RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000393389.7

ANKRD42-202, Transcript of ankyrin repeat domain 42, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene ANKRD42, Length 4,066 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD42-202ENST00000393389 MAMLD1Q13495 774 aa9.07□□□□□ -0.96
ANKRD42-202ENST00000393389 LY6KQ17RY6 165 aa9.07□□□□□ -0.96
ANKRD42-202ENST00000393389 ATF7IP2Q5U623 682 aa9.07□□□□□ -0.96
ANKRD42-202ENST00000393389 CES3Q6UWW8 571 aa9.07□□□□□ -0.96
ANKRD42-202ENST00000393389 C15orf52Q6ZUT6 534 aaKnown RBP9.07□□□□□ -0.96
ANKRD42-202ENST00000393389 PRPF39Q86UA1 669 aaKnown RBP9.07□□□□□ -0.96
ANKRD42-202ENST00000393389 PPIL6Q8IXY8 311 aa9.07□□□□□ -0.96
ANKRD42-202ENST00000393389 AGGF1Q8N302 714 aaeCLIP9.07□□□□□ -0.96
ANKRD42-202ENST00000393389 EXD1Q8NHP7 514 aa9.07□□□□□ -0.96
ANKRD42-202ENST00000393389 CCT6BQ92526 530 aa9.07□□□□□ -0.96
ANKRD42-202ENST00000393389 ART4Q93070 314 aa9.07□□□□□ -0.96
ANKRD42-202ENST00000393389 CCDC22O60826 627 aa9.07□□□□□ -0.96
ANKRD42-202ENST00000393389 CRCPO75575 148 aa9.07□□□□□ -0.96
ANKRD42-202ENST00000393389 GSTA1P08263 222 aa9.07□□□□□ -0.96
ANKRD42-202ENST00000393389 GSTA2P09210 222 aa9.07□□□□□ -0.96
ANKRD42-202ENST00000393389 CHRNB2P17787 502 aa9.07□□□□□ -0.96
ANKRD42-202ENST00000393389 POU5F1BQ06416 359 aa9.07□□□□□ -0.96
ANKRD42-202ENST00000393389 MMRN1Q13201 1228 aa9.07□□□□□ -0.96
ANKRD42-202ENST00000393389 CUL3Q13618 768 aa9.07□□□□□ -0.96
ANKRD42-202ENST00000393389 EFCAB12Q6NXP0 572 aa9.07□□□□□ -0.96
ANKRD42-202ENST00000393389 ACOT1Q86TX2 421 aa9.07□□□□□ -0.96
ANKRD42-202ENST00000393389 FITM2Q8N6M3 262 aa9.07□□□□□ -0.96
ANKRD42-202ENST00000393389 TMC2Q8TDI7 906 aa9.07□□□□□ -0.96
ANKRD42-202ENST00000393389 USP33Q8TEY7 942 aa9.07□□□□□ -0.96
ANKRD42-202ENST00000393389 SEPT1Q8WYJ6 367 aa9.07□□□□□ -0.96
ANKRD42-202ENST00000393389 DCPSQ96C86 337 aaKnown RBP9.07□□□□□ -0.96
ANKRD42-202ENST00000393389 CPB2Q96IY4 423 aa9.07□□□□□ -0.96
ANKRD42-202ENST00000393389 GGA3Q9NZ52 723 aa9.07□□□□□ -0.96
ANKRD42-202ENST00000393389 TLK1Q9UKI8 766 aa9.07□□□□□ -0.96
ANKRD42-202ENST00000393389 PACSIN3Q9UKS6 424 aa9.07□□□□□ -0.96
ANKRD42-202ENST00000393389 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP9.07□□□□□ -0.96
ANKRD42-202ENST00000393389 GPC4O75487 556 aa9.06□□□□□ -0.96
ANKRD42-202ENST00000393389 DSG3P32926 999 aa9.06□□□□□ -0.96
ANKRD42-202ENST00000393389 NCALDP61601 193 aa9.06□□□□□ -0.96
ANKRD42-202ENST00000393389 CRADDP78560 199 aa9.06□□□□□ -0.96
ANKRD42-202ENST00000393389 YTHDF3Q7Z739 585 aaKnown RBP9.06□□□□□ -0.96
ANKRD42-202ENST00000393389 MAP4K3Q8IVH8 894 aa9.06□□□□□ -0.96
ANKRD42-202ENST00000393389 SIX6OS1Q8N1H7 587 aa9.06□□□□□ -0.96
ANKRD42-202ENST00000393389 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP9.06□□□□□ -0.96
ANKRD42-202ENST00000393389 PLEKHO2Q8TD55 490 aa9.06□□□□□ -0.96
ANKRD42-202ENST00000393389 ASAP3Q8TDY4 903 aa9.06□□□□□ -0.96
ANKRD42-202ENST00000393389 CKAP2Q8WWK9 683 aa9.06□□□□□ -0.96
ANKRD42-202ENST00000393389 RANBP17Q9H2T7 1088 aaKnown RBP9.06□□□□□ -0.96
ANKRD42-202ENST00000393389 ELP3Q9H9T3 547 aa9.06□□□□□ -0.96
ANKRD42-202ENST00000393389 FBXO6Q9NRD1 293 aaPredicted RBP9.06□□□□□ -0.96
ANKRD42-202ENST00000393389 SENP1Q9P0U3 644 aa9.06□□□□□ -0.96
ANKRD42-202ENST00000393389 ZFATQ9P243 1243 aa9.06□□□□□ -0.96
ANKRD42-202ENST00000393389 C15orf41Q9Y2V0 281 aa9.06□□□□□ -0.96
ANKRD42-202ENST00000393389 BCL9LQ86UU0 1499 aa9.06□□□□□ -0.96
ANKRD42-202ENST00000393389 DISP2A7MBM2 1401 aa9.06□□□□□ -0.96
ANKRD42-202ENST00000393389 DNALI1O14645 258 aaPredicted RBP9.06□□□□□ -0.96
ANKRD42-202ENST00000393389 APOL1O14791 398 aa9.06□□□□□ -0.96
ANKRD42-202ENST00000393389 PSTPIP1O43586 416 aa9.06□□□□□ -0.96
ANKRD42-202ENST00000393389 NPTXRO95502 500 aa9.06□□□□□ -0.96
ANKRD42-202ENST00000393389 CASP2P42575 452 aa9.06□□□□□ -0.96
ANKRD42-202ENST00000393389 VCPP55072 806 aaKnown RBP9.06□□□□□ -0.96
ANKRD42-202ENST00000393389 GTF2BQ00403 316 aa9.06□□□□□ -0.96
ANKRD42-202ENST00000393389 FAAP100Q0VG06 881 aa9.06□□□□□ -0.96
ANKRD42-202ENST00000393389 C15orf59Q2T9L4 293 aaPredicted RBP9.06□□□□□ -0.96
ANKRD42-202ENST00000393389 TATDN1Q6P1N9 297 aa9.06□□□□□ -0.96
ANKRD42-202ENST00000393389 SLFN11Q7Z7L1 901 aa9.06□□□□□ -0.96
ANKRD42-202ENST00000393389 C3orf20Q8ND61 904 aa9.06□□□□□ -0.96
ANKRD42-202ENST00000393389 ZNF75CPQ92670 426 aaPredicted RBP9.06□□□□□ -0.96
ANKRD42-202ENST00000393389 MTBPQ96DY7 904 aa9.06□□□□□ -0.96
ANKRD42-202ENST00000393389 DDX27Q96GQ7 796 aaKnown RBP9.06□□□□□ -0.96
ANKRD42-202ENST00000393389 NDE1Q9NXR1 346 aa9.06□□□□□ -0.96
ANKRD42-202ENST00000393389 KLK14Q9P0G3 267 aa9.06□□□□□ -0.96
ANKRD42-202ENST00000393389 MEI4A8MW99 385 aa9.06□□□□□ -0.96
ANKRD42-202ENST00000393389 KBTBD13C9JR72 458 aa9.06□□□□□ -0.96
ANKRD42-202ENST00000393389 ZWINTO95229 277 aa9.06□□□□□ -0.96
ANKRD42-202ENST00000393389 VTNP04004 478 aa9.06□□□□□ -0.96
ANKRD42-202ENST00000393389 CYP1A2P05177 515 aa9.06□□□□□ -0.96
ANKRD42-202ENST00000393389 TCF4P15884 667 aa9.06□□□□□ -0.96
ANKRD42-202ENST00000393389 PTGIRP43119 386 aa9.06□□□□□ -0.96
ANKRD42-202ENST00000393389 STX3Q13277 289 aa9.06□□□□□ -0.96
ANKRD42-202ENST00000393389 NBPF20Q3BBV1 942 aa9.06□□□□□ -0.96
ANKRD42-202ENST00000393389 SUPT20HL1Q3ZLR7 823 aa9.06□□□□□ -0.96
ANKRD42-202ENST00000393389 ANKRD20A2Q5SQ80 823 aa9.06□□□□□ -0.96
ANKRD42-202ENST00000393389 ANKRD20A1Q5TYW2 823 aa9.06□□□□□ -0.96
ANKRD42-202ENST00000393389 HACE1Q8IYU2 909 aa9.06□□□□□ -0.96
ANKRD42-202ENST00000393389 TTC8Q8TAM2 541 aa9.06□□□□□ -0.96
ANKRD42-202ENST00000393389 SGF29Q96ES7 293 aa9.06□□□□□ -0.96
ANKRD42-202ENST00000393389 TMEM120AQ9BXJ8 343 aa9.06□□□□□ -0.96
ANKRD42-202ENST00000393389 EME2A4GXA9 379 aaPredicted RBP9.05□□□□□ -0.96
ANKRD42-202ENST00000393389 VWA5AO00534 786 aa9.05□□□□□ -0.96
ANKRD42-202ENST00000393389 EDIL3O43854 480 aa9.05□□□□□ -0.96
ANKRD42-202ENST00000393389 LGR5O75473 907 aa9.05□□□□□ -0.96
ANKRD42-202ENST00000393389 SUPT20HL2P0C7V6 817 aa9.05□□□□□ -0.96
ANKRD42-202ENST00000393389 KCNA3P22001 575 aa9.05□□□□□ -0.96
ANKRD42-202ENST00000393389 GARTP22102 1010 aa9.05□□□□□ -0.96
ANKRD42-202ENST00000393389 ADSSP30520 456 aa9.05□□□□□ -0.96
ANKRD42-202ENST00000393389 KLC1Q07866 573 aa9.05□□□□□ -0.96
ANKRD42-202ENST00000393389 RPS6KA2Q15349 733 aa9.05□□□□□ -0.96
ANKRD42-202ENST00000393389 TRIM42Q8IWZ5 723 aa9.05□□□□□ -0.96
ANKRD42-202ENST00000393389 EFCAB3Q8N7B9 438 aa9.05□□□□□ -0.96
ANKRD42-202ENST00000393389 GLIS1Q8NBF1 620 aa9.05□□□□□ -0.96
ANKRD42-202ENST00000393389 E2F7Q96AV8 911 aa9.05□□□□□ -0.96
ANKRD42-202ENST00000393389 NAF1Q96HR8 494 aaKnown RBP9.05□□□□□ -0.96
ANKRD42-202ENST00000393389 HPDLQ96IR7 371 aa9.05□□□□□ -0.96
ANKRD42-202ENST00000393389 ANLNQ9NQW6 1124 aa9.05□□□□□ -0.96
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.9 ms