RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000027667.12

Pkp1-201, Transcript of Plakophilin-1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Pkp1, Length 4,669 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Cuedc2Q9CXX9 284 aa13.39□□□□□ -0.27
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Zfp472B0V2W5 534 aa13.39□□□□□ -0.27
Pkp1-201ENSMUST00000027667 March10E9PX79 788 aa13.39□□□□□ -0.27
Pkp1-201ENSMUST00000027667 PtprcP06800 1291 aa13.39□□□□□ -0.27
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Klra1P20937 262 aa13.39□□□□□ -0.27
Pkp1-201ENSMUST00000027667 SybuQ8BHS8 665 aa13.39□□□□□ -0.27
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Chmp2bQ8BJF9 213 aa13.39□□□□□ -0.27
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Nxnl1Q8VC33 217 aa13.39□□□□□ -0.27
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Rprd1aQ8VDS4 312 aa13.39□□□□□ -0.27
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Pcdhb11Q91UZ8 797 aa13.39□□□□□ -0.27
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Sytl1Q99N80 567 aa13.39□□□□□ -0.27
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Trpm3Q5F4S9 1721 aa13.38□□□□□ -0.27
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Dhx35A2ACQ1 703 aaKnown RBP13.38□□□□□ -0.27
Pkp1-201ENSMUST00000027667 2010300C02RikE9Q3M9 1175 aa13.38□□□□□ -0.27
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Hoxc6P10629 235 aa13.38□□□□□ -0.27
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Zfy2P20662 777 aa13.38□□□□□ -0.27
Pkp1-201ENSMUST00000027667 YwhahP68510 246 aaKnown RBP13.38□□□□□ -0.27
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Rnf10Q3UIW5 804 aa13.38□□□□□ -0.27
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Gpatch2lQ6PE65 482 aa13.38□□□□□ -0.27
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Fbxl21Q8BFZ4 434 aa13.38□□□□□ -0.27
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Gtf2h1Q9DBA9 547 aa13.38□□□□□ -0.27
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Slc13a1Q9JHI4 594 aa13.38□□□□□ -0.27
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Cdc42ep5Q9Z0X0 150 aa13.38□□□□□ -0.27
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Adamtsl3G3UXC7 1706 aa13.38□□□□□ -0.27
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Apol7bB1AQP7 369 aa13.38□□□□□ -0.27
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Ccdc175E9PVB3 822 aa13.38□□□□□ -0.27
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Gm7694J3QNH8 270 aa13.38□□□□□ -0.27
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Apol7eQ3UZ24 369 aa13.38□□□□□ -0.27
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Krt35Q497I4 455 aa13.38□□□□□ -0.27
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Wscd1Q80XH4 572 aa13.38□□□□□ -0.27
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Dcun1d2Q8BZJ7 259 aa13.38□□□□□ -0.27
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Pak5Q8C015 719 aa13.38□□□□□ -0.27
Pkp1-201ENSMUST00000027667 SmtnQ921U8 923 aa13.38□□□□□ -0.27
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Anxa13Q99JG3 317 aa13.38□□□□□ -0.27
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Q9D4A5 307 aa13.38□□□□□ -0.27
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Aldh1a3Q9JHW9 512 aa13.38□□□□□ -0.27
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Tk2Q9R088 270 aa13.38□□□□□ -0.27
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Zfp846G3X996 541 aa13.38□□□□□ -0.27
Pkp1-201ENSMUST00000027667 B020004C17RikJ3QP07 232 aa13.38□□□□□ -0.27
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Ap3d1O54774 1199 aa13.38□□□□□ -0.27
Pkp1-201ENSMUST00000027667 SPINDOCQ05AH6 381 aa13.38□□□□□ -0.27
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Ndst1Q3UHN9 882 aa13.38□□□□□ -0.27
Pkp1-201ENSMUST00000027667 FdxrQ61578 494 aa13.38□□□□□ -0.27
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Ddx3xQ62167 662 aaKnown RBP13.38□□□□□ -0.27
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Xpo1Q6P5F9 1071 aaKnown RBP13.38□□□□□ -0.27
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Lrrc24Q8BHA1 521 aa13.38□□□□□ -0.27
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Ndfip2Q91ZP6 311 aa13.38□□□□□ -0.27
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Lpin2Q99PI5 893 aa13.38□□□□□ -0.27
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Lsm7Q9CQQ8 103 aaKnown RBP13.38□□□□□ -0.27
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Ddx39bQ9Z1N5 428 aaKnown RBP13.38□□□□□ -0.27
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Scgb2b11A0A087WR49 112 aa13.37□□□□□ -0.27
Pkp1-201ENSMUST00000027667 PotegA5H0M4 473 aa13.37□□□□□ -0.27
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Gm5160F8VPN3 147 aa13.37□□□□□ -0.27
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Hes2O54792 157 aa13.37□□□□□ -0.27
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Rnf113a2Q14B01 337 aa13.37□□□□□ -0.27
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Q3TQQ9 903 aa13.37□□□□□ -0.27
Pkp1-201ENSMUST00000027667 PostnQ62009 838 aa13.37□□□□□ -0.27
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Ddx55Q6ZPL9 600 aaKnown RBP13.37□□□□□ -0.27
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Pramel7Q810Y8 479 aa13.37□□□□□ -0.27
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Gcfc2Q8BKT3 769 aa13.37□□□□□ -0.27
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Rhpn2Q8BWR8 686 aa13.37□□□□□ -0.27
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Setdb2Q8C267 713 aa13.37□□□□□ -0.27
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Pnma3Q8JZW8 466 aa13.37□□□□□ -0.27
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Tmprss4Q8VCA5 435 aa13.37□□□□□ -0.27
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Fam114a2Q8VE88 497 aa13.37□□□□□ -0.27
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Abcf2Q99LE6 628 aaKnown RBP13.37□□□□□ -0.27
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Vps33aQ9D2N9 598 aa13.37□□□□□ -0.27
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Atp11cQ9QZW0 1129 aa13.37□□□□□ -0.27
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Klhl33G3UW92 533 aa13.37□□□□□ -0.27
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Usp35M0QWN7 1009 aa13.37□□□□□ -0.27
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Ap1g2O88512 791 aa13.37□□□□□ -0.27
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Rrm1P07742 792 aa13.37□□□□□ -0.27
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Prl3b1P09586 222 aa13.37□□□□□ -0.27
Pkp1-201ENSMUST00000027667 IppP28575 584 aa13.37□□□□□ -0.27
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Nkx2-5P42582 318 aa13.37□□□□□ -0.27
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Heatr9Q5QNV8 569 aa13.37□□□□□ -0.27
Pkp1-201ENSMUST00000027667 CbarpQ66L44 698 aa13.37□□□□□ -0.27
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Fam167aQ6P1G6 215 aa13.37□□□□□ -0.27
Pkp1-201ENSMUST00000027667 LppQ8BFW7 613 aa13.37□□□□□ -0.27
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Naa25Q8BWZ3 972 aa13.37□□□□□ -0.27
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Nudcd3Q8R1N4 363 aa13.37□□□□□ -0.27
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Ppp6r2Q8R3Q2 923 aa13.37□□□□□ -0.27
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Wdr98Q8VC42 657 aa13.37□□□□□ -0.27
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Pin4Q9CWW6 131 aa13.37□□□□□ -0.27
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Rpn2Q9DBG6 631 aaKnown RBP13.37□□□□□ -0.27
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Cnga3Q9JJZ8 631 aa13.37□□□□□ -0.27
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Rnf19aP50636 840 aa13.37□□□□□ -0.27
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Il6stQ00560 917 aa13.37□□□□□ -0.27
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Ptcd3Q14C51 685 aaKnown RBP13.37□□□□□ -0.27
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Tbx2Q60707 711 aa13.37□□□□□ -0.27
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Znf280dQ68FE8 974 aa13.37□□□□□ -0.27
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Rassf10Q8BL43 508 aa13.37□□□□□ -0.27
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Shisa4Q8CA71 197 aa13.37□□□□□ -0.27
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Ildr1Q8CBR1 537 aa13.37□□□□□ -0.27
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Sox30Q8CGW4 782 aa13.37□□□□□ -0.27
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Mlc1Q8VHK5 382 aa13.37□□□□□ -0.27
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Q922M7 232 aa13.37□□□□□ -0.27
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Stk33Q924X7 491 aa13.37□□□□□ -0.27
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Utp11Q9CZJ1 253 aaKnown RBP13.37□□□□□ -0.27
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Zfy1P10925 782 aa13.37□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 36.7 ms