RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000298838.10

PACSIN3-201, Transcript of protein kinase C and casein kinase substrate in neurons 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PACSIN3, Length 1,843 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3-201ENST00000298838 TCEAL1Q15170 157 aa21.94■■□□□ 1.1
PACSIN3-201ENST00000298838 PKDCCQ504Y2 493 aa21.94■■□□□ 1.1
PACSIN3-201ENST00000298838 MDH1BQ5I0G3 518 aa21.94■■□□□ 1.1
PACSIN3-201ENST00000298838 INTS6LQ5JSJ4 861 aaKnown RBP21.94■■□□□ 1.1
PACSIN3-201ENST00000298838 COL13A1Q5TAT6 717 aaPredicted RBP21.94■■□□□ 1.1
PACSIN3-201ENST00000298838 FAM171A1Q5VUB5 890 aa21.94■■□□□ 1.1
PACSIN3-201ENST00000298838 TTC30AQ86WT1 665 aa21.94■■□□□ 1.1
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PACSIN3-201ENST00000298838 DPF3Q92784 378 aa21.94■■□□□ 1.1
PACSIN3-201ENST00000298838 CALR3Q96L12 384 aaKnown RBP21.94■■□□□ 1.1
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PACSIN3-201ENST00000298838 CYTH4Q9UIA0 394 aa21.94■■□□□ 1.1
PACSIN3-201ENST00000298838 OAZ2O95190 189 aa21.93■■□□□ 1.1
PACSIN3-201ENST00000298838 RRM1P23921 792 aa21.93■■□□□ 1.1
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PACSIN3-201ENST00000298838 TMEM173Q86WV6 379 aaPredicted RBP21.93■■□□□ 1.1
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PACSIN3-201ENST00000298838 OR10T2Q8NGX3 314 aa21.92■■□□□ 1.1
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PACSIN3-201ENST00000298838 CXXC1Q9P0U4 656 aaPredicted RBP21.92■■□□□ 1.1
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PACSIN3-201ENST00000298838 MYBPHLA2RUH7 354 aa21.92■■□□□ 1.1
PACSIN3-201ENST00000298838 CCDC85CA6NKD9 419 aa21.92■■□□□ 1.1
PACSIN3-201ENST00000298838 LAG3P18627 525 aa21.92■■□□□ 1.1
PACSIN3-201ENST00000298838 FGFR3P22607 806 aa21.92■■□□□ 1.1
PACSIN3-201ENST00000298838 SLC8A3P57103 927 aa21.92■■□□□ 1.1
PACSIN3-201ENST00000298838 PLCB3Q01970 1234 aa21.92■■□□□ 1.1
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PACSIN3-201ENST00000298838 KCNT2Q6UVM3 1135 aa21.92■■□□□ 1.1
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PACSIN3-201ENST00000298838 CEP57Q86XR8 500 aa21.92■■□□□ 1.1
PACSIN3-201ENST00000298838 TPCN2Q8NHX9 752 aa21.92■■□□□ 1.1
PACSIN3-201ENST00000298838 ZNF564Q8TBZ8 553 aaPredicted RBP21.92■■□□□ 1.1
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PACSIN3-201ENST00000298838 HERVK_113Q902F9 699 aa21.92■■□□□ 1.1
PACSIN3-201ENST00000298838 PCED1BQ96HM7 432 aa21.92■■□□□ 1.1
PACSIN3-201ENST00000298838 ZNF558Q96NG5 402 aa21.92■■□□□ 1.1
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PACSIN3-201ENST00000298838 CHORDC1Q9UHD1 332 aaPredicted RBP21.92■■□□□ 1.1
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PACSIN3-201ENST00000298838 FANCGO15287 622 aa21.91■■□□□ 1.1
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PACSIN3-201ENST00000298838 MTA2O94776 668 aa21.91■■□□□ 1.1
PACSIN3-201ENST00000298838 PDE4CQ08493 712 aa21.91■■□□□ 1.1
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PACSIN3-201ENST00000298838 C18orf8Q96DM3 657 aa21.91■■□□□ 1.1
PACSIN3-201ENST00000298838 MED10Q9BTT4 135 aa21.91■■□□□ 1.1
PACSIN3-201ENST00000298838 MIS12Q9H081 205 aa21.91■■□□□ 1.1
PACSIN3-201ENST00000298838 MTIF3Q9H2K0 278 aaKnown RBP21.91■■□□□ 1.1
PACSIN3-201ENST00000298838 ST7Q9NRC1 585 aa21.91■■□□□ 1.1
PACSIN3-201ENST00000298838 PARVAQ9NVD7 372 aa21.91■■□□□ 1.1
PACSIN3-201ENST00000298838 GRID2IPA4D2P6 1211 aa21.9■■□□□ 1.1
PACSIN3-201ENST00000298838 CTAGE9A4FU28 777 aa21.9■■□□□ 1.1
PACSIN3-201ENST00000298838 CAPN15O75808 1086 aa21.9■■□□□ 1.1
PACSIN3-201ENST00000298838 FAM171BQ6P995 826 aa21.9■■□□□ 1.1
PACSIN3-201ENST00000298838 SLC35F5Q8WV83 523 aa21.9■■□□□ 1.1
PACSIN3-201ENST00000298838 IGSF21Q96ID5 467 aa21.9■■□□□ 1.1
PACSIN3-201ENST00000298838 SLC9A7Q96T83 725 aa21.9■■□□□ 1.1
PACSIN3-201ENST00000298838 NAPGQ99747 312 aaPredicted RBP21.9■■□□□ 1.1
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PACSIN3-201ENST00000298838 B3GNT5Q9BYG0 378 aa21.9■■□□□ 1.1
PACSIN3-201ENST00000298838 SLC4A7Q9Y6M7 1214 aa21.9■■□□□ 1.1
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PACSIN3-201ENST00000298838 FAM200BP0CF97 657 aa21.89■■□□□ 1.09
PACSIN3-201ENST00000298838 GABRB2P47870 512 aa21.89■■□□□ 1.09
PACSIN3-201ENST00000298838 PMF1Q6P1K2 205 aa21.89■■□□□ 1.09
PACSIN3-201ENST00000298838 LLGL2Q6P1M3 1020 aa21.89■■□□□ 1.09
PACSIN3-201ENST00000298838 PAQR9Q6ZVX9 377 aa21.89■■□□□ 1.09
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