RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000370542.1

LMO4-201, Transcript of LIM domain only 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LMO4, Length 1,260 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO4-201ENST00000370542 FAM13AO94988 1023 aa15.97■□□□□ 0.15
LMO4-201ENST00000370542 TYMPP19971 482 aa15.97■□□□□ 0.15
LMO4-201ENST00000370542 FCARP24071 287 aa15.97■□□□□ 0.15
LMO4-201ENST00000370542 CCR2P41597 374 aa15.97■□□□□ 0.15
LMO4-201ENST00000370542 LIG4P49917 911 aa15.97■□□□□ 0.15
LMO4-201ENST00000370542 SPAG1Q07617 926 aa15.97■□□□□ 0.15
LMO4-201ENST00000370542 MORC3Q14149 939 aa15.97■□□□□ 0.15
LMO4-201ENST00000370542 MLF2Q15773 248 aaPredicted RBP15.97■□□□□ 0.15
LMO4-201ENST00000370542 DNAJC21Q5F1R6 531 aaKnown RBP15.97■□□□□ 0.15
LMO4-201ENST00000370542 SHC4Q6S5L8 630 aa15.97■□□□□ 0.15
LMO4-201ENST00000370542 LEMD2Q8NC56 503 aa15.97■□□□□ 0.15
LMO4-201ENST00000370542 KIF12Q96FN5 646 aa15.97■□□□□ 0.15
LMO4-201ENST00000370542 BICD1Q96G01 975 aa15.97■□□□□ 0.15
LMO4-201ENST00000370542 PLA2G2FQ9BZM2 168 aa15.97■□□□□ 0.15
LMO4-201ENST00000370542 ANKZF1Q9H8Y5 726 aa15.97■□□□□ 0.15
LMO4-201ENST00000370542 CEP72Q9P209 647 aa15.97■□□□□ 0.15
LMO4-201ENST00000370542 DERAQ9Y315 318 aa15.97■□□□□ 0.15
LMO4-201ENST00000370542 PCDHA5Q9Y5H7 936 aa15.97■□□□□ 0.15
LMO4-201ENST00000370542 SRPRBQ9Y5M8 271 aaKnown RBP15.97■□□□□ 0.15
LMO4-201ENST00000370542 FAM208BQ5VWN6 2430 aa15.96■□□□□ 0.15
LMO4-201ENST00000370542 ANO9A1A5B4 782 aa15.96■□□□□ 0.15
LMO4-201ENST00000370542 SHISA7A6NL88 538 aa15.96■□□□□ 0.15
LMO4-201ENST00000370542 K7ENM7 598 aa15.96■□□□□ 0.15
LMO4-201ENST00000370542 PIRO00625 290 aa15.96■□□□□ 0.15
LMO4-201ENST00000370542 NRG2O14511 850 aaPredicted RBP15.96■□□□□ 0.15
LMO4-201ENST00000370542 DCNP07585 359 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.15
LMO4-201ENST00000370542 HOXB3P14651 431 aaPredicted RBP15.96■□□□□ 0.15
LMO4-201ENST00000370542 CEBPBP17676 345 aa15.96■□□□□ 0.15
LMO4-201ENST00000370542 MARCKSP29966 332 aaPredicted RBP15.96■□□□□ 0.15
LMO4-201ENST00000370542 LILRA4P59901 499 aa15.96■□□□□ 0.15
LMO4-201ENST00000370542 YWHAHQ04917 246 aaPredicted RBP15.96■□□□□ 0.15
LMO4-201ENST00000370542 CKAP4Q07065 602 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.15
LMO4-201ENST00000370542 ADCY1Q08828 1119 aa15.96■□□□□ 0.15
LMO4-201ENST00000370542 GPR17Q13304 367 aa15.96■□□□□ 0.15
LMO4-201ENST00000370542 CASP8Q14790 479 aa15.96■□□□□ 0.15
LMO4-201ENST00000370542 POSTNQ15063 836 aa15.96■□□□□ 0.15
LMO4-201ENST00000370542 SWT1Q5T5J6 900 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.15
LMO4-201ENST00000370542 TANGO2Q6ICL3 276 aa15.96■□□□□ 0.15
LMO4-201ENST00000370542 IQCEQ6IPM2 695 aa15.96■□□□□ 0.15
LMO4-201ENST00000370542 ZC3H14Q6PJT7 736 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.15
LMO4-201ENST00000370542 RNF19BQ6ZMZ0 732 aa15.96■□□□□ 0.15
LMO4-201ENST00000370542 GBP6Q6ZN66 633 aa15.96■□□□□ 0.15
LMO4-201ENST00000370542 USP49Q70CQ1 688 aa15.96■□□□□ 0.15
LMO4-201ENST00000370542 ZNF720Q7Z2F6 126 aa15.96■□□□□ 0.15
LMO4-201ENST00000370542 ING5Q8WYH8 240 aa15.96■□□□□ 0.15
LMO4-201ENST00000370542 TCEAL4Q96EI5 215 aa15.96■□□□□ 0.15
LMO4-201ENST00000370542 MCRS1Q96EZ8 462 aa15.96■□□□□ 0.15
LMO4-201ENST00000370542 EPSTI1Q96J88 318 aa15.96■□□□□ 0.15
LMO4-201ENST00000370542 KXD1Q9BQD3 176 aa15.96■□□□□ 0.15
LMO4-201ENST00000370542 PYM1Q9BRP8 204 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.15
LMO4-201ENST00000370542 TACO1Q9BSH4 297 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.15
LMO4-201ENST00000370542 LRRC3Q9BY71 257 aa15.96■□□□□ 0.15
LMO4-201ENST00000370542 FOXQ1Q9C009 403 aa15.96■□□□□ 0.15
LMO4-201ENST00000370542 ASB7Q9H672 318 aa15.96■□□□□ 0.15
LMO4-201ENST00000370542 RPF1Q9H9Y2 349 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.15
LMO4-201ENST00000370542 TRPV4Q9HBA0 871 aa15.96■□□□□ 0.15
LMO4-201ENST00000370542 FBXO2Q9UK22 296 aaPredicted RBP15.96■□□□□ 0.15
LMO4-201ENST00000370542 MAN1B1Q9UKM7 699 aa15.96■□□□□ 0.15
LMO4-201ENST00000370542 JRKLQ9Y4A0 524 aa15.96■□□□□ 0.15
LMO4-201ENST00000370542 NFE2L3Q9Y4A8 694 aa15.96■□□□□ 0.15
LMO4-201ENST00000370542 ANK1P16157 1881 aa15.95■□□□□ 0.14
LMO4-201ENST00000370542 OR6C75A6NL08 312 aa15.95■□□□□ 0.14
LMO4-201ENST00000370542 EIF3CLB5ME19 914 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
LMO4-201ENST00000370542 ANKRD63C9JTQ0 380 aa15.95■□□□□ 0.14
LMO4-201ENST00000370542 STK25O00506 426 aa15.95■□□□□ 0.14
LMO4-201ENST00000370542 FANCGO15287 622 aa15.95■□□□□ 0.14
LMO4-201ENST00000370542 CYP11A1P05108 521 aa15.95■□□□□ 0.14
LMO4-201ENST00000370542 NMT1P30419 496 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
LMO4-201ENST00000370542 ARPP19P56211 112 aa15.95■□□□□ 0.14
LMO4-201ENST00000370542 PNOCQ13519 176 aa15.95■□□□□ 0.14
LMO4-201ENST00000370542 MYBPC2Q14324 1141 aa15.95■□□□□ 0.14
LMO4-201ENST00000370542 CCDC70Q6NSX1 233 aa15.95■□□□□ 0.14
LMO4-201ENST00000370542 TOGARAM2Q6ZUX3 1019 aa15.95■□□□□ 0.14
LMO4-201ENST00000370542 SPATS2Q86XZ4 545 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
LMO4-201ENST00000370542 C1orf210Q8IVY1 113 aa15.95■□□□□ 0.14
LMO4-201ENST00000370542 MAML2Q8IZL2 1156 aaPredicted RBP15.95■□□□□ 0.14
LMO4-201ENST00000370542 EHBP1Q8NDI1 1231 aa15.95■□□□□ 0.14
LMO4-201ENST00000370542 ANKRD20A12PQ8NF67 263 aa15.95■□□□□ 0.14
LMO4-201ENST00000370542 CLDN23Q96B33 292 aa15.95■□□□□ 0.14
LMO4-201ENST00000370542 HVCN1Q96D96 273 aa15.95■□□□□ 0.14
LMO4-201ENST00000370542 ASB16Q96NS5 453 aa15.95■□□□□ 0.14
LMO4-201ENST00000370542 EIF3CQ99613 913 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
LMO4-201ENST00000370542 CORO1BQ9BR76 489 aa15.95■□□□□ 0.14
LMO4-201ENST00000370542 MSTO1Q9BUK6 570 aa15.95■□□□□ 0.14
LMO4-201ENST00000370542 TRPV5Q9NQA5 729 aa15.95■□□□□ 0.14
LMO4-201ENST00000370542 INTS13Q9NVM9 706 aa15.95■□□□□ 0.14
LMO4-201ENST00000370542 HSFX1Q9UBD0 423 aa15.95■□□□□ 0.14
LMO4-201ENST00000370542 STK17AQ9UEE5 414 aa15.95■□□□□ 0.14
LMO4-201ENST00000370542 C2CD2Q9Y426 696 aa15.95■□□□□ 0.14
LMO4-201ENST00000370542 ASPMQ8IZT6 3477 aa15.95■□□□□ 0.14
LMO4-201ENST00000370542 MIA3Q5JRA6 1907 aa15.94■□□□□ 0.14
LMO4-201ENST00000370542 PPEF2O14830 753 aa15.94■□□□□ 0.14
LMO4-201ENST00000370542 CLSTN1O94985 981 aa15.94■□□□□ 0.14
LMO4-201ENST00000370542 MATR3P43243 847 aaKnown RBP eCLIP15.94■□□□□ 0.14
LMO4-201ENST00000370542 TWF1Q12792 350 aa15.94■□□□□ 0.14
LMO4-201ENST00000370542 FZD5Q13467 585 aa15.94■□□□□ 0.14
LMO4-201ENST00000370542 FAM78AQ5JUQ0 283 aa15.94■□□□□ 0.14
LMO4-201ENST00000370542 JADE1Q6IE81 842 aa15.94■□□□□ 0.14
LMO4-201ENST00000370542 SLFN12LQ6IEE8 588 aa15.94■□□□□ 0.14
LMO4-201ENST00000370542 CRELD2Q6UXH1 353 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.4 ms