RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000237247.10

SGIP1-201, Transcript of SH3 domain GRB2 like endophilin interacting protein 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene SGIP1, Length 3,997 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGIP1-201ENST00000237247 SHROOM1Q2M3G4 852 aaPredicted RBP6.61□□□□□ -1.35
SGIP1-201ENST00000237247 ARL13BQ3SXY8 428 aa6.61□□□□□ -1.35
SGIP1-201ENST00000237247 EAPPQ56P03 285 aaPredicted RBP6.61□□□□□ -1.35
SGIP1-201ENST00000237247 CCSAPQ6IQ19 270 aaPredicted RBP6.61□□□□□ -1.35
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SGIP1-201ENST00000237247 DNAAF5Q86Y56 855 aa6.61□□□□□ -1.35
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SGIP1-201ENST00000237247 SPARCL1Q14515 664 aa6.6□□□□□ -1.35
SGIP1-201ENST00000237247 MESDQ14696 234 aa6.6□□□□□ -1.35
SGIP1-201ENST00000237247 COG2Q14746 738 aa6.6□□□□□ -1.35
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