 aa8.66□□□□□ -1.02
TTC28-AS1-209ENST00000428858 CCDC130P13994 396 aa8.66□□□□□ -1.02
TTC28-AS1-209ENST00000428858 CD19P15391 556 aa8.66□□□□□ -1.02
TTC28-AS1-209ENST00000428858 CYP2F1P24903 491 aa8.66□□□□□ -1.02
TTC28-AS1-209ENST00000428858 SOX5P35711 763 aa8.66□□□□□ -1.02
TTC28-AS1-209ENST00000428858 USP8P40818 1118 aa8.66□□□□□ -1.02
TTC28-AS1-209ENST00000428858 STAT1P42224 750 aa8.66□□□□□ -1.02
TTC28-AS1-209ENST00000428858 ZNF75DP51815 510 aa8.66□□□□□ -1.02
TTC28-AS1-209ENST00000428858 BPIFB4P59827 614 aa8.66□□□□□ -1.02
TTC28-AS1-209ENST00000428858 RPL10AP62906 217 aaKnown RBP8.66□□□□□ -1.02
TTC28-AS1-209ENST00000428858 CYP27A1Q02318 531 aa8.66□□□□□ -1.02
TTC28-AS1-209ENST00000428858 PTK2Q05397 1052 aa8.66□□□□□ -1.02
TTC28-AS1-209ENST00000428858 ITIH3Q06033 890 aa8.66□□□□□ -1.02
TTC28-AS1-209ENST00000428858 PLD1Q13393 1074 aa8.66□□□□□ -1.02
TTC28-AS1-209ENST00000428858 ARID5BQ14865 1188 aa8.66□□□□□ -1.02
TTC28-AS1-209ENST00000428858 STILQ15468 1287 aa8.66□□□□□ -1.02
TTC28-AS1-209ENST00000428858 CNGA2Q16280 664 aa8.66□□□□□ -1.02
TTC28-AS1-209ENST00000428858 PTPN21Q16825 1174 aa8.66□□□□□ -1.02
TTC28-AS1-209ENST00000428858 MGAT5BQ3V5L5 792 aa8.66□□□□□ -1.02
TTC28-AS1-209ENST00000428858 PKDCCQ504Y2 493 aa8.66□□□□□ -1.02
TTC28-AS1-209ENST00000428858 SGO2Q562F6 1265 aa8.66□□□□□ -1.02
TTC28-AS1-209ENST00000428858 SYCE2Q6PIF2 218 aa8.66□□□□□ -1.02
TTC28-AS1-209ENST00000428858 LCLAT1Q6UWP7 414 aa8.66□□□□□ -1.02
TTC28-AS1-209ENST00000428858 SPATA31D4Q6ZUB0 917 aa8.66□□□□□ -1.02
TTC28-AS1-209ENST00000428858 CACNA2D4Q7Z3S7 1137 aa8.66□□□□□ -1.02
TTC28-AS1-209ENST00000428858 MICALL1Q8N3F8 863 aa8.66□□□□□ -1.02
TTC28-AS1-209ENST00000428858 MAFAQ8NHW3 353 aaPredicted RBP8.66□□□□□ -1.02
TTC28-AS1-209ENST00000428858 ZNF707Q96C28 371 aaPredicted RBP8.66□□□□□ -1.02
TTC28-AS1-209ENST00000428858 CYFIP2Q96F07 1278 aa8.66□□□□□ -1.02
TTC28-AS1-209ENST00000428858 SMARCD1Q96GM5 515 aa8.66□□□□□ -1.02
TTC28-AS1-209ENST00000428858 MSLNLQ96KJ4 702 aa8.66□□□□□ -1.02
TTC28-AS1-209ENST00000428858 C8orf48Q96LL4 319 aa8.66□□□□□ -1.02
TTC28-AS1-209ENST00000428858 SEPT5Q99719 369 aaPredicted RBP8.66□□□□□ -1.02
TTC28-AS1-209ENST00000428858 PRKD2Q9BZL6 878 aa8.66□□□□□ -1.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.2 ms