RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000400919.7

FAAP20-204, Transcript of FA core complex associated protein 20, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene FAAP20, Length 1,413 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAAP20-204ENST00000400919 AVENQ9NQS1 362 aaPredicted RBP29.21■■■□□ 2.27
FAAP20-204ENST00000400919 CISHQ9NSE2 258 aa29.21■■■□□ 2.27
FAAP20-204ENST00000400919 ATP8B3O60423 1300 aa29.21■■■□□ 2.27
FAAP20-204ENST00000400919 A0A0C4DFX4 3053 aa29.21■■■□□ 2.27
FAAP20-204ENST00000400919 PES1O00541 588 aaKnown RBP29.2■■■□□ 2.27
FAAP20-204ENST00000400919 ZNF197O14709 1029 aa29.2■■■□□ 2.27
FAAP20-204ENST00000400919 NFKBIBQ15653 356 aa29.2■■■□□ 2.27
FAAP20-204ENST00000400919 CCDC142Q17RM4 750 aa29.2■■■□□ 2.27
FAAP20-204ENST00000400919 CDKAL1Q5VV42 579 aa29.2■■■□□ 2.27
FAAP20-204ENST00000400919 PDZD4Q76G19 769 aaPredicted RBP29.2■■■□□ 2.27
FAAP20-204ENST00000400919 PLCD3Q8N3E9 789 aa29.2■■■□□ 2.27
FAAP20-204ENST00000400919 PPM1KQ8N3J5 372 aa29.2■■■□□ 2.27
FAAP20-204ENST00000400919 PSMG2Q969U7 264 aa29.2■■■□□ 2.27
FAAP20-204ENST00000400919 NECAB3Q96P71 396 aaPredicted RBP29.2■■■□□ 2.27
FAAP20-204ENST00000400919 ELOVL4Q9GZR5 314 aa29.2■■■□□ 2.27
FAAP20-204ENST00000400919 MRPS23Q9Y3D9 190 aaKnown RBP29.2■■■□□ 2.27
FAAP20-204ENST00000400919 C19orf67A6NJJ6 358 aa29.2■■■□□ 2.26
FAAP20-204ENST00000400919 SMTNL1A8MU46 457 aa29.2■■■□□ 2.26
FAAP20-204ENST00000400919 LOC730098B7Z3J9 87 aa29.2■■■□□ 2.26
FAAP20-204ENST00000400919 SP100P23497 879 aaPredicted RBP29.2■■■□□ 2.26
FAAP20-204ENST00000400919 BDNFP23560 247 aa29.2■■■□□ 2.26
FAAP20-204ENST00000400919 GBP2P32456 591 aaPredicted RBP29.2■■■□□ 2.26
FAAP20-204ENST00000400919 NTHL1P78549 312 aa29.2■■■□□ 2.26
FAAP20-204ENST00000400919 EXOC3L4Q17RC7 722 aa29.2■■■□□ 2.26
FAAP20-204ENST00000400919 DNAJB7Q7Z6W7 309 aaPredicted RBP29.2■■■□□ 2.26
FAAP20-204ENST00000400919 SCN4BQ8IWT1 228 aa29.2■■■□□ 2.26
FAAP20-204ENST00000400919 ARID3AQ99856 593 aa29.2■■■□□ 2.26
FAAP20-204ENST00000400919 INTS2Q9H0H0 1204 aaKnown RBP29.2■■■□□ 2.26
FAAP20-204ENST00000400919 HMGXB4Q9UGU5 601 aa29.2■■■□□ 2.26
FAAP20-204ENST00000400919 ATF6P18850 670 aa29.19■■■□□ 2.26
FAAP20-204ENST00000400919 CDK11BP21127 795 aaKnown RBP29.19■■■□□ 2.26
FAAP20-204ENST00000400919 GRIK1P39086 918 aa29.19■■■□□ 2.26
FAAP20-204ENST00000400919 ZNF165P49910 485 aa29.19■■■□□ 2.26
FAAP20-204ENST00000400919 ZSCAN23Q3MJ62 389 aa29.19■■■□□ 2.26
FAAP20-204ENST00000400919 GET4Q7L5D6 327 aaPredicted RBP29.19■■■□□ 2.26
FAAP20-204ENST00000400919 AOPEPQ8N6M6 819 aa29.19■■■□□ 2.26
FAAP20-204ENST00000400919 FAM81BQ96LP2 452 aa29.19■■■□□ 2.26
FAAP20-204ENST00000400919 CEP295NLQ96MC4 621 aa29.19■■■□□ 2.26
FAAP20-204ENST00000400919 CRACR2AQ9BSW2 395 aa29.19■■■□□ 2.26
FAAP20-204ENST00000400919 MED10Q9BTT4 135 aa29.19■■■□□ 2.26
FAAP20-204ENST00000400919 ZFP37Q9Y6Q3 630 aaPredicted RBP29.19■■■□□ 2.26
FAAP20-204ENST00000400919 TRIM66O15016 1216 aa29.18■■■□□ 2.26
FAAP20-204ENST00000400919 FGF19O95750 216 aa29.18■■■□□ 2.26
FAAP20-204ENST00000400919 ANXA13P27216 316 aa29.18■■■□□ 2.26
FAAP20-204ENST00000400919 GCNT1Q02742 428 aa29.18■■■□□ 2.26
FAAP20-204ENST00000400919 DDR2Q16832 855 aa29.18■■■□□ 2.26
FAAP20-204ENST00000400919 LPIN3Q9BQK8 851 aa29.18■■■□□ 2.26
FAAP20-204ENST00000400919 FUCA2Q9BTY2 467 aa29.18■■■□□ 2.26
FAAP20-204ENST00000400919 B3GNT5Q9BYG0 378 aa29.18■■■□□ 2.26
FAAP20-204ENST00000400919 CAVIN2O95810 425 aa29.17■■■□□ 2.26
FAAP20-204ENST00000400919 CSH1P0DML2 217 aa29.17■■■□□ 2.26
FAAP20-204ENST00000400919 CSH2P0DML3 217 aa29.17■■■□□ 2.26
FAAP20-204ENST00000400919 EPHA5P54756 1037 aa29.17■■■□□ 2.26
FAAP20-204ENST00000400919 ORC1Q13415 861 aa29.17■■■□□ 2.26
FAAP20-204ENST00000400919 ZNF394Q53GI3 561 aa29.17■■■□□ 2.26
FAAP20-204ENST00000400919 WHAMMQ8TF30 809 aa29.17■■■□□ 2.26
FAAP20-204ENST00000400919 GIPC2Q8TF65 315 aa29.17■■■□□ 2.26
FAAP20-204ENST00000400919 TMEM176AQ96HP8 235 aa29.17■■■□□ 2.26
FAAP20-204ENST00000400919 HEXIM2Q96MH2 286 aaKnown RBP29.17■■■□□ 2.26
FAAP20-204ENST00000400919 TWNKQ96RR1 684 aa29.17■■■□□ 2.26
FAAP20-204ENST00000400919 BECN2A8MW95 431 aa29.16■■■□□ 2.26
FAAP20-204ENST00000400919 C2CD4DB7Z1M9 353 aa29.16■■■□□ 2.26
FAAP20-204ENST00000400919 MICAL2O94851 1124 aa29.16■■■□□ 2.26
FAAP20-204ENST00000400919 MYL4P12829 197 aa29.16■■■□□ 2.26
FAAP20-204ENST00000400919 MIIPQ5JXC2 388 aa29.16■■■□□ 2.26
FAAP20-204ENST00000400919 SMARCD1Q96GM5 515 aa29.16■■■□□ 2.26
FAAP20-204ENST00000400919 ZNF518BQ9C0D4 1074 aa29.16■■■□□ 2.26
FAAP20-204ENST00000400919 TCF20Q9UGU0 1960 aaKnown RBP29.16■■■□□ 2.26
FAAP20-204ENST00000400919 NCAPHQ15003 741 aa29.15■■■□□ 2.26
FAAP20-204ENST00000400919 KRT31Q15323 416 aa29.15■■■□□ 2.26
FAAP20-204ENST00000400919 TRIM65Q6PJ69 517 aa29.15■■■□□ 2.26
FAAP20-204ENST00000400919 RRAGAQ7L523 313 aa29.15■■■□□ 2.26
FAAP20-204ENST00000400919 ENOSF1Q7L5Y1 443 aa29.15■■■□□ 2.26
FAAP20-204ENST00000400919 ZDHHC14Q8IZN3 488 aa29.15■■■□□ 2.26
FAAP20-204ENST00000400919 HS6ST3Q8IZP7 471 aa29.15■■■□□ 2.26
FAAP20-204ENST00000400919 C12orf29Q8N999 325 aa29.15■■■□□ 2.26
FAAP20-204ENST00000400919 GPR152Q8TDT2 470 aa29.15■■■□□ 2.26
FAAP20-204ENST00000400919 JAKMIP2Q96AA8 810 aa29.15■■■□□ 2.26
FAAP20-204ENST00000400919 COL25A1Q9BXS0 654 aaPredicted RBP29.15■■■□□ 2.26
FAAP20-204ENST00000400919 TAB2Q9NYJ8 693 aa29.15■■■□□ 2.26
FAAP20-204ENST00000400919 CDH7Q9ULB5 785 aa29.15■■■□□ 2.26
FAAP20-204ENST00000400919 VCANP13611 3396 aa29.15■■■□□ 2.26
FAAP20-204ENST00000400919 CLDN5O00501 218 aa29.14■■■□□ 2.26
FAAP20-204ENST00000400919 GPR15P49685 360 aa29.14■■■□□ 2.26
FAAP20-204ENST00000400919 FAM35AQ86V20 835 aa29.14■■■□□ 2.26
FAAP20-204ENST00000400919 FUKQ8N0W3 1084 aa29.14■■■□□ 2.26
FAAP20-204ENST00000400919 ITFG1Q8TB96 612 aa29.14■■■□□ 2.26
FAAP20-204ENST00000400919 SLC2A14Q8TDB8 520 aa29.14■■■□□ 2.26
FAAP20-204ENST00000400919 FGF13Q92913 245 aa29.14■■■□□ 2.26
FAAP20-204ENST00000400919 CYFIP2Q96F07 1278 aa29.14■■■□□ 2.26
FAAP20-204ENST00000400919 SPATA17Q96L03 361 aa29.14■■■□□ 2.26
FAAP20-204ENST00000400919 C8orf48Q96LL4 319 aa29.14■■■□□ 2.26
FAAP20-204ENST00000400919 FAM49BQ9NUQ9 324 aa29.14■■■□□ 2.26
FAAP20-204ENST00000400919 EHD2Q9NZN4 543 aa29.14■■■□□ 2.26
FAAP20-204ENST00000400919 CCDC130P13994 396 aa29.13■■■□□ 2.25
FAAP20-204ENST00000400919 SLC9A1P19634 815 aa29.13■■■□□ 2.25
FAAP20-204ENST00000400919 RAD23BP54727 409 aa29.13■■■□□ 2.25
FAAP20-204ENST00000400919 SLC5A9Q2M3M2 681 aa29.13■■■□□ 2.25
FAAP20-204ENST00000400919 PHLDB3Q6NSJ2 640 aa29.13■■■□□ 2.25
FAAP20-204ENST00000400919 GCNAQ96QF7 691 aa29.13■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12.6 ms