RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000373619.7

CITED1-202, Transcript of Cbp/p300 interacting transactivator with Glu/Asp rich carboxy-terminal domain 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene CITED1, Length 886 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CITED1-202ENST00000373619 TGM1P22735 817 aa15.08■□□□□ 0
CITED1-202ENST00000373619 CMA1P23946 247 aa15.08■□□□□ 0
CITED1-202ENST00000373619 PCSK1P29120 753 aa15.08■□□□□ 0
CITED1-202ENST00000373619 CASP1P29466 404 aa15.08■□□□□ 0
CITED1-202ENST00000373619 LHX1P48742 406 aa15.08■□□□□ 0
CITED1-202ENST00000373619 NLRP12P59046 1061 aa15.08■□□□□ 0
CITED1-202ENST00000373619 MYO1EQ12965 1108 aa15.08■□□□□ 0
CITED1-202ENST00000373619 NR1H3Q13133 447 aa15.08■□□□□ 0
CITED1-202ENST00000373619 ZNF268Q14587 947 aaPredicted RBP15.08■□□□□ 0
CITED1-202ENST00000373619 FBXO43Q4G163 708 aa15.08■□□□□ 0
CITED1-202ENST00000373619 AASDHQ4L235 1098 aaPredicted RBP15.08■□□□□ 0
CITED1-202ENST00000373619 L1TD1Q5T7N2 865 aaKnown RBP15.08■□□□□ 0
CITED1-202ENST00000373619 CACNA2D4Q7Z3S7 1137 aa15.08■□□□□ 0
CITED1-202ENST00000373619 SPATA2LQ8IUW3 424 aaPredicted RBP15.08■□□□□ 0
CITED1-202ENST00000373619 LRRC52Q8N7C0 313 aa15.08■□□□□ 0
CITED1-202ENST00000373619 IQUBQ8NA54 791 aa15.08■□□□□ 0
CITED1-202ENST00000373619 LOXL4Q96JB6 756 aa15.08■□□□□ 0
CITED1-202ENST00000373619 PI4K2AQ9BTU6 479 aa15.08■□□□□ 0
CITED1-202ENST00000373619 STRA6Q9BX79 667 aa15.08■□□□□ 0
CITED1-202ENST00000373619 FGFBP2Q9BYJ0 223 aa15.08■□□□□ 0
CITED1-202ENST00000373619 TMEM206Q9H813 350 aa15.08■□□□□ 0
CITED1-202ENST00000373619 IL21Q9HBE4 155 aa15.08■□□□□ 0
CITED1-202ENST00000373619 DDX43Q9NXZ2 648 aaKnown RBP15.08■□□□□ 0
CITED1-202ENST00000373619 FAM13BQ9NYF5 915 aa15.08■□□□□ 0
CITED1-202ENST00000373619 EHD2Q9NZN4 543 aa15.08■□□□□ 0
CITED1-202ENST00000373619 TBC1D7Q9P0N9 293 aa15.08■□□□□ 0
CITED1-202ENST00000373619 SERTAD1Q9UHV2 236 aa15.08■□□□□ 0
CITED1-202ENST00000373619 AGAP1Q9UPQ3 857 aa15.08■□□□□ 0
CITED1-202ENST00000373619 ATP6V1DQ9Y5K8 247 aa15.08■□□□□ 0
CITED1-202ENST00000373619 ATG2BQ96BY7 2078 aa15.07■□□□□ 0
CITED1-202ENST00000373619 TRAV19A0A0A6YYK7 116 aa15.07■□□□□ 0
CITED1-202ENST00000373619 FRMD3A2A2Y4 597 aa15.07■□□□□ 0
CITED1-202ENST00000373619 TRDMT1O14717 391 aaKnown RBP15.07■□□□□ 0
CITED1-202ENST00000373619 ITGB3P05106 788 aa15.07■□□□□ 0
CITED1-202ENST00000373619 USP17L7P0C7H9 530 aa15.07■□□□□ 0
CITED1-202ENST00000373619 PFKFB1P16118 471 aa15.07■□□□□ 0
CITED1-202ENST00000373619 POLR2BP30876 1174 aaKnown RBP15.07■□□□□ 0
CITED1-202ENST00000373619 IFNAR2P48551 515 aa15.07■□□□□ 0
CITED1-202ENST00000373619 RBP5P82980 135 aa15.07■□□□□ 0
CITED1-202ENST00000373619 KCNA1Q09470 495 aa15.07■□□□□ 0
CITED1-202ENST00000373619 SURF1Q15526 300 aa15.07■□□□□ 0
CITED1-202ENST00000373619 TMEM196Q5HYL7 178 aa15.07■□□□□ 0
CITED1-202ENST00000373619 PPM1JQ5JR12 505 aa15.07■□□□□ 0
CITED1-202ENST00000373619 C4orf50Q6ZRC1 276 aa15.07■□□□□ 0
CITED1-202ENST00000373619 LRRTM3Q86VH5 581 aa15.07■□□□□ 0
CITED1-202ENST00000373619 MON1AQ86VX9 555 aa15.07■□□□□ 0
CITED1-202ENST00000373619 BRSK2Q8IWQ3 736 aa15.07■□□□□ 0
CITED1-202ENST00000373619 EFCAB13Q8IY85 973 aa15.07■□□□□ 0
CITED1-202ENST00000373619 CAMKK1Q8N5S9 505 aa15.07■□□□□ 0
CITED1-202ENST00000373619 FAM160A2Q8N612 972 aaPredicted RBP15.07■□□□□ 0
CITED1-202ENST00000373619 CSGALNACT2Q8N6G5 542 aa15.07■□□□□ 0
CITED1-202ENST00000373619 GAB3Q8WWW8 586 aa15.07■□□□□ 0
CITED1-202ENST00000373619 ATP2A3Q93084 1043 aa15.07■□□□□ 0
CITED1-202ENST00000373619 HPS3Q969F9 1004 aa15.07■□□□□ 0
CITED1-202ENST00000373619 ACDQ96AP0 544 aa15.07■□□□□ 0
CITED1-202ENST00000373619 ANKRD36BP1Q96IX9 119 aa15.07■□□□□ 0
CITED1-202ENST00000373619 LRRC3BQ96PB8 259 aa15.07■□□□□ 0
CITED1-202ENST00000373619 FAM83CQ9BQN1 747 aa15.07■□□□□ 0
CITED1-202ENST00000373619 TRIM9Q9C026 710 aa15.07■□□□□ 0
CITED1-202ENST00000373619 LRRC27Q9C0I9 530 aa15.07■□□□□ 0
CITED1-202ENST00000373619 SCAND2PQ9GZW5 306 aaPredicted RBP15.07■□□□□ 0
CITED1-202ENST00000373619 SMG9Q9H0W8 520 aaKnown RBP15.07■□□□□ 0
CITED1-202ENST00000373619 TNMDQ9H2S6 317 aa15.07■□□□□ 0
CITED1-202ENST00000373619 CUEDC2Q9H467 287 aa15.07■□□□□ 0
CITED1-202ENST00000373619 EBF3Q9H4W6 596 aa15.07■□□□□ 0
CITED1-202ENST00000373619 OLFML3Q9NRN5 406 aa15.07■□□□□ 0
CITED1-202ENST00000373619 PANK4Q9NVE7 773 aa15.07■□□□□ 0
CITED1-202ENST00000373619 HPSEQ9Y251 543 aa15.07■□□□□ 0
CITED1-202ENST00000373619 HELZP42694 1942 aaKnown RBP15.06■□□□□ 0
CITED1-202ENST00000373619 ZFP91-CNTFA0A0A6YYC7 529 aaPredicted RBP15.06■□□□□ 0
CITED1-202ENST00000373619 TISP43B9A030 160 aa15.06■□□□□ 0
CITED1-202ENST00000373619 ACTN4O43707 911 aaKnown RBP15.06■□□□□ 0
CITED1-202ENST00000373619 PPP1R37O75864 691 aa15.06■□□□□ 0
CITED1-202ENST00000373619 AKAP3O75969 853 aa15.06■□□□□ 0
CITED1-202ENST00000373619 TNNC2P02585 160 aa15.06■□□□□ 0
CITED1-202ENST00000373619 F11P03951 625 aa15.06■□□□□ 0
CITED1-202ENST00000373619 CKMP06732 381 aa15.06■□□□□ 0
CITED1-202ENST00000373619 KCNA4P22459 653 aa15.06■□□□□ 0
CITED1-202ENST00000373619 CASP5P51878 434 aa15.06■□□□□ 0
CITED1-202ENST00000373619 DMWDQ09019 674 aa15.06■□□□□ 0
CITED1-202ENST00000373619 KCNB1Q14721 858 aa15.06■□□□□ 0
CITED1-202ENST00000373619 MAPRE1Q15691 268 aaKnown RBP15.06■□□□□ 0
CITED1-202ENST00000373619 INTS6LQ5JSJ4 861 aaKnown RBP15.06■□□□□ 0
CITED1-202ENST00000373619 TXNDC8Q6A555 127 aa15.06■□□□□ 0
CITED1-202ENST00000373619 GRAMD1CQ8IYS0 662 aa15.06■□□□□ 0
CITED1-202ENST00000373619 PDCL2Q8N4E4 241 aa15.06■□□□□ 0
CITED1-202ENST00000373619 TOP6BLQ8N6T0 577 aa15.06■□□□□ 0
CITED1-202ENST00000373619 GLIS3Q8NEA6 775 aa15.06■□□□□ 0
CITED1-202ENST00000373619 TTC16Q8NEE8 873 aa15.06■□□□□ 0
CITED1-202ENST00000373619 USP13Q92995 863 aaPredicted RBP15.06■□□□□ 0
CITED1-202ENST00000373619 SAAL1Q96ER3 474 aa15.06■□□□□ 0
CITED1-202ENST00000373619 TRMT2BQ96GJ1 504 aaKnown RBP15.06■□□□□ 0
CITED1-202ENST00000373619 FUBP3Q96I24 572 aaKnown RBP eCLIP15.06■□□□□ 0
CITED1-202ENST00000373619 P2RY13Q9BPV8 354 aa15.06■□□□□ 0
CITED1-202ENST00000373619 C7orf25Q9BPX7 421 aa15.06■□□□□ 0
CITED1-202ENST00000373619 BLZF1Q9H2G9 400 aa15.06■□□□□ 0
CITED1-202ENST00000373619 GOLPH3LQ9H4A5 285 aa15.06■□□□□ 0
CITED1-202ENST00000373619 TRPC7Q9HCX4 862 aa15.06■□□□□ 0
CITED1-202ENST00000373619 FAM237AA0A1B0GTK4 181 aa15.05■□□□□ -0
CITED1-202ENST00000373619 EXTL3O43909 919 aa15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.5 ms