RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000311659.4

UBQLN3-201, Transcript of ubiquilin 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene UBQLN3, Length 2,407 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBQLN3-201ENST00000311659 TMEM120AQ9BXJ8 343 aa8.92□□□□□ -0.98
UBQLN3-201ENST00000311659 C1orf112Q9NSG2 853 aa8.92□□□□□ -0.98
UBQLN3-201ENST00000311659 PKD2L1Q9P0L9 805 aa8.92□□□□□ -0.98
UBQLN3-201ENST00000311659 ZNF70Q9UC06 446 aaPredicted RBP8.92□□□□□ -0.98
UBQLN3-201ENST00000311659 USTQ9Y2C2 406 aa8.92□□□□□ -0.98
UBQLN3-201ENST00000311659 MTO1Q9Y2Z2 717 aaKnown RBP8.92□□□□□ -0.98
UBQLN3-201ENST00000311659 MRPL11Q9Y3B7 192 aaKnown RBP8.92□□□□□ -0.98
UBQLN3-201ENST00000311659 MAGEA13PA6NCF6 341 aa8.91□□□□□ -0.98
UBQLN3-201ENST00000311659 A8MXQ7 604 aa8.91□□□□□ -0.98
UBQLN3-201ENST00000311659 TCP10L2B9ZVM9 353 aa8.91□□□□□ -0.98
UBQLN3-201ENST00000311659 E7ESA3 106 aa8.91□□□□□ -0.98
UBQLN3-201ENST00000311659 WNT10BO00744 389 aa8.91□□□□□ -0.98
UBQLN3-201ENST00000311659 TLR3O15455 904 aaKnown RBP8.91□□□□□ -0.98
UBQLN3-201ENST00000311659 HSD17B4P51659 736 aa8.91□□□□□ -0.98
UBQLN3-201ENST00000311659 NEK3P51956 506 aa8.91□□□□□ -0.98
UBQLN3-201ENST00000311659 ARFIP2P53365 341 aa8.91□□□□□ -0.98
UBQLN3-201ENST00000311659 BPIFB4P59827 614 aa8.91□□□□□ -0.98
UBQLN3-201ENST00000311659 HIF1AQ16665 826 aa8.91□□□□□ -0.98
UBQLN3-201ENST00000311659 GSTA3Q16772 222 aa8.91□□□□□ -0.98
UBQLN3-201ENST00000311659 SPOCD1Q6ZMY3 1216 aa8.91□□□□□ -0.98
UBQLN3-201ENST00000311659 NIPA1Q7RTP0 329 aa8.91□□□□□ -0.98
UBQLN3-201ENST00000311659 C4orf19Q8IY42 314 aa8.91□□□□□ -0.98
UBQLN3-201ENST00000311659 ABRAQ8N0Z2 381 aa8.91□□□□□ -0.98
UBQLN3-201ENST00000311659 ATP11CQ8NB49 1132 aa8.91□□□□□ -0.98
UBQLN3-201ENST00000311659 IL31RAQ8NI17 732 aa8.91□□□□□ -0.98
UBQLN3-201ENST00000311659 SLC35B2Q8TB61 432 aa8.91□□□□□ -0.98
UBQLN3-201ENST00000311659 FEZF2Q8TBJ5 459 aa8.91□□□□□ -0.98
UBQLN3-201ENST00000311659 ALKBH8Q96BT7 664 aaKnown RBP8.91□□□□□ -0.98
UBQLN3-201ENST00000311659 ZNF184Q99676 751 aaPredicted RBP8.91□□□□□ -0.98
UBQLN3-201ENST00000311659 TSSK1BQ9BXA7 367 aa8.91□□□□□ -0.98
UBQLN3-201ENST00000311659 AGO4Q9HCK5 861 aaKnown RBP8.91□□□□□ -0.98
UBQLN3-201ENST00000311659 COL20A1Q9P218 1284 aa8.91□□□□□ -0.98
UBQLN3-201ENST00000311659 CNTN3Q9P232 1028 aa8.91□□□□□ -0.98
UBQLN3-201ENST00000311659 POLIQ9UNA4 740 aa8.91□□□□□ -0.98
UBQLN3-201ENST00000311659 SNCAIPQ9Y6H5 919 aa8.91□□□□□ -0.98
UBQLN3-201ENST00000311659 SCINQ9Y6U3 715 aa8.91□□□□□ -0.98
UBQLN3-201ENST00000311659 WASF2Q9Y6W5 498 aa8.91□□□□□ -0.98
UBQLN3-201ENST00000311659 hCG_1818297A0A087WSY0 165 aa8.91□□□□□ -0.98
UBQLN3-201ENST00000311659 TCRBV5S1A1TA0A578 114 aa8.91□□□□□ -0.98
UBQLN3-201ENST00000311659 NDC80O14777 642 aa8.91□□□□□ -0.98
UBQLN3-201ENST00000311659 ATP2A1O14983 1001 aa8.91□□□□□ -0.98
UBQLN3-201ENST00000311659 EGFRP00533 1210 aa8.91□□□□□ -0.98
UBQLN3-201ENST00000311659 ATF7P17544 494 aaPredicted RBP8.91□□□□□ -0.98
UBQLN3-201ENST00000311659 RPL7AP62424 266 aaKnown RBP8.91□□□□□ -0.98
UBQLN3-201ENST00000311659 C1QBPQ07021 282 aaKnown RBP8.91□□□□□ -0.98
UBQLN3-201ENST00000311659 FNBP1LQ5T0N5 605 aa8.91□□□□□ -0.98
UBQLN3-201ENST00000311659 LRRC38Q5VT99 294 aa8.91□□□□□ -0.98
UBQLN3-201ENST00000311659 ANKRD22Q5VYY1 191 aa8.91□□□□□ -0.98
UBQLN3-201ENST00000311659 KAZNQ674X7 775 aa8.91□□□□□ -0.98
UBQLN3-201ENST00000311659 SH2D5Q6ZV89 423 aa8.91□□□□□ -0.98
UBQLN3-201ENST00000311659 USP37Q86T82 979 aa8.91□□□□□ -0.98
UBQLN3-201ENST00000311659 TTC7BQ86TV6 843 aa8.91□□□□□ -0.98
UBQLN3-201ENST00000311659 PASD1Q8IV76 773 aa8.91□□□□□ -0.98
UBQLN3-201ENST00000311659 PIAS4Q8N2W9 510 aaPredicted RBP8.91□□□□□ -0.98
UBQLN3-201ENST00000311659 GPD1LQ8N335 351 aa8.91□□□□□ -0.98
UBQLN3-201ENST00000311659 DTX3LQ8TDB6 740 aa8.91□□□□□ -0.98
UBQLN3-201ENST00000311659 ACER1Q8TDN7 264 aa8.91□□□□□ -0.98
UBQLN3-201ENST00000311659 BSNDQ8WZ55 320 aa8.91□□□□□ -0.98
UBQLN3-201ENST00000311659 MCUR1Q96AQ8 359 aa8.91□□□□□ -0.98
UBQLN3-201ENST00000311659 ZBED3Q96IU2 234 aaPredicted RBP8.91□□□□□ -0.98
UBQLN3-201ENST00000311659 SENP7Q9BQF6 1050 aa8.91□□□□□ -0.98
UBQLN3-201ENST00000311659 TMEM121Q9BTD3 319 aa8.91□□□□□ -0.98
UBQLN3-201ENST00000311659 FAM192AQ9GZU8 254 aa8.91□□□□□ -0.98
UBQLN3-201ENST00000311659 IP6K2Q9UHH9 426 aa8.91□□□□□ -0.98
UBQLN3-201ENST00000311659 TMX2Q9Y320 296 aa8.91□□□□□ -0.98
UBQLN3-201ENST00000311659 TMEM191CA6NGB0 347 aa8.9□□□□□ -0.98
UBQLN3-201ENST00000311659 F8W8V4 182 aa8.9□□□□□ -0.98
UBQLN3-201ENST00000311659 GOLGA8RI6L899 631 aa8.9□□□□□ -0.98
UBQLN3-201ENST00000311659 MAGEC1O60732 1142 aa8.9□□□□□ -0.98
UBQLN3-201ENST00000311659 PIAS1O75925 651 aa8.9□□□□□ -0.98
UBQLN3-201ENST00000311659 KRT1P04264 644 aa8.9□□□□□ -0.98
UBQLN3-201ENST00000311659 TMEM191BP0C7N4 346 aa8.9□□□□□ -0.98
UBQLN3-201ENST00000311659 AMPD1P23109 780 aa8.9□□□□□ -0.98
UBQLN3-201ENST00000311659 PHBP35232 272 aa8.9□□□□□ -0.98
UBQLN3-201ENST00000311659 CDKN2BP42772 138 aa8.9□□□□□ -0.98
UBQLN3-201ENST00000311659 KLHL38Q2WGJ6 581 aa8.9□□□□□ -0.98
UBQLN3-201ENST00000311659 TXNRD3NBQ6F5E7 133 aa8.9□□□□□ -0.98
UBQLN3-201ENST00000311659 SAMD7Q7Z3H4 446 aa8.9□□□□□ -0.98
UBQLN3-201ENST00000311659 GPC2Q8N158 579 aa8.9□□□□□ -0.98
UBQLN3-201ENST00000311659 NAT8LQ8N9F0 302 aa8.9□□□□□ -0.98
UBQLN3-201ENST00000311659 CPT1BQ92523 772 aa8.9□□□□□ -0.98
UBQLN3-201ENST00000311659 OXNAD1Q96HP4 312 aaPredicted RBP8.9□□□□□ -0.98
UBQLN3-201ENST00000311659 FGD4Q96M96 766 aa8.9□□□□□ -0.98
UBQLN3-201ENST00000311659 NR1H4Q96RI1 486 aaPredicted RBP8.9□□□□□ -0.98
UBQLN3-201ENST00000311659 NTPCRQ9BSD7 190 aaKnown RBP8.9□□□□□ -0.98
UBQLN3-201ENST00000311659 RNF181Q9P0P0 153 aa8.9□□□□□ -0.98
UBQLN3-201ENST00000311659 CNTN6Q9UQ52 1028 aa8.9□□□□□ -0.98
UBQLN3-201ENST00000311659 UBIAD1Q9Y5Z9 338 aa8.9□□□□□ -0.98
UBQLN3-201ENST00000311659 IVNS1ABPQ9Y6Y0 642 aa8.9□□□□□ -0.98
UBQLN3-201ENST00000311659 CAPN14A8MX76 684 aa8.9□□□□□ -0.99
UBQLN3-201ENST00000311659 GOLGA8SH3BPF8 625 aa8.9□□□□□ -0.99
UBQLN3-201ENST00000311659 GOLGA8MH3BSY2 632 aa8.9□□□□□ -0.99
UBQLN3-201ENST00000311659 FCHO1O14526 889 aa8.9□□□□□ -0.99
UBQLN3-201ENST00000311659 MAP3K7O43318 606 aa8.9□□□□□ -0.99
UBQLN3-201ENST00000311659 RNF8O76064 485 aa8.9□□□□□ -0.99
UBQLN3-201ENST00000311659 SSR1P43307 286 aaKnown RBP8.9□□□□□ -0.99
UBQLN3-201ENST00000311659 WNT7BP56706 349 aa8.9□□□□□ -0.99
UBQLN3-201ENST00000311659 SLC18A2Q05940 514 aa8.9□□□□□ -0.99
UBQLN3-201ENST00000311659 THOC5Q13769 683 aaKnown RBP8.9□□□□□ -0.99
UBQLN3-201ENST00000311659 TKFCQ3LXA3 575 aa8.9□□□□□ -0.99
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.7 ms