RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000311308.6

TTC9B-201, Transcript of tetratricopeptide repeat domain 9B, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TTC9B, Length 843 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC9B-201ENST00000311308 ZBTB44Q8NCP5 570 aa21.63■■□□□ 1.05
TTC9B-201ENST00000311308 SECISBP2LQ93073 1101 aaKnown RBP21.63■■□□□ 1.05
TTC9B-201ENST00000311308 CCDC127Q96BQ5 260 aa21.63■■□□□ 1.05
TTC9B-201ENST00000311308 ZFYVE19Q96K21 471 aa21.63■■□□□ 1.05
TTC9B-201ENST00000311308 CGRRF1Q99675 332 aa21.63■■□□□ 1.05
TTC9B-201ENST00000311308 SYT15Q9BQS2 421 aa21.63■■□□□ 1.05
TTC9B-201ENST00000311308 MAGEC2Q9UBF1 373 aaPredicted RBP21.63■■□□□ 1.05
TTC9B-201ENST00000311308 RCOR1Q9UKL0 485 aa21.63■■□□□ 1.05
TTC9B-201ENST00000311308 CFAP54Q96N23 3096 aa21.63■■□□□ 1.05
TTC9B-201ENST00000311308 NOL4O94818 638 aa21.62■■□□□ 1.05
TTC9B-201ENST00000311308 SLFN14P0C7P3 912 aa21.62■■□□□ 1.05
TTC9B-201ENST00000311308 CHRNB1P11230 501 aa21.62■■□□□ 1.05
TTC9B-201ENST00000311308 MAGEA11P43364 429 aa21.62■■□□□ 1.05
TTC9B-201ENST00000311308 GPR15P49685 360 aa21.62■■□□□ 1.05
TTC9B-201ENST00000311308 CYP24A1Q07973 514 aa21.62■■□□□ 1.05
TTC9B-201ENST00000311308 TRPC3Q13507 836 aa21.62■■□□□ 1.05
TTC9B-201ENST00000311308 CUL4BQ13620 913 aa21.62■■□□□ 1.05
TTC9B-201ENST00000311308 KNOP1Q1ED39 458 aaKnown RBP21.62■■□□□ 1.05
TTC9B-201ENST00000311308 ITPRIPL2Q3MIP1 535 aa21.62■■□□□ 1.05
TTC9B-201ENST00000311308 SDHAF4Q5VUM1 108 aa21.62■■□□□ 1.05
TTC9B-201ENST00000311308 MON1AQ86VX9 555 aa21.62■■□□□ 1.05
TTC9B-201ENST00000311308 SCN4BQ8IWT1 228 aa21.62■■□□□ 1.05
TTC9B-201ENST00000311308 TRMT2BQ96GJ1 504 aaKnown RBP21.62■■□□□ 1.05
TTC9B-201ENST00000311308 LRRC3BQ96PB8 259 aa21.62■■□□□ 1.05
TTC9B-201ENST00000311308 PKMYT1Q99640 499 aa21.62■■□□□ 1.05
TTC9B-201ENST00000311308 TDP1Q9NUW8 608 aa21.62■■□□□ 1.05
TTC9B-201ENST00000311308 GTSE1Q9NYZ3 720 aa21.62■■□□□ 1.05
TTC9B-201ENST00000311308 EXOC3O60645 756 aa21.61■■□□□ 1.05
TTC9B-201ENST00000311308 FAM163BP0C2L3 166 aa21.61■■□□□ 1.05
TTC9B-201ENST00000311308 WARSP23381 471 aaKnown RBP21.61■■□□□ 1.05
TTC9B-201ENST00000311308 CASP1P29466 404 aa21.61■■□□□ 1.05
TTC9B-201ENST00000311308 CXCL12P48061 93 aa21.61■■□□□ 1.05
TTC9B-201ENST00000311308 SOX9P48436 509 aa21.61■■□□□ 1.05
TTC9B-201ENST00000311308 TNNC1P63316 161 aa21.61■■□□□ 1.05
TTC9B-201ENST00000311308 AMPD2Q01433 879 aa21.61■■□□□ 1.05
TTC9B-201ENST00000311308 FAM171BQ6P995 826 aa21.61■■□□□ 1.05
TTC9B-201ENST00000311308 TSSK4Q6SA08 328 aa21.61■■□□□ 1.05
TTC9B-201ENST00000311308 VSTM1Q6UX27 236 aa21.61■■□□□ 1.05
TTC9B-201ENST00000311308 LIMS2Q7Z4I7 341 aa21.61■■□□□ 1.05
TTC9B-201ENST00000311308 TMEM150AQ86TG1 271 aa21.61■■□□□ 1.05
TTC9B-201ENST00000311308 C12orf56Q8IXR9 622 aa21.61■■□□□ 1.05
TTC9B-201ENST00000311308 TTC8Q8TAM2 541 aa21.61■■□□□ 1.05
TTC9B-201ENST00000311308 MYRFLQ96LU7 910 aa21.61■■□□□ 1.05
TTC9B-201ENST00000311308 CEP295NLQ96MC4 621 aa21.61■■□□□ 1.05
TTC9B-201ENST00000311308 SMG9Q9H0W8 520 aaKnown RBP21.61■■□□□ 1.05
TTC9B-201ENST00000311308 SNX25Q9H3E2 840 aa21.61■■□□□ 1.05
TTC9B-201ENST00000311308 EXOC1Q9NV70 894 aa21.61■■□□□ 1.05
TTC9B-201ENST00000311308 EHD2Q9NZN4 543 aa21.61■■□□□ 1.05
TTC9B-201ENST00000311308 USP25Q9UHP3 1055 aa21.61■■□□□ 1.05
TTC9B-201ENST00000311308 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa21.61■■□□□ 1.05
TTC9B-201ENST00000311308 ANXA13P27216 316 aa21.6■■□□□ 1.05
TTC9B-201ENST00000311308 KRT85P78386 507 aa21.6■■□□□ 1.05
TTC9B-201ENST00000311308 PKP1Q13835 747 aa21.6■■□□□ 1.05
TTC9B-201ENST00000311308 ZNF268Q14587 947 aaPredicted RBP21.6■■□□□ 1.05
TTC9B-201ENST00000311308 TXNDC8Q6A555 127 aa21.6■■□□□ 1.05
TTC9B-201ENST00000311308 SCARA3Q6AZY7 606 aa21.6■■□□□ 1.05
TTC9B-201ENST00000311308 SYNPOQ8N3V7 929 aa21.6■■□□□ 1.05
TTC9B-201ENST00000311308 SPEM1Q8N4L4 309 aa21.6■■□□□ 1.05
TTC9B-201ENST00000311308 KBTBD7Q8WVZ9 684 aa21.6■■□□□ 1.05
TTC9B-201ENST00000311308 NELL1Q92832 810 aa21.6■■□□□ 1.05
TTC9B-201ENST00000311308 EXOC4Q96A65 974 aa21.6■■□□□ 1.05
TTC9B-201ENST00000311308 GKN1Q9NS71 199 aa21.6■■□□□ 1.05
TTC9B-201ENST00000311308 NCDNQ9UBB6 729 aa21.6■■□□□ 1.05
TTC9B-201ENST00000311308 SERTAD1Q9UHV2 236 aa21.6■■□□□ 1.05
TTC9B-201ENST00000311308 GVINP1Q7Z2Y8 2422 aa21.6■■□□□ 1.05
TTC9B-201ENST00000311308 TRAV19A0A0A6YYK7 116 aa21.59■■□□□ 1.05
TTC9B-201ENST00000311308 PHACTR2O75167 634 aa21.59■■□□□ 1.05
TTC9B-201ENST00000311308 CLSTN1O94985 981 aa21.59■■□□□ 1.05
TTC9B-201ENST00000311308 MYL1P05976 194 aa21.59■■□□□ 1.05
TTC9B-201ENST00000311308 PDGFRBP09619 1106 aa21.59■■□□□ 1.05
TTC9B-201ENST00000311308 LMO2P25791 158 aa21.59■■□□□ 1.05
TTC9B-201ENST00000311308 ATICP31939 592 aa21.59■■□□□ 1.05
TTC9B-201ENST00000311308 GNL1P36915 607 aaPredicted RBP21.59■■□□□ 1.05
TTC9B-201ENST00000311308 GRIK1P39086 918 aa21.59■■□□□ 1.05
TTC9B-201ENST00000311308 ID4P47928 161 aa21.59■■□□□ 1.05
TTC9B-201ENST00000311308 PDE6CP51160 858 aa21.59■■□□□ 1.05
TTC9B-201ENST00000311308 AP3M2P53677 418 aa21.59■■□□□ 1.05
TTC9B-201ENST00000311308 PSMC1P62191 440 aaKnown RBP21.59■■□□□ 1.05
TTC9B-201ENST00000311308 CYP27A1Q02318 531 aa21.59■■□□□ 1.05
TTC9B-201ENST00000311308 TNK2Q07912 1038 aa21.59■■□□□ 1.05
TTC9B-201ENST00000311308 PSMD2Q13200 908 aa21.59■■□□□ 1.05
TTC9B-201ENST00000311308 WDR72Q3MJ13 1102 aa21.59■■□□□ 1.05
TTC9B-201ENST00000311308 SUMF1Q8NBK3 374 aa21.59■■□□□ 1.05
TTC9B-201ENST00000311308 USP13Q92995 863 aaPredicted RBP21.59■■□□□ 1.05
TTC9B-201ENST00000311308 MYLPFQ96A32 169 aa21.59■■□□□ 1.05
TTC9B-201ENST00000311308 SYAP1Q96A49 352 aaPredicted RBP21.59■■□□□ 1.05
TTC9B-201ENST00000311308 TRPC7Q9HCX4 862 aa21.59■■□□□ 1.05
TTC9B-201ENST00000311308 RAB23Q9ULC3 237 aa21.59■■□□□ 1.05
TTC9B-201ENST00000311308 EP300Q09472 2414 aaPredicted RBP21.59■■□□□ 1.05
TTC9B-201ENST00000311308 TICRRQ7Z2Z1 1910 aa21.59■■□□□ 1.05
TTC9B-201ENST00000311308 TRIM66O15016 1216 aa21.58■■□□□ 1.05
TTC9B-201ENST00000311308 HCRTO43612 131 aa21.58■■□□□ 1.05
TTC9B-201ENST00000311308 LILRB5O75023 590 aa21.58■■□□□ 1.05
TTC9B-201ENST00000311308 TACC1O75410 805 aa21.58■■□□□ 1.05
TTC9B-201ENST00000311308 CKMP06732 381 aa21.58■■□□□ 1.05
TTC9B-201ENST00000311308 USP17L7P0C7H9 530 aa21.58■■□□□ 1.05
TTC9B-201ENST00000311308 CMA1P23946 247 aa21.58■■□□□ 1.05
TTC9B-201ENST00000311308 FOXK2Q01167 660 aa21.58■■□□□ 1.05
TTC9B-201ENST00000311308 FAM160A1Q05DH4 1040 aa21.58■■□□□ 1.05
TTC9B-201ENST00000311308 RUNX3Q13761 415 aa21.58■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.3 ms