RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000400053.8

PTPRM-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene PTPRM, Length 5,292 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-202ENST00000400053 PRPF18Q99633 342 aaKnown RBP9.24□□□□□ -0.93
PTPRM-202ENST00000400053 SPON2Q9BUD6 331 aa9.24□□□□□ -0.93
PTPRM-202ENST00000400053 SPATA16Q9BXB7 569 aa9.24□□□□□ -0.93
PTPRM-202ENST00000400053 GID8Q9NWU2 228 aa9.24□□□□□ -0.93
PTPRM-202ENST00000400053 HOXC10Q9NYD6 342 aa9.24□□□□□ -0.93
PTPRM-202ENST00000400053 KCND2Q9NZV8 630 aa9.24□□□□□ -0.93
PTPRM-202ENST00000400053 ARHGAP20Q9P2F6 1191 aa9.24□□□□□ -0.93
PTPRM-202ENST00000400053 CST8O60676 142 aa9.23□□□□□ -0.93
PTPRM-202ENST00000400053 KRT75O95678 551 aa9.23□□□□□ -0.93
PTPRM-202ENST00000400053 FAM153BP0C7A2 387 aa9.23□□□□□ -0.93
PTPRM-202ENST00000400053 HOXD10P28358 340 aa9.23□□□□□ -0.93
PTPRM-202ENST00000400053 SERPINB1P30740 379 aa9.23□□□□□ -0.93
PTPRM-202ENST00000400053 NUP62P37198 522 aaPredicted RBP9.23□□□□□ -0.93
PTPRM-202ENST00000400053 ACOT2P49753 483 aa9.23□□□□□ -0.93
PTPRM-202ENST00000400053 GPC3P51654 580 aa9.23□□□□□ -0.93
PTPRM-202ENST00000400053 CDC42EP1Q00587 391 aa9.23□□□□□ -0.93
PTPRM-202ENST00000400053 NME3Q13232 169 aa9.23□□□□□ -0.93
PTPRM-202ENST00000400053 FAM153CQ494X1 144 aa9.23□□□□□ -0.93
PTPRM-202ENST00000400053 CEP78Q5JTW2 689 aa9.23□□□□□ -0.93
PTPRM-202ENST00000400053 IYDQ6PHW0 289 aa9.23□□□□□ -0.93
PTPRM-202ENST00000400053 OTULINQ96BN8 352 aa9.23□□□□□ -0.93
PTPRM-202ENST00000400053 SENP7Q9BQF6 1050 aa9.23□□□□□ -0.93
PTPRM-202ENST00000400053 FAM153AQ9UHL3 310 aa9.23□□□□□ -0.93
PTPRM-202ENST00000400053 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa9.23□□□□□ -0.93
PTPRM-202ENST00000400053 APOL1O14791 398 aa9.23□□□□□ -0.93
PTPRM-202ENST00000400053 TRAPPC3O43617 180 aa9.23□□□□□ -0.93
PTPRM-202ENST00000400053 VCAM1P19320 739 aa9.23□□□□□ -0.93
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PTPRM-202ENST00000400053 MTDHQ86UE4 582 aaKnown RBP9.23□□□□□ -0.93
PTPRM-202ENST00000400053 YAF2Q8IY57 180 aa9.23□□□□□ -0.93
PTPRM-202ENST00000400053 RFWD2Q8NHY2 731 aa9.23□□□□□ -0.93
PTPRM-202ENST00000400053 MRPL48Q96GC5 212 aaKnown RBP9.23□□□□□ -0.93
PTPRM-202ENST00000400053 SIK2Q9H0K1 926 aa9.23□□□□□ -0.93
PTPRM-202ENST00000400053 SEMA4AQ9H3S1 761 aa9.23□□□□□ -0.93
PTPRM-202ENST00000400053 RNF146Q9NTX7 359 aa9.23□□□□□ -0.93
PTPRM-202ENST00000400053 SESN1Q9Y6P5 492 aa9.23□□□□□ -0.93
PTPRM-202ENST00000400053 ALDH1A1P00352 501 aa9.23□□□□□ -0.93
PTPRM-202ENST00000400053 PDGFRAP16234 1089 aa9.23□□□□□ -0.93
PTPRM-202ENST00000400053 HPCAP84074 193 aa9.23□□□□□ -0.93
PTPRM-202ENST00000400053 PLOD1Q02809 727 aaPredicted RBP9.23□□□□□ -0.93
PTPRM-202ENST00000400053 ANO4Q32M45 955 aa9.23□□□□□ -0.93
PTPRM-202ENST00000400053 WDR72Q3MJ13 1102 aa9.23□□□□□ -0.93
PTPRM-202ENST00000400053 SUGP1Q8IWZ8 645 aaKnown RBP9.23□□□□□ -0.93
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PTPRM-202ENST00000400053 MKNK1Q9BUB5 465 aa9.23□□□□□ -0.93
PTPRM-202ENST00000400053 POLR3FQ9H1D9 316 aaPredicted RBP9.23□□□□□ -0.93
PTPRM-202ENST00000400053 SMARCAD1Q9H4L7 1026 aa9.23□□□□□ -0.93
PTPRM-202ENST00000400053 IL1RL2Q9HB29 575 aa9.23□□□□□ -0.93
PTPRM-202ENST00000400053 NFKBIL1Q9UBC1 381 aaPredicted RBP9.23□□□□□ -0.93
PTPRM-202ENST00000400053 BCL9O00512 1426 aa9.23□□□□□ -0.93
PTPRM-202ENST00000400053 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP9.23□□□□□ -0.93
PTPRM-202ENST00000400053 RARGP13631 454 aa9.23□□□□□ -0.93
PTPRM-202ENST00000400053 RXRBP28702 533 aa9.23□□□□□ -0.93
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PTPRM-202ENST00000400053 RGS4P49798 205 aa9.23□□□□□ -0.93
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PTPRM-202ENST00000400053 SMTNL2Q2TAL5 461 aa9.23□□□□□ -0.93
PTPRM-202ENST00000400053 ZNF544Q6NX49 715 aa9.23□□□□□ -0.93
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PTPRM-202ENST00000400053 SPATA18Q8TC71 538 aa9.23□□□□□ -0.93
PTPRM-202ENST00000400053 MTMR8Q96EF0 704 aa9.23□□□□□ -0.93
PTPRM-202ENST00000400053 TIPINQ9BVW5 301 aa9.23□□□□□ -0.93
PTPRM-202ENST00000400053 SYBUQ9NX95 663 aa9.23□□□□□ -0.93
PTPRM-202ENST00000400053 MAP3K20Q9NYL2 800 aaKnown RBP9.23□□□□□ -0.93
PTPRM-202ENST00000400053 WDR35Q9P2L0 1181 aa9.23□□□□□ -0.93
PTPRM-202ENST00000400053 LSM7Q9UK45 103 aaKnown RBP9.23□□□□□ -0.93
PTPRM-202ENST00000400053 PRR12Q9ULL5 1215 aa9.23□□□□□ -0.93
PTPRM-202ENST00000400053 V9GYQ6 96 aa9.23□□□□□ -0.93
PTPRM-202ENST00000400053 JCADQ9P266 1359 aa9.23□□□□□ -0.93
PTPRM-202ENST00000400053 FAM205AQ6ZU69 1335 aa9.22□□□□□ -0.93
PTPRM-202ENST00000400053 RSPH10B2B2RC85 870 aa9.22□□□□□ -0.93
PTPRM-202ENST00000400053 SPAG6O75602 509 aa9.22□□□□□ -0.93
PTPRM-202ENST00000400053 RSPH10BP0C881 870 aa9.22□□□□□ -0.93
PTPRM-202ENST00000400053 ITGA4P13612 1032 aa9.22□□□□□ -0.93
PTPRM-202ENST00000400053 ADORA2BP29275 332 aa9.22□□□□□ -0.93
PTPRM-202ENST00000400053 MLH1P40692 756 aa9.22□□□□□ -0.93
PTPRM-202ENST00000400053 COPAP53621 1224 aa9.22□□□□□ -0.93
PTPRM-202ENST00000400053 TBX2Q13207 712 aaPredicted RBP9.22□□□□□ -0.93
PTPRM-202ENST00000400053 DUOXA2Q1HG44 320 aa9.22□□□□□ -0.93
PTPRM-202ENST00000400053 BTBD8Q5XKL5 378 aa9.22□□□□□ -0.93
PTPRM-202ENST00000400053 C16orf89Q6UX73 402 aa9.22□□□□□ -0.93
PTPRM-202ENST00000400053 CALML6Q8TD86 181 aa9.22□□□□□ -0.93
PTPRM-202ENST00000400053 ACSF2Q96CM8 615 aaPredicted RBP9.22□□□□□ -0.93
PTPRM-202ENST00000400053 ARHGEF26Q96DR7 871 aa9.22□□□□□ -0.93
PTPRM-202ENST00000400053 CDC42EP4Q9H3Q1 356 aaKnown RBP9.22□□□□□ -0.93
PTPRM-202ENST00000400053 KCND1Q9NSA2 647 aa9.22□□□□□ -0.93
PTPRM-202ENST00000400053 CLCA2Q9UQC9 943 aa9.22□□□□□ -0.93
PTPRM-202ENST00000400053 ZC3H11BA0A1B0GUI2 810 aaPredicted RBP9.22□□□□□ -0.93
PTPRM-202ENST00000400053 C3orf70A6NLC5 250 aaPredicted RBP9.22□□□□□ -0.93
PTPRM-202ENST00000400053 SLC37A4O43826 429 aa9.22□□□□□ -0.93
PTPRM-202ENST00000400053 ATP9AO75110 1047 aa9.22□□□□□ -0.93
PTPRM-202ENST00000400053 RGS2P41220 211 aa9.22□□□□□ -0.93
PTPRM-202ENST00000400053 CACNA2D1P54289 1103 aa9.22□□□□□ -0.93
PTPRM-202ENST00000400053 ACCSLQ4AC99 568 aa9.22□□□□□ -0.93
PTPRM-202ENST00000400053 EARS2Q5JPH6 523 aaKnown RBP9.22□□□□□ -0.93
PTPRM-202ENST00000400053 WLSQ5T9L3 541 aa9.22□□□□□ -0.93
PTPRM-202ENST00000400053 IZUMO2Q6UXV1 221 aa9.22□□□□□ -0.93
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