RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000063006.11

Ccdc42-201, Transcript of Coiled-coil domain-containing protein 42, mousemouse

TSL 5 BASIC

Gene Ccdc42, Length 1,029 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Mbtps1Q9WTZ2 1052 aa9.75□□□□□ -0.85
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Ppp2r3dQ9Z176 491 aa9.75□□□□□ -0.85
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Efcab12V9GXH0 673 aa9.75□□□□□ -0.85
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Gm11983V9GXS8 105 aa9.75□□□□□ -0.85
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Col5a3Q9JLI2 1739 aa9.75□□□□□ -0.85
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Kif26aQ52KG5 1881 aa9.74□□□□□ -0.85
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Piezo1E2JF22 2547 aa9.74□□□□□ -0.85
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 IqccA2ADZ8 418 aa9.74□□□□□ -0.85
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Vmn2r121A2BE32 847 aa9.74□□□□□ -0.85
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Gm4846B2RWH8 538 aa9.74□□□□□ -0.85
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Zfp174B9EJW5 407 aa9.74□□□□□ -0.85
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Tcp10bE9PYJ0 438 aa9.74□□□□□ -0.85
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Zfr2E9Q5M4 874 aa9.74□□□□□ -0.85
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 FancfE9Q5Z5 343 aa9.74□□□□□ -0.85
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Impa1O55023 277 aa9.74□□□□□ -0.85
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 PrkchP23298 683 aa9.74□□□□□ -0.85
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Rasgrf1P27671 1262 aa9.74□□□□□ -0.85
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Drg1P32233 367 aaKnown RBP9.74□□□□□ -0.85
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Hsd17b1P51656 344 aa9.74□□□□□ -0.85
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Surf6P70279 355 aaKnown RBP9.74□□□□□ -0.85
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Spink5Q148R4 1017 aa9.74□□□□□ -0.85
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Ccndbp1Q3TVC7 356 aa9.74□□□□□ -0.85
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Znf583Q3V080 568 aa9.74□□□□□ -0.85
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Elf1Q60775 612 aa9.74□□□□□ -0.85
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Phlda1Q62392 405 aa9.74□□□□□ -0.85
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Sh3gl2Q62420 352 aa9.74□□□□□ -0.85
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Cyp3a16Q64481 504 aa9.74□□□□□ -0.85
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Tbc1d12Q6A039 696 aa9.74□□□□□ -0.85
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Inppl1Q6P549 1257 aa9.74□□□□□ -0.85
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Mrgprb8Q7TN51 330 aa9.74□□□□□ -0.85
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Nek5Q7TSC3 627 aa9.74□□□□□ -0.85
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Fnbp1Q80TY0 616 aa9.74□□□□□ -0.85
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 MogsQ80UM7 834 aaKnown RBP9.74□□□□□ -0.85
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Crybg3Q80W49 1005 aa9.74□□□□□ -0.85
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Wdtc1Q80ZK9 677 aa9.74□□□□□ -0.85
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Mical2Q8BML1 960 aa9.74□□□□□ -0.85
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Nipal1Q8BMW7 416 aa9.74□□□□□ -0.85
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Pyhin1Q8BV49 420 aa9.74□□□□□ -0.85
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Dis3lQ8C0S1 1053 aa9.74□□□□□ -0.85
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Fbxl5Q8C2S5 690 aa9.74□□□□□ -0.85
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Brat1Q8C3R1 822 aa9.74□□□□□ -0.85
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Usp20Q8C6M1 916 aa9.74□□□□□ -0.85
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Epc1Q8C9X6 813 aa9.74□□□□□ -0.85
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Adnp2Q8CHC8 1165 aaKnown RBP9.74□□□□□ -0.85
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Gga1Q8R0H9 635 aa9.74□□□□□ -0.85
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Gle1Q8R322 699 aa9.74□□□□□ -0.85
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Cpa5Q8R4H4 436 aa9.74□□□□□ -0.85
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Olfr1494Q8VGP8 315 aa9.74□□□□□ -0.85
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Olfr385Q8VGT1 312 aa9.74□□□□□ -0.85
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Ube2sQ921J4 223 aa9.74□□□□□ -0.85
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 NamptQ99KQ4 491 aa9.74□□□□□ -0.85
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Mcrs1Q99L90 462 aa9.74□□□□□ -0.85
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 CactinQ9CS00 772 aaKnown RBP9.74□□□□□ -0.85
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Arhgap8Q9CXP4 425 aa9.74□□□□□ -0.85
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Gstt4Q9D4P7 240 aa9.74□□□□□ -0.85
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Mrpl4Q9DCU6 294 aaKnown RBP9.74□□□□□ -0.85
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 DpysQ9EQF5 519 aa9.74□□□□□ -0.85
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Cpb2Q9JHH6 422 aa9.74□□□□□ -0.85
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Prl2a1Q9JHK0 228 aa9.74□□□□□ -0.85
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Edf1Q9JMG1 148 aaKnown RBP9.74□□□□□ -0.85
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 St6galnac4Q9R2B6 360 aa9.74□□□□□ -0.85
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Trpv2Q9WTR1 756 aa9.74□□□□□ -0.85
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Slc22a3Q9WTW5 551 aa9.74□□□□□ -0.85
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Pacsin2Q9WVE8 486 aaKnown RBP9.74□□□□□ -0.85
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Msl3Q9WVG9 525 aa9.74□□□□□ -0.85
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Kcng1A2BDX4 514 aa9.73□□□□□ -0.85
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Supt3B0QZW4 406 aa9.73□□□□□ -0.85
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Mroh5E9PUJ8 762 aa9.73□□□□□ -0.85
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 F6Y6L6 278 aa9.73□□□□□ -0.85
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Rgs22G3UYX5 1258 aa9.73□□□□□ -0.85
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 SprtnG3X912 497 aa9.73□□□□□ -0.85
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Top6blJ3QMY9 579 aa9.73□□□□□ -0.85
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 1700122O11RikJ3QPW6 241 aa9.73□□□□□ -0.85
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Gm3164L7N2B9 238 aa9.73□□□□□ -0.85
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Gm3264L7N2C5 238 aa9.73□□□□□ -0.85
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 PtgisO35074 501 aa9.73□□□□□ -0.85
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Pdk4O70571 412 aa9.73□□□□□ -0.85
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Chmp6P0C0A3 200 aa9.73□□□□□ -0.85
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Cd72P21855 354 aa9.73□□□□□ -0.85
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Epha3P29319 983 aa9.73□□□□□ -0.85
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Psmc1P62192 440 aa9.73□□□□□ -0.85
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Smyd1P97443 490 aa9.73□□□□□ -0.85
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 MlxipQ2VPU4 917 aa9.73□□□□□ -0.85
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Hexim2Q3TVI4 313 aa9.73□□□□□ -0.85
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Arglu1Q3UL36 271 aaKnown RBP9.73□□□□□ -0.85
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Nr1d1Q3UV55 615 aa9.73□□□□□ -0.85
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Tp53i13Q5F267 385 aa9.73□□□□□ -0.85
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Trim38Q5SZ99 471 aa9.73□□□□□ -0.85
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Tfap2bQ61313 459 aa9.73□□□□□ -0.85
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Tspyl5Q69ZB3 406 aa9.73□□□□□ -0.85
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Tcaf3Q6QR59 914 aa9.73□□□□□ -0.85
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Olfr670Q7TRP3 312 aa9.73□□□□□ -0.85
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Wscd1Q80XH4 572 aa9.73□□□□□ -0.85
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Arhgap15Q811M1 481 aa9.73□□□□□ -0.85
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Gpt2Q8BGT5 522 aa9.73□□□□□ -0.85
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Cnot10Q8BH15 744 aa9.73□□□□□ -0.85
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Bicd1Q8BR07 835 aa9.73□□□□□ -0.85
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Kdm1bQ8CIG3 826 aa9.73□□□□□ -0.85
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Unc93b1Q8VCW4 598 aa9.73□□□□□ -0.85
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 GldcQ91W43 1025 aa9.73□□□□□ -0.85
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 36.8 ms