RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000328024.10

RAB11B-201, Transcript of RAB11B, member RAS oncogene family, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RAB11B, Length 1,751 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11B-201ENST00000328024 HAPLN1P10915 354 aaPredicted RBP21.46■■□□□ 1.03
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RAB11B-201ENST00000328024 GPR15P49685 360 aa21.46■■□□□ 1.03
RAB11B-201ENST00000328024 SMARCB1Q12824 385 aa21.46■■□□□ 1.03
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RAB11B-201ENST00000328024 NFE2Q16621 373 aaPredicted RBP21.46■■□□□ 1.03
RAB11B-201ENST00000328024 PTCRAQ6ISU1 281 aaPredicted RBP21.46■■□□□ 1.03
RAB11B-201ENST00000328024 PAQR9Q6ZVX9 377 aa21.46■■□□□ 1.03
RAB11B-201ENST00000328024 C12orf29Q8N999 325 aa21.46■■□□□ 1.03
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RAB11B-201ENST00000328024 TWF1Q12792 350 aa21.46■■□□□ 1.03
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RAB11B-201ENST00000328024 ATF6P18850 670 aa21.45■■□□□ 1.02
RAB11B-201ENST00000328024 TBXAS1P24557 533 aaPredicted RBP21.45■■□□□ 1.02
RAB11B-201ENST00000328024 KLK7P49862 253 aa21.45■■□□□ 1.02
RAB11B-201ENST00000328024 RAD23BP54727 409 aa21.45■■□□□ 1.02
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RAB11B-201ENST00000328024 RTL10Q7L3V2 364 aa21.45■■□□□ 1.02
RAB11B-201ENST00000328024 PHF6Q8IWS0 365 aaKnown RBP eCLIP21.45■■□□□ 1.02
RAB11B-201ENST00000328024 SLC4A11Q8NBS3 891 aa21.45■■□□□ 1.02
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RAB11B-201ENST00000328024 SEPT5Q99719 369 aaPredicted RBP21.45■■□□□ 1.02
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RAB11B-201ENST00000328024 TMEM30AQ9NV96 361 aa21.45■■□□□ 1.02
RAB11B-201ENST00000328024 HSFX1Q9UBD0 423 aa21.45■■□□□ 1.02
RAB11B-201ENST00000328024 RNF225M0QZC1 329 aaPredicted RBP21.44■■□□□ 1.02
RAB11B-201ENST00000328024 BMP1P13497 986 aa21.44■■□□□ 1.02
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RAB11B-201ENST00000328024 CACNA2D1P54289 1103 aa21.44■■□□□ 1.02
RAB11B-201ENST00000328024 NTHL1P78549 312 aa21.44■■□□□ 1.02
RAB11B-201ENST00000328024 CFAP221Q4G0U5 840 aa21.44■■□□□ 1.02
RAB11B-201ENST00000328024 ELMSAN1Q6PJG2 1045 aa21.44■■□□□ 1.02
RAB11B-201ENST00000328024 SPATA2LQ8IUW3 424 aaPredicted RBP21.44■■□□□ 1.02
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RAB11B-201ENST00000328024 NAP1L5Q96NT1 182 aaPredicted RBP21.44■■□□□ 1.02
RAB11B-201ENST00000328024 ZNF518BQ9C0D4 1074 aa21.44■■□□□ 1.02
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RAB11B-201ENST00000328024 GPR152Q8TDT2 470 aa21.43■■□□□ 1.02
RAB11B-201ENST00000328024 POMKQ9H5K3 350 aa21.43■■□□□ 1.02
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RAB11B-201ENST00000328024 FAM49BQ9NUQ9 324 aa21.43■■□□□ 1.02
RAB11B-201ENST00000328024 APEX2Q9UBZ4 518 aa21.43■■□□□ 1.02
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RAB11B-201ENST00000328024 MAPRE1Q15691 268 aaKnown RBP21.43■■□□□ 1.02
RAB11B-201ENST00000328024 SMAD2Q15796 467 aaKnown RBP21.43■■□□□ 1.02
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RAB11B-201ENST00000328024 C4orf50Q6ZRC1 276 aa21.43■■□□□ 1.02
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RAB11B-201ENST00000328024 TMEM270Q6UE05 265 aa21.41■■□□□ 1.02
RAB11B-201ENST00000328024 HS6ST3Q8IZP7 471 aa21.41■■□□□ 1.02
RAB11B-201ENST00000328024 TTC39CQ8N584 583 aa21.41■■□□□ 1.02
RAB11B-201ENST00000328024 SLC2A14Q8TDB8 520 aa21.41■■□□□ 1.02
RAB11B-201ENST00000328024 LSM14BQ9BX40 385 aaKnown RBP21.41■■□□□ 1.02
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RAB11B-201ENST00000328024 EPHB6O15197 1021 aa21.41■■□□□ 1.02
RAB11B-201ENST00000328024 NOL4O94818 638 aa21.41■■□□□ 1.02
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