RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000089950.10

Rabggtb-201, Transcript of Geranylgeranyl transferase type-2 subunit beta, mousemouse

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene Rabggtb, Length 1,381 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabggtb-201ENSMUST00000089950 Pcdha11Q91Y19 950 aa13.53□□□□□ -0.24
Rabggtb-201ENSMUST00000089950 Afg3l1Q920A7 789 aaKnown RBP13.53□□□□□ -0.24
Rabggtb-201ENSMUST00000089950 Fam49bQ921M7 324 aa13.53□□□□□ -0.24
Rabggtb-201ENSMUST00000089950 Rab30Q923S9 203 aa13.53□□□□□ -0.24
Rabggtb-201ENSMUST00000089950 Mrpl9Q99N94 265 aaKnown RBP13.53□□□□□ -0.24
Rabggtb-201ENSMUST00000089950 Rpa3Q9CQ71 121 aa13.53□□□□□ -0.24
Rabggtb-201ENSMUST00000089950 Ctnnbl1Q9CWL8 563 aaKnown RBP13.53□□□□□ -0.24
Rabggtb-201ENSMUST00000089950 Pin4Q9CWW6 131 aa13.53□□□□□ -0.24
Rabggtb-201ENSMUST00000089950 GOLGA7BQ9D428 167 aa13.53□□□□□ -0.24
Rabggtb-201ENSMUST00000089950 Gm3404Q9D506 307 aa13.53□□□□□ -0.24
Rabggtb-201ENSMUST00000089950 Rpf2Q9JJ80 306 aaKnown RBP13.53□□□□□ -0.24
Rabggtb-201ENSMUST00000089950 Dclk1Q9JLM8 756 aa13.53□□□□□ -0.24
Rabggtb-201ENSMUST00000089950 Trpv2Q9WTR1 756 aa13.53□□□□□ -0.24
Rabggtb-201ENSMUST00000089950 Gm3127E9Q9P5 263 aa13.52□□□□□ -0.25
Rabggtb-201ENSMUST00000089950 Vmn2r111K7N674 857 aa13.52□□□□□ -0.25
Rabggtb-201ENSMUST00000089950 Gm3453K7N724 263 aa13.52□□□□□ -0.25
Rabggtb-201ENSMUST00000089950 Myl1P05977 188 aa13.52□□□□□ -0.25
Rabggtb-201ENSMUST00000089950 Rrm1P07742 792 aa13.52□□□□□ -0.25
Rabggtb-201ENSMUST00000089950 Mgat1P27808 447 aa13.52□□□□□ -0.25
Rabggtb-201ENSMUST00000089950 Gjb3P28231 270 aa13.52□□□□□ -0.25
Rabggtb-201ENSMUST00000089950 Eef1dP57776 281 aaKnown RBP13.52□□□□□ -0.25
Rabggtb-201ENSMUST00000089950 Ctnnb1Q02248 781 aaKnown RBP13.52□□□□□ -0.25
Rabggtb-201ENSMUST00000089950 Q3TQQ9 903 aa13.52□□□□□ -0.25
Rabggtb-201ENSMUST00000089950 Ccdc125Q5U465 500 aa13.52□□□□□ -0.25
Rabggtb-201ENSMUST00000089950 Smarcd1Q61466 515 aaKnown RBP13.52□□□□□ -0.25
Rabggtb-201ENSMUST00000089950 Mapk6Q61532 720 aa13.52□□□□□ -0.25
Rabggtb-201ENSMUST00000089950 Oca2Q62052 833 aa13.52□□□□□ -0.25
Rabggtb-201ENSMUST00000089950 Sema4bQ62179 823 aa13.52□□□□□ -0.25
Rabggtb-201ENSMUST00000089950 Scube3Q66PY1 993 aa13.52□□□□□ -0.25
Rabggtb-201ENSMUST00000089950 Nrg1Q6DR99 700 aa13.52□□□□□ -0.25
Rabggtb-201ENSMUST00000089950 Wdtc1Q80ZK9 677 aa13.52□□□□□ -0.25
Rabggtb-201ENSMUST00000089950 Tmco3Q8BH01 678 aa13.52□□□□□ -0.25
Rabggtb-201ENSMUST00000089950 Arhgef33Q8BW86 850 aa13.52□□□□□ -0.25
Rabggtb-201ENSMUST00000089950 Rhpn2Q8BWR8 686 aa13.52□□□□□ -0.25
Rabggtb-201ENSMUST00000089950 Tmprss4Q8VCA5 435 aa13.52□□□□□ -0.25
Rabggtb-201ENSMUST00000089950 Hip1Q8VD75 1029 aaKnown RBP13.52□□□□□ -0.25
Rabggtb-201ENSMUST00000089950 Pde2aQ922S4 916 aa13.52□□□□□ -0.25
Rabggtb-201ENSMUST00000089950 Ddx56Q9D0R4 546 aaKnown RBP13.52□□□□□ -0.25
Rabggtb-201ENSMUST00000089950 Ifi35Q9D8C4 286 aa13.52□□□□□ -0.25
Rabggtb-201ENSMUST00000089950 Tspan3Q9QY33 253 aa13.52□□□□□ -0.25
Rabggtb-201ENSMUST00000089950 Padi3Q9Z184 664 aa13.52□□□□□ -0.25
Rabggtb-201ENSMUST00000089950 Plxna1P70206 1894 aa13.51□□□□□ -0.25
Rabggtb-201ENSMUST00000089950 Rp1l1Q8CGM2 1859 aa13.51□□□□□ -0.25
Rabggtb-201ENSMUST00000089950 Edil3O35474 480 aa13.51□□□□□ -0.25
Rabggtb-201ENSMUST00000089950 BhmtO35490 407 aaKnown RBP13.51□□□□□ -0.25
Rabggtb-201ENSMUST00000089950 TertO70372 1122 aa13.51□□□□□ -0.25
Rabggtb-201ENSMUST00000089950 Enpp1P06802 906 aa13.51□□□□□ -0.25
Rabggtb-201ENSMUST00000089950 Nr2c2P49117 596 aa13.51□□□□□ -0.25
Rabggtb-201ENSMUST00000089950 UrosP51163 265 aa13.51□□□□□ -0.25
Rabggtb-201ENSMUST00000089950 Rhox5P52651 210 aa13.51□□□□□ -0.25
Rabggtb-201ENSMUST00000089950 RabggtbP53612 339 aa13.51□□□□□ -0.25
Rabggtb-201ENSMUST00000089950 Rad23aP54726 363 aa13.51□□□□□ -0.25
Rabggtb-201ENSMUST00000089950 Pi4k2aQ2TBE6 479 aa13.51□□□□□ -0.25
Rabggtb-201ENSMUST00000089950 Pank2Q3U4S0 443 aa13.51□□□□□ -0.25
Rabggtb-201ENSMUST00000089950 Pik3r6Q3U6Q4 756 aa13.51□□□□□ -0.25
Rabggtb-201ENSMUST00000089950 Mindy4Q3UQI9 744 aa13.51□□□□□ -0.25
Rabggtb-201ENSMUST00000089950 PighQ5M9N4 188 aa13.51□□□□□ -0.25
Rabggtb-201ENSMUST00000089950 Shroom1Q5SX79 823 aa13.51□□□□□ -0.25
Rabggtb-201ENSMUST00000089950 Sema5aQ62217 1077 aa13.51□□□□□ -0.25
Rabggtb-201ENSMUST00000089950 Xpo1Q6P5F9 1071 aaKnown RBP13.51□□□□□ -0.25
Rabggtb-201ENSMUST00000089950 DstykQ6XUX1 927 aa13.51□□□□□ -0.25
Rabggtb-201ENSMUST00000089950 Sytl5Q80T23 753 aa13.51□□□□□ -0.25
Rabggtb-201ENSMUST00000089950 Nod1Q8BHB0 953 aa13.51□□□□□ -0.25
Rabggtb-201ENSMUST00000089950 Rps6kc1Q8BLK9 1056 aa13.51□□□□□ -0.25
Rabggtb-201ENSMUST00000089950 Uba3Q8C878 462 aa13.51□□□□□ -0.25
Rabggtb-201ENSMUST00000089950 Cd209bQ8CJ91 325 aa13.51□□□□□ -0.25
Rabggtb-201ENSMUST00000089950 Olfr348Q8VGK3 313 aa13.51□□□□□ -0.25
Rabggtb-201ENSMUST00000089950 Lztr1Q9CQ33 837 aa13.51□□□□□ -0.25
Rabggtb-201ENSMUST00000089950 Lgals2Q9CQW5 130 aa13.51□□□□□ -0.25
Rabggtb-201ENSMUST00000089950 Cfap57Q9D180 1249 aa13.51□□□□□ -0.25
Rabggtb-201ENSMUST00000089950 Tubb4aQ9D6F9 444 aa13.51□□□□□ -0.25
Rabggtb-201ENSMUST00000089950 Ccdc91Q9D8L5 442 aa13.51□□□□□ -0.25
Rabggtb-201ENSMUST00000089950 St6galnac4Q9R2B6 360 aa13.51□□□□□ -0.25
Rabggtb-201ENSMUST00000089950 Col4a6B1AVK5 1691 aa13.51□□□□□ -0.25
Rabggtb-201ENSMUST00000089950 Gm4924A0A1B0GR71 966 aa13.5□□□□□ -0.25
Rabggtb-201ENSMUST00000089950 Skint6A7XUZ6 1240 aa13.5□□□□□ -0.25
Rabggtb-201ENSMUST00000089950 Gcom1E9PZ54 550 aa13.5□□□□□ -0.25
Rabggtb-201ENSMUST00000089950 Xirp1O70373 1129 aa13.5□□□□□ -0.25
Rabggtb-201ENSMUST00000089950 Scrg1O88745 98 aa13.5□□□□□ -0.25
Rabggtb-201ENSMUST00000089950 Itm2bO89051 266 aa13.5□□□□□ -0.25
Rabggtb-201ENSMUST00000089950 Vti1aO89116 217 aa13.5□□□□□ -0.25
Rabggtb-201ENSMUST00000089950 P01878 344 aa13.5□□□□□ -0.25
Rabggtb-201ENSMUST00000089950 Stat5aP42230 793 aa13.5□□□□□ -0.25
Rabggtb-201ENSMUST00000089950 Uchl4P58321 233 aa13.5□□□□□ -0.25
Rabggtb-201ENSMUST00000089950 Gabrb2P63137 512 aa13.5□□□□□ -0.25
Rabggtb-201ENSMUST00000089950 Meis3P97368 378 aa13.5□□□□□ -0.25
Rabggtb-201ENSMUST00000089950 MylpfP97457 169 aa13.5□□□□□ -0.25
Rabggtb-201ENSMUST00000089950 IhhP97812 411 aa13.5□□□□□ -0.25
Rabggtb-201ENSMUST00000089950 Stt3bQ3TDQ1 823 aa13.5□□□□□ -0.25
Rabggtb-201ENSMUST00000089950 Q3UE31 404 aa13.5□□□□□ -0.25
Rabggtb-201ENSMUST00000089950 MyzapQ3UIJ9 466 aa13.5□□□□□ -0.25
Rabggtb-201ENSMUST00000089950 Traf3Q60803 567 aa13.5□□□□□ -0.25
Rabggtb-201ENSMUST00000089950 EfsQ64355 560 aa13.5□□□□□ -0.25
Rabggtb-201ENSMUST00000089950 Mon1aQ6PDG8 556 aa13.5□□□□□ -0.25
Rabggtb-201ENSMUST00000089950 Zdhhc17Q80TN5 632 aa13.5□□□□□ -0.25
Rabggtb-201ENSMUST00000089950 Ints2Q80UK8 1198 aa13.5□□□□□ -0.25
Rabggtb-201ENSMUST00000089950 Csnk1g1Q8BTH8 459 aa13.5□□□□□ -0.25
Rabggtb-201ENSMUST00000089950 Nrip1Q8CBD1 1161 aa13.5□□□□□ -0.25
Rabggtb-201ENSMUST00000089950 Arl8aQ8VEH3 186 aa13.5□□□□□ -0.25
Rabggtb-201ENSMUST00000089950 Snx9Q91VH2 595 aa13.5□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 27.5 ms