RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000296642.4

PGGT1B-201, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

TSL 3

Gene PGGT1B, Length 552 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-201ENST00000296642 TMEFF1Q8IYR6 380 aa8.5□□□□□ -1.05
PGGT1B-201ENST00000296642 GALNT15Q8N3T1 639 aa8.5□□□□□ -1.05
PGGT1B-201ENST00000296642 MINDY1Q8N5J2 469 aa8.5□□□□□ -1.05
PGGT1B-201ENST00000296642 KIAA1958Q8N8K9 716 aa8.5□□□□□ -1.05
PGGT1B-201ENST00000296642 OLIG1Q8TAK6 271 aa8.5□□□□□ -1.05
PGGT1B-201ENST00000296642 SPATA18Q8TC71 538 aa8.5□□□□□ -1.05
PGGT1B-201ENST00000296642 OXER1Q8TDS5 423 aa8.5□□□□□ -1.05
PGGT1B-201ENST00000296642 GIPC2Q8TF65 315 aa8.5□□□□□ -1.05
PGGT1B-201ENST00000296642 LRIG1Q96JA1 1093 aa8.5□□□□□ -1.05
PGGT1B-201ENST00000296642 TM6SF1Q9BZW5 370 aa8.5□□□□□ -1.05
PGGT1B-201ENST00000296642 ZCWPW1Q9H0M4 648 aa8.5□□□□□ -1.05
PGGT1B-201ENST00000296642 CRISPLD1Q9H336 500 aa8.5□□□□□ -1.05
PGGT1B-201ENST00000296642 IL21Q9HBE4 155 aa8.5□□□□□ -1.05
PGGT1B-201ENST00000296642 TRPC7Q9HCX4 862 aa8.5□□□□□ -1.05
PGGT1B-201ENST00000296642 PDRG1Q9NUG6 133 aa8.5□□□□□ -1.05
PGGT1B-201ENST00000296642 ABI2Q9NYB9 513 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
PGGT1B-201ENST00000296642 ARHGAP28Q9P2N2 729 aa8.5□□□□□ -1.05
PGGT1B-201ENST00000296642 DKK4Q9UBT3 224 aa8.5□□□□□ -1.05
PGGT1B-201ENST00000296642 TUBGCP4Q9UGJ1 667 aa8.5□□□□□ -1.05
PGGT1B-201ENST00000296642 PILRBQ9UKJ0 227 aa8.5□□□□□ -1.05
PGGT1B-201ENST00000296642 KIF26AQ9ULI4 1882 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
PGGT1B-201ENST00000296642 ZFYVE26Q68DK2 2539 aa8.5□□□□□ -1.05
PGGT1B-201ENST00000296642 ZNF638Q14966 1978 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
PGGT1B-201ENST00000296642 OTOL1A6NHN0 477 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
PGGT1B-201ENST00000296642 PRPF40AO75400 957 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
PGGT1B-201ENST00000296642 SOAT2O75908 522 aa8.49□□□□□ -1.05
PGGT1B-201ENST00000296642 VNN2O95498 520 aa8.49□□□□□ -1.05
PGGT1B-201ENST00000296642 CYP11A1P05108 521 aa8.49□□□□□ -1.05
PGGT1B-201ENST00000296642 FTH1P19P0C7X4 201 aa8.49□□□□□ -1.05
PGGT1B-201ENST00000296642 CXCL8P10145 99 aa8.49□□□□□ -1.05
PGGT1B-201ENST00000296642 HAPLN1P10915 354 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
PGGT1B-201ENST00000296642 ATF6P18850 670 aa8.49□□□□□ -1.05
PGGT1B-201ENST00000296642 U2AF2P26368 475 aaKnown RBP eCLIP8.49□□□□□ -1.05
PGGT1B-201ENST00000296642 EIF2DP41214 584 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
PGGT1B-201ENST00000296642 SEC13P55735 322 aa8.49□□□□□ -1.05
PGGT1B-201ENST00000296642 LILRA4P59901 499 aa8.49□□□□□ -1.05
PGGT1B-201ENST00000296642 MCL1Q07820 350 aa8.49□□□□□ -1.05
PGGT1B-201ENST00000296642 GNL2Q13823 731 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
PGGT1B-201ENST00000296642 EML3Q32P44 896 aa8.49□□□□□ -1.05
PGGT1B-201ENST00000296642 WDR45BQ5MNZ6 344 aa8.49□□□□□ -1.05
PGGT1B-201ENST00000296642 KRT79Q5XKE5 535 aa8.49□□□□□ -1.05
PGGT1B-201ENST00000296642 TXNDC8Q6A555 127 aa8.49□□□□□ -1.05
PGGT1B-201ENST00000296642 SDE2Q6IQ49 451 aa8.49□□□□□ -1.05
PGGT1B-201ENST00000296642 ZNF605Q86T29 641 aa8.49□□□□□ -1.05
PGGT1B-201ENST00000296642 DIS3L2Q8IYB7 885 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
PGGT1B-201ENST00000296642 RGL4Q8IZJ4 473 aa8.49□□□□□ -1.05
PGGT1B-201ENST00000296642 CCDC33Q8N5R6 958 aa8.49□□□□□ -1.05
PGGT1B-201ENST00000296642 LSM14AQ8ND56 463 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
PGGT1B-201ENST00000296642 KCNV2Q8TDN2 545 aa8.49□□□□□ -1.05
PGGT1B-201ENST00000296642 HMGB4Q8WW32 186 aa8.49□□□□□ -1.05
PGGT1B-201ENST00000296642 SPIRE2Q8WWL2 714 aa8.49□□□□□ -1.05
PGGT1B-201ENST00000296642 FOXJ1Q92949 421 aa8.49□□□□□ -1.05
PGGT1B-201ENST00000296642 PNKPQ96T60 521 aa8.49□□□□□ -1.05
PGGT1B-201ENST00000296642 NTPCRQ9BSD7 190 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
PGGT1B-201ENST00000296642 FBRSL1Q9HCM7 1045 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
PGGT1B-201ENST00000296642 DNAAF2Q9NVR5 837 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
PGGT1B-201ENST00000296642 KIAA1522Q9P206 1035 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
PGGT1B-201ENST00000296642 LRWD1Q9UFC0 647 aa8.49□□□□□ -1.05
PGGT1B-201ENST00000296642 KIAA1024Q9UPX6 916 aa8.49□□□□□ -1.05
PGGT1B-201ENST00000296642 CCL26Q9Y258 94 aa8.49□□□□□ -1.05
PGGT1B-201ENST00000296642 DERAQ9Y315 318 aa8.49□□□□□ -1.05
PGGT1B-201ENST00000296642 ATG2BQ96BY7 2078 aa8.49□□□□□ -1.05
PGGT1B-201ENST00000296642 TTC26A0AVF1 554 aa8.48□□□□□ -1.05
PGGT1B-201ENST00000296642 E9PAM4 449 aa8.48□□□□□ -1.05
PGGT1B-201ENST00000296642 CYB561D2O14569 222 aa8.48□□□□□ -1.05
PGGT1B-201ENST00000296642 HIP1RO75146 1068 aa8.48□□□□□ -1.05
PGGT1B-201ENST00000296642 NDUFS2O75306 463 aa8.48□□□□□ -1.05
PGGT1B-201ENST00000296642 ADH1CP00326 375 aa8.48□□□□□ -1.05
PGGT1B-201ENST00000296642 F11P03951 625 aa8.48□□□□□ -1.05
PGGT1B-201ENST00000296642 TCF3P15923 654 aa8.48□□□□□ -1.05
PGGT1B-201ENST00000296642 PTGER3P43115 390 aa8.48□□□□□ -1.05
PGGT1B-201ENST00000296642 ABCG1P45844 678 aa8.48□□□□□ -1.05
PGGT1B-201ENST00000296642 TAF6P49848 677 aa8.48□□□□□ -1.05
PGGT1B-201ENST00000296642 LIG4P49917 911 aa8.48□□□□□ -1.05
PGGT1B-201ENST00000296642 ZNF33AQ06730 810 aa8.48□□□□□ -1.05
PGGT1B-201ENST00000296642 SCRN1Q12765 414 aa8.48□□□□□ -1.05
PGGT1B-201ENST00000296642 SUZ12Q15022 739 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
PGGT1B-201ENST00000296642 ZNF77Q15935 545 aa8.48□□□□□ -1.05
PGGT1B-201ENST00000296642 SV2CQ496J9 727 aa8.48□□□□□ -1.05
PGGT1B-201ENST00000296642 EARS2Q5JPH6 523 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
PGGT1B-201ENST00000296642 SPATA1Q5VX52 437 aa8.48□□□□□ -1.05
PGGT1B-201ENST00000296642 BTBD8Q5XKL5 378 aa8.48□□□□□ -1.05
PGGT1B-201ENST00000296642 IL27RAQ6UWB1 636 aa8.48□□□□□ -1.05
PGGT1B-201ENST00000296642 LRRC69Q6ZNQ3 347 aa8.48□□□□□ -1.05
PGGT1B-201ENST00000296642 DDX42Q86XP3 938 aaKnown RBP eCLIP8.48□□□□□ -1.05
PGGT1B-201ENST00000296642 NAXDQ8IW45 347 aa8.48□□□□□ -1.05
PGGT1B-201ENST00000296642 SCUBE3Q8IX30 993 aa8.48□□□□□ -1.05
PGGT1B-201ENST00000296642 EFCAB13Q8IY85 973 aa8.48□□□□□ -1.05
PGGT1B-201ENST00000296642 KCTD17Q8N5Z5 321 aa8.48□□□□□ -1.05
PGGT1B-201ENST00000296642 TXNDC5Q8NBS9 432 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
PGGT1B-201ENST00000296642 RLN3Q8WXF3 142 aa8.48□□□□□ -1.05
PGGT1B-201ENST00000296642 TRMT2BQ96GJ1 504 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
PGGT1B-201ENST00000296642 ZNF560Q96MR9 790 aa8.48□□□□□ -1.05
PGGT1B-201ENST00000296642 PNMA5Q96PV4 448 aa8.48□□□□□ -1.05
PGGT1B-201ENST00000296642 CDC6Q99741 560 aa8.48□□□□□ -1.05
PGGT1B-201ENST00000296642 PI4K2AQ9BTU6 479 aa8.48□□□□□ -1.05
PGGT1B-201ENST00000296642 ABCB6Q9NP58 842 aa8.48□□□□□ -1.05
PGGT1B-201ENST00000296642 TMEM74BQ9NUR3 256 aa8.48□□□□□ -1.05
PGGT1B-201ENST00000296642 POLR3BQ9NW08 1133 aaPredicted RBP8.48□□□□□ -1.05
PGGT1B-201ENST00000296642 LARSQ9P2J5 1176 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
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