RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000236273.8

SYF2-201, Transcript of SYF2 pre-mRNA splicing factor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SYF2, Length 1,345 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYF2-201ENST00000236273 SAMSN1Q9NSI8 373 aaKnown RBP23.76■■□□□ 1.39
SYF2-201ENST00000236273 MAGEC2Q9UBF1 373 aaPredicted RBP23.76■■□□□ 1.39
SYF2-201ENST00000236273 CILPO75339 1184 aa23.75■■□□□ 1.39
SYF2-201ENST00000236273 CLSTN1O94985 981 aa23.75■■□□□ 1.39
SYF2-201ENST00000236273 AFPP02771 609 aaKnown RBP23.75■■□□□ 1.39
SYF2-201ENST00000236273 HMGA1P17096 107 aaKnown RBP23.75■■□□□ 1.39
SYF2-201ENST00000236273 BDNFP23560 247 aa23.75■■□□□ 1.39
SYF2-201ENST00000236273 GBP2P32456 591 aaPredicted RBP23.75■■□□□ 1.39
SYF2-201ENST00000236273 CACNA2D1P54289 1103 aa23.75■■□□□ 1.39
SYF2-201ENST00000236273 KLHL40Q2TBA0 621 aa23.75■■□□□ 1.39
SYF2-201ENST00000236273 IQCEQ6IPM2 695 aa23.75■■□□□ 1.39
SYF2-201ENST00000236273 SASS6Q6UVJ0 657 aa23.75■■□□□ 1.39
SYF2-201ENST00000236273 C4orf50Q6ZRC1 276 aa23.75■■□□□ 1.39
SYF2-201ENST00000236273 ACOT1Q86TX2 421 aa23.75■■□□□ 1.39
SYF2-201ENST00000236273 STKLD1Q8NE28 680 aa23.75■■□□□ 1.39
SYF2-201ENST00000236273 ELOVL4Q9GZR5 314 aa23.75■■□□□ 1.39
SYF2-201ENST00000236273 IL21Q9HBE4 155 aa23.75■■□□□ 1.39
SYF2-201ENST00000236273 CDH7Q9ULB5 785 aa23.75■■□□□ 1.39
SYF2-201ENST00000236273 CLDN5O00501 218 aa23.74■■□□□ 1.39
SYF2-201ENST00000236273 MICAL2O94851 1124 aa23.74■■□□□ 1.39
SYF2-201ENST00000236273 CEBPBP17676 345 aa23.74■■□□□ 1.39
SYF2-201ENST00000236273 CYP27A1Q02318 531 aa23.74■■□□□ 1.39
SYF2-201ENST00000236273 WDR44Q5JSH3 913 aa23.74■■□□□ 1.39
SYF2-201ENST00000236273 GAREM2Q75VX8 874 aa23.74■■□□□ 1.39
SYF2-201ENST00000236273 NPAS3Q8IXF0 933 aa23.74■■□□□ 1.39
SYF2-201ENST00000236273 ELMOD1Q8N336 334 aa23.74■■□□□ 1.39
SYF2-201ENST00000236273 UBR7Q8N806 425 aa23.74■■□□□ 1.39
SYF2-201ENST00000236273 CCDC150Q8NCX0 1101 aa23.74■■□□□ 1.39
SYF2-201ENST00000236273 EHBP1Q8NDI1 1231 aa23.74■■□□□ 1.39
SYF2-201ENST00000236273 ANO10Q9NW15 660 aa23.74■■□□□ 1.39
SYF2-201ENST00000236273 MUTYHQ9UIF7 546 aa23.74■■□□□ 1.39
SYF2-201ENST00000236273 MRPS23Q9Y3D9 190 aaKnown RBP23.74■■□□□ 1.39
SYF2-201ENST00000236273 GREB1Q4ZG55 1949 aa23.73■■□□□ 1.39
SYF2-201ENST00000236273 PI4K2BG5E9Z4 385 aa23.73■■□□□ 1.39
SYF2-201ENST00000236273 GJA1P17302 382 aa23.73■■□□□ 1.39
SYF2-201ENST00000236273 CD58P19256 250 aa23.73■■□□□ 1.39
SYF2-201ENST00000236273 LRMPQ12912 555 aa23.73■■□□□ 1.39
SYF2-201ENST00000236273 MTMR3Q13615 1198 aa23.73■■□□□ 1.39
SYF2-201ENST00000236273 VSTM1Q6UX27 236 aa23.73■■□□□ 1.39
SYF2-201ENST00000236273 C12orf29Q8N999 325 aa23.73■■□□□ 1.39
SYF2-201ENST00000236273 SHKBP1Q8TBC3 707 aa23.73■■□□□ 1.39
SYF2-201ENST00000236273 ING5Q8WYH8 240 aa23.73■■□□□ 1.39
SYF2-201ENST00000236273 TNIP3Q96KP6 325 aa23.73■■□□□ 1.39
SYF2-201ENST00000236273 ZNF518BQ9C0D4 1074 aa23.73■■□□□ 1.39
SYF2-201ENST00000236273 ASAH2Q9NR71 780 aa23.73■■□□□ 1.39
SYF2-201ENST00000236273 CISHQ9NSE2 258 aa23.73■■□□□ 1.39
SYF2-201ENST00000236273 ANHXE9PGG2 379 aa23.72■■□□□ 1.39
SYF2-201ENST00000236273 ASGR2P07307 311 aa23.72■■□□□ 1.39
SYF2-201ENST00000236273 MYL4P12829 197 aa23.72■■□□□ 1.39
SYF2-201ENST00000236273 TYRO3Q06418 890 aa23.72■■□□□ 1.39
SYF2-201ENST00000236273 CUL2Q13617 745 aa23.72■■□□□ 1.39
SYF2-201ENST00000236273 STX1AQ16623 288 aa23.72■■□□□ 1.39
SYF2-201ENST00000236273 TPD52L1Q16890 204 aaPredicted RBP23.72■■□□□ 1.39
SYF2-201ENST00000236273 HSP90AA4PQ58FG1 418 aa23.72■■□□□ 1.39
SYF2-201ENST00000236273 CYP4A22Q5TCH4 519 aa23.72■■□□□ 1.39
SYF2-201ENST00000236273 PDZD4Q76G19 769 aaPredicted RBP23.72■■□□□ 1.39
SYF2-201ENST00000236273 TMEM150AQ86TG1 271 aa23.72■■□□□ 1.39
SYF2-201ENST00000236273 ITIH5Q86UX2 942 aa23.72■■□□□ 1.39
SYF2-201ENST00000236273 CREBRFQ8IUR6 639 aa23.72■■□□□ 1.39
SYF2-201ENST00000236273 FUKQ8N0W3 1084 aa23.72■■□□□ 1.39
SYF2-201ENST00000236273 LEMD2Q8NC56 503 aa23.72■■□□□ 1.39
SYF2-201ENST00000236273 FUCA2Q9BTY2 467 aa23.72■■□□□ 1.39
SYF2-201ENST00000236273 EPHX3Q9H6B9 360 aa23.72■■□□□ 1.39
SYF2-201ENST00000236273 NFE2L3Q9Y4A8 694 aa23.72■■□□□ 1.39
SYF2-201ENST00000236273 ZNF197O14709 1029 aa23.71■■□□□ 1.39
SYF2-201ENST00000236273 RPL10AP62906 217 aaKnown RBP23.71■■□□□ 1.39
SYF2-201ENST00000236273 MIIPQ5JXC2 388 aa23.71■■□□□ 1.39
SYF2-201ENST00000236273 ST13P5Q8NFI4 369 aaPredicted RBP23.71■■□□□ 1.39
SYF2-201ENST00000236273 RSAD2Q8WXG1 361 aa23.71■■□□□ 1.39
SYF2-201ENST00000236273 KAT5Q92993 513 aa23.71■■□□□ 1.39
SYF2-201ENST00000236273 MCRS1Q96EZ8 462 aa23.71■■□□□ 1.39
SYF2-201ENST00000236273 ZSWIM3Q96MP5 696 aa23.71■■□□□ 1.39
SYF2-201ENST00000236273 NT5C1AQ9BXI3 368 aa23.71■■□□□ 1.39
SYF2-201ENST00000236273 KCNK12Q9HB15 430 aa23.71■■□□□ 1.39
SYF2-201ENST00000236273 ZFP37Q9Y6Q3 630 aaPredicted RBP23.71■■□□□ 1.39
SYF2-201ENST00000236273 NOL4O94818 638 aa23.7■■□□□ 1.38
SYF2-201ENST00000236273 RAD23BP54727 409 aa23.7■■□□□ 1.38
SYF2-201ENST00000236273 NCAPHQ15003 741 aa23.7■■□□□ 1.38
SYF2-201ENST00000236273 CDKAL1Q5VV42 579 aa23.7■■□□□ 1.38
SYF2-201ENST00000236273 ARHGEF19Q8IW93 802 aa23.7■■□□□ 1.38
SYF2-201ENST00000236273 SCN4BQ8IWT1 228 aa23.7■■□□□ 1.38
SYF2-201ENST00000236273 SLC4A11Q8NBS3 891 aa23.7■■□□□ 1.38
SYF2-201ENST00000236273 FAM200AQ8TCP9 573 aa23.7■■□□□ 1.38
SYF2-201ENST00000236273 SPATA17Q96L03 361 aa23.7■■□□□ 1.38
SYF2-201ENST00000236273 C8orf48Q96LL4 319 aa23.7■■□□□ 1.38
SYF2-201ENST00000236273 MYRFLQ96LU7 910 aa23.7■■□□□ 1.38
SYF2-201ENST00000236273 RPP25Q9BUL9 199 aaKnown RBP23.7■■□□□ 1.38
SYF2-201ENST00000236273 FAM124BQ9H5Z6 455 aaPredicted RBP23.7■■□□□ 1.38
SYF2-201ENST00000236273 DENND4CQ5VZ89 1909 aa23.7■■□□□ 1.38
SYF2-201ENST00000236273 A0A1W2PRU2 124 aa23.69■■□□□ 1.38
SYF2-201ENST00000236273 SLC38A8A6NNN8 435 aa23.69■■□□□ 1.38
SYF2-201ENST00000236273 F8VP50 259 aa23.69■■□□□ 1.38
SYF2-201ENST00000236273 F11P03951 625 aa23.69■■□□□ 1.38
SYF2-201ENST00000236273 CCDC130P13994 396 aa23.69■■□□□ 1.38
SYF2-201ENST00000236273 ACO1P21399 889 aaKnown RBP23.69■■□□□ 1.38
SYF2-201ENST00000236273 GRIK1P39086 918 aa23.69■■□□□ 1.38
SYF2-201ENST00000236273 MTIF2P46199 727 aaKnown RBP23.69■■□□□ 1.38
SYF2-201ENST00000236273 HTR4Q13639 388 aa23.69■■□□□ 1.38
SYF2-201ENST00000236273 VEPH1Q14D04 833 aa23.69■■□□□ 1.38
SYF2-201ENST00000236273 TEAD2Q15562 447 aa23.69■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.6 ms